迪安肿瘤基因检测

迪安肿瘤个体化治疗

个体化治疗前沿简介>>

大规模人群调查和世界卫生组织调查均发现药物安全性问题是住院病人致死最重要的原因之一，居于全部死亡原因的第五位。

“全世界每年死亡的患者中，有1/3是药物不良反应所致。这是由传统的给药方式造成的，医生没有考虑人的个体差异，而是千人一药，千人一量。” 周宏灏——我国遗传药理学的开拓者、中国工程院院士。

华法林——常用抗凝药，在美国每年200万患者在服用该药，造成高达10万例严重的副作用，其中包括数千人死亡的。该药个体剂量差异可相差20倍,剂量过大会使病人有出血的危险；剂量太少可能会导致血栓，心脏病，中风，甚至死亡。

最佳用药剂量很大程度上取决于药物相关基因变异，即单核苷酸多态性（SNP）。SNP的复杂性，决定了药物反应的多态性，所以个体化用药，也意味着理想的治疗需要进行全基因组的药物筛选。目前，个体化治疗已经成为恶性肿瘤、高血压、糖尿病等重大慢性疾病临床治疗的发展方向和最有效的手段。 肿瘤个体化用药及有关检测

目前常用的抗肿瘤化疗药物对患者治疗的有效性低于70%，约20%-35%的患者接受了不恰当的药物治疗。如果肿瘤治疗能够同病异治、因人而异、实施个体化治

迪安肿瘤个体化治疗

个体化治疗前沿简介>>

大规模人群调查和世界卫生组织调查均发现药物安全性问题是住院病人致死最重要的原因之一，居于全部死亡原因的第五位。

“全世界每年死亡的患者中，有1/3是药物不良反应所致。这是由传统的给药方式造成的，医生没有考虑人的个体差异，而是千人一药，千人一量。” 周宏灏——我国遗传药理学的开拓者、中国工程院院士。

华法林——常用抗凝药，在美国每年200万患者在服用该药，造成高达10万例严重的副作用，其中包括数千人死亡的。该药个体剂量差异可相差20倍,剂量过大会使病人有出血的危险；剂量太少可能会导致血栓，心脏病，中风，甚至死亡。

最佳用药剂量很大程度上取决于药物相关基因变异，即单核苷酸多态性（SNP）。SNP的复杂性，决定了药物反应的多态性，所以个体化用药，也意味着理想的治疗需要进行全基因组的药物筛选。目前，个体化治疗已经成为恶性肿瘤、高血压、糖尿病等重大慢性疾病临床治疗的发展方向和最有效的手段。 肿瘤个体化用药及有关检测

目前常用的抗肿瘤化疗药物对患者治疗的有效性低于70%，约20%-35%的患者接受了不恰当的药物治疗。如果肿瘤治疗能够同病异治、因人而异、实施个体化治

肿瘤基因突变检测

癌症是一类难以预防的疾病，中晚期癌症治愈的可能性又很小，而早期癌症的治愈率可

达65%以上，有些肿瘤可达90%以上，因此，战胜癌症的关键是早期发现癌症。由于癌症

早期常无特殊症状，甚至毫无症状，故癌症的早期发现、早期诊断主要是通过定期健康体检

和人群筛查完成。目前筛查癌症的方法主要是通过化验血肿瘤指标及B超、CT、MRI、PET-CT

等检查，但这些方法的敏感性和特异性均不高，发现有异常时往往已是中晚期。

17种常见高发肿瘤，包括乳腺癌（breast cancer）、结肠癌（colorectalcancer）、子宫癌

（endometrial cancer）、脑胶质瘤（glioma）、白血病（leukemia）、肺癌（lungcancer）、淋巴

癌（lymphoma）、成神经管细胞瘤（medulloblastoma）、黑色素癌(melanoma)、间皮瘤

(mesothelioma) 、多性骨髓瘤(multiple myeloma) 、卵巢癌(ovarian cancer)、胰腺癌(pancreatic

cancer) 、真性红细胞增多(polycythemia vera) 、前列腺癌(prostatecancer) 、肾细胞癌(renal

范文范例参考

从临床进入基因检测流程是入口，检测结果结合临床信息进行合理解读是出口，这一入一出之间需经历检测前临床咨询部分、实验室部分、信息分析部分、临床解读部分共四个环节。其中的第四部分临床解读部分即是根据检测结果、患者信息、医生共识综合判断，临床和遗传咨询有效衔接、充分沟通，最终出具临床解读报告。

