trizol法提取rna中DNA
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TRIzol法提取RNA
总RNA提取(TRIzol法)
仪器和材料:氯仿、异丙醇、无水乙醇、无RNA酶枪头(1000μL,200μL,
10μL)、移液枪、无RNA酶EP管(有1.5mL、2mL、15mL、50mL等不同规格)、75%乙醇(尽量现配现用,配制好后置于4℃冰箱待用)、滤纸、DEPC水、计时器记号笔等
注:上述材料标记好提RNA专用,自己保管好!
操作步骤:
1.细胞悬液按照每5×105~106个细胞加1mL TRIzol,贴壁细胞直接加TRIzol裂解,(1个T25cm2细胞培养瓶可加1~2mL TRIzol,可根据需求来添加),裂解数分钟(5~10分钟,可在倒置显微镜下观察细胞脱落情况),反复用枪吹打或持续振荡以裂解细胞。
2.将上述TRIzol裂解液转移至1.5mL EP管中,每个EP管做好标记,按照每1mL TRIzol加200μL氯仿的量加入氯仿,盖上EP管盖子,用力振荡(手动)15秒,在室温下放置10~15分钟(观察到明显分层即可);然后4℃离心机12000rpm离心15分钟。
3.将离心后EP管内上层液体转入新的EP管内(离心后分为3层,注意吸取第一层水相时不要吸到第二层,一般可吸到500μL左右),按照每1mL TRIzol加500μL异丙
TRIzol法同时提取RNA,DNA,蛋白质
TRIzol法同时提取RNA,DNA,蛋白质
TRIzol试剂适用于从细胞和组织中快速分离RNA。TRIzol试剂有多组分分离作用,与其他方法如硫氰酸胍/酚法、酚/SDS法、盐酸胍法、硫氰酸胍法等相比,最大特点是可同时分离一个样品的RNA\\DNA\\蛋白质.TRIzol使样品匀浆化,细胞裂解,溶解细胞内含物,同时因含有RNase抑制剂可保持RNA的完整性。在加入氯仿离心后,溶液分为水相和有机相,RNA在水相中。取出水相用异丙醇沉淀可回收RNA;用乙醇沉淀中间层可回收DNA;用异丙醇沉淀有机相可回收蛋白质。
TRIzol试剂可用于小量样品(50-100mg组织、5×106细胞)也适用于大量样品(≥1g组织、>107细胞)。对人,动物,植物组织,细菌均适用,可同时处理大量不同样品,整个提取过程在一小时内即可完成。分离的总RNA无蛋白质和DNA污染,可用于Northern Blot,dot blot,ployA筛选,体外翻译,RNase保护分析和分子克隆。在用于RT-PCR时如果两条引物存在于一个单一外显子内,建议用无RNase的DNaseⅠ处理RNA样品,避免出现假阳性。共纯化的DNA可用作标准,比较不同样品RNA的得率,也可用于PCR和酶切
Trizol法提取总RNA(细胞和组织)
Trizol法提取总RNA
1、①提取组织RNA时,研钵高温高压灭菌,每50-100mg组织液氮研磨后,将粉末用液氮预冷的药匙转移至预先装有1ml Trizol的EP管中,充分混匀(粉末总体积不能超过Trizol体积的10%)用1ml Trizol试剂裂解;
②提取细胞RNA时,每5-10×106个细胞用1ml Trizol裂解,反复吹打或剧烈振荡;
2、将上述裂解液,室温15-30℃静置5min;
3、每1ml Trizol加入0.2ml氯仿,在手中用力振荡15s,室温放置2-3min后,12000r离心15min(2-8℃);
4、取上层水相置于新EP管中,按照每1ml Trizol加入0.5ml异丙醇的量加入异丙醇,室温放置10min,12000r离心10min(2-8℃),弃上清;
5、向沉淀中按每1ml Trizol加1ml 75% 乙醇(4℃),涡旋混合,进行洗涤,7500r离心5min(2-8℃),弃上清; 6、将RNA沉淀在室温下自然干燥(5-10min); 7、用30μl RNase-free water溶解RNA沉淀; 8、取出1μl,稀释10倍,测定RNA浓度并记录; 9、进行反转录或分装保存于-80℃
Trizol法提取RNA-电子版
Trizol法提取RNA步骤
1. 胰酶消化六孔板细胞(每孔相当于3.5cm皿),每孔细胞收于EP管中,PBS洗一遍(或
弃旧培养基,1ml PBSA洗2遍,直接向孔中加入600ul Trizol,吹打细胞,并吸入EP管中即可,无需胰酶消化);
2. 向细胞沉淀中加入600ul Trizol裂解细胞5min;
3. 加入三氯甲烷(氯仿)120ul(V三氯甲烷:VTrizol=1:5)提取核酸; 4. 振荡10s至粉红色出现时停止,室温静置2~3min后分层; 5. 4℃,12000×g,离心15min,离心后,底部为细胞碎片,中间为DNA,上层为RNA产
