miRNA的GO分析

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miRNA相关分析网站

标签:文库时间:2024-11-19
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miRNA数据库及靶基因分析软件 1.miRBase: http://www.mirbase.org

miRBase序列数据库是一个提供包括已发表的miRNA序列数据、注释、预测基因靶标等信息的全方位数据库,是存储miRNA信息最主要的公共数据库之一。miRBase提供便捷的网上查询服务,允许用户使用关键词或序列在线搜索已知的miRNA和靶标信息。

2.miRecords: http://mirecords.biolead.org/

动物 mirna的靶相互作用的数据库, 包括人工收集实验验证的, 预测的 miRNA的靶目标. 靶标预测工具DIANA-microT, MicroInspector, miRanda, MirTarget2, miTarget,

NBmiRTar,

PicTar,

PITA,

RNA22,

RNAhybrid,

and

TargetScan/TargertScanS.

3.PMRD: http://BioInformatics.cau.edu.cn/PMRD/ PMRD是一个关于植物microRNA数据库,包括了microRNA序列和它们的靶基因、二级结构、表达谱、基因组搜索等等,并且该数据库尝试着整合大量的关于

miRNA相关分析网站

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miRNA数据库及靶基因分析软件 1.miRBase: http://www.mirbase.org

miRBase序列数据库是一个提供包括已发表的miRNA序列数据、注释、预测基因靶标等信息的全方位数据库,是存储miRNA信息最主要的公共数据库之一。miRBase提供便捷的网上查询服务,允许用户使用关键词或序列在线搜索已知的miRNA和靶标信息。

2.miRecords: http://mirecords.biolead.org/

动物 mirna的靶相互作用的数据库, 包括人工收集实验验证的, 预测的 miRNA的靶目标. 靶标预测工具DIANA-microT, MicroInspector, miRanda, MirTarget2, miTarget,

NBmiRTar,

PicTar,

PITA,

RNA22,

RNAhybrid,

and

TargetScan/TargertScanS.

3.PMRD: http://BioInformatics.cau.edu.cn/PMRD/ PMRD是一个关于植物microRNA数据库,包括了microRNA序列和它们的靶基因、二级结构、表达谱、基因组搜索等等,并且该数据库尝试着整合大量的关于

使用siRNA、miRNA mimic 、pre-miRNA进行miRNA 生物学功能研究的

标签:文库时间:2024-11-19
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已有文献报道表明,等量的miRNA mimics 和pre-miRNA 进入体外或体内时,pre-miRNA能更特异地且高效的形成mature miRNA,并表现出更高的生物学活性。鉴于pre-miRNA 具有高效、低细胞毒性的特点,我们合成了pre-miR-21 和miRNA mimic,以相同剂量转染细胞,然后用RT-PCR 检测miRNA-21 成熟体的形成。试验结果表明效果远优于mimics,因此pre-miRNA在系统多因素的研究中具备其更独特的优势!

使用siRNA、miRNA mimic 、pre-miRNA进行miRNA 生物学功能研究的区别

Frank 20120715

miRNA是一类大小约为22个碱基的小RNA分子。它们在转录后阶段对基因表达进行调控。调控机制是通过与靶基因的mRNA互补序列结合,抑制蛋白质的 翻译或降低mRNA的稳

定性,从而抑制靶基因的表达。科研人员已逐步认识到miRNA在细胞的发育,分化,生长等生命活动中起着非常重要的调控作用,因此越来越多的科研人员把目光聚焦到这一领域,并期待能一窥miRNA的科学奥妙。

成熟的miRNA是由较长的初级转录物经过一系列核酸酶的剪切加工而产生的,初级转录物称为pri-miRN

使用siRNA、miRNA mimic 、pre-miRNA进行miRNA 生物学功能研究的区别

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已有文献报道表明,等量的miRNA mimics 和pre-miRNA 进入体外或体内时,pre-miRNA能更特异地且高效的形成mature miRNA,并表现出更高的生物学活性。鉴于pre-miRNA 具有高效、低细胞毒性的特点,我们合成了pre-miR-21 和miRNA mimic,以相同剂量转染细胞,然后用RT-PCR 检测miRNA-21 成熟体的形成。试验结果表明效果远优于mimics,因此pre-miRNA在系统多因素的研究中具备其更独特的优势!

