如何使用r语言绘图

相关性分析

gaom

在我们平时分析的时候，经常会遇到样品间的相关性检验分析，并以此判断对我们后续分析的影响。今天主要跟大家讨论一下简单的相关性分析以及结果展示。 利用的测试数据还是之前我们在geo数据库中随便找的一份表达谱数据。首先还是导入数据，进行简单分析，获取相关数值。

rm(list=ls())#先把我们的R清空一下

data<-read.table(file =\语言绘图\\\\相关性分析\\\\test_data.txt\,header = T,row.names =1,sep=\)#读取数据

cor(data,method =\)#方法可选pearson、kendall、spearman。 ## T01 T02 T03 T04 T05 T06 T07

## T01 1.0000000 0.9626878 0.9820587 0.9775637 0.9672888 0.9664156 0.9752635

## T02 0.9626878 1.0000000 0.9871793 0.9739935 0.9779155 0.9794141 0.9786400

## T03 0.9820587 0.9871793 1.0000000 0.9823576 0.9819684 0.9808063 0.9833352

##

R语言中的外在软件包“Vegan”是专门用于群落生态学分析的工具。Vegan能够提供所有基本的排序方法,同时具有生成精美排序图的功能,版本更新很快。我们认为Vegan包完全可以取代CANOCO,成为今后排序分析的首选统计工具。

MultivariateAnalysisofEcologicalCommunitiesinR:vegantutorial

JariOksanenFebruary8,2013

Abstract

ThistutorialdemostratestheuseofordinationmethodsinRpack-agevegan.ThetutorialassumesfamiliaritybothwithRandwithcommunityordination.Packagevegansupportsallbasicor-dinationmethods,includingnon-metricmultidimensionalscaling.Theconstrainedordinationmethodsincludeconstrainedanalysisofproximities,redundancyanalysisandconstrained

R语言绘图：多图叠加和图形分页

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R绘图课程：多图叠加与图形分页

gaom

在我们用R画图的时候常常碰到一种问题，就是我们简简单单一个对象的图无法达到我们想要的结果。可能我们是一个对象但有多种展示，需要把多个图放在一起。也可能我们要画的是多个对象，但每个对象的图其实都是并行的。前面一种情况我理解为是多图叠加，即需要多张不同的图拼凑到一张图中。后面的情况我理解为是图形分页，即把类似的图形有序的排列展示给大家看。今天我们讨论的主题就是如何去解决上述的两种情况。

首先，我们针对第一种情况。其实第一种情况我们还是要划分一下。多图叠加，其中的叠是指我们的绘图中两张或多张不同的图整合到一种图中，共用一个坐标轴。比如一张柱状图，一张曲线图合并到一张图中。而其中的加则是指我们想合并的图之间无法共用坐标轴，我们只能在一张图中划分不同的区域加需要的多张图放置进去。

光说不练假把式，今天我们就找几个实例展示一下，让大家看下我们如果处理这种常见的问题。

library("ggplot2")#这次主要是用ggplot来处理

data<-read.table(file ="C:/Users/gaom/Desktop/R语言绘图：多图叠加和图形分页/test_data2.txt",header=F,stringsAsFactors=F,sep ="\t")#因为文件中有数字也有字符，所以建议加上stringsAsFactors=F。

head(data)

## V1 V2 V3 V4

## 1 1 0.15415052 0.7645350 A

01. R语言的安装与使用

R是统计分析软件，在数据分析、数据挖掘领域有优势；与SAS比最大的好处就是免费，其次是有各种现成的程序包可用，再次是具有极好的制图功能（数据可视化）。

一、下载安装

到R语言官网或镜像站：

https://www.r-project.org/

https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/ 下载最新版R-3.3.1安装即可，安装时可选择32位或64位版本。

建议再接着安装相应版本的R语言集成开发环境Rstudio，地址：

https://www.rstudio.com/products/rstudio/download/

升级R：

在其它目录安装R，再将旧版本保留的library目录下的文件（程序包packages）拷贝到新版本library目录下，然后update.packages()

二、操作界面

图1R-3.3.1操作界面

类似Matlab的命令窗口，输入命令，按回车得到运行结果。 【程序包】菜单可以实现载入程序包、设定CRAN镜像、安装及更新程序包等功能。

图2 RStudio操作界面

代码编辑窗口：新建或打开脚本可调出，用来编写代码，打开R脚本，单击Run运行代码

实验五数据结构（向量、因子、列表）

实验目的：

1.熟悉R中数据基本结构特点及使用方法 2.熟悉R中向量的编辑方法 3.熟悉R中因子的设置方法 4.熟悉R中列表的编辑方法

实验要求：完成每个实验内容的同时，在每题后面附上程序代码。要求独立完成。

实验内容：

一、编写一个函数，具有如下功能： 1.输入参数为一个向量或者数据框

2.计算向量（或数据框中的列向量）的均值、方差、标准差、中位数 3.计算向量（或数据框中的列向量）的标准化得分

4.将2与3中的计算结果存储到一个列表中作为函数返回对象 > f<-function(x){ + mean<-mean(x) + var<-var(x) + sd<-sd(x)

+ median<-median(x) + m<-(x-mean(x))/sd(x)

+ j<-list(f.mean=mean,f.var=var,f.sd=sd,f.median=median,f.m=m) + j + }

二、有三组学生使用了不同的数学辅导教材，期末考试成绩如下。问这三组学生的成绩有无显著差异？（使用stack函数将三组向量合并成一个向量以及一个平行因子，然后使用aov函数或者oneway.test函数进行方差分析。）