物;
6. 吸取上层液相RNA提取液,置另一个EP管中(小心勿吸到沉淀,约为250~300ul); 7. 每管加入异丙醇300ul(V异丙醇:VTRIZOL=1:2)(异丙醇为有机溶剂,根据相似相溶原理,
RNA不溶于其中,其他杂质溶于其中); 8. 上下颠倒,轻轻混匀,室温下静置10分钟; 9. 4℃,12000×g,离心10分钟,弃上清; 10. 用800ul 75%乙醇(用1‰DEPC处理水配制)洗沉淀,振荡器振荡15秒钟; 11. 4℃,12000×g,离心5分钟,弃上清(挥发乙醇2分钟)
DNA和RNA提取常见问题分析及对策
DNA和RNA提取常见问题
DNA和RNA提取 和 提取 常见问题分析及对策
DNA和RNA提取常见问题
DNA提取专题 DNA提取专题第一部分: 第一部分:DNA提取方法简介 提取方法简介 第二部分: 第二部分:DNA提取常见问题分析及对策 提取常见问题分析及对策
DNA和RNA提取常见问题
前言DNA是遗传信息的载体,是最重要的生物 是遗传信息的载体, 是遗传信息的载体 信息分子,是分子生物学研究的主要对象。 信息分子,是分子生物学研究的主要对象。为 了进行测序、杂交和基因的表达,获得高分子 了进行测序、杂交和基因的表达, 量和高纯度的DNA是非常重要的前提。 是非常重要的前提。 量和高纯度的 是非常重要的前提
DNA和RNA提取常见问题
DNA提取原则 DNA提取原则保证DNA结构的完整性 纯化后不应存在对酶有抑制作用的物质 排除有机溶剂和金属离子的污染 蛋白质、多糖、脂类等降低到最低程度 排除其他核酸分子的污染
DNA和RNA提取常见问题
DNA提取的几种方法 DNA提取的几种方法染色体DNA的提取 染色体DNA的提取 DNACTAB法 法 SDS法 SDS法 其它
DNA和RNA提取常见问题
DNA提取的几种方法 DNA提取的几种方法非染色体DNA的提取
【生物课件】植物DNA、RNA及蛋白的提取与分析
植物DNA、RNA及蛋白 的提取与分析
植物DNA提取
DNA提取原则
保证DNA结构的完整性 排除有机溶剂和金属离子的污染 排除其它核酸分子的污染 蛋白质、多糖、脂类等降低到最低程度 纯化后不应存在对酶抑制性的物质
植物DNA提取的方法
CTAB法 SDS法 煮提法
--植物DNA提取的经典方法
DNA提取的基本步骤
材料的准备(新鲜或冷冻保存) 细胞的裂解(液氮研磨,释放内容物) DNA的分离与纯化(酚氯仿抽提) DNA的沉淀与洗涤(2V无水乙醇或2/3V 异丙醇) DNA的干燥与溶解(ddH2O或TE)
CTAB法流程植物材料 裂解液沉淀
液氮研磨
抽提
离心洗涤
细胞裂解
上层溶液
干燥溶解
CTAB提取液主要成分CTAB: 十六烷基三甲基溴化铵,是一种阳离子去污剂,可 溶解细胞膜,并与核酸形成复合物,通过有机溶剂抽提, 去除蛋白、多糖、酚类等杂质后加入乙醇或异丙醇沉淀即 可使核酸分离出来。
Tris-HCl(pH8.0): 提供一个缓冲环境,防止核酸 被破坏。 EDTA:螯合Mg2+或Mn2+离子,抑制DNase活性。 NaCl: 提供一个高盐环境,使DNP充分溶解,存在 于液相中。
CTAB法步骤1.取约0.1g的水稻叶片在液态中磨成粉末,将适 量的粉
酚氯仿法提取DNA的原理
酚氯仿法提取DNA的原理
作者: 渭水凡夫 (站内联系TA) 发布: 2013-04-06
最近在博客上看到的一篇 可以作为入门级 《分子生物学十万个为什么》 和大家分享一下
用酚抽提细胞DNA时,有什么作用?
使蛋白质变性,同时抑制了DNase的降解作用。用苯酚处理匀浆液时,由于蛋白与DNA 联结键已断,蛋白分子表面又含有很多极性基团与苯酚相似相溶。蛋白分子溶于酚相,而DNA溶于水相。
使用酚的优点:1. 有效变性蛋白质;2. 抑制了DNase的降解作用。
缺点:1. 能溶解10-15%的水,从而溶解一部分poly(A)RNA。2. 不能完全抑制RNase的活性。 氯仿的作用?
氯仿:克服酚的缺点;加速有机相与液相分层。
最后用氯仿抽提:去除核酸溶液中的迹量酚。(酚易溶于氯仿中)
用酚-氯仿抽提细胞基因组DNA时,通常要在酚-氯仿中加少许异戊醇,为什么? 异戊醇:减少蛋白质变性操作过程中产生的气泡。异戊醇可以降低表面张力,从而减少气泡产生。另外,异戊醇有助于分相,使离心后的上层含DNA的水相、中间的变性蛋白相及下层有机溶剂相维持稳定。
用乙醇沉淀DNA时,为什么加入单价的阳离子?
