提取dna样品的关键操作环节

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DNA提取的操作

标签:文库时间:2024-11-20
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基因组DNA提取

基因组DNA提取试剂盒简介

DNA是遗传信息的载体,是最重要的生物信息分子,是分子生物学研究的主要对象,为了进行测序、杂交、基因表达、文库构建等试验,获得高分子量和高纯度的基因组DNA是非常重要的前提,因此基因组DNA的提取也是分子生物学试验技术中最重要、最基本的操作之一。 一、基因组DNA提取的原则

1、保证核酸一级结构的完整性(因为遗传信息全部储存在核酸一级结构中,故完整的一级结构是保证核酸结构与功能研究的基层)。

2、排除其它分子(如蛋白质、多糖,、脂类、有机溶剂等)的污染,使下游试验顺利进行。

二、基因组DNA提取的原理和方法

DNA与组蛋白构成核小体,核小体缠绕成中空的螺旋管状结构,即染色丝,染色丝再与许多非组蛋白形成染色体。染色体存在于细胞核中,外有核膜及胞膜。从组织中提取DNA必须先将组织分散成单个细胞,然后破碎胞膜及核膜,使染色体释放出来,同时去除与DNA结合的组蛋白及非组蛋白。 1、样品预处理

从各种不同来源的样品(如细菌、酵母、血液、动植物组织细胞等)中提取高纯度的基因组DNA,因细胞结构及所成分不同,样品预处理方式也不同,以下简单介绍常用提取材料的预处理方式,若需详细了解,请参考本公司各基因组DNA提取

DNA提取的操作

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基因组DNA提取

基因组DNA提取试剂盒简介

DNA是遗传信息的载体,是最重要的生物信息分子,是分子生物学研究的主要对象,为了进行测序、杂交、基因表达、文库构建等试验,获得高分子量和高纯度的基因组DNA是非常重要的前提,因此基因组DNA的提取也是分子生物学试验技术中最重要、最基本的操作之一。 一、基因组DNA提取的原则

1、保证核酸一级结构的完整性(因为遗传信息全部储存在核酸一级结构中,故完整的一级结构是保证核酸结构与功能研究的基层)。

2、排除其它分子(如蛋白质、多糖,、脂类、有机溶剂等)的污染,使下游试验顺利进行。

二、基因组DNA提取的原理和方法

DNA与组蛋白构成核小体,核小体缠绕成中空的螺旋管状结构,即染色丝,染色丝再与许多非组蛋白形成染色体。染色体存在于细胞核中,外有核膜及胞膜。从组织中提取DNA必须先将组织分散成单个细胞,然后破碎胞膜及核膜,使染色体释放出来,同时去除与DNA结合的组蛋白及非组蛋白。 1、样品预处理

从各种不同来源的样品(如细菌、酵母、血液、动植物组织细胞等)中提取高纯度的基因组DNA,因细胞结构及所成分不同,样品预处理方式也不同,以下简单介绍常用提取材料的预处理方式,若需详细了解,请参考本公司各基因组DNA提取

质粒DNA的提取

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质粒DNA的提取、纯化与纯度鉴定

李笃财 生科

1班 201200140048

【实验目的】

1、掌握碱变性提取法的原理及各种试剂的作用。 2、掌握碱变性法提取质粒DNA的方法。

3、学习并掌握凝胶电泳进行DNA分离纯化的实验原理。 【实验原理】

1. 质粒DNA的提取——碱变性提取法:

提取和纯化质粒DNA的方法很多,目前常用的有:碱变性提取法、煮沸法、羟基磷灰石柱层析法、EB-氯化铯密度梯度离心法和Wizard法等。其中,碱变性提取法最为经典和常用,适于不同量质粒DNA的提取。该方法操作简单,易于操作,一般实验室均可进行。提取质粒DNA纯度高,可直接用于酶切、序列测定及分析。

碱变性法提取质粒DNA一般包括三个基本步骤:培养细菌细胞以扩增质粒;收集和裂解细胞;分离和纯化质粒DNA。

在细菌细胞中,染色体DNA以双螺旋结构存在,质粒DNA以共价闭合环状形式存在。细胞破碎后,染色体DNA和质粒DNA均被释放出来,但两者变性与复性所依赖的溶液pH值不同。在pH值高达12.0的碱性溶液中,染色体DNA氢键断裂,双螺旋结构解开而变性;共价闭合环状质粒DNA的大部分氢键断裂,但两条互补链不完全分离

总DNA的提取

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第二章 材料与方法

2.2总DNA的提取

土壤中存在着大量的腐植酸、蛋白质等杂质都将会影响以下实验步骤,而过多的纯化的步骤又会造成DNA的大量损失和DNA片段的破碎。土壤总DNA的质量直接决定实验着是否能够准确的反应微生物的实际群落组成结构,实验证明不同提取方法获得的DNA,经DGGE分析会产生不同的群落结构指纹图谱

