生物学固定常用技术有

生物信息学常用网站及其使用说明

分子生物信息数据库简介

生物信息学常用网站及其使用说明

数据库类型随着近年来生物学实验方法和检测手段的不断发展与提高，积累了大量生物学的实验数据，通过对这些数据按一定目标与功能分类收集整理，形成了目前数以百计的生物信息数据库。

核酸和蛋白一级数据库、基因组数据库生物大分子三维空间结构数据库以上一级数据库为基础而形成的二级数据库

生物信息学广西医学科学实验中心

xy

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分子生物信息数据库概述1960年代，第一个分子生物学数据库——Fred Sanger的胰岛素序列测定(1955)——蛋白质数据库PSD(Protein Sequence Database)——Margaret Dayhoff: 1960年代，创立PSD,即PIR的前身 1978,scoring matrices——PAM

Fred Sanger at The Wellcome Trust xy生物信息学广西医学科学实验中心 Sanger Institute

Pioneer in Bioinformatics Dr. Margaret O. Dayhoff (1925-1983)3

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1982年，第一个核酸

生物学常用试剂配制 Document number【980KGB-6898YT-769T8CB-246UT-18GG08】

常用试剂

储存注意事项：储存于阴凉、通风的地方；远离火种、热源。避免光照。室温不超过30℃，相对湿度不超过80％。包装必须密封，切勿受潮。应与易（可）燃物、还原剂、碱类、醇类、食用化学品分开存放，切忌混储，储区应备有合适的材料收容泄漏物。

操作注意事项：尽量在通风橱操作，加强通风，避免粉尘扩散。远离易燃、可燃物，避免与还原剂、碱类、醇类接触，防止包装及容器损坏。

EDTA（PH ）

组分浓度: mol/L EDTA（MW：）

配制量: 500ml

配制方法:

1．称取93g Na2EDTA·2H2O置于500ml蓝盖瓶中。

2．加入400ml的去离子水，置于磁力搅拌器上充分搅拌。

3．用NaOH调节调节pH值至（约需加入20g固体NaOH），当pH 接近时，EDTA方可完全溶解，加入去离子水定容至1L。

4．高温高压灭菌后，室温保存半年。

5M NaCl

组份浓度： 5mol/L NaCl (MW：

配制量： 1L

配制方法：

1.准确称取氯化钠，置于1L的蓝盖瓶中。

2.用去离子水溶解并稀释

分子生物学软件介绍

刘吉平讲师 Bioscau@ /zhw xxx/index.htm

一、实验准备阶段 一般要查一些与实验相关的文献,以便对自己所要做课题的最新进展有一个基本的了解，从而确定自己的实验策略。较常使用软件：Reference Manager 9.0

1.Reference Manager 9.0可以在线通过查找关键词搜索PubMed和609个Z39.50数据库中的专业资料,同时保存查找的资料为本地文件。

资料内容和记录分上下两个屏幕，如有全文或想连接网络时敲键盘就可到相应的全文文章和摘要。可以直接在WORD中查找资料，并插入引用。在文章中对引用的文献可以格式化，引用的参考资料格式有很强的用户自定义功能，可以符合各种杂志对引用格式的要求，引用时不用多窗口切换。

2. Endnote 3.1.2

是一个在线专业资料查找系统,可以保存查找资料,并在文章中对引用格式化.

二、 实验实施阶段

随着实验的进行，就必须对实验过程中的DNA、RNA和蛋白质的信息进行各种处理，包括限制酶分析、引物设计、同源序列比较、质粒作图、结构域(motif)查找、RNA二级结构预测、蛋白二级结构分析、三维结构显示等方面的内容。

1、 综合软件Omiga 2.0

O

常用分子生物学技术及基因诊断、治疗

一、选择题 （一） A 型题 1 ．印迹技术可以分为

A ．DNA 印迹 B ．RNA 印迹 C ．蛋白质印迹 D ．斑点印迹 E ．以上都对 2 ． PCR 实验延伸温度一般是

A ． 90 ℃ B ．72 ℃ C ．80 ℃ D ．95 ℃ E ．60 ℃ 3 ． Western blot 中的探针是

A ．RNA B ．单链 DNA C ．cDNA D ．抗体 E ．双链 DNA 4． Northern blotting 与 Southern blotting 不同的是

