snp检测技术具有密度低的特点
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SNP及检测技术
1定义:
单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP),主要是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA序列多态性。它是人类可遗传的变异中最常见的一种。占所有已知多态性的90%以上。SNP在人类基因组中广泛存在,平均每500~1000个碱基对中就有1个,估计其总数可达300万个甚至更多。SNP所表现的多态性只涉及到单个碱基的变异,这种变异可由单个碱基的转换(transition)或颠换(transversion)所引起,也可由碱基的插入或缺失所致。但通常所说的SNP并不包括后两种情况。单核苷酸多态性(SNP)是指在基因组上单个核苷酸的变异,包括置换、颠换、缺失和插入。所谓转换是指同型碱基之间的转换,如嘌呤与嘌呤( G2A) 、嘧啶与嘧啶( T2C) 间的替换;所谓颠换是指发生在嘌呤与嘧啶(A2T、A2C、C2G、G2T) 之间的替换。从理论上来看每一个SNP 位点都可以有4 种不同的变异形式,但实际上发生的只有两种,即转换和颠换,二者之比为2:1。SNP 在CG序列上出现最为频繁,而且多是C转换为T ,原因是CG中的C 常为甲基化的,自发地脱氨后即成为胸腺嘧啶。一般而言,SNP 是指变异频率大于
SNP检测方法汇总
TaqMan SNP基因分型
技术方法:
此技术是由美国Life technologies公司研发的SNP分型技术,其技术原理如下简介。PCR 反应时,加入一对两端有不同荧光标记的特异探针来识别不同的等位基因(allele1和allele2),5’端为报告荧光基团(reporter),3’端为淬灭荧光基团 (quencher)。PCR过程中,两个探针能与正向引物和反向引物之间的互补序列特异退火结合。当探针以完整形式存在时,由于能量共振转移,荧光基团只发出微弱荧光。特异的探针与相应的等位基因杂合后,DNA聚合酶发挥5’到3’外切酶活性,把报告荧光基团切割下来,脱离了3’端淬灭荧光基团的淬灭作用 (quench),从而发出荧光。两个探针的5’端标有不同的荧光 (FAM或VIC),3’端标有MGB 淬灭基团结合体。根据检测到的不同荧光,可以判断相应的样本的SNP 等位基因型。 整个技术的示意图如下:
应用领域:本方法适用于多个涉及到SNP分型的遗传研究领域。尤其适合针对全基因组SNP关联研究获得的初步阳性位点,以及全基因组测序得到的大量初筛突变位点进行进一步的大样品验证研究。
RFLP (多重荧光)SNP分型技术
已知的很多SNP位点正好位于限制性
illumina SNP 分析技术方案书
编号: JN-20110912
illumina SNP 分析技术方案书
晶能生物技术(上海)有限公司
二0一一年九月十二日
晶能生物技术(上海)有限公司
公司背景
Illumina公司是一家从事开发,制造及销售用于分析遗传变异和生物功能的综合系统的高科技公司,于1998年成立,2005年进入中国,2007和2009年两次入选福布斯杂志评出的全美年度成长速度最快的高科技公司,同时亚太地区是Illumina全球增长最快的区域。公司在福布斯所公布的2009年度成长最快的高科技公司中超越Google,位列榜首。
Illumina的业务范围包括生物芯片技术,和新一代高通量测序技术两大领