使用siRNA、miRNA mimic 、pre-miRNA进行miRNA 生物学功能研究的区别

Frank 20120715

miRNA是一类大小约为22个碱基的小RNA分子。它们在转录后阶段对基因表达进行调控。调控机制是通过与靶基因的mRNA互补序列结合,抑制蛋白质的 翻译或降低mRNA的稳

定性,从而抑制靶基因的表达。科研人员已逐步认识到miRNA在细胞的发育,分化,生长等生命活动中起着非常重要的调控作用,因此越来越多的科研人员把目光聚焦到这一领域,并期待能一窥miRNA的科学奥妙。

成熟的miRNA是由较长的初级转录物经过一系列核酸酶的剪切加工而产生的,初级转录物称为pri-miRN

人教版go for it 教材分析 - 图文

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人教版《新目标英语》Go for it!教材分析

邓晓芳 西南大学外国语学院

一、 《新目标英语》教学目标

本套教材主要是依据中华人民共和国教育部颁布的《义务教育英语课程标准》,在(美国)圣智学习出版公司最新出版的Go for it!教材的基础上,由人民教育出版社与圣智学习出版公司合作改编而成。

1.1 英语课程性质和课程目标

义务阶段英语课程具有工具性和人文性双重性质。工具性指英语课程承担着培养学生基本英语素质和发展学生思维能力的任务,即学生掌握基本的英语语言知识,发展基本的英语听说读写技能,初步形成用英语与他人交流的能力,进一步促进思维能力的发展,为今后进一步学习英语和用英语学习其他相关科学文化知识奠定基础。人文性指英语课程承担着提高学生综合人文素养的任务,即学生通过英语课程能够开阔视野,丰富生活经历,形成跨文化意识,增强爱国主义精神,发展创新能力,形成良好的品格和正确的人生观与价值观。工具性和人文性统一的英语课程。

英语课程的学习,既是学生通过英语学习和实践活动,逐步掌握英语知识和技能,提高语言实际运用能力的过程,又是有利于为学生

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的终身发展奠定基础。他们磨砺意志、陶冶情操、拓展视野、丰富生活经历、开发思维能力、发展

Human miRNA PCR Array

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Human Brain Cancer miRNA PCR Array: MIHS-108Z

Anaplastic Astrocytoma: miR-107, miR-10b-5p, miR-124-3p, miR-125b-5p, miR-127-5p, miR-129-5p, miR-137, miR-138-5p, miR-187-3p, miR-203a, miR-218-5p, miR-296-5p,

miR-31-5p, miR-320a, miR-7-5p.

Glioblastoma: miR-101-3p, miR-107, miR-10b-5p, miR-124-3p, miR-128, miR-129-5p, miR-130a-3p, miR-132-3p, miR-133a, miR-133b, miR-137, miR-138-5p, miR-149-5p, miR-153, miR-16-5p, miR-181a-5p, miR-181b-5p, miR-185-5p, miR-187-3p, miR-191-5p, miR-203a, miR-21-5p, miR-210, miR-218-5p, miR-221-

调控DNA损伤修复的miRNA

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调控DNA损伤修复基因的microRNA

摘要:肿瘤的发生是个多级的过程,正常细胞的基因组受到各种各样的损伤而无法修复时,就有可能发生癌变转化为肿瘤细胞。细胞为了保护其基因组的完整性,会需要一套复杂的DNA损伤修复系统,当细胞的DNA受到损伤时,细胞就会启动该系统,引起细胞周期阻断、凋亡或者进行DNA损伤修复。放、化疗是通过引起DNA损伤而杀死肿瘤细胞的,也是一种主要的肿瘤治疗方法。损伤DNA修复蛋白,使细胞损伤无法修复,就能增加肿瘤放、化疗的效率。近年来,越来越多的证据证明microRNA(miRNA)参与DNA损失修复网络的调控过程。miRNA是一类内源性的小的非编码RNA,能在转录后水平调节基因的表达。由于其本身的特性,miRNA在许多生命进程中扮演着重要角色,本文探讨了miRNA在DNA损伤修复通路和肿瘤中的作用。

