代谢组学数据分析软件

20144312·357·

代谢组学数据分析的统计学方法

柯朝甫

1

*

张涛

2

武晓岩

1

李康

1Δ

代谢组学是近年发展快速的一门学科，目前在医学、植物学、微生物学、毒理学、药物研发等诸多领域中

［1-5］

。代谢组学研究产生大量的数得到了广泛的应用

据，这些数据具有高维、小样本、高噪声等复杂特征。

（4）相互作用关系复杂：各种代谢物质可能不仅

具有简单的相加效应，而且可能具有交互作用，从而增加了识别这些具有复杂关系的生物标志物的难度。

（5）相关性和冗余性：各种代谢物并非独立存在，而是相互之间具有不同程度的相关性，同时由于碎片、加合物和同位素的存在使得数据结构存在很大的冗余性，这就需要采用合理的统计分析策略来揭示隐藏其中的复杂数据关系。

（6）分布的不规则和稀疏性：代谢组学数据分布不规则，而且数据具有稀疏性（即有很多值为零），因此，传统的一些线性和参数分析方法此时可能失效。

数据的预处理

代谢组学数据分析的目的是希望从中挖掘出生物相关信息，然而，代谢组学数据的变异来源很多，不仅包括生物变异，还包括环境影响和操作性误差等方面。处理手段主要包括归一化（standardization）、标准化（normalization），即中心化（centering）和尺度

《主流数据分析工具对比研究》实践教学报告书

姓名：徐英豪

班级： 113010101 学号： 11301010113 专业：信息与计算科学

院系：数学与统计学院

任课教师：苏理云

SAS软件

SAS把数据存取，管理，分析和展现有机地融为一体。主要特点如下：

1）功能强大，统计方法齐、全、新

SAS提供了从基本统计数的计算到各种试验设计的方差分析，相关回归分析以及多变数分析的多种统计分析过程，几乎囊括了所有最新分析方法，其分析技术先进，可靠。分析方法的实现通过过程调用完成。许多过程同时提供了多种算法和选项。例如方差分析中的多重比较，提供了包括LSD，DUNCAN，TUKEY测验在内的10余种方法；回归分析提供了9种自变量选择的方法（如STEPWISE，BACKWARD，FORWARD，RSQUARE等）。

回归模型中可以选择是否包括截距，还可以事先指定一些包括在模型中的自变量字组（SUBSET）等。对于中间计算结果，可以全部输出，不输出或选择输出，也可存储到文件中供后续分析过程调用。2）使用简便，操作灵活

SAS以一个通用的数据（DATA）步产生数据集，尔后以不同的过程调用完成各种数据分析。其编程语句简洁，短小，通常只需很小的几句语

《数据分析及其应用软件》习题

姓名＿＿ 学号＿ ＿ ＿成绩

习题1：出钢时所用盛钢水的钢包，因钢水对耐火材料的侵蚀，容积不断增大

我们希望找出使用次数与增大的容积之间的关系，试验数据如下：

使用次数x 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16

写出分析报告（内容包括以下四点） 1. 用双曲线1/y = a+b/x作曲线拟合：（1）画出散点图， （2）写出回归方程， （3）进行检验， （4）分析结果， （α= 0.05）

2. 用指数曲线y = aeb/x 作曲线拟合： （1）画出散点图， （2）写出回归方程， （3）进行检验， （4）分析结果， （α= 0.05） 3. 比较两种曲线后，写出较优的曲线回归方程.