域,具体则包括测序分析、基因表达分析、基因调控及表观遗传学分析、蛋白筛选分析、基因分型及CNV(拷贝数变异)分析。当然最为用户所知的是30倍磁珠覆盖产生的业内最高重复度及准确率,另外基因分型分析作为一种新兴遗传学技术,也正成为Illumina的一种核心技术。这项技术能够从核酸水平分析导致个体疾病的遗传变异,为多基因复杂疾病易感性,复杂疾病的发生机制和疾病防治与药物开发等领域的研究提供帮助。在Il
具有季节性特点的时间序列的预测
3.2 具有季节性特点的时间序列的预测
这里提到的季节,可以是自然季节,也可以是某种产品的销售季节等。显然,在现实的经济活动中,表现为季节性的时间序列是非常多的。比如,空调、取暖设备、季节性服装的生产与销售所产生的数据等。对于季节性时间序列的预测,要从数学上完全拟合其变化曲线是非常困难的。但预测的目的是为了找到时间序列的变化趋势,尽可能地做到精确。从这个意义上来讲,可以有多种方法,下面介绍其中一种,即所谓季节系数法。季节系数法的具体计算步骤如下:
1.收集m年的每年各季度或者各月份(每年n个季度)的时间序列样本数据xij。 2.计算每年所有的季度或所有月份的算术平均值,即:
1mn
xij,
ki 1j 1
m
k mn
3.计算同季度或同月份数据的算术平均值.j
x
i 1
ij
,j 1,2, ,n
4.计算季节系数或月份系数 j .j/。其中j 1,2, ,n为季度或者月份的序号。 5.预测计算。当时间序列是按季度列出时,先求出预测年份(下一年)的年加权平均:
ym 1
n
w1y1 w2y2 wmym
w1 w2 wm
式中,yi
x
j 1
ij
为i年份的年合计数:wi为i年份权数,按自然数列取值。再计算预
测年份的季度平均值m 1:m 1 ym 14。最
高密度脂蛋白胆固醇低的介绍
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高密度脂蛋白胆固醇低的介绍
导语:人体的内脏是有一定的有益元素含量的,比如人体含有大部分
的高密度脂蛋白胆固醇,这种物质对于人来说是非常重要的,他也可以说是形成胆汁的
人体的内脏是有一定的有益元素含量的,比如人体含有大部分的高密度脂蛋白胆固醇,这种物质对于人来说是非常重要的,他也可以说是形成胆汁的重要源泉,这种东西在人体内的作用相当的重要,因此,许多医生将高密度脂蛋白胆固醇作为检查疾病的依据,而高密度脂蛋白胆固醇低专门回事呢?下面看看介绍吧。
高密度脂蛋白胆固醇(HDL-C),高密度脂蛋白胆固醇可通俗地理解为\好\胆固醇,抗动脉粥样硬化的胆固醇,因为HDL-C可减少患冠状动脉心脏病的危险。高密度脂蛋白胆固醇主要是由肝脏合成。它是由载脂蛋白、磷脂、胆固醇和少量脂肪酸组成。
增高:是大家梦寐以求的愿望,最主要的临床价值是能够将动脉粥样硬化斑块的泡沫细胞转移至肝脏排出体外,可见于原发性高HDL血症(家族性高α-脂蛋白血症),并发现此群家族中长寿者多。接受雌激素胰岛素或某些药物(如烟酸、维生素E,肝素等)治疗者,亦可增高,虾青素可显著提升人类高密度脂蛋白胆固醇[1]。降低:常见于脑血管病、冠心病、高甘油三酯血症、肝功能损害如急慢
金融衍生产品具有以下几个特点
金融 衍生市场具体措施
金融衍生产品
金融衍生产品(derivatives)是指其价值依赖于基础资产(underlyings)价值变动的合约(contracts).
这种合约可以是标准化的,也可以是非标准化的.
标准化合约是指其标的物(基础资产)的交易价格,交易时间,资产特征,交易方式等都是事先标准化的,因此次类合约大多在交易所上市交易.如期货.
非标准化合约是指以上各项由交易的双方自行约定,因此具有很强的灵活性.比如远期协议.
金融衍生产品具有以下几个特点:
1.零和博弈.即合约交易的双方(在标准化合约中由于可以交易是不确定的)盈亏完全负相关,并且净损益为零,因此称"零和".
