遗传多样性指数

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多样性指数介绍

标签:文库时间:2024-10-01
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多样性指数

多样性指数是用来描述一个群落的多样性的统计量。在生态学中,它被用来描述生态系统中的生物多样性,在经济学中可以用来描述一个地区中经济活动的分布。多样性指数经常被用来估算任何一个群落,每个成员都属于一个独特的群体或物种。在很多情况下,多样性指数的估计量是有偏的,因此相似的值之间往往不能直接比较。

一些常用多样性指数将讨论如下:

种丰富度(Species richness)

种丰富度S便是生态系统中物种的数目。这个指数无法表示相对丰度。实际上,除了一些非常贫瘠的系统之外,记录一个生态系统真实的种总丰富度是不可能的。系统中物种的观察值是其真实物种丰富度的有偏估计值,并且观察值会随着取样的增加非线性的增长。因此在表示从生态系统中观察到的物种丰富度时,S常被称作种密度(species density)。

香农多样性指数(Shannon's diversity index)

香农多样性指数用来估算群落多样性的高低,也叫香农-维纳(Shannon-Wiener)或香农-韦弗(Shannon-Weaver)指数。公式如下:

其中S表示总的物种数,pi表示第i个种占总数的比例(Pielou 1975)。当群落中只有一个居群存在时,香农指数达最小值

多样性指数介绍

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多样性指数

多样性指数是用来描述一个群落的多样性的统计量。在生态学中,它被用来描述生态系统中的生物多样性,在经济学中可以用来描述一个地区中经济活动的分布。多样性指数经常被用来估算任何一个群落,每个成员都属于一个独特的群体或物种。在很多情况下,多样性指数的估计量是有偏的,因此相似的值之间往往不能直接比较。

一些常用多样性指数将讨论如下:

种丰富度(Species richness)

种丰富度S便是生态系统中物种的数目。这个指数无法表示相对丰度。实际上,除了一些非常贫瘠的系统之外,记录一个生态系统真实的种总丰富度是不可能的。系统中物种的观察值是其真实物种丰富度的有偏估计值,并且观察值会随着取样的增加非线性的增长。因此在表示从生态系统中观察到的物种丰富度时,S常被称作种密度(species density)。

香农多样性指数(Shannon's diversity index)

香农多样性指数用来估算群落多样性的高低,也叫香农-维纳(Shannon-Wiener)或香农-韦弗(Shannon-Weaver)指数。公式如下:

其中S表示总的物种数,pi表示第i个种占总数的比例(Pielou 1975)。当群落中只有一个居群存在时,香农指数达最小值

物种多样性指数计算实例

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计算多样性指数

物种多样性指数计算

(1)多样性指数的计算公式如下: ① Gleason(1922)指数

D=S / lnA

式中:A为单位面积,S为群落中的物种数目。 ② Margalef指数

D=(S-1)/ lnN

式中S为群落中的总数目,N为观察到的个体总数。 ③ Simpson指数

D=1-ΣPi2

式中Pi种的个体数占群落中总个体数的比例。 ④ Shannon-wiener指数

H′= -ΣPilnPi

式中:Pi=Ni/N 。 ⑤ Pielou均匀度指数

E=H/Hmax

式中:H为实际观察的物种多样性指数,Hmax为最大的物种多样性指数,Hmax=LnS(S为群落中的总物种数)。

(2)乔木层物种多样性

调查区域乔木层物种多样性指数见表6-11和图6-4。评价范围内各群落乔木层Gleason指数在0.434~0.651之间,Margalef指数在0.254~0.588之间,Simpson指数在0.111~0.551之间,Shannon-wiener指数在0.224~0.882之间,Pielou指数在0.323~0.803之间。数据表明评价范围内乔木层的多样性指数较低。

