PCR扩增仪原理

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PCR仪原理及其应用

标签:文库时间:2025-01-30
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PCR仪的原理及其操作应用 §1. PCR仪的技术原理 §2. PCR仪的分类与应用 §3. PCR仪的操作步骤轻纺与食品学院 报告人:裴乐乐 指导老师:林教授

§1.PCR原理简介PCR(Polymerase Chain Reaction)即聚 合酶链式反应,主要用于DNA片段的体外 扩增,基本原理类似于DNA的天然复制过 程 ,其特异性依赖于与靶序列两端互补的 寡核苷酸引物。PCR由变性--退火--延伸三 个基本反应步骤构成。

PCR原理示意图

PCR Cycle - Step 1 - Denaturation Template DNA by Heat (94oC)Target Sequence

Target Sequence

①模板DNA的变性:模板DNA经加热至94℃左右一定时 间后,使模板DNA双链或经PCR扩增形成的双链DNA解 离,使之成为单链,以便它与引物结合,为下轮反应作准 备;

PCR Cycle - Step 2 – Temperature is lowered (Tm ) and primers anneal to target sequences

②模板DNA与引物的退火(复性):模

PCR仪原理及其应用

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PCR仪的原理及其操作应用 §1. PCR仪的技术原理 §2. PCR仪的分类与应用 §3. PCR仪的操作步骤轻纺与食品学院 报告人:裴乐乐 指导老师:林教授

§1.PCR原理简介PCR(Polymerase Chain Reaction)即聚 合酶链式反应,主要用于DNA片段的体外 扩增,基本原理类似于DNA的天然复制过 程 ,其特异性依赖于与靶序列两端互补的 寡核苷酸引物。PCR由变性--退火--延伸三 个基本反应步骤构成。

PCR原理示意图

PCR Cycle - Step 1 - Denaturation Template DNA by Heat (94oC)Target Sequence

Target Sequence

①模板DNA的变性:模板DNA经加热至94℃左右一定时 间后,使模板DNA双链或经PCR扩增形成的双链DNA解 离,使之成为单链,以便它与引物结合,为下轮反应作准 备;

PCR Cycle - Step 2 – Temperature is lowered (Tm ) and primers anneal to target sequences

②模板DNA与引物的退火(复性):模

pcr扩增实验报告

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pcr扩增实验报告

篇一:DNA提取及PCR扩增实验报告

PCR扩增及DNA琼脂糖凝胶电泳 刘琳 1131428 环境科学 一、实验目的

1.学习并掌握PCR扩增的基本原理与实验技术。

2.对扩增后的DNA进行琼脂糖凝胶电泳试验,并分析相应结果。 二、实验原理 1. PCR扩增

多聚酶链反应(PCR)技术的原理类似于DNA的天然复制过程。在微量离心管中加入适量缓冲液,加入微量模板DNA、四种脱氧核苷酸(dNTP)、耐热Taq聚合酶及两个合成DNA的引物,而后加热使模板DNA在高温下(94℃)变性,双链解链,这是所谓变性阶段。降低溶液温度,使合成引物在低温(55℃)----------------精选公文范文----------------

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与模板DNA互补退火形成部分双链,这是所谓退火阶段。溶液反应温度升至中温(72℃),在T

实验三 PCR扩增制备目的基因

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反转录

概念

反转录是以RNA为模板,通过反转录酶,合成DNA的过程,是DNA生物合成的一种特殊方式。

区分:反转录与逆转录不等同。反转录是进行基因工程过程中,人为地提取出所需要的目的基因的信使RNA,并以之为模板人工合成DNA的过程;逆转录是RNA类病毒自主行为,在整合到宿主细胞内以RNA为模板形成DNA的过程。二者虽同为RNA→DNA的过程,但地点不同,相对性的来说,反转录在体外,逆转录在体内。

2反转录酶与反转录过程

反转录过程由反转录酶催化,该酶也称依赖RNA的DNA聚合酶(RDDP),即以RNA为模板催化DNA链的合成。合成的DNA链称为与RNA互补DNA(cDNA)。反转录酶存在于一些RNA病毒中,可能与病毒的恶性转化有关。人类免疫缺陷病毒(HIV)也是一种RNA病毒,含有反转录酶。在小鼠及人的正常细胞和胚胎细胞中也有反转录酶,推测可能与细胞分化和胚胎发育有关。

