SNP的常用检测方法

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SNP检测方法汇总

标签:文库时间:2024-09-29
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TaqMan SNP基因分型

技术方法:

此技术是由美国Life technologies公司研发的SNP分型技术,其技术原理如下简介。PCR 反应时,加入一对两端有不同荧光标记的特异探针来识别不同的等位基因(allele1和allele2),5’端为报告荧光基团(reporter),3’端为淬灭荧光基团 (quencher)。PCR过程中,两个探针能与正向引物和反向引物之间的互补序列特异退火结合。当探针以完整形式存在时,由于能量共振转移,荧光基团只发出微弱荧光。特异的探针与相应的等位基因杂合后,DNA聚合酶发挥5’到3’外切酶活性,把报告荧光基团切割下来,脱离了3’端淬灭荧光基团的淬灭作用 (quench),从而发出荧光。两个探针的5’端标有不同的荧光 (FAM或VIC),3’端标有MGB 淬灭基团结合体。根据检测到的不同荧光,可以判断相应的样本的SNP 等位基因型。 整个技术的示意图如下:

应用领域:本方法适用于多个涉及到SNP分型的遗传研究领域。尤其适合针对全基因组SNP关联研究获得的初步阳性位点,以及全基因组测序得到的大量初筛突变位点进行进一步的大样品验证研究。

RFLP (多重荧光)SNP分型技术

已知的很多SNP位点正好位于限制性

SNP及检测技术

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1定义:

单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP),主要是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA序列多态性。它是人类可遗传的变异中最常见的一种。占所有已知多态性的90%以上。SNP在人类基因组中广泛存在,平均每500~1000个碱基对中就有1个,估计其总数可达300万个甚至更多。SNP所表现的多态性只涉及到单个碱基的变异,这种变异可由单个碱基的转换(transition)或颠换(transversion)所引起,也可由碱基的插入或缺失所致。但通常所说的SNP并不包括后两种情况。单核苷酸多态性(SNP)是指在基因组上单个核苷酸的变异,包括置换、颠换、缺失和插入。所谓转换是指同型碱基之间的转换,如嘌呤与嘌呤( G2A) 、嘧啶与嘧啶( T2C) 间的替换;所谓颠换是指发生在嘌呤与嘧啶(A2T、A2C、C2G、G2T) 之间的替换。从理论上来看每一个SNP 位点都可以有4 种不同的变异形式,但实际上发生的只有两种,即转换和颠换,二者之比为2:1。SNP 在CG序列上出现最为频繁,而且多是C转换为T ,原因是CG中的C 常为甲基化的,自发地脱氨后即成为胸腺嘧啶。一般而言,SNP 是指变异频率大于

几种常用的抗体检测方法

标签:文库时间:2024-09-29
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几种常用的抗体检测方法

(1)免疫酶技术

免疫酶技术是将抗原抗体反应的特异性和酶对底物显色反应的高效催化作用有机结合而成的免疫学技术。由于它特异性强,灵敏度高,现已广泛用于筛选和鉴定单抗。 A、器材和试剂 a. 包被缓冲液:

碳酸盐缓冲液:取0.2mol/L Na2CO3 8ml,0.2mol/L NaHCO3 17ml混合,再加75ml蒸馏水,调PH至9.6。

Tris-HCl缓冲液(PH8.0,0.02mol/L):取0.1mol/L Tris 100ml,0.1mol/L HCl 58.4ml混合,加蒸馏水至1000ml。

b. 洗涤缓冲液(PH7.2的PBS):KH2PO4 0.2g,KCl 0.2g,Na2HPO4&S226;12H2O 2.9g,NaCl 8.0g,Tween-20 0.5ml,加蒸馏水至1000ml。

c. 稀释液和封闭液:牛血清白蛋白(BSA)0.1g,加洗涤液至100ml;或用洗涤液将小牛血清配成5-10%使用。

d. 酶反应终止液(2mol/L H2SO4):取蒸馏水178.3ml,滴加浓硫酸(98%)21.7ml。 e. 底物缓冲液(PH5.0,磷酸盐-柠檬酸缓冲液):取0.2mol/L Na2HPO4

