重组质粒的筛选和鉴定方法
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重组质粒的构建、转化、筛选和鉴定
重组质粒的构建、转化、筛选和鉴定
实验目的:
1. 学习在实现DNA体外重组过程中,正确选择合适的载体和限制性内切酶并能对限制性核
酸内切酶对载体和目的DNA进行切割,产生利于连接的合适末端。
2. 学习设计构建重组DNA分子的基本方法,掌握载体和外源目的DNA酶切的操作。 3. 学习利用T4DNA连接酶把酶切后的载体片段和外源目的DNA片段连接起来,构建体外DNA
分子的技术,了解并掌握几种常用的连接方式。 4. 掌握利用Cacl2 感受态细胞的方法。
5. 学习掌握热击法转化E.coli的原理和方法。
6. 掌握α互补筛选法和PCR检测法筛选重组子的方法。并鉴定体外导入目的DNA片段的大
小。
7. 学习和掌握PCR反应的基本原理和操作技术,了解引物设计的基本要求。
实验原理:
外源DNA与载体分子的连接即为DNA重组技术,这样重新组合的DNA分子叫做重组子。重组的DNA分子式在DNA连接酶的作用下,有Mg2+、ATP存在的连接缓冲系统中,将分别经限制性内切酶酶切的载体分子和外源DNA分子连接起来。将重组质粒导入感受态细胞中,将转化后的细胞在选择性培养基中培养,可以通过α互补筛选法筛选出重组子,并可通过酶切电泳及PCR检验的方法进行重组子的
重组质粒的构建转化筛选和鉴定(2)
DNA的酶切、连接、转化和重组子的筛选与鉴定
摘要
本实验通为了验证重组质粒的类型,进行了如下实验:PUC19的单酶切、连接、转化、重组子的筛选与鉴定、转化子的菌落PCR、平板复证、琼脂糖凝胶电泳等。所用的酶有Hind Ⅲ核酸内切酶,T4连接酶和Taq酶。由于Hind Ⅲ单酶切质粒产生的片段多样,需要通过一系列的筛选、副证与电泳鉴定来最终确定酶切片段的类型。
关键字 酶切 连接 转化 重组子琼脂糖凝胶电泳
引言
重组DNA技术是指将一种生物体(供体)的基因与载体在体外进行拼接重组,然后转入另一种生物体(受体)内,使之按照人们的意愿稳定遗传并表达出新产物或新性状的DNA体外操作程序,也称为分子克隆技术。因此,供体、受体、载体是重组DNA技术的三大基本元件。本实验的供体是λ DNA,受体是E.coliDH5α,载体是PUC19。
DNA的酶切通常是DNA重组技术的第一步,酶切是指将不同来源的DNA上将待克隆的DNA片段特异性切下,同时在载体DNA分子(一般为质粒DNA)上打开相应的缺口,然后将两者连接成重组DNA分子。这一特异性的切割过程常由特定的限制性核酸内切酶来完成。目前在细菌中发现有600多种限制性核酸内切酶,根据其性质的不同可分为三大类
重组质粒的转化(转菌)
重组质粒的转化
重组质粒的转化(热休克法)
本方案不仅适合于转化连接体系,同样适合于转化已有的质粒(一般1~2μl质粒即可)。 本流程以α-互补鉴定为例。适用于含有?-半乳糖苷酶基因(LacZ)的载体(如T载体),载体含有LacZ的调控序列和头146个氨基酸的编码信息。不能使用α-互补鉴定的载体可以使用含相应抗生素的平板鉴定(即直接使用LB/Amp或LB/Kana等,不用加IPTG/X-Gal)。
㈠试剂及材料:
1. IPTG溶液(异丙基硫代-?-D-半乳糖苷,200mg/ml): 2g IPTG溶于8ml双蒸去离子水中,用双蒸去离子水调节体积至10ml,0.22um滤器过滤除菌,分装1ml/管,-20℃保存。 2. X-Gal(5-溴-4氯-3吲哚-?-D-半乳糖苷):已购入,铝箔纸包裹避光,-20℃保存。 3. LB液体培养基(无抗生素)。
4. 含有ampicillin/IPTG/X-Gal的LB培养板(LB/Amp/IPTG/X-Gal): 在含有ampicillin的LB培养板表面加入4μl 200mg/ml IPTG和16μl 50mg/ml X-Gal,用无菌玻璃涂布器均匀涂布平板表面,37℃×30min可完全吸收,即可使用。
重组质粒的酶切和PCR验证-郑小煜
重组质粒的酶切和PCR验证
姓名:郑小煜
学号:201100140069 班级:11级生物技术班 同组者:赵莉、高瑞
【实验目的】