大多数反转录酶都具有多种酶活性,主要包括以下几种活性。

①DNA聚合酶活性;以RNA为模板,催化dNTP聚合成DNA的过程。此酶需要RNA为引物,多为色氨酸的tRNA,在引物tRNA3′-末端以5′→3′方向合成DNA。反转录酶中不具有3′→5′外切酶活性,因此没有校正功能,所以由反转

改良的降落PCR扩增中国地鼠目的基因

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86 7

山西医科大学学报 ( hn i dUnv 08年 l JS ax i)2 0 Me 0月,3 (0 9 1

文章编号: 10—6 1 (0 8 1—0 7—0 0 7 6 12 0 )0 86 3

改良的降落 P R扩增中国地鼠目的基因 C宋国华一庞文彪 .,农业大学动物科技学院 )

张锐虎 刘田福 岳文斌 (山西医科大学实验动物中心,太原 000;山西,, 30 1

摘要:目的

优化 P R程序, C尝试用降落 P R扩增中国地鼠目的基因。方法 C

设计了 4对引物,用普通 P R和改良的 C降落 P R省略了常规 P R中摸索最适 C C

降落 P R扩增中国地鼠 C X1C X、 A H、 A 6部分基因。结果 C O、O 2 N D 5 N DH

普通 P R只有 1对引物扩增出特异性条带, C而

降落 P R 4引物都扩增出特异性条带, C对并与中国地鼠目的基因大小一致。结论 关键词:中国地鼠;降落 P R;退火温度; P R特异性 C C中图分类号: Q 8 71文献标识码: A

退火温度的过程,对中国地鼠一些 T值相近的基因可以使用降落 P R温度程序扩增, m C是一种行之有效的 P R方法。 C

M o fe o h wn P

改良的降落PCR扩增中国地鼠目的基因

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山西医科大学学报 ( hn i dUnv 08年 l JS ax i)2 0 Me 0月,3 (0 9 1

文章编号: 10—6 1 (0 8 1—0 7—0 0 7 6 12 0 )0 86 3

改良的降落 P R扩增中国地鼠目的基因 C宋国华一庞文彪 .,农业大学动物科技学院 )

张锐虎 刘田福 岳文斌 (山西医科大学实验动物中心,太原 000;山西,, 30 1

摘要:目的

优化 P R程序, C尝试用降落 P R扩增中国地鼠目的基因。方法 C

设计了 4对引物,用普通 P R和改良的 C降落 P R省略了常规 P R中摸索最适 C C

降落 P R扩增中国地鼠 C X1C X、 A H、 A 6部分基因。结果 C O、O 2 N D 5 N DH

普通 P R只有 1对引物扩增出特异性条带, C而

降落 P R 4引物都扩增出特异性条带, C对并与中国地鼠目的基因大小一致。结论 关键词:中国地鼠;降落 P R;退火温度; P R特异性 C C中图分类号: Q 8 71文献标识码: A

退火温度的过程,对中国地鼠一些 T值相近的基因可以使用降落 P R温度程序扩增, m C是一种行之有效的 P R方法。 C

M o fe o h wn P

消灭PCR非特异性扩增的黄金方法

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消灭PCR非特异性扩增的黄金方法 by 老谈

2014-07-17 解螺旋

PCR技术作为实验室的入门级技术,却经常困扰各位实验大神们。虽然度过了初学者们少加漏加PCR体系的阶段,但很多奋战在实验室一线的小伙伴正遭遇着PCR非特异性扩增的尴尬事件。为了解决这个问题,有多少人曾经把退火温度从50℃试到70℃、重新合成过引物、换过模板、换过全新的电泳缓冲液,或者还带着满腔的愤怒捏碎过电泳胶?今天老谈来教教大家如何对非特异性扩增嗤之以鼻!