4. 使用较优的曲线回归方程预测当使用次数为17次时钢包的容积增大多少？

增大容积y 6.42 8.20 9.58 9.50 9.70 10.00 9.93 9.99 10.49 10.59 10.60 10.80 10.60 10.90 10.76 习题2：1．研究货运总量Y（万吨）与工业总值X1(亿元)、农业总

第1章 科学绘图及数据分析软件Origin

1.1 Origin功能简介

图表是显示和分析复杂数据的理想方式，因此高端图表工具是科学家和工程师们必备的软件。Microcal Software公司的Origin软件(演示版可以从下载)一直在科学作图和数据处理领域享受较高的声誉，和它的主要竞争对手SPSS Scientific公司的SigmaPlot（/）和MathSoft公司的Axum相比，它的功能更强大但需要花费更多时间来学习。在最新发布的Origin 7.5中，OriginLab公司对它的易用性进行了大量的改进，并彻底调整了其编程语言战略，从而使该软件在同类产品中脱颖而出。

现流行的Origin版本有5.0、6.0、6.1、7.0和7.5。Origin包括两大类功能：数据分析和科学绘图。Origin的数据分析功能包括：给出选定数据的各项统计参数平均值（Mean）、标准偏差（Standard Deviation，SD）、标准误差（Standard Error，SE）、总和（Sum）以及数据组数N；数据的排序、调整、计算、统计、频谱变换；线性、多项式和多重拟合；快速FFT变换、相关性分析、FFT过滤、峰找寻和拟合；可利用约200个内建的以及自定义的

第1章 数据分析及展示软件平台选型

1.1 项目采购软件要求

1.1.1 数据查询和分析软件

行业运行分析标项需采购数据查询和分析软件，并基于此软件开发标准的可被其他应用重复使用和可扩充的综合分析查询，此部分支撑软件技术要求如下：

1.1.1.1 技术架构

1.1.1.1.1 数据查询与分析

（1） 数据资源层

分成两个部分，一类是系统外部业务数据资源，一类则是系统内部管理的知识库和配置库。外部业务数据存放着海量的业务数据，实际就是整个系统分析的对象，可以是直接的原始业务数据库，也可以是经过整合清洗后的数据仓库或数据集市；知识库则存放着关于业务库的元数据、业务规则、各类商业分析模型等，可以说是业务分析专家知识的结晶；配置库则是系统内部管理需要的数据。

（2） 分析支撑平台

此层以应用中间见平台为基础，提供了一个用于构建实时商业智能分析的支撑平台，为上层查询和分析应用提供一组基础性、关键性服务和组件；确保了整个系统的安全、可靠、高性能、可扩展性。

（3） 数据资源层

此处实现了数据查询与分析系统的各类可信服务和引擎，针对每种查询分析和其他数据应用都会有对应的引擎在后台提供支撑。

（4） 数据展现

数据资源层展现是整个系统的统一访问入口和集成展现

平衡分析法

所谓平衡就是各个互相联系的因素之间，在数量上保持一定的合理的对应关系。平衡分析法是分析事物之间相互关系的一种方法。它分析事物之间发展是否平衡，揭示出事物间出现的不平衡状态、性质和原因，指引人们去研究积极平衡的方法，促进事物的发展。统计平衡分析的主要方法有编制平衡表和建立平衡关系式。

平衡表与一般统计表的区别在于：指标体系必须包括收入与支出，来源与使用两个对应平衡的指标。平衡表的主要形式有三种，即收付式平衡表、并列式平衡表和棋盘式平衡表，前两种形式如资产负债表、能源平衡表，后一种形式如投入产出表。

平衡关系式是用等式表示各相关指标间平衡关系的式子。如，期初库存+本期入库＝本期出库+期末库存，资产＝负债+所有者权益，增加值＝总产出－中间投入。

统计中的平衡分析基本要求和特点是：平衡分析要通过有联系指标数值的对等关系来表现经济现象之间的联系；要通过有联系指标数值的比例关系来表现经济现象之间的联系；要通过任务的完成与时间进度之间的正比关系来表现经济现象的发展速度；要通过各有关指标的联系表现出全局平衡与局部平衡之间的联系。

其他数据分析方法

回归分析

研究变量之间存在但又不确定的相互关系以及密切程度的分析叫做相关分析，如果把其中的一些因素作

数据采集与结果处理 本实验中有40人参加实验，删除正确率低于90%的被试数据，还剩31名被试数据。其中，消极情绪启动组16人（男生7人，女生9人）；无启动组15人（男生6人，女生9人）。反应时数据处理: 正式数据分析前对数据进行了整理,删除了被试按键反应出错的trails以及反应时在三个标准差以外的trails。被删除的trails小于10%。两组被试在视觉搜索任务的反应准确率均高达90% 以上。以往相关的文献中, 准确率一般不作为因变量加以考察, 因此, 在本研究中, 反应时间是唯一的因变量。