2.跨期性.金融衍生工具是交易双方通过对利率、汇率、股价等因素变动的趋势的预测,约定在未来某一时间按一定的条件进行交易或选择是否交易的合约。无论是哪一种金融衍生工具,都会影响交易者在未来一段时间内或未来某时间上的现金流,跨期交易的特点十分突出。这就要求交易的双方对利率、汇率、股价等价格因素的未来变动趋势作出判断,而判断的准确与否直接决定了交易者的交易盈亏。
3.联动性.这里指金融衍生工具的价值与基础产品或基础变量紧密联系,规则变动。通常,金融衍生工具与基础变量相联系
试验检测人员继续教育低应变检测技术自测答案
试验检测人员继续教育低应变检测技术自测答
案
LG GROUP system office room 【LGA16H-LGYY-LGUA8Q8-LGA162】
试验检测人员继续教育低应变检测技术自测答案
第1题
空心桩的激振点与测量传感器安装位置宜在同一水平面上,且与桩中心连线形成的夹角宜为
答案:B
第2题
低应变反射波法检测中,用加速度计测得的原始信号是,实际分析的曲线是
A.加速度加速度
B.加速度速度
C.速度加速度
D.速度速度
答案:B
第3题
低应变反射波法检测时,每个检测点有效信号数不宜少于个,通过叠加平均提高信噪比
答案:C
第4题
当桩进入硬夹层时,在实测曲线上将产生一个与入射波的反射波
A.反向
B.奇数次反射反向,偶数次反射同向
C.同向
D.奇数次反射同向,偶数次反射反向
答案:A
第5题
低应变反射波法检测中,桩身完整性类别分为类
答案:D
第6题
低应变反射波法所针对的检测对象,下列哪个说法不正确
A.工程桩
B.桩基
C.基桩
D.试桩
答案:B
第7题
对某一工地确定桩身波速平均值时,应选取同条件下不少于几根Ⅰ类桩的桩身波速参于平均波速的计算
答案:D
第8题
低应变反射波法计算桩身平均波速的必要条件是
A.测点下桩长、桩径
B.测点下桩长、桩顶相应时间、桩底反射时间
C.测点下桩长、成桩
SNP分析命令
E:\\ > cd e: E:\\
E:\\ > cd plink-1
E:\\plink-1>plink –file test 1. Map 更新
Plink --sheep --file data --update-map position.txt --recode --out data1
Chrnew.txt -- update-chr --recode --out data2 Position: SNP code and position Chrnew:SNP code and Chr. 2.SNP merge
Plink --file data1 --merge data2.ped data2.map --recode --out merge 3.提取SNP位点
Plink --file data --extract 50kSNP.txt --recode --out data1 50kSNP.txt: 50k中的SNP名 4. Quality control
Call rate >98%/99%
Plink --file sheep --geno 0.02 --r
根据新闻推送的特点发现其具有几点优势
根据新闻推送的特点发现其具有几点优势 1、新闻推送用户规模大,接触率高。一项针对互联网核心用户之一的大学生进行调查发现,有的会下意识的点击新闻查看,就算不点击,也会对新闻有一个感性认识。
2、新闻推送属于一种强制推送,为了不让用户产生反感,对于一些用户基数较大的软件平台,在推送消息数量和质量上都严格把控,在一定程度上契合了用户需求。比如旺旺,推送的消息都和买家或者卖家息息相关的,一般很少人对旺旺的推送消息产生反感情绪。
3、在突发新闻事件中,新闻推送有着不可比拟的优势。新闻报道一大特点就是快,这种快包括多重含义,包括第一时间报道,也包含在第一时间传播到受众,而新闻推送可以让正在使用具有新闻推送软件的用户最快知道发生的重大新闻。
以上是新闻推送的几个优势,但是,我们发现,现在很多软件都带有新闻推送功能,不同客户端会出现内容同质化严重,微信和今日头条的矛盾之一就是新闻同质化现象特别严重,二者之间都是以传播新闻而不是制造新闻为主要特点,发生撞车现象再正常不过了。其次,目前只有纯粹的新闻事件用户比较容易接受,而利用新闻推送进行营销,却差强人意,想要达到某种目的的推送,需要针对目标人群才能显示出效果。
现在很多企业开启互联网营销,他们通过网站或者通过第三方
低信噪比检测总结
低信噪比检测技术算法总结
微弱信号检测技术是运用电子学、信息论、计算机和物理学等方法,研究被测信号和噪声的统计特性及其差别;采用一系列信号处理方法,从噪声中检测出有用的微弱信号,从而满足现代科学研究和技术应用需要的检测技术。
微弱信号检测特点是第一,在较低的信噪比中检测微弱信号。造成信噪比低的原因,一方面是由于特征信号本身十分微弱;另一方面是由于强噪声干扰使得信噪比降低。如在机械设备处在故障早期阶段时,故障对应的各类特征信号往往以某种方式与其它信源信号混合,使得特征信号相当微弱;同时设备在工作时,又有强噪声干扰。因此,特征信号多为低信噪比的微弱信号。第二,要求检测具有一定的快速性和实时性。工程实际中所采集的数据长度或持续时间往往会受到限制,这种在较短数据长度下的微弱信号检测在诸如通讯、雷达、声纳、地震、工业测量、机械系统实时监控等领域有着广泛的需求[3-5]。微弱特征信号检测方法日新月异,从传统的频谱分析、相关检测、取样积分和时域平均方法到新近发展起来的小波分析理论、神经网络、混沌振子、高阶统计量,随机共振等方法,在微弱特征信号检测中均有广泛的应用。 1 时域检测法
1.1 相关检测(可以再找找相关的论文补充一下)
相关检测是上世纪60年代发