表1 调查区域乔木层物种多样性指数

1

计算多样性指数

图1 调查区域乔木层物种多样性指

物种多样性指数计算实例

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计算多样性指数

物种多样性指数计算

(1)多样性指数的计算公式如下: ① Gleason(1922)指数

D=S / lnA

式中:A为单位面积,S为群落中的物种数目。 ② Margalef指数

D=(S-1)/ lnN

式中S为群落中的总数目,N为观察到的个体总数。 ③ Simpson指数

D=1-ΣPi2

式中Pi种的个体数占群落中总个体数的比例。 ④ Shannon-wiener指数

H′= -ΣPilnPi

式中:Pi=Ni/N 。 ⑤ Pielou均匀度指数

E=H/Hmax

式中:H为实际观察的物种多样性指数,Hmax为最大的物种多样性指数,Hmax=LnS(S为群落中的总物种数)。

(2)乔木层物种多样性

调查区域乔木层物种多样性指数见表6-11和图6-4。评价范围内各群落乔木层Gleason指数在0.434~0.651之间,Margalef指数在0.254~0.588之间,Simpson指数在0.111~0.551之间,Shannon-wiener指数在0.224~0.882之间,Pielou指数在0.323~0.803之间。数据表明评价范围内乔木层的多样性指数较低。

表1 调查区域乔木层物种多样性指数

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计算多样性指数

图1 调查区域乔木层物种多样性指

抗体多样性的遗传学原理

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抗体多样性的遗传学原理

摘要 日本分子生物学家利根进川凭借抗体多样性遗传机制的发现,获得了1987年诺贝尔生理学或医学奖。他主要运用限制酶酶切和重组DNA技术,通过演示一个DNA分子的突变和重组或重新排列证明了体细胞突变理论。本文将就该成就的取得过程、实验原理和实验经过进行详细阐述。

关键词 利根进川 体细胞突变理论 限制酶酶切 重组DNA

1、问题的产生

二十世纪是生命科学迅猛发展的时代,免疫学是其中一个飞速发展的领域。免疫学研究的基本问题之一是机体识别“自我”和“非我”。生物体受到外源物质感染后,会启动体液免疫而产生某些特殊的蛋白质进行抵御,即抗体。[1]由于可作为抗原刺激机体产生免疫应答的物种成千上万,理论而言可产生相应数量的抗体。但一个物种只有数量有限的编码基因,因此20世纪70年代前,抗体多样性的产生机制一直是免疫学家争论不休的问题。主要分歧为生殖系理论和体细胞突变理论。生殖系理论认为,所有抗体都有专一基因负责,但该理论问题在于生物体内基因数目无法满足众多的抗体;体细胞突变理论认为,抗体基因可以发生突变和重组,该理论可以解释很少基因数能够产生大量微小差异的抗体,但缺乏有力的实验支持。

1971年,日本分子生物学家利根进川加入巴塞尔

棉花耐盐相关种质资源遗传多样性分析

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生物多样性 2010, 18 (2): 142–149 Biopersity Science http: //080ecaecd4d8d15abe234e7d

——————————————————

收稿日期: 2009-11-02; 接受日期: 2010-01-25

基金项目: “十一五”国家科技支撑计划(2006BAD13B04-1)

* 通讯作者 Author for correspondence. E-mail: yew158@080ecaecd4d8d15abe234e7d 棉花耐盐相关种质资源遗传多样性分析

张丽娜 叶武威* 王俊娟 樊保香 王德龙

(中国农业科学院棉花研究所, 农业部棉花遗传改良重点实验室, 河南安阳 455000)

摘要: 为了解我国棉花耐盐相关种质资源的遗传变异, 利用88对SSR 引物对23份棉花耐盐材料和24份盐敏感材料

进行遗传多样性分析。88个SSR 位点在47份材料中共检测

生物多样性公约

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生物多样性公约

CBD

Distr. GENERAL

UNEP/CBD/WG-RI/2/7

16 May 2007

CHINESE

ORIGINAL: ENGLISH 生物多样性公约

关于审查《公约》执行情况的

不限成员名额特设工作组

第二次会议

2007年7月9日至13日,巴黎教科文组织 *临时议程项目11

《公约》的运作:第VIII/10号决定所产生的事项

执行秘书的说明

摘要

缔约方大会在关于《公约》运作的第VIII/10号决定第35段中,请审查公约执行情况的不限名额特设工作组制订指导意见,以用于今后审查和撤回缔约方大会的决定;缔约方大会还在同一决定第30段中请工作组审议接纳政府或非政府组织和机构的程序。