——by老谈

给各位小伙伴脑补一下非特异性扩增,即进行PCR所扩增出来的条带不是所要的,引物与模板在非目的条带处有错配,导致延伸产物不是目的条带。例如引物二聚体,即引物在退火过程中产生了hairpin结构或其他二级结构,或者引物在模板的某些位置非特异性地结合,也同样会产生非特异性扩增。

我们都知道,PCR产物都是通过引物延伸产生的。当引物产生了二聚体或者非特异性扩增产物之后,引物本身就无法再延伸形成PCR产物了,这样的情况下,非特异性扩增产物越是多,那目的产物就越是少。如果在qPCR过程中,就会在熔解曲线中形成双峰。

小伙伴们遇到这样的问题,首先想到的可能是加入DMSO来阻止引物二聚体形成,或者E

登革2型病毒全长基因组的长链RT_PCR法扩增

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中国公共卫生2006年4月第22卷第4期  ChinJPublicHealthApr2006Vol.22No.

4文章编号:100120580(2006)0420429202  中图分类号:R373133  文献标识码:A

429

【论  著】

登革2型病毒全长基因组的长链RT-PCR法扩增3

贡树基,赵卫,曹虹,张文炳,周浩,陈丽丹

  摘 要:目的 采用长链RT-PCR技术扩增登革2型病毒新几内亚株(NGC)全长基因组。方法 根据登革2

型病毒NGC株基因组全序列设计引物,在上游引物中加入Sp6RNA聚合酶启动子核心序列,下游引物中加入ClaⅠ内切酶位点。从病毒感染的乳鼠脑中提取RNA,采用长链RT-PCR技术进行扩增。以获得的PCR产物为模板分别扩增3个NGC株特异的基因片段。结果 长链RT-PCR法扩增出约11kb基因片段,经PCR法证实为登革2型病毒NGC株特异序列。结论 通过长链RT-PCR技术,获得了登革2型病毒NGC株全长基因组性克隆打下基础。

关键词:登革2型病毒;全长cDNA;长链RT-PCR

Amplificationofcompletegenomeofdengue2virusbylongRT-Shuji,,CAOHong,etal.De

CFX荧光定量PCR仪操作指南(Bio-rad)

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CFX96实时荧光定量PCF仪操作流程及注意事项

开始运行仪器

打开电脑

打开定量PCR仪底座开关

启动CFX Manager软件

放置样品

将PCR反应体系加入到0.2ml低缘八联管,盖上管盖;或加入低缘96孔板,用光学级封膜封好。注意,必须带一次性塑料手套,不要让手指接触到反应管表面。将反应管按顺序放入仪器的加热孔中。

设置程序,运行实验

定量PCR软件操作基本步骤为:a.设置热循环程序文件(Protocol Tab ) b.设置反应板文件

(Plate Tab )。C.点击“ Start RUn "键,运行程序热循环程序文件( Protocol Tab )设置指南:点击Edit (编辑)或Create NeW (创建新程序)。

反应板设置文件(Plate Tab )设置指南:选择本次实验所要使用的荧光染料种类;单击样品类型;

如要某些反应孔第一荧光染料对应的样品类型为标准品( Standard ),点击“ DiIUtiOn SerieS "键可设置其标准品浓度及稀释倍数。

点击“ Start Run"键。单击OPen lid (打开热盖)或Close lid (关闭热盖)放置样品;单击Start Run,保存文件,开始运行程序。

结果分析

PCR反应结束后,软件会

从文献作者提供的质粒中扩增GRP78新设计的PCR引物 - 图文

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基本步骤:

1. 2. 3. 4. 5. 6.

收集拟扩增片段基因的基本信息;

样品扩增目的,与样品性质、数量、样品制作或处理方式,如制作标准曲线; 设计、合成、稀释与保存引物;收集扩增片段长度、扩增温度与时间条件; 普通PCR扩增条件的优化,凝胶电泳证实; 定量PCR条件的设计与标准曲线的制备;

溶解曲线、标准曲线等的判读与应用、标准曲线制备;

7. 改成相对定量测定,相对于内参基因以后的待测基因表达水平变化。

基础 1 X RXN (15 ul体系),除1 ul样标外的溶剂预混 Sense(10uM): 0.5ul Antisense(10uM): 0.5ul 2 X PCR mix (东洋纺,含SYBR)7.5ul

H2O (天根): 5.5ul

总体积: 14.0 ul

2 X PCR mix(东洋纺,含SYBR和ROX,产品号:QPK-201)。注释:ROX用于校正加样枪加样体积等(