A ．基本原理不同 B ．无需进行限制性内切酶消化 C ．探针必须是 RNA D ．探针必须是 DNA E ．靠毛细作用进行转移

5 ．可以不经电泳分离而直接点样在 NC 膜上进行杂交分析的是

A ．斑点印迹 B ．原位杂交 C ．RNA 印迹 D ．DNA 芯片技术 E ．DNA 印迹 6 ．下列哪种物质在 PCR 反应中不能作为模板

A ．RNA B ．单链 DNA C ． cDNA D ．蛋白质 E ．双链 DNA 7 ． RT

植物生物学教学大纲

课程编号：1200034 课程名称：植物生物学 英文名称：Plant Biology 学分：2 总学时：34 实验学时：34

适用年级专业（学科类）：生物技术（二年级第一学期）

Ⅰ 课程说明

（一）制定教学大纲的指导思想、原则依据

本教学大纲是以马列主义思想为指导，坚持辩证唯物主义和理论联系实际的原则，根据植物生物学课的总体要求，结合我们的教学实践编写的。 （二）课程教学的目的和要求

植物生物学是从细胞、组织、器官、个体、类群、生态系统等不同层次，有机地阐述植物的形态、构造、生理、分类、分布、遗传变异和进化及其与环境相互关系的一门课程。目的是使踏入生物学大门的大学生对植物科学有一整体的了解，为学习后续课程打下较为广泛的知识基础和开阔的视野，培养全面、综合思维的能力。 （三）教学的难点和重点

1、本课程具有直观性和系统性强的特点，通过讲授和实践教学环节，要求学生掌握其基本理论、基本知识和基本技能，注意和提高学生分析问题、解决问题的能力和实际动手操作能力，同时注重基本理论知识的巩固，为相关专业课程奠定坚实的基础。

2、应采用讲授与实践教学紧密结合的教学模式，通过采用教学模型、实物以及电化教学手段，提高学生的学习兴趣，进一步加

第21章 常用分子生物学技术的原理及其应用

学习要求

1．掌握分子杂交、印迹技术、PCR技术、核酸序列分析技术、基因文库构建的基本原理及应用；基因诊断、基因治疗的基本概念。

2．熟悉生物大分子相互作用的研究技术；基因诊断的方法；基因治疗的策略和程序。 3．了解生物芯片技术、遗传修饰动物模型的建立及应用、疾病相关基因的克隆与鉴定。

基本知识点

本章简要介绍了目前医学分子生物学中的部分常用技术。主要内容包括：分子杂交技术、印迹技术、PCR技术、核酸序列分析技术、基因文库构建的基本原理及应用、生物芯片技术、生物大分子相互作用研究技术、遗传修饰动物模型的建立及应用、疾病相关基因的克隆与鉴定以及基因诊断和基因治疗技术。

印迹技术是指将在凝胶中分离的生物大分子转移或直接放在固定化介质上并加以检测分析的技术。它主要包括DNA印迹技术、RNA印迹技术和蛋白质印迹技术。DNA印迹技术主要用于基因组DNA的定性和定量分析。RNA印迹技术主要用于检测某一组织中或细胞中已知的特异mRNA的表达水平，也可比较基因的表达情况。蛋白质印迹技术用于检测样品中特异性的蛋白质的存在、细胞中特异蛋白质的半定量分析以及蛋白质分子的相互作用研究等。其它方法还有斑点印迹、原位杂交、D

植物生物学教学大纲

课程编号：1200034 课程名称：植物生物学 英文名称：Plant Biology 学分：2 总学时：34 实验学时：34

适用年级专业（学科类）：生物技术（二年级第一学期）

Ⅰ 课程说明

（一）制定教学大纲的指导思想、原则依据

本教学大纲是以马列主义思想为指导，坚持辩证唯物主义和理论联系实际的原则，根据植物生物学课的总体要求，结合我们的教学实践编写的。 （二）课程教学的目的和要求

植物生物学是从细胞、组织、器官、个体、类群、生态系统等不同层次，有机地阐述植物的形态、构造、生理、分类、分布、遗传变异和进化及其与环境相互关系的一门课程。目的是使踏入生物学大门的大学生对植物科学有一整体的了解，为学习后续课程打下较为广泛的知识基础和开阔的视野，培养全面、综合思维的能力。 （三）教学的难点和重点

1、本课程具有直观性和系统性强的特点，通过讲授和实践教学环节，要求学生掌握其基本理论、基本知识和基本技能，注意和提高学生分析问题、解决问题的能力和实际动手操作能力，同时注重基本理论知识的巩固，为相关专业课程奠定坚实的基础。

