如何使用r语言绘图
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R语言绘图:相关性分析及绘图展示
相关性分析
gaom
在我们平时分析的时候,经常会遇到样品间的相关性检验分析,并以此判断对我们后续分析的影响。今天主要跟大家讨论一下简单的相关性分析以及结果展示。 利用的测试数据还是之前我们在geo数据库中随便找的一份表达谱数据。首先还是导入数据,进行简单分析,获取相关数值。
rm(list=ls())#先把我们的R清空一下
data<-read.table(file =\语言绘图\\\\相关性分析\\\\test_data.txt\,header = T,row.names =1,sep=\)#读取数据
cor(data,method =\)#方法可选pearson、kendall、spearman。 ## T01 T02 T03 T04 T05 T06 T07
## T01 1.0000000 0.9626878 0.9820587 0.9775637 0.9672888 0.9664156 0.9752635
## T02 0.9626878 1.0000000 0.9871793 0.9739935 0.9779155 0.9794141 0.9786400
## T03 0.9820587 0.9871793 1.0000000 0.9823576 0.9819684 0.9808063 0.9833352
##
R语言vegan包使用教程
R语言中的外在软件包“Vegan”是专门用于群落生态学分析的工具。Vegan能够提供所有基本的排序方法,同时具有生成精美排序图的功能,版本更新很快。我们认为Vegan包完全可以取代CANOCO,成为今后排序分析的首选统计工具。
MultivariateAnalysisofEcologicalCommunitiesinR:vegantutorial
JariOksanenFebruary8,2013
Abstract
ThistutorialdemostratestheuseofordinationmethodsinRpack-agevegan.ThetutorialassumesfamiliaritybothwithRandwithcommunityordination.Packagevegansupportsallbasicor-dinationmethods,includingnon-metricmultidimensionalscaling.Theconstrainedordinationmethodsincludeconstrainedanalysisofproximities,redundancyanalysisandconstrained
R语言绘图:多图叠加和图形分页讲课讲稿
R语言绘图:多图叠加和图形分页
精品文档
R绘图课程:多图叠加与图形分页
gaom
在我们用R画图的时候常常碰到一种问题,就是我们简简单单一个对象的图无法达到我们想要的结果。可能我们是一个对象但有多种展示,需要把多个图放在一起。也可能我们要画的是多个对象,但每个对象的图其实都是并行的。前面一种情况我理解为是多图叠加,即需要多张不同的图拼凑到一张图中。后面的情况我理解为是图形分页,即把类似的图形有序的排列展示给大家看。今天我们讨论的主题就是如何去解决上述的两种情况。
首先,我们针对第一种情况。其实第一种情况我们还是要划分一下。多图叠加,其中的叠是指我们的绘图中两张或多张不同的图整合到一种图中,共用一个坐标轴。比如一张柱状图,一张曲线图合并到一张图中。而其中的加则是指我们想合并的图之间无法共用坐标轴,我们只能在一张图中划分不同的区域加需要的多张图放置进去。
光说不练假把式,今天我们就找几个实例展示一下,让大家看下我们如果处理这种常见的问题。
library("ggplot2")#这次主要是用ggplot来处理
data<-read.table(file ="C:/Users/gaom/Desktop/R语言绘图:多图叠加和图形分页/test_data2.txt",header=F,stringsAsFactors=F,sep ="\t")#因为文件中有数字也有字符,所以建议加上stringsAsFactors=F。
head(data)
## V1 V2 V3 V4
## 1 1 0.15415052 0.7645350 A
R语言学习系列01-R语言的安装与使用
01. R语言的安装与使用