基于以往的做法,并根据缔约方大会最近就该事项做出的各项决定,兹建议通过一项决定和对其进行审查以可能撤回之间的时间间隔应该为8年。除时间间隔之外,似乎不必对审查的标准和办法做出任何改变。

本文件利用其他公约的做法,概述了接纳观察员组织和机构的程序。这一程序要求此类组织和机构必须向执行秘书提供相关的信息,执行秘书须将名单提交缔约方大会。

提出的建议

谨建议审查公约执行情况的工作组建议缔约方大会通过一项措辞大致如下的决定:

“A. 审查和撤回缔约方大会的各项决定

“缔约方大

生态遗传学在生物多样性保护中的作用

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本文就生态遗传学在生物多样性保护中的作用问题谈了几点看法。首先陈述了生态遗传学的性质,它是种群生态学和种群遗传学的结合,研究种群层次上正在进行着的进化;其次列举了生态遗传学的基本内容,说明生态遗传学是生物多样性研究和保护不可缺少的基本知识。最后举两个实例阐

生物多样性!第"卷,第#期,$%%%年#月

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生态遗传学在生物多样性保护中的作用

黄瑞复

(云南大学,昆明!5=%%>#)!

摘!要!本文就生态遗传学在生物多样性保护中的作用问题谈了几点看法。首先陈述了生态遗传学的性质,它是种群生态学和种群遗传学的结合,研究种群层次上正在进行着的进化;其次列举了生态遗传学的基本内容,说明生态遗传学是生物多样性研究和保护不可缺少的基本知识。最后举两个实例阐明生态遗传学在生物多样性保护中的具体应用。

关键词!生态遗传学,种群,生物多样性

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广西普通野生稻的遗传多样性及分布特征

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中国农业科学 2009,42(8):2633-2642 Scientia Agricultura Sinica doi: 10.3864/j.issn.0578-1752.2009.08.001

广西普通野生稻的遗传多样性及分布特征

黄 娟

1,2

,杨庆文,陈成斌,梁世春,张万霞,乔伟华,王家祥

122111

(1中国农业科学院作物科学研究所,北京 100081;2广西农业科学院水稻研究所,南宁 530007)

摘要:【目的】对广西境内普通野生稻居群遗传多样性进行研究,明确广西普通野生稻遗传多样性分布与地理特征的关系。【方法】利用36对分布于水稻12条染色体上的微卫星引物对来自广西14个区域(县级行政区域)的27个居群690份普通野生稻材料进行遗传多样性分析。【结果】所有个体平均等位基因数A=9.86,有效等位基因数Ae=5.05,总遗传多样度Ht=0.74,基因分化系数Gst=0.49,说明广西普通野生稻遗传多样性丰富,且居群内与居群间的多样性对总遗传多样性的贡献相当。通过不同区域遗传多样性检测和聚类分析,在遗传一致度为0.5处可把广西普通野生稻分为

生态遗传学在生物多样性保护中的作用

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本文就生态遗传学在生物多样性保护中的作用问题谈了几点看法。首先陈述了生态遗传学的性质,它是种群生态学和种群遗传学的结合,研究种群层次上正在进行着的进化;其次列举了生态遗传学的基本内容,说明生态遗传学是生物多样性研究和保护不可缺少的基本知识。最后举两个实例阐

生物多样性!第"卷,第#期,$%%%年#月

&’()*+*,(-.(/*0+(12!!(#):#34#5,6789:;9<,$%%%

生态遗传学在生物多样性保护中的作用

黄瑞复

(云南大学,昆明!5=%%>#)!

摘!要!本文就生态遗传学在生物多样性保护中的作用问题谈了几点看法。首先陈述了生态遗传学的性质,它是种群生态学和种群遗传学的结合,研究种群层次上正在进行着的进化;其次列举了生态遗传学的基本内容,说明生态遗传学是生物多样性研究和保护不可缺少的基本知识。最后举两个实例阐明生态遗传学在生物多样性保护中的具体应用。

关键词!生态遗传学,种群,生物多样性

"#$%&’$(&)$*&’&+,*-’+$.$/,*(,.0,&1,2$%(,/3*&.($%2-/,&.456789:;,<=;

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