常用的刀具磨损检测方法比较

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篇一:刀具的磨损和耐用度浅谈

刀具磨损和耐用度浅谈

刀具在切削金属的同时,本身也逐渐被磨损。当磨损到一定程度时,就需要更换刀具,否则会产生降低加工表面质量等不良后果。 让我们先来看看刀具的磨损过程:常用的高速钢和硬质合金钢刀具的磨损过程如图所示,它反映了切削时间和刀具磨损之间的关系。 正常磨损

后刀面磨损初期磨损

切削时间/

1. 初期磨损阶段

在该阶段中,由于是新刃磨的刀具,刀后面粗糙不平,后面与工件过渡表面间的实际接触面很小,压力大,磨损速度很快。初期磨损量与刀具刃磨质量有关,经过研磨的刀具初期磨损量小。

2. 正常磨损阶段

刀后面经过初期的磨损后,粗糙度值降低,与工件过渡表面实际接触面积增大,压力减小,刀刃仍然比较锋利,磨损速度比较缓慢。该阶段切削过程平稳,持续时间长,是刀具的有效工作阶段。

3. 急剧磨损阶段

当刀具磨损到一定程度后,刃口变钝,摩擦力增大,切削力和切削温度迅速上升,刀具材料的性能下降,引起刀具迅速磨损,直至完全丧失切削性能。所以在切削过程中应避免刀具发生急剧磨损。

刀具的磨损过程又可看为刀具的钝化过程

从上述磨损过程可以看出,刀具在正常磨损阶段即将结束前,刀具必须及时重磨或可转位刀片转换刀刃。否则不仅会损坏刀具,而且会使工件的加工质量变坏。此

SNP数据统计详细方法

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SNP操作步骤与结果记录

按照陈丽学位论文第二部——替比夫定致肌酸激酶升高与TK2基因多态性的关系——2.2.4.3(单核苷酸多态性位点的选择)及2.2.6(数据处理及分析)条目进行理解和统计操作。

步骤一、使用在线软件SHEsis检验各个危险的hw遗传平衡(因rs2607659未发生突变,故不纳入分析。)

根据2.3.2(TK2单核苷酸多态性位点的测定结果)整理等位基因频率和HW平衡检测结果。

结论:9个位点P值均大于0.05,均符合HW遗传平衡。(有附件)

步骤二、分析前将协变量进行分类,并用KS法检验连续变量正态性,结果如下: 正态性连续变量 非正态连续变量 分类变量 ALT CR eGFR-A AST BMI HBeAg 年龄 eGFR 年龄-A 药物浓度 ADV合用

常用元器件的标识与检测方法

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常用元器件

一、电阻

电阻在电路中用“R”加数字表示,如:R1表示编号为1的电阻。电阻在电路中的主要作用为分流、限流、分压、偏置等。

1、参数识别:

电阻的单位为欧姆(Ω),倍率单位有:千欧(KΩ),兆欧(MΩ)等。换算方法是:1兆欧=1000千欧=1000000欧

电阻的参数标注方法有3种,即直标法、色标法和数标法。

数标法主要用于贴片等小体积的电路,如:

472 表示 47×100Ω(即4.7K); 104则表示100K

色环标注法使用最多

2、色环电阻的识别:

(1)四色环电阻:

第一色环是十位数,第二色环是个位数,色环是应乘颜色次幂颜色次,第四色环是误差率

例如:棕 红 红 金

其阻值为12×10^2=1.2K 误差为±5%

误差表示电阻数值,在标准值1200上下波动(5%×1200)都表示此电阻是可以接受的,即在1140-1260之间都是好的电阻。

(2)五色环电阻:

第一色环是百位数,第二色环是十位数,三色环是个位数,第四色环是应乘颜色次幂颜色次,五色环是误差率。

例如:红 红 黑 棕 金

五色环电阻最后一环为误差,前三环数值乘以第四环的10颜色次幂颜色次,其电阻为 220×10^1=2.2K 误差为±5%

药物晶型常用的检测分析方法

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文档参考了相关资料,加以完整。

药物晶型常用的检测分析方法

物质在结晶时由于受各种因素影响,使分子内或分子间键合方式发生改变,致使分子或原子在晶格空间排列不同,形成不同的晶体结构。同一物质具有两种或两种以上的空间排列和晶胞参数,形成多种晶型的现象称为多晶现象(polymorphism)。虽然在一定的温度和压力下,只有一种晶型在热力学上是稳定的,但由于从亚稳态转变为稳态的过程通常非常缓慢,因此许多结晶药物都存在多晶现象。固体多晶型包括构象型多晶型、构型型多晶型、色多晶型和假多晶型。物质在结晶时由于受各种因素影响,使分子内或分子间键合方式发生改变,致使分子或原子在晶格空间排列不同,形成不同的晶体结构。同一物质具有两种或两种以上的空间排列和晶胞参数,形成多种晶型的现象称为多晶现象(polymorphism)。虽然在一定的温度和压力下,只有一种晶型在热力学上是稳定的,但由于从亚稳态转变为稳态的过程通常非常缓慢,因此许多结晶药物都存在多晶现象。固体多晶型包括构象型多晶型、构型型多晶型、色多晶型和假多晶型。

药物分子通常有不同的固体形态,包括盐类,多晶,共晶,无定形,水合物和溶剂合物;同一药物分子的不同晶型,在晶体结构,稳定性,可生产性和生物利用度等性质方面可

流式细胞仪常用的几种检测方法

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1) 4) 2 1) 流式细胞仪常用的几种检测方法(转载)

一、测定用乙醇固定的DNA的含量 1、培养细胞的DNA含量的测定 制备单细胞悬液于200μl的PBS缓冲液中;

加入2ml预冷的70%乙醇,4℃保存;

附:细胞固定的一般步骤

取单细胞悬液1~2×106个细胞于PBS(PH=7.2)缓冲液中;

2) 300g离心5分钟,弃上清,反复两次; 3) 重悬细胞于0.5ml PBS缓冲液中;

将细胞悬液放置于2~3ml冷70%乙醇中,混匀,保存于4℃,至少30分

钟。在4℃条件下可保存2~3周。

注意:

2 根据实验的要求,固定剂也可选用1~3%多聚甲醛; 2 将乙醇作为固定剂时,乙醇应预冷至0~4℃;

细胞在固定时,固定剂应缓慢滴入细胞悬液中,使固定剂的浓度缓慢增加,

并不断震摇,以免细胞成团(特别是用乙醇固定时)。 2 300g离心5分钟,去上清,再重悬于400μl PBS中; 2 显微镜下观察,若有明显的黏附,须再用筛网过滤;

2 加入PI(含Rnase),避光孵育30分钟;

2 上机检测。 2、新鲜组织的DNA

SNP分析命令

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E:\\ > cd e: E:\\

E:\\ > cd plink-1

E:\\plink-1>plink –file test 1. Map 更新

Plink --sheep --file data --update-map position.txt --recode --out data1

Chrnew.txt -- update-chr --recode --out data2 Position: SNP code and position Chrnew:SNP code and Chr. 2.SNP merge

Plink --file data1 --merge data2.ped data2.map --recode --out merge 3.提取SNP位点

Plink --file data --extract 50kSNP.txt --recode --out data1 50kSNP.txt: 50k中的SNP名 4. Quality control

Call rate >98%/99%

Plink --file sheep --geno 0.02 --r

SNP分析命令

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E:\\ > cd e: E:\\

E:\\ > cd plink-1

E:\\plink-1>plink –file test 1. Map 更新

Plink --sheep --file data --update-map position.txt --recode --out data1

Chrnew.txt -- update-chr --recode --out data2 Position: SNP code and position Chrnew:SNP code and Chr. 2.SNP merge

Plink --file data1 --merge data2.ped data2.map --recode --out merge 3.提取SNP位点

Plink --file data --extract 50kSNP.txt --recode --out data1 50kSNP.txt: 50k中的SNP名 4. Quality control

Call rate >98%/99%

Plink --file sheep --geno 0.02 --r