R是统计分析软件,在数据分析、数据挖掘领域有优势;与SAS比最大的好处就是免费,其次是有各种现成的程序包可用,再次是具有极好的制图功能(数据可视化)。
一、下载安装
到R语言官网或镜像站:
https://www.r-project.org/
https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/ 下载最新版R-3.3.1安装即可,安装时可选择32位或64位版本。
建议再接着安装相应版本的R语言集成开发环境Rstudio,地址:
https://www.rstudio.com/products/rstudio/download/
升级R:
在其它目录安装R,再将旧版本保留的library目录下的文件(程序包packages)拷贝到新版本library目录下,然后update.packages()
二、操作界面
图1R-3.3.1操作界面
类似Matlab的命令窗口,输入命令,按回车得到运行结果。 【程序包】菜单可以实现载入程序包、设定CRAN镜像、安装及更新程序包等功能。
图2 RStudio操作界面
代码编辑窗口:新建或打开脚本可调出,用来编写代码,打开R脚本,单击Run运行代码
r语言作业
实验五数据结构(向量、因子、列表)
实验目的:
1.熟悉R中数据基本结构特点及使用方法 2.熟悉R中向量的编辑方法 3.熟悉R中因子的设置方法 4.熟悉R中列表的编辑方法
实验要求:完成每个实验内容的同时,在每题后面附上程序代码。要求独立完成。
实验内容:
一、编写一个函数,具有如下功能: 1.输入参数为一个向量或者数据框
2.计算向量(或数据框中的列向量)的均值、方差、标准差、中位数 3.计算向量(或数据框中的列向量)的标准化得分
4.将2与3中的计算结果存储到一个列表中作为函数返回对象 > f<-function(x){ + mean<-mean(x) + var<-var(x) + sd<-sd(x)
+ median<-median(x) + m<-(x-mean(x))/sd(x)
+ j<-list(f.mean=mean,f.var=var,f.sd=sd,f.median=median,f.m=m) + j + }
二、有三组学生使用了不同的数学辅导教材,期末考试成绩如下。问这三组学生的成绩有无显著差异?(使用stack函数将三组向量合并成一个向量以及一个平行因子,然后使用aov函数或者oneway.test函数进行方差分析。)
99 88 99 89 94 90 第一组
55 50 67 67 56 56 第二组
79 56 89 99 70 89 第三组
> x1<-c(99,88,99,89,94,90) > x2<-c(55,50,67,67,56,56) > x3<-c(79,56,89,99,70,89) > f<-stac
利用C语言图形函数绘图
信息与计算科学专业基础课
Computer Graphics
Report Of course experiment
课程实
计算机图形学验 报 告
实验题目 利用C语言图形函数绘图 班 级 姓 名 学 号 指导教师 日 期
西安理工大学理学院应用数学系
二零一三年春季学期
实验
?实验说明
1
利用C语言图形函数绘图
试验目的: 掌握TurboC语言图形函数的使用和学会绘制一般图形。 试验地点: 教九楼401 数学系机房
实验要求(Direction):1. 每个学生单独完成;2.开发语言为TurboC或C++,也可使用其它
语言;3.请在自己的实验报告上写明姓名、学号、班级;4.每次交的实验报告内容包括:题目、试验目的和意义、程序制作步骤、主程序、运行结果图以及参考文件;5. 自己保留一份可执行程序,考试前统一检查和上交。
?实验内容
?实验题一
1.1实验题目
用如下图1所示,图中最大正n边形的外接圆半径为R,旋转该正n边形,每次旋转?角度,旋转后的的n边形顶点
R语言spine作图
Stata如何做cubic spine图横轴:Number of nodes examined;纵轴:Log hazard ratio Number of nodes examined Survival months Sensored Age Gender 18 11 6 16 12 11 8 12 2 3 2 5 4 1 4