用乙醇沉淀DNA时,通常要在溶液中加入单价的阳离子,
2×CTAB法植物总DNA提取
2×CTAB法植物总DNA提取
1. 液氮研磨1g左右的植物组织,转移到离心管中。改用研磨枪在冰上研磨,不加β-巯基乙醇
研磨时可加入适量的PVP、β-巯基乙醇。若CTAB准备2-3天内用完,则可将PVP、β-巯基乙醇直接加入其中。
2. 加入500μl的2*CTAB (60℃或65℃预热) ,颠倒混合均匀后在60℃或65℃水浴30m-1h小时,其间要上下颠倒混匀数次。
3.取出离心管,加入等体积的24:1(三氯甲烷:异戊醇),上下颠倒充分混合。 若量多,则可以直接侧立于摇床上晃动10分钟。
4.12000转速离心5-10min。将离心管动作轻缓的取出转子,放置于离心管架上。 a.离心后溶液分三层:上层为水相;中层为碎片和蛋白相;底层为氯仿 b.迅速进入下一步,以免各相混合
5.用移液枪吸取管中上层水相,动作一定要轻缓,不可搅动其它两层。 a.此步骤要宁舍不贪多,尽量避免吸取到下层液体。
b.若上步骤中中间层较厚,则继续加入等体积24:1,再次抽提一次,直至中间层较薄。 6. 在抽提出的水相中加入1/3体积的5M的KAc及等体积的异丙醇(4℃预冷),轻轻晃动混合均匀后在-20℃沉淀。沉淀至少15分钟至过夜。
6-1 在抽提出的水
【生物课件】植物DNA、RNA及蛋白的提取与分析
植物DNA、RNA及蛋白 的提取与分析
植物DNA提取
DNA提取原则
保证DNA结构的完整性 排除有机溶剂和金属离子的污染 排除其它核酸分子的污染 蛋白质、多糖、脂类等降低到最低程度 纯化后不应存在对酶抑制性的物质
植物DNA提取的方法
CTAB法 SDS法 煮提法
--植物DNA提取的经典方法
DNA提取的基本步骤
材料的准备(新鲜或冷冻保存) 细胞的裂解(液氮研磨,释放内容物) DNA的分离与纯化(酚氯仿抽提) DNA的沉淀与洗涤(2V无水乙醇或2/3V 异丙醇) DNA的干燥与溶解(ddH2O或TE)
CTAB法流程植物材料 裂解液沉淀
液氮研磨
抽提
离心洗涤
细胞裂解
上层溶液
干燥溶解
CTAB提取液主要成分CTAB: 十六烷基三甲基溴化铵,是一种阳离子去污剂,可 溶解细胞膜,并与核酸形成复合物,通过有机溶剂抽提, 去除蛋白、多糖、酚类等杂质后加入乙醇或异丙醇沉淀即 可使核酸分离出来。
Tris-HCl(pH8.0): 提供一个缓冲环境,防止核酸 被破坏。 EDTA:螯合Mg2+或Mn2+离子,抑制DNase活性。 NaCl: 提供一个高盐环境,使DNP充分溶解,存在 于液相中。
CTAB法步骤1.取约0.1g的水稻叶片在液态中磨成粉末,将适 量的粉
组织RNA提取
哺乳动物组织样品RNA的抽提
哺乳动物组织样品RNA的抽提最基本的要素是防止RNA在抽提过程中降解,以及尽可能得到最高的RNA抽提效率。以下介绍我们实验室认为最符合以上两个要素的抽提方法。
关键词:抽提 样品 哺乳动物组织 样品RNA
哺乳动物组织样品RNA的抽提最基本的要素是防止RNA在抽提过程中降解,以及尽可能得到最高的RNA抽提效率。以下介绍我们实验室认为最符合以上两个要素的抽提方法。 一、实验材料:
Trizol试剂(Invitrogen公司)
研钵,匀浆器,镊子,铝箔都高温灭菌即可; 二、具体过程:
1、样品在离体后应迅速冷冻在液氮中,若是比较大块的组织,要尽量把组织剪切成黄豆大小的块,使液氮迅速渗透到组织内部而防止组织内部的RNA降解。组织用铝箔包好或放入冻存管中,并做好记号,注意不要把记号写在纸上,以防纸被组织的血水渗透而导致记号模糊。可以把铝箔放入纱布袋并储存在液氮中。
2、在抽提RNA前,先把研钵预冷,往研钵内反复加入液氮,至少4-5次,使研钵充分预冷。从液氮罐中取出样本后,把组织块放入已预冷的研钵中进行研磨,边研磨边加液氮,整个过程都不要使液氮挥干。一次研磨的组织块重量不要超过300mg。
3、研磨到组织样品成粉末状后