错误!未找到引用源。

,因此选用合适的DNA 提取方法

是十分重要的;,所以必须在在DNA的质量和纯度上做出最佳的平衡选择,Krsek和Welington

错误!未找到引用源。

认为玻珠+溶菌酶+SDS的组合可从土壤中获较高产量和纯度的DNA。

错误!未找到引用源。

直接提取法参照Krsek和Welington 步骤方法如下:

实验试剂:

的试验方法并略作改变,具体使用试剂和

DNA提取液(1%(W/V) CTAB(十六烷基三乙基溴化铵) 1.5mol/lNaCl、100mM磷酸钠、100mM Tris-HCl、100mM EDTA、PH=8);20mg/ml蛋白酶K;50mg/ml溶菌酶;10%SDS;饱和酚;酚/氯仿/异戊醇(25:24:1 V/+V);氯仿;100%乙醇;70%乙醇;异丙醇。

提取步骤:

1.称取1g土样放入2.0

植物DNA的提取

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综合性实验设计

——植物DNA的提取及纯度检验方案

班级 组别 成员 指导教师 10级生物科学2班 第七组 刘梦雅、王芳、毛阿威、张杰 刘立亚

2011年11月11日

综合性实验设计

——植物DNA的提取及纯度检验方案

一、 实验目的

1. 学习从生物体中分离核酸的原理和方法; 2. 掌握测定核酸的原理和方法;

3. 掌握核酸的琼脂糖凝胶电泳的原理和方法;

4. 培养学生创新实践能力和团队合作精神,并强化科研反哺教学效果。

二、 实验原理

1、 关于植物DNA制备的基本原理

植物细胞中DNA主要存在于细胞核内,称为核DNA。细胞质中含有少量的DNA,称之为细胞质DNA,主要分布于线粒体或叶绿体中,分别称为线粒体DNA和叶绿体DNA,细胞内各种DNA称为总DNA。植物DNA的制备,必须首先注意植物细胞的特点:①植物组织中含有坚硬的纤维素,采用温和条件难以破碎细胞;②植物细胞一般具有大的液泡,破碎细胞时有机酸随之逸出将使pH显著下降;③通常植物细胞的DNA含量较低;④植物中含有大量多糖、脂质、色素和酚类等物质,这些杂质往往会与提取的DNA混在一起,给核酸的提取与纯化带来诸多不便。鉴于以上特点,提取植物DNA时除了选

植物DNA的提取

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综合性实验设计

——植物DNA的提取及纯度检验方案

班级 组别 成员 指导教师 10级生物科学2班 第七组 刘梦雅、王芳、毛阿威、张杰 刘立亚

2011年11月11日

综合性实验设计

——植物DNA的提取及纯度检验方案

一、 实验目的

1. 学习从生物体中分离核酸的原理和方法; 2. 掌握测定核酸的原理和方法;

3. 掌握核酸的琼脂糖凝胶电泳的原理和方法;

4. 培养学生创新实践能力和团队合作精神,并强化科研反哺教学效果。

二、 实验原理

1、 关于植物DNA制备的基本原理

植物细胞中DNA主要存在于细胞核内,称为核DNA。细胞质中含有少量的DNA,称之为细胞质DNA,主要分布于线粒体或叶绿体中,分别称为线粒体DNA和叶绿体DNA,细胞内各种DNA称为总DNA。植物DNA的制备,必须首先注意植物细胞的特点:①植物组织中含有坚硬的纤维素,采用温和条件难以破碎细胞;②植物细胞一般具有大的液泡,破碎细胞时有机酸随之逸出将使pH显著下降;③通常植物细胞的DNA含量较低;④植物中含有大量多糖、脂质、色素和酚类等物质,这些杂质往往会与提取的DNA混在一起,给核酸的提取与纯化带来诸多不便。鉴于以上特点,提取植物DNA时除了选

试剂盒DNA提取详细操作步骤

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一、试剂盒打开后需要准备的工作

1、Proteinase K(蛋白酶K)的溶解

①取4.5ml双蒸水加入蛋白酶K粉中使其充分溶解

②将溶解好的蛋白酶K溶液分装进小离心管,每管100ul~200ul

③将分装好的Proteinase K放入-20℃冰箱中保存,使用期限为12个月 2、组织抑制剂(Inhibitor Removal buffer)的调配

加入20ml无水乙醇(absolute ethanol)颠倒混匀并在空白方框处打钩 3、洗液(wash buffer)的调配

加入80ml无水乙醇(absolute ethanol)颠倒混匀并在空白方框处打钩

二、组织DNA提取(试剂盒)

