dti弥散张量成像绘图软件
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DTI--弥散张量成像
Outline DTI原理 DTI参数 ADC—表观弥散系数 MD—平均弥散率 FA—部分各向异性 RA—相对各向异性 VR—容积比 AI—各向异性指数
DTI的基本原理
DTI参数及其应用
ADC eADC的图的信号对比度较ADC图高 病变部位的边界显示清晰 表现与DWI图像一致,符合临床观察习惯
ADC 自由水的ADC值大约为2.5x10-3mm2/S 正常脑组织的ADC值为0.7-0.9x10-3mm2/S 脑组织急性病变的ADC值多为降低 脑组织亚急性或慢性病变的ADC值多为升高 ADC:0.4x10-3mm2/S —— 2.5x10-3mm2/S
病变
细胞毒性水肿 脑梗死急性期
血管源性水肿 脑梗死亚急性期 升高 eADC图 亚急性或慢性病变
ADC值变化 高信号 所属类型
降低 ADC图 急性病变
MD MD—平均弥散率 MD=(λ1+λ2+λ3)/3(等于平均ADC??)
特征值对应特征向量 大小、方向 平行于纤维走向的MD>垂直的MD
FA
FA优势 各向异性的参数有很多,目前临床上,应用较多的 是 FA 值 FA 图像可以提供较好的灰白质对比,易选择感兴趣 区,使得所测量的 FA 值较准确 FA 值不随坐标系
弥散张量成像评估亚低温治疗弥漫性轴索损伤的优势
SICENCE新闻发布作者:荆国杰稿号:NRR_3_14
弥散张量成像评估亚低温治疗弥漫性轴索损伤的优势
有研究表明,亚低温疗法治疗重型脑损伤有效,弥漫性轴索损伤是为重型颅脑损伤的主要类型之一。那么亚低温治疗弥漫性轴索损伤是否同样有疗效呢?弥散张量成像中的各向异性分数值可定量脑损伤时神经纤维的一致性,使用弥散张量成像定量评估弥漫性轴索损伤疗效的研究报告仍未出现。中国惠州市第一人民医院荆国杰所在课题组进行的一项研究显示,弥散张量成像可以作为定量评估弥漫性轴索损伤的指标,亚低温组平均疗效在神经轴索损伤程度恢复方面约为常温组的1.32-1.36倍。由此作者认为,弥散张量成像能评估亚低温疗法对弥漫性轴索损伤的治疗效果。文章发表在《中国神经再生研究(英文版)》杂志2014年1月第2期。
弥散张量成像检测显示,亚低温治疗后,弥散性轴索损伤患者脑各项异向分数图中可见损伤病灶(圆圈部分)缩小
Article: " Mild hypothermia for treatment of diffuse axonal injury: a quantitative analysis of diffusion tensor imaging," by Guojie Jing1,
扩散张量成像在椎管内占位性疾病的应用研究
分类号密级
国际十进分类号(UDC)
第四军医大学
学位论文
扩散张量成像在椎管内占位性疾病的应用研究
(题名和副题名)
马成
指导教师姓名
印弘教授(主任医师)
指导教师单位
第四军医大学西京医院放射科
申请学位级别硕士
专业名称
影像医学与核医学
论文提交日期2010.04
答辩日期
2010.05
论文起止时间
2009年09月至2010年04月学位授予单位
第四军医大学
独创性声明
秉承学校严谨的学风与优良的科学道德,本人声明所呈交的论文是我个人在导师指导下进行的研究工作及取得的研究成果。尽我所知,除了文中特别加以标注和致谢的地方外,论文中不包含其他人已经发表或撰写过的研究成果,不包含本人或他人已申请学位或其他用途使用过的成果。与我一同工作的同志对本研究所做的任何贡献均已在论文中作了明确的说明并表示了致谢。
申请学位论文与资料若有不实之处,本人承担一切相关责任。
论文作者签名:日期:
保护知识产权声明
本人完全了解第四军医大学有关保护知识产权的规定,即:研究生在校攻读学位期间论文工作的知识产权单位属第四军医大学。本人保证毕业离校后,发表论文或使用论文工作成果时署名单位仍然为第四军医大学。学校可以公布论文的全部或部分内容(含电子版,保密内容除外),可以采用影印,缩印或其他复制手段保存论
绘图软件-origin 用法
打开origin,在book1里输入数据,点击下方图标
1.显示多条曲线: ,显示点线图。
book1数据栏右键点击空白处,选择add new column,添加列,全选新添加的列,右键---将列设置为X或Y轴,输入数据。