13 8 5 6 4 16 30 26 11 3 5 15 68 16 46 1 1 1 1 1 1 1 1 1 0 1 1 1 1 1 33 63 73 63 68 65 51 74 72 72 69 66 59 54 54 Male Female Male `Male Male Male Male Male Female Male Male Male Male Female Male
rcspline.plot(x,y,model=c(\\\xrange, event, nk=5,knots=NULL, show=c(\adj=NULL, xlab, ylab,ylim, plim=c(0,1), plotcl=TRUE, showknots=TRUE, add=FALSE,subset, lty=1, nop
管理人员如何使用语言
管理人员如何使用语言
尊重并善待团队中的每一位,相信并鼓励每一位同事获得个人能力的进步。
只有让员工满意,才能体现管理人员的个人价值,我们将花更多的时间创造员工满意。
激励是管理者的重大责任,是我们统一的工作手段和重要工具。
我们遵循交流是管理的核心这一理念。
员工离问题很近,离顾客最近,收到的反馈意见最多,这就要求管理人员在决策时应多听、多采纳员工的意见。
全体员工无论其职位高低,在精神、人格和基本权益上是绝对平等的。
优秀的辅导就是一种优秀的管理,管理人员应展开两项技术工作:辅导和劝说。
谦卑绝不仅是一种日常伦理,还一直是成熟的商业伦理,更是一种个人成功的策略。
基础管理用语训练:
语言原理:
语言是身份与涵养的表现,组织内语言表达质量体现合作关系的质量,现代职业分工要求语言职业化,管理人员必须运用工作语言完成工作内容的传达。
有效指令的发布语言:
“您好,王小姐,未来三分钟之内您需要将包间整理完成。”
“您好,王小姐,五分钟之后我们应该能看到您整理干净后的营业区。”
让员工明白指令是您的职务工作,不要简单以为员工知道怎么去做:
“您现在要把垃圾清理干净,水杯擦拭干净,谢谢。”
“请您用拖把将地拖一遍,谢谢。”
“您要特别留意将座椅摆放整齐。”
“请您增加给客人续酒的次数,谢
R语言常用函数
R语言:常用函数
数据结构
一、数据管理 vector:向量 numeric:数值型向量 logical:逻辑型向量 character;字符型向量 list:列表
data.frame:数据框 c:连接为向量或列表 length:求长度 subset:求子集
seq,from:to,sequence:等差序列 rep:重复 NA:缺失值 NULL:空对象
sort,order,unique,rev:排序 unlist:展平列表
attr,attributes:对象属性
mode,typeof:对象存储模式与类型 names:对象的名字属性
二、字符串处理 character:字符型向量 nchar:字符数 substr:取子串
format,format C:把对象用格式转换为字符串 paste,strsplit:连接或拆分 charmatch,pmatch:字符串匹配 grep,sub,gsub:模式匹配与替换
三、复数
complex,Re,Im,Mod,Arg,Conj:复数函数
四、因子 factor:因子 codes:因子的编码 levels:因子的各水平的名字 nlevels:因子的水
GrADS绘图软件使用手3
第三章 GrADS数据格式
每一组GrADS数据应至少包括两组数据文件,数据描述文件—ASCII码和数据文件—二进制,数据的真正存放地。数据文件中只是用户数据的有序排放,而关于数据种类、排放次序等是单独放在一个文件中的称—数据描述文件。而象GRIB和NETCDF等通用数据格式,以上两者是存于同一个文件的—或称为自定义/自解释格式数据。但考虑到GrADS传统,对这类自定义格式数据仍将生成相应的数据描述文件。
GrADS并不直接使用“数据文件”,而是通过“描述文件”间接使用“数据文件”。
上一章中我们已使用过了这样的一组数据。以此为例,介绍用户如何按GrADS的格式,将自己的数据生成相应的数据文件和数据描述文件。
1. 格点数据描述文件 model.le.ctl文件清单:
以*开始的行为注解行。
1.1 数据描述文件各项解释
1. DSET <路经/>数据文件名
定义与此数据描述文件相对应的数据文件名。若两者位于同一目录,前面的路经可以省略或以“^”开始,代表两者位于同一目录。若不在同一目录下,应给出路经参数。如:
c:/pcgrads/sample/model.le.dat
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注意路经的给法与DOS不同,而与UNIX环境一致,便于移植!或