1、组织样品处理与消化

①将采集来的样品剪碎(≤0.1cm)洗净保存液。

②加入组织破解液Tissue-lysis 200ul 蛋白酶K 40ul然后放入55℃水浴锅内3

个小时使其充分消化。

2、DNA提取

①在消化好的组织样品中加入结合液binding buffer 200ul 然后放入70°水浴

锅中10分钟。

②再加异丙醇100ul 混合均匀吸取上清液放入柱体中,然后离心8000g一分钟。 ③倒掉底液,加500ul组织抑制剂Inhibitor

DNA提取方法

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DNeasy Blood & Tissue Kit (Qiagen, Hilden, Germany)试剂盒中文操作说明书 作者: Allanflying (站内联系TA) 发布: 2012-09-11

一.利用DNeasy? Blood & Tissue试剂盒提取样本总DNA 1.前处理: 注意:

1) 石蜡包埋组织的DNA一般小于650bp,还要视样本类型与保存年限而定。 2) 固定剂一般为福尔马林或酒精。不推荐用蛾酸固定的样本。 3) 溶解时间随样本类型和溶解状态而定。 4) 产量视样本类型和保存年限而定。推荐用50-100ul的AE缓冲液洗脱纯化的DNA。 5) 开始前要预热孵化器或水浴锅至37℃,用于操作步骤9)。 1.石蜡包埋组织的前处理 操作步骤:

1) 将小片石蜡包埋的组织(小于25mg)放入2ml离心管中(自备)。 2) 加入1200ul的二甲苯,用力涡旋震荡。 3) 最大转速室温(15-25°)离心5分钟。 4) 移液枪吸去上清。小心不要吸去沉淀。

5) 往沉淀中加1200ul的

DNA的粗提取与鉴定

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DNA的粗提取与鉴定(选修)

一、实验原理

1.DNA在NaCl溶液中的溶解度,是随着NaCl溶液浓度的变化而改变的。当NaCl物质的量浓度为0.14mol / L时,DNA的溶解度最低。

2.DNA不溶于酒精溶液,但是细胞中的其他许多物质则可以溶于酒精溶液。 3.DNA遇二苯胺会染成蓝色(遇甲基绿溶液被染成蓝绿色)。 4.鸟类红细胞有细胞核,核内DNA与蛋白质结合成染色质。

二、实验步骤

实验步骤 制备鸡血细胞液 (由教师完成) 1.提取鸡血细胞细胞核物质 操作方法 实验原理 取质量浓度为0.1g/mL的柠檬酸钠溶液100mL,柠檬酸钠能防止血液与新鲜的鸡血混合并搅拌,然后在冰箱内静置一凝固,静置使血细胞天,除去上清液,即得鸡血细胞液 与血浆分离 取20mL蒸馏水与约5-10 mL的鸡血细胞液混合并沿一个方向快速充分搅拌,然后用单层纱布过滤,取滤液于烧杯中 取质量浓度为2mol/L的NaCl溶液40mL与上述滤液混合后,沿一个方向轻轻搅拌,核中DNA溶解,染色质中的DNA与蛋白质分离 沿烧杯内壁慢慢加入蒸馏水并沿一个方向轻轻搅拌,至白色丝状粘稠物不再增加时停止加水 用多层纱布过滤,取纱布上的粘稠物 使细胞过度吸水而破裂 DNA在高浓度Na

酵母菌DNA的提取

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酵母DNA提取方法

方法一:

石英砂法

1、5000rpm×5min 收集过夜培养的菌体(5ml左右),于 200μL 裂解液(50 mmol/ L Tris-HCl pH 8.0 , 180 mmol/ LEDTA pH 8.0 , 1 % SDS , 现配)中,加入 3/10 总体积石英砂在涡流混合器上振荡 13min,每隔 4min 将离心管取出用力甩几下,然后 65℃水浴 10min。 2、加入 200μL 5mol/L KAc,冰浴 8min; 3、12000rpm×5min 转移上清至新的离心管中;

4、加入 3 mol/L NaAc 35μl,加入异丙醇 200μL混匀后冰浴 8min,12000rpm×5min收集沉淀;

5、200μL TE 溶解,加入 RNase10μL,65℃水浴 10min; 6、加入 200μL 氯仿-异戊醇(24:1),抽提;

7、温柔地取上清 150μL ,加入 20μL 3 mol/L NaAc 及 375μL 无水乙醇,混匀后12000rpm×8min 收集 DNA;

8、70% 乙醇洗涤沉淀,吹干后 TE 溶解,-20℃保藏。

方法二:

蜗牛酶法

1. 接种于5 ml的YEPD培养基中在