关键词:DNA损伤修复通路;miRNA;调控 1、前言

DNA损伤修复(DDR)通路是一个复杂的信号传导通路,在DNA损伤之后被激活。人体基因组DNA每时每刻都在遭受着来自体内外的各种因子的攻击而被损伤,细胞为了保护基因组的完整性,会启动DNA损伤修复系统,使细胞发生周期阻滞,最终细胞被修复或者凋亡[1]。许多研究已证实,

miRNA研究方法

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miRNA研究方法

尽管早在1993年,科学家就发现了第一个microRNA,但直到2003年以后,这种小RNA分子的大作用才不断被发现。研究显示:miRNA通过与转录本的相互作用,关闭或抑制基因的表达,影响了30%的基因。miRNA在多个组织中,例如正常和肿瘤组织中差异表达。因此,通过表达谱分析寻找疾病相关miRNA并进行发病机理研究,最终应用于肿瘤诊断和治疗,已经成为目前miRNA研究的重要方向。在研究中,从深度测序、miRNA芯片到通过导入化学合成的mimics/antagomirs等实现miRNA过表达和抑制,都是研究中常用的方法。同时,在miRNA研究中,生物信息学分析扮演着越来越重要的角色。

下表介绍了miRNA研究和应用中科学家关注的主要科学问题以及目前常用的研究方法。

miRNA主要研究技术

深度测序 抽提分离小分子(例如18-30nt)RNA,通过RT-PCR扩增之后,利用solexa深度测序,并进行生物信息学分析,获得miRNA表达谱。深度测序结合生物信息学分析手段,可以对海量数据进行分析,分别统计出已知的miRNA(miRNA-known)、新的miRNA(miRNA-new)以及可能的新miRNA(miRNA-cadida

Go语言应用范围及开发前景分析

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www.oldboyedu.com 老男孩IT教育,只培养技术精英

Go语言应用范围及开发前景分析

Go语言主要用作服务器端开发,其定位是用来开发“大型软件”的,适合于很多程序员一起开发大型软件,并且开发周期长,支持云计算的网络服务。Go语言能够让程序员快速开发,并且在软件不断的增长过程中,它能让程序员更容易地进行维护和修改。它融合了传统编译型语言的高效性和脚本语言的易用性和富于表达性。

Go语言作为服务器编程语言,很适合处理日志、数据打包、虚拟机处理、文件系统、分布式系统、数据库代理等;网络编程方面,Go语言广泛应用于Web应用、API应用、下载应用等;除此之外,Go语言还可用于内存数据库和云平台领域,目前国外很多云平台都是采用Go开发。

Go语言成功案例

Nsq:Nsq 是由Go语言开发的高性能、高可用消息队列系统,性能非常高,每天能处理数十亿条的消息;

Docker:基于lxc的一个虚拟打包工具,能够实现PAAS平台的组建。 Packer:用来生成不同平台的镜像文件,例如VM、vbox、AWS等,作者是vagrant的作者

Skynet:分布式调度框架

Doozer:分布式同步工具,类似ZooKeeper Heka:mazila开源的

miRNA与肺癌关系的研究进展

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东南国防医药 2 0 1 4年1月第 1 6卷第 1期

M i l i t a r y M e d i c a 1 J o u n r a l o f S o u t h e a s t C h i n a, V o 1 . 1 6, N o . 1, J a n . 2 0 1 4

7 3

m i R N A与肺癌关系的研究进展许德兵,吴凌云综述,宋勇 审校

[摘要] m i R N A是一类长约 2 1~ 2 5个核苷酸的小分子非编码 R N A,能调节转录后靶基因的表达,它在机体内对生长发

育、细胞繁殖、代谢、凋亡等生理过程发挥着重要作用。mi R N A具有癌基因或抑癌基因的双重作用,其表达水平的变化与肿瘤形成密切相关。肺癌是危害人类健康的恶性肿瘤之一,由于常常不能及时诊断,大部分肺癌患者发现时多已经是晚期,因而预后较差。近年来, mi R N A与肺癌的关系备受关注。 [关键词]肺癌; mi R N A;诊断[中图分类号] R 6 0 5 . 9 7 [文献标志码] A d o i: 1 0 . 3 9 6 9/ j . i s s n . 1 6 7 2— 2 7 1 X . 2 0 1 4 . 0 1 . 0 2 4