2、应采用讲授与实践教学紧密结合的教学模式，通过采用教学模型、实物以及电化教学手段，提高学生的学习兴趣，进一步加

1、分子生物学检验技术：是以核酸或蛋白质为分析材料，通过分析基因的结构、表达的变化和由此而导致的基因功能的改变，为疾病的研究和诊断提供更准确、更科学的信息和依据的一门学科。

2、请说明分子生物学检验技术在临床试验诊断中的应用。 （1）感染性微生物的检测。如：用PCR技术进行甲型肝炎病毒的检测、乙型肝炎病毒的检测和解脲脲原体的检测等。 （2）基因突变的检测。如：用PCR一限制性片段长度多态性（RFLP)技术检测地中海贫血基因突变。

（3）法医学检测。如：用PCR微卫星检测技术进行亲子关系的鉴定和个体识别。

（4）基因异常表达的检测。如：用cDNA表达的芯片技术进行基因异常表达的检测。

（5）基因定位。如：用原位杂交技术进行组织与细胞中基因表达的定位。

3、基因组：是一个细胞或一种生物体的整套遗传物质。 4、基因：是基因组中一个功能单位，是贮存有功能的蛋白质多肽链信息或RNA序列信息及表达这些信息所必需的全部核苷酸序列。

5、原核生物：是细菌、支原体、衣原体、立克次体、螺旋体、放线菌和蓝绿藻等原始生物的总称，是最简单的细胞生物体。

6、操纵子结构：是原核生物基因组的功能单位。 7、质粒：是指细菌细胞染色体外，能独立复制并稳定遗传的共价闭合环状分子

_______期日______ _名___签__任__主__室__研_教名课姓 任 _ _ ____________名__签__员_教号题学 出 _ ________________员__教_课次任班学 __教_ _ _ _ _ _ ______________次__班_核别考队 ______数人核考湖北医药学院2011-2012学年第二学期《分子生物学检验技术》期末考试试卷 湖北医药学院

A、内含子 B、外显子 C、DNA D、质粒 E、重叠基因

… ………《分子生物学检验技术》期末考试试卷(C卷)8、对染色体端粒进行的显带称为

A、C显带 B、D显带 C、G显带 D、Q显带 E、T显带

………

9、染色质和染色体是

……题 目 一 二 三 四 五 总 分 核分人 复查人 A、同一物质在细胞中的不同时期的两种不同的存在形式 B、不同物质在细胞中的不同时期

……得分 的两种不同的存在形式 C、同一物质在细胞的同一时期的不同表现 D、不同物质在细胞的…

同一时期的不同表现 E、染色质是染色体的前体物质

………

10、物理图是以什么作为图距

线…评卷人 得分

A、摩尔 B、摩尔根 C、纳

分子生物学实验技术

目录

实验一细菌的培养 (2)

实验二质粒DNA的提取 (3)

实验三紫外吸收法测定核酸浓度与纯度 (4)

实验四水平式琼脂糖凝胶电泳法检测DNA (5)

实验五质粒DNA酶切及琼脂糖电泳分析鉴定 (7)

实验六植物基因组DNA提取、酶切及电泳分析 (8)

实验七聚合酶链反应（PCR）技术体外扩增DNA (9)

实验八RNA提取与纯化 (11)

实验九RT-PCR扩增目的基因cDNA (13)

实验十质粒载体和外源DNA的连接反应 (15)

实验十一感受态细胞的制备及转化 (16)

实验十二克隆的筛选和快速鉴定 (18)

实验十三DNA分析——Southern杂交 (19)

一基本操作

实验一、细菌培养

实验二、质粒DNA提取

实验三、紫外吸收法测定核酸浓度与纯度

实验四、水平式琼脂糖凝胶电泳法检测DNA

实验五、质粒DNA酶切及琼脂糖电泳分析鉴定

实验六、植物基因组DNA提取、定量、酶切及电泳分析

实验八、植物RNA提取及纯化

二、目的基因获取

实验七、聚合酶链式反应（PCR）技术体外扩增DNA

实验九、RT-PCR扩增目的基因cDNA

三、目的基因的克隆和表达

实验十、质粒载体和外源DNA的连接反应

实验十一、感受态细胞的制备及转化

实验十二、克隆的筛选和快速鉴定

实验十三、D