在做成临床解读报告之前，首先需要将解读的各个环节进行明确，包括解读的步骤流程，解读的技术细节。这样才有可能真正的做到解读的规范化，使解读过程有据可依，有章可循，才能出具一份好的临床解读报告，基因检测才能更好的服务患者和临床医生。从大的框架讲，基因检测数据解读可分为三个步骤：原始数据→分析数据、基于数据库的解读→与患者个体表征/临床病例结合的解读。

1、读懂原始数据

将测序的原始序列数据（FASTQ）去除接头及低质量序列，经BWA软件比对至GRCh37/38（NCBI版本）或hg19/hg38（UCSC版本）人类基因组参考序列上，Picard去除重复序列，使用GATK检测SNV与Indel变异，使用ANNOVAR进行变异注释。最后获得一份.vcf文件（图1）。

安 阳 迪 克 食 品 有 限 公 司

文件编号：AYDK—JS

技术文件汇编

版 本： A

受控号： 编 制： 审 核：

批 准：

2009年9月16日发布 2009年9月16日实施

安阳迪克食品有限公司

技术文件目录

序号 01 02 03 04 05 06 07 08 09 10 11 12 13 14 15 16 文件类别 技术文件 技术文件 技术文件 技术文件 技术文件 技术文件 技术文件 技术文件 技术文件 技术文件 技术文件 技术文件 技术文件 技术文件 技术文件 技术文件 文件编号 AYDK-ZS-01 AYDK-ZS-02 AYDK-ZS-03 AYDK-ZS-04 AYDK-ZS-05 AYDK-ZS-06 AYDK-ZS-07 AYDK-ZS-08 AYDK-ZS-09 AYDK-ZS-10 AYD

50个肿瘤核心基因

?

ABL1

?

全名：Abelson murine leukemia viral oncogene homolog 1。ABL1基因位于第9号染色体上

临床作用：当BRA基因与ABL1基因型成BRA-ABL1融合基因的时候，新的BRA-ABL1融合蛋白就会使细胞的增生脱离细胞因子的控制，细胞癌化 BRA-ABL1融合基因是慢性粒细胞性白血病的一个重要病因

治疗药物：依马替尼（Imatinib mesylate）是针对BRA-ABL1融合基因的抑制剂，也是治疗此种癌症的靶向治疗药物 AKT1

全名：RAC-alpha serine/threonine-protein kinase。位于第14号染色体上。

AKT1是细胞分裂、生长的正调控元件。AKT1可以抑制细胞的凋亡，促进细胞生长在横纹肌实体瘤中有发现AKT1过表达

抑制剂：Selleck公司出品的“MK-2206 2HCl”是一种高度选择性的Akt1/2/3抑制剂。 ALK

全名：Anaplastic lymphoma kinase，位于2号染色体上 功能：ALK在神经发育过程中起重要作用，是正调控元件

与肿瘤的关系：EML4-ALK融合基因占非小细胞肺癌中的3~5%，E

肿瘤个体化治疗相关基因突变检测试剂

技术审查指导原则

本指导原则旨在指导注册申请人对肿瘤个体化治疗相关基因突变检测试剂注册申报资料的准备及撰写，同时也为技术审评部门对注册申报资料的技术审评提供参考。

本指导原则是针对肿瘤个体化治疗相关基因突变检测试剂的一般要求，申请人应依据产品的具体特性确定其中内容是否适用，若不适用，需具体阐述理由及相应的科学依据，并依据产品的具体特性对注册申报资料的内容进行充实和细化。