点击
点线图,
出现: ,add plot to layer,添加新的
2.添加新标签
在折线图空白处,右键----new legend,添加新标签,
,双击黑
色符号,对其进行定义,如下图:
3.设置参考值
将某一列所有数据同时除以一个数,如速度无量纲化。
选中一列A(x),右键----set column values ,弹出set value对话框,如下图,
点击上方Col(A),其即出现在公式框中,在框中输入公式,如下图,点击应用,
OK
4.移除坏点
点击,remove bad points,出现下图和一个定位框,选中要移除的点,双击左键,坏点即被移除。
5.数据排序
选中X、Y两列,右键------sort worksheet----custom-----X-----ascending(升序)-----OK,如下图
或者选中X、Y两列,右键------sort worksheet----ascending
6.设置坐标轴
双击点线或坐标轴,可以修改点
GrADS绘图软件使用手3
第三章 GrADS数据格式
每一组GrADS数据应至少包括两组数据文件,数据描述文件—ASCII码和数据文件—二进制,数据的真正存放地。数据文件中只是用户数据的有序排放,而关于数据种类、排放次序等是单独放在一个文件中的称—数据描述文件。而象GRIB和NETCDF等通用数据格式,以上两者是存于同一个文件的—或称为自定义/自解释格式数据。但考虑到GrADS传统,对这类自定义格式数据仍将生成相应的数据描述文件。
GrADS并不直接使用“数据文件”,而是通过“描述文件”间接使用“数据文件”。
上一章中我们已使用过了这样的一组数据。以此为例,介绍用户如何按GrADS的格式,将自己的数据生成相应的数据文件和数据描述文件。
1. 格点数据描述文件 model.le.ctl文件清单:
以*开始的行为注解行。
1.1 数据描述文件各项解释
1. DSET <路经/>数据文件名
定义与此数据描述文件相对应的数据文件名。若两者位于同一目录,前面的路经可以省略或以“^”开始,代表两者位于同一目录。若不在同一目录下,应给出路经参数。如:
c:/pcgrads/sample/model.le.dat
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注意路经的给法与DOS不同,而与UNIX环境一致,便于移植!或
绘图软件快捷键大全
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计算机绘图常用软件快捷键大全
(CAD) (3D) (PS) (LS)(Windows) (Word) (CorelDRAW)
CAD常用快捷键
F1: (获取帮助)
F2: (实现作图窗和文本窗口的切换) F3: (控制是否实现对象自动捕捉) F4: (数字化仪控制) F5: (等轴测平面切换)
F6: (控制状态行上坐标的显示方式) F7: (栅格显示模式控制) F8: (正交模式控制) F9: (栅格捕捉模式控制) F10: (极轴模式控制) F11: (对象追 踪式控制) Ctrl B: (栅格捕捉模式控制F9) Ctrl C: (将选择的对象复制到剪切板上) Ctrl F: (控制是否实现对象自动捕捉f3) Ctrl G: (栅格显示模式控制F7) Ctrl J: (重复执行上一步命令)
Ctrl K: (超级链接) Ctrl N: (新建图形文件) Ctrl M: (打开选项对话框)
AA: (测量区域
科学绘图及数据分析软件Origin
第1章 科学绘图及数据分析软件Origin
1.1 Origin功能简介
图表是显示和分析复杂数据的理想方式,因此高端图表工具是科学家和工程师们必备的软件。Microcal Software公司的Origin软件(演示版可以从下载)一直在科学作图和数据处理领域享受较高的声誉,和它的主要竞争对手SPSS Scientific公司的SigmaPlot(/)和MathSoft公司的Axum相比,它的功能更强大但需要花费更多时间来学习。在最新发布的Origin 7.5中,OriginLab公司对它的易用性进行了大量的改进,并彻底调整了其编程语言战略,从而使该软件在同类产品中脱颖而出。