1、 检验重组质粒的插入片段的大小
2、 学习和掌握PCR反应的基本原理和实验技术。
【实验原理】
(一) 重组质粒酶切鉴定
将含有外源DNA的转化子的E.coliDH5α菌株进行培养,并用试剂盒提取其质粒DNA,将所提取的DNA用切pUC19质粒的同一种限制性内切酶进行切割以验证所插入的外源DNA的大小。 (二) 引物设计
1、引物
体内,引物是一段与模板DNA互补的RNA单链
体外PCR反应中,引物是人工合成的两段寡核苷酸序列,分别与靶DNA模板的两端互补,从而界定了产物的范围
引物能否与靶DNA特异结合,决定了PCR的特异性;引物能否被DNA聚合酶有效延伸,决定了PCR的灵敏性。
2、引物设计原则
长度:15-30nt,longPCR或某些特殊的PCR需使用较长的引物。 碱基分布:随机分布,同一碱基不应连续出现超过4次。 GC含量:一般40-60%。太低会导致引物Tm值较低,不利于PCR的特异性;太高则不利于引物结合,亦能引发非特异扩增。→Tm值(55℃-65℃)过低,PCR特异性低;过高,PCR效率低,
利用不同的方法筛选与鉴定转化子
利用不同的方法筛选与鉴定转化子
院系: 生命科学学院
专业:生物工程
班级:10生物工程一班
姓名: 周伟竞
学号:1014200006
摘要 本文通过蓝白斑筛选、菌落直接PCR、提质粒进行PCR、酶切鉴定的实验
方法,通过α-互补筛选(蓝白斑)从转化子中筛选重组子,由于pET32-CaM5 Vector上带有lacZ基因,因此可以通过菌落直接PCR的分子鉴定,可以鉴定细菌中有没有转入外源DNA;然后再挑取单菌落进行培养、提取质粒,通过凝胶电泳观察质粒的大小;最后用限制性内切酶切割大小符合的质粒,电泳观察酶切片段的大小是否与预期的一致。
关键词 菌落直接PCR 提质粒 酶切 鉴定
前言
通过本次的一系列实验操作,目的是为了能够筛选出含有pET32-CaM5质
粒的大肠杆菌DH5α,并进行鉴定该转化子。质粒具有稳定可靠和操作简便的优点,若要克隆较小的DNA片段(<10kb)且结构简单,则质粒是最好使用的了。因为在实际操作过程中,用重组质粒转化的大肠杆菌DH5α的量少,连接产物没有也不可能在经过分离纯化而获得纯的重组质粒,连接产物中混有载体自连而成的空载体、载体与目的片段连接而成的目的重组质粒和载体与非目的片段连接而成的非目的重组质粒。同时,宿主的转化效率极低,因此,绝大部分宿主是没有被转化的,所以很有必要对转化产物进行筛选与鉴定。 二、摘要:
利用含有抗性的培养基从转化后代中筛选出转化子。因为不含有pET32-CaM5质粒的大肠杆菌DH5α是不能再含有抗生素的培养基上生长的,而含有重组质粒的细菌则能够在该培养基上生长,采用A mp抗性筛选,所以就
质粒DNA的提取、纯化与鉴定 - 图文
山东大学实验报告
姓名 宿智新 学院 生命科学学院 班级 11级生工2班 科目 分子生物学实验 学号 201100140155 第 8 组
质粒DNA的提取、纯化与鉴定
摘要:本实验利用碱变法从大肠杆菌DH5?(E.coli DH5?)中提取pUC19质粒,旨在学习并掌握质粒DNA提取的原理、纯化和检测方法及琼脂糖凝胶电泳技术。同时通过对质粒DNA的提取、纯化过程及电泳图谱的分析,探讨碱变法提取高质量质粒DNA的关键步骤及影响所提质粒纯度和量的相关因子。 关键词:碱变法 质粒 电泳 实验目的:
1. 学习并掌握凝胶电泳进行DNA的分离纯化的实验原理。 2. 学习并掌握凝胶的制备及电泳方法。 3. 学习并掌握凝胶中DNA的分离纯化方法。 4. 掌握碱变性提取发的原理及各种试剂的作用。 5. 掌握碱变性法提取质粒DNA的方法。 实验原理:
1. 质粒DNA的提取——碱变性提取法:
提取和纯化质粒DNA的方法很多,目前常用的有:碱变性提取法、煮沸法、羟基磷灰石柱层析法、EB-氯化铯密度梯度
转染细胞的稳定筛选方法和实验步骤
转染细胞的稳定筛选 1、药物筛选前的准备
药筛前应确定药物筛选浓度,不同细胞系具有不同的药物敏感度,因此在筛选前应该用在药物浓度范围内设定浓度梯度来确定筛选稳定克隆的药物浓度。药物浓度一般确定为能使未转染细胞在7天之内全部死亡,如G418一般需要7天,而puro一般时间很短,只需要3-4天即可。 2、药物筛选注意事项 (1)药筛的时间