本指导原则是对申请人和审查人员的指导性文件，但不包括注册审批所涉及的行政事项，亦不作为法规强制执行，如果有能够满足相关法规要求的其他方法，也可以采用，但需要详细阐明理由，并对其科学合理性进行验证，提供详细的研究资料和验证资料，相关人员应在遵循相关法规的前提下使用本指导原则。

本指导原则是在现行法规和标准体系以及当前认知水平下制定的，随着法规和标准的不断完善，以及科学技术的不断发展，本指导原则相关内容也将适时进行调整。

一、范围

本指导原则所述肿瘤个体化治疗相关基因突变检测试剂是指利用基于聚合酶链式反应（PCR）方法的核酸检测技术，以肿瘤个体化治疗相关的突变基因为检测目标，对人体样本（包括组织、体液等）提取的核酸组分中的目标序列进行体外检测的

基因疾病检测概述

引言：（基因与健康）

基因是DNA分子上的一个功能片断，是遗传信息的基本单位，是决定一切生物物种最基本的因子；基因决定人的生老病死，是健康、靓丽、长寿之因，是生命的操纵者和调控者。因此，哪里有生命，哪里就有基因，一切生命的存在与衰亡的形式都是由基因决定的，包括您的长相、身高、体重、肤色、性格等均与基因密不可分。基因（Gene,Mendelian factor）是指携带有遗传信息的DNA或RNA序列（即基因是具有遗传效应的DNA或RNA片段），也称为遗传因子，是控制性状的基本遗传单位。基因通过指导蛋白质的合成来表达自己所携带的遗传信息，从而控制生物个体的性状表现。人类疾病的发生是基因、环境共同作用的结果，若检测出某种疾病的风险，那么可以针对性的避开不良的环境，从而让疾病不能表达，做到真正的预防疾病。现代医学研究证明，除外伤外，几乎所有的疾病都和基因有关系。像血液分不同血型一样，人体中正常基因也分为不同的基因型，即基因多态型。不同的基因型对环境因素的敏感性不同，敏感基因型在环境因素的作用下可引起疾病。另外，异常基因可以直接引起疾病，这种情况下发生的疾病为遗传病。

定义：

基因检测是通过血液、其他体液或细胞对DNA进行检测的技术。 基因检

肿瘤个体化治疗相关基因突变

检测试剂技术审查指导原则 （第二次征求意见稿）

二零一三年十一月

目录

一、前言 ......................................... 2二、适用范围 ..................................... 3三、注册申报资料要求 ............................. 4(一)综述资料 .................................... 4

1

(二)产品说明书 .................................. 5 (三)拟定产品标准及编制说明 ..................... 12 (四)注册检测 ................................... 13 (五)主要原材料研究资料 ......................... 13 (六)主要生产工艺及反应体系的研究资料 ........... 18 (七)分析性能评估资料 ........................... 19 (八)参考值（参考范围）确定资料 ................. 25

常见血液肿瘤FISH检测小册

一.FISH是什么

FISH即荧光原位杂交技术（Fluorescence in situ hybridization），是在细胞遗传学水平上检测染色体及基因数目和结构异常的一种分子病理检测技术。其基本原理是利用标记了荧光素的核酸作为探针，按照碱基互补原则，与待检样本中与之互补的核酸经过变性-退火而形成杂交双链核酸，然后通过荧光显微镜进行检测和分析。

FISH技术具有直观、快速、敏感性高和方便灵活等特点，目前已经广泛应用于临床的肿瘤遗传学及各种基因相关疾病的分型与个体化治疗等多个领域。

二.血液肿瘤的诊断分型

MICM：血液肿瘤诊断的精确分型是临床选择正确治疗方案的前提，目前国际上通用的是结合细胞形态学（Morphology）、免疫学（Immunology）、细胞遗传学（Cytogenetics）和分子生物学（Molecular）的MICM分型。 ?

形态学诊断(Morphology)

细胞学：外周血、骨髓涂片，淋巴结穿刺 组织学：骨髓、淋巴结活检 ? ? ?

免疫学检查(Immunology)

免疫组化（IHC），流式细胞（FCM） 细胞遗传学检查(Cytogenetics) 核型分析，荧光原位杂交（FISH）