现流行的Origin版本有5.0、6.0、6.1、7.0和7.5。Origin包括两大类功能:数据分析和科学绘图。Origin的数据分析功能包括:给出选定数据的各项统计参数平均值(Mean)、标准偏差(Standard Deviation,SD)、标准误差(Standard Error,SE)、总和(Sum)以及数据组数N;数据的排序、调整、计算、统计、频谱变换;线性、多项式和多重拟合;快速FFT变换、相关性分析、FFT过滤、峰找寻和拟合;可利用约200个内建的以及自定义的
磁共振弥散加权成像及表观扩散系数在脑转移瘤诊断中的价值_赵志
磁共振弥散加权成像及表观扩散系数在脑转移
瘤诊断中的价值
赵志伟*,伊利亚尔 拜合提亚尔,刘文亚**
(新疆医科大学第一附属医院影像中心,新疆 乌鲁木齐 830011)
摘要:目的:探讨磁共振(M RI)弥散加权成像(DWI)及表观扩散系数(A DC)在脑转移瘤诊断中的价值。方法:对疑似脑转移瘤患者161例行弥散加权成像并做诊断实验研究。测定DW I对脑转移瘤的敏感性、特异性和准确性;同时与病理结果随访对照,分别测定肿瘤实质、坏死/囊变部分、瘤周水肿部分及正常脑实质ADC值,并与确诊脑胶质瘤进行比较。结果:(1)DWI对脑转移瘤诊断的敏感性、特异性、准确性分别为82.27%、91.46%和
86.95%;(2)脑转移瘤肿瘤实质部分A DC值为(1.08 0.37) 10-3mm2/s,坏死/囊变部分A DC值为(1.90
0.36) 10-3mm2/s。与瘤周水肿区及正常脑实质A DC值比较,差异均有统计学意义(P<0.05)。脑转移瘤与胶
质瘤不同区域A DC值比较无明显差异(P>0.05)。结论:DWI成像对脑转移瘤的诊断有较高价值;瘤灶及瘤周ADC值的测量有助于鉴别诊断。
关键词:脑转移瘤;磁共振弥散加权成像;表观扩散系数;诊断
中图分类号:R445.2;R739.4 文献标识
水动力弥散系数
>>专门水文地质学>>教材>>专门水文地质学
§6.3水动力弥散系数
一、基本概念
在研究地下水溶质运移问题中,水动力弥散系数是一个很重要的参数。水动力弥散系数是表征在一定流速下,多孔介质对某种污染物质弥散能力的参数,它在宏观上反映了多孔介质中地下水流动过程和空隙结构特征对溶质运移过程的影响。水动力弥散系数是一个与流速及多孔介质有关的张量,即使几何上均质,且有均匀的水力传导系数的多孔介质,就弥散而论,仍然是有方向性的,即使在各向同性介质中,沿水流方向的纵向弥散和与水流方向垂直的横向弥散不同。一般地说,水动力弥散系数包括机械弥散系数与分子扩散系数。当地下水流速较大以致于可以忽略分子扩散系数,同时假设弥散系数与孔隙平均流速呈线性关系,这样可先求出弥散系数再除以孔隙平均流速便可获取弥散度。
分子扩散系数D?与介质的性质有关。经验证明:
D??Dd?T (6-25)
式中 Dd——溶质在静水中的分子扩散系数,它主要取决于溶质分子的特性和温度;
T——多孔介质的弯曲度。
机械弥散系数D??是一个与地下水流速有关的量。在各向同性介质中,经试验证明为:
用FSL预处理DTI数据
目前已经在网上和有关处理磁共振弥散加权收购方法文献中大量的信息。 这些说明提供了有关如何预处理DTI数据的简要介绍,重点是在放射学学术运行的项目。 一个类似的指南也可以从克里斯Rorden,并从达特茅斯脑成像中心 。
为了遵循这一点,你将需要访问FSL在GNU / Linux或安装Cygwin的 。 所有需要的软件已经安装在放射学学术Linux服务器上。 如果安装Cygwin与FSL使用,一些当地的笔记可能是有用的。后安装Cygwin,下载和描述上安装的Windows版本的FSL 佛山照明的网页。
您可能还需要保罗的DICOM来分析的副本DTOA遵守软件Cygwin的。 基本的预处理步骤
1. 导出弥散加权从MR扫描仪图像。 2. 转换弥散加权图像分析。 3. 计算扩散方向和b值。 4. 使用FSL
正确的空间失真由于涡流引起的差异。
o 创建脑的二进制掩码。
o 计算的扩散张量和相关联的参数。
o 检查的原理特征向量出现似是而非的使用FSLView。
o
如果DICOM图像可在步骤1中导出,上面和FSL安装,然后剩下的步骤可以由我的DICOM标准执行,以分析转换软件, DTOA ,通过指定-DIFF-FDT命令行选项,下面的转换到分析,运行