研究结果

2情绪启动（消极启动，无启动）×2面孔情绪图片（负性情绪图片，中性情绪图片）进行两因素混合设计方差分析结果表明：情绪启动主效应显著，F(1，31)=4.212，P=0.049＜0.05，表明电影启动消极情绪显著。面孔情绪图片的主效应显著F(1，31)=207.456，P<0.000；被是对负性面孔情绪图片的反应时显著快于中性情绪图片。情绪启动与面孔情绪图片的交互作用显著F(1，31)= 6.933，P=0.013<0.05。进一步做简单效应（见表2）分析表明：(1)无情绪启动条件下，被试对负性面孔情绪图片反应时显著快于中性面孔图片

实验课程：专 业：班 级：学 号：姓 名：

数据分析 数学与应用数学 11070141 1107014111 宁巧娇

中北大学理学院

实验一 SAS系统的使用

【实验类型】（验证性） 【实验学时】2学时

【实验目的】 使学生了解SAS系统，熟练掌握SAS数据集的建立及一些必要

的SAS语句。

【实验内容】1. 将SCORE数据集的内容复制到一个临时数据集test。

SCORE数据集

Name Sex

Alice f Tom m Jenny f Mike m Fred m Kate f Alex m Cook m Bennie f Hellen f Wincelet f Butt m Geoge m Tod m Chris f Janet f

2．将SCORE数据集中的记录按照

Math Chinese English 90 85 91 95 87 84 93 90 83 80 85 80 84 85 89 97 83 82 92 90 91 75 78 76 82 79 84 85 74 84 90 82 87 77 81 79 86 85 82 89 84 84 89 84 87 86 65 87

math的高低拆分到

山东农业大学水利土木工程学院毕业设计专用纸

7．PKPM部分

| TAT 结构控制参数、各层质量和质心坐标、各层风荷载输出文件 | | TAT-M.OUT |

********************************************************************** * 第一部分 结构计算控制参数 *

**********************************************************************

-------------------- | 总 信 息 | --------------------

结构计算层数：Nsu = 4

结构对称性标志：Naxy = 0 按不对称分析 地震力计算标志：Mear = 3 计算水平地震 竖向力计算标志：Mver = 2 模拟施工加载1 风力计算标志：Mwin = 3 计

管理数据分析实验教程

第1章 财务会计模型 孙梦楠

会计为管理者提供信息，会计的目标是帮助管理者制定经济活动的决策。

1.1 会计凭证概述

会计要真实、准确、及时、完整地反映各单位的经济活动，就必须按照一定的格式填制会计凭证，并按照严格的程序审核、处理会计凭证。

1.1.1 会计凭证

会计凭证是记录经济业务、明确经济责任的书面证明，是登记账簿的重要依据。 会计凭证一般分为原始凭证和记账凭证两类，在实际工作中一般采用通用记账凭证格式。

1.1.2 记账凭证的填制

记账凭证填制的程序是：首先审核原始凭证；其次，根据原始凭证或原始凭证汇总表中所记录的经济业务内容，按照会计制度的规定，运用复式记账原理，确定应借、应贷的会计科目和金额；再次，填制记账凭证；最后，将填制好的记账凭证交由审核人员进行审核，审核通过后作为登记账簿的依据。

1.2 上机一 财务会计模型（一）

一、实验目的

1．掌握记账凭证模板的修改方法 2．学习记账凭证的填制方法

二、实验内容

1．记账凭证模板的修改：自动生成合计；函数校验；单元格内容的保护；保存记账凭证模板

2．记账凭证的填制：复制工作表；填制经济业务的会计分录

三、操作指导

1．记账凭证模板的修改