加药时间一般为转染后48h。但由于慢病毒表达较慢,因此利用慢病毒感染将质粒转入细胞的方法,加药时间一般为72h 空白对照
加药筛选时,最好设置空白对照,即未转染细胞同时加药,待空白对照中细胞全部死亡,转染组中不具有抗药性的细胞基本药杀完,但还需继续加药。 (2)换液
如果加药后,细胞死亡较多,需及时换液,以防死细胞释放有害物质导致具有抗药性的细胞死亡。另外,随着细胞的代谢,抗生素的活性会降低,因此,每隔3-5天应更换一次抗生素筛选培养液。 3、克隆筛选注意事项
若转染的质粒带有荧光标记,不管是以下哪种筛选克隆的方法,都应该选择带有荧光较强的细胞克隆,因为加药筛选时,可能会产生耐药性的细胞,因此最好选择带有荧光较强的细胞。若是转染的质粒不带有荧光,那么只能盲挑。不管是带有或者不带有荧光标记,都应该挑出克隆
碱裂解法提取质粒DNA和质粒DNA的纯化
实验一、碱裂解法提取质粒DNA和质粒DNA的纯化
一、实验目的
学习并掌握基因工程操作技术中最常用的载体质粒DNA的提取方法和进一步的纯化技术。
二、实验原理
在碱性溶液中,双链DNA氢键断裂,DNA双螺旋结构遭破坏而发生变性,但由于质粒DNA分子量相对较小,且呈环状超螺旋结构,即使在高碱性pH条件下,两条互补链也不会充分分离,当加入中和缓冲液时,变性质粒DNA又恢复到原来的够型;而线性的大分子量细菌染色体DNA则不能复性,与细胞碎片、蛋白质、SDS等形成不溶物,通过离心沉淀可被除去,而质粒DNA及小分子量的RNA则留在上清液中。混杂的RNA可用RNaseA酶消除,再用酚/氯仿处理,可除去残留的蛋白质,达到纯化质粒DNA的目的。
三、实验材料
大肠杆菌DH5α(含重组了约800bp DNA片断的pMD18-T质粒,Amp抗性)
四、实验仪器、用具
高压灭菌锅、超净工作台、恒温摇床、台式离心机、涡旋振动器、培养管、移液器、离心管、吸管头、量筒、紫外观测仪
五、实验试剂
LB培养基、3mol/L醋酸钠(pH5.2)、TE缓冲液(pH8.0)、无水乙醇、75%乙醇、RNaseA(10mg/ml)、goldview DNA染色剂、氯仿、琼脂糖 抽提质粒DNA所需的溶液:
拟南芥突变体的筛选与鉴定综述
本科生文献综述
题 目
拟南芥突变体的筛选综述
系 别
林学与园艺学院
班 级
姓 名
园艺102班
唐辉
学 号 103231228
答辩时间 年 月
新疆农业大学 林园 学院
拟南芥突变体的筛选综述
唐辉 指导老师:王燕凌
摘要:本文归纳了拟南芥抗旱、抗氧化、耐低钾、耐硒、耐盐、晚花突变体筛选的研究内容。在拟南芥抗旱突变体筛选中将用到甘露醇模拟干旱胁迫来进行试验。在抗氧化、耐低钾、耐硒中将用到Na2SeO3、钾、硒、NaCl等化合物或者化学元素对拟南芥突变体的生长发育影响来进行拟南芥突变体的筛选。概括了拟南芥突变体在甘露醇模拟干旱中的生长影响以及
芽孢杆菌营养缺陷型的筛选检出与鉴定
实验二、芽孢杆菌氨基酸营养缺陷型菌株的筛选、检出与鉴定
一、实验目的
掌握各种培养基的配制方法;
理解选育营养缺陷突变株的选育原理;
掌握细菌氨基酸营养缺陷型的诱变、筛选与鉴定方法; 获得芽孢杆菌氨基酸营养缺陷型菌株并对其鉴定。 二、实验原理
营养缺陷型是指野生型菌株由于基因突变,致使细胞合成途径出现某些缺陷,丧失合成某些物质的能力,必须在基本培养基中外源补加该营养物质,才能正常生长的一类突变菌株。其本质是一种减低或消除末端产物浓度,以解除反馈控制的代谢调控中间产物或分支合成途径中末端产物得以积累。营养缺陷型菌株广泛应用于氨基酸、核苷酸、维生素的生产中。也广泛应用于基因定位、杂交及基因重组等研究中的遗传标记制作。
筛选营养缺陷型菌株一般具有四个环节:诱变处理、淘汰野生型、营养缺陷型的检出、
[1]
鉴定缺陷型。
1.诱变处理
基因突变可分为自发突变和诱发突变,许多物理、化学、生物因素对微生物都有诱变作用,这些能使突变率提高到自发突变水平以上的因素称为诱变剂,对于氨基酸营养缺陷型的诱变常选用亚硝基胍。
亚硝基胍(NTG,N-甲基-N-硝基-亚硝基胍)为诱变剂,在低致死率的情况下又很强的诱变作用,有超诱变剂之称。在碱性时NTG 能形成重氮甲烷(CH