99 88 99 89 94 90 第一组

55 50 67 67 56 56 第二组

79 56 89 99 70 89 第三组

> x1<-c(99,88,99,89,94,90) > x2<-c(55,50,67,67,56,56) > x3<-c(79,56,89,99,70,89) > f<-stac

信息与计算科学专业基础课

Computer Graphics

Report Of course experiment

课程实

计算机图形学验 报 告

实验题目 利用C语言图形函数绘图 班 级 姓 名 学 号 指导教师 日 期

西安理工大学理学院应用数学系

二零一三年春季学期

实验

?实验说明

1

利用C语言图形函数绘图

试验目的： 掌握TurboC语言图形函数的使用和学会绘制一般图形。 试验地点： 教九楼401 数学系机房

实验要求(Direction)：1. 每个学生单独完成；2.开发语言为TurboC或C++，也可使用其它

语言；3.请在自己的实验报告上写明姓名、学号、班级；4.每次交的实验报告内容包括：题目、试验目的和意义、程序制作步骤、主程序、运行结果图以及参考文件；5. 自己保留一份可执行程序,考试前统一检查和上交。

?实验内容

?实验题一

1.1实验题目

用如下图1所示，图中最大正n边形的外接圆半径为R，旋转该正n边形，每次旋转?角度，旋转后的的n边形顶点

Stata如何做cubic spine图横轴：Number of nodes examined；纵轴：Log hazard ratio Number of nodes examined Survival months Sensored Age Gender 18 11 6 16 12 11 8 12 2 3 2 5 4 1 4

13 8 5 6 4 16 30 26 11 3 5 15 68 16 46 1 1 1 1 1 1 1 1 1 0 1 1 1 1 1 33 63 73 63 68 65 51 74 72 72 69 66 59 54 54 Male Female Male `Male Male Male Male Male Female Male Male Male Male Female Male

rcspline.plot(x,y,model=c(\\\xrange, event, nk=5,knots=NULL, show=c(\adj=NULL, xlab, ylab,ylim, plim=c(0,1), plotcl=TRUE, showknots=TRUE, add=FALSE,subset, lty=1, nop

管理人员如何使用语言

尊重并善待团队中的每一位，相信并鼓励每一位同事获得个人能力的进步。

只有让员工满意，才能体现管理人员的个人价值，我们将花更多的时间创造员工满意。

激励是管理者的重大责任，是我们统一的工作手段和重要工具。

我们遵循交流是管理的核心这一理念。

员工离问题很近，离顾客最近，收到的反馈意见最多，这就要求管理人员在决策时应多听、多采纳员工的意见。

全体员工无论其职位高低，在精神、人格和基本权益上是绝对平等的。

优秀的辅导就是一种优秀的管理，管理人员应展开两项技术工作：辅导和劝说。

谦卑绝不仅是一种日常伦理，还一直是成熟的商业伦理，更是一种个人成功的策略。

基础管理用语训练：

语言原理：

语言是身份与涵养的表现，组织内语言表达质量体现合作关系的质量，现代职业分工要求语言职业化，管理人员必须运用工作语言完成工作内容的传达。

有效指令的发布语言：

“您好，王小姐，未来三分钟之内您需要将包间整理完成。”

“您好，王小姐，五分钟之后我们应该能看到您整理干净后的营业区。”

让员工明白指令是您的职务工作，不要简单以为员工知道怎么去做：

“您现在要把垃圾清理干净，水杯擦拭干净，谢谢。”

“请您用拖把将地拖一遍，谢谢。”

“您要特别留意将座椅摆放整齐。”

“请您增加给客人续酒的次数，谢

R语言：常用函数

数据结构

一、数据管理 vector：向量 numeric：数值型向量 logical：逻辑型向量 character；字符型向量 list：列表

data.frame：数据框 c：连接为向量或列表 length：求长度 subset：求子集

seq，from:to，sequence：等差序列 rep：重复 NA：缺失值 NULL：空对象

sort，order，unique，rev：排序 unlist：展平列表

attr，attributes：对象属性

mode，typeof：对象存储模式与类型 names：对象的名字属性

二、字符串处理 character：字符型向量 nchar：字符数 substr：取子串

format，format C：把对象用格式转换为字符串 paste，strsplit：连接或拆分 charmatch，pmatch：字符串匹配 grep，sub，gsub：模式匹配与替换

三、复数

complex，Re，Im，Mod，Arg，Conj：复数函数

四、因子 factor：因子 codes：因子的编码 levels：因子的各水平的名字 nlevels：因子的水

第三章 GrADS数据格式

每一组GrADS数据应至少包括两组数据文件，数据描述文件—ASCII码和数据文件—二进制，数据的真正存放地。数据文件中只是用户数据的有序排放，而关于数据种类、排放次序等是单独放在一个文件中的称—数据描述文件。而象GRIB和NETCDF等通用数据格式，以上两者是存于同一个文件的—或称为自定义/自解释格式数据。但考虑到GrADS传统，对这类自定义格式数据仍将生成相应的数据描述文件。

GrADS并不直接使用“数据文件”，而是通过“描述文件”间接使用“数据文件”。

上一章中我们已使用过了这样的一组数据。以此为例，介绍用户如何按GrADS的格式，将自己的数据生成相应的数据文件和数据描述文件。

1. 格点数据描述文件 model.le.ctl文件清单：

以*开始的行为注解行。

1.1 数据描述文件各项解释

1. DSET <路经/>数据文件名

定义与此数据描述文件相对应的数据文件名。若两者位于同一目录，前面的路经可以省略或以“^”开始，代表两者位于同一目录。若不在同一目录下，应给出路经参数。如：

c:/pcgrads/sample/model.le.dat

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注意路经的给法与DOS不同，而与UNIX环境一致，便于移植！或