miRNA研究热点

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miRNA研究方法

标签:文库时间:2024-09-14
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miRNA研究方法

尽管早在1993年,科学家就发现了第一个microRNA,但直到2003年以后,这种小RNA分子的大作用才不断被发现。研究显示:miRNA通过与转录本的相互作用,关闭或抑制基因的表达,影响了30%的基因。miRNA在多个组织中,例如正常和肿瘤组织中差异表达。因此,通过表达谱分析寻找疾病相关miRNA并进行发病机理研究,最终应用于肿瘤诊断和治疗,已经成为目前miRNA研究的重要方向。在研究中,从深度测序、miRNA芯片到通过导入化学合成的mimics/antagomirs等实现miRNA过表达和抑制,都是研究中常用的方法。同时,在miRNA研究中,生物信息学分析扮演着越来越重要的角色。

下表介绍了miRNA研究和应用中科学家关注的主要科学问题以及目前常用的研究方法。

miRNA主要研究技术

深度测序 抽提分离小分子(例如18-30nt)RNA,通过RT-PCR扩增之后,利用solexa深度测序,并进行生物信息学分析,获得miRNA表达谱。深度测序结合生物信息学分析手段,可以对海量数据进行分析,分别统计出已知的miRNA(miRNA-known)、新的miRNA(miRNA-new)以及可能的新miRNA(miRNA-cadida

使用siRNA、miRNA mimic 、pre-miRNA进行miRNA 生物学功能研究的

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已有文献报道表明,等量的miRNA mimics 和pre-miRNA 进入体外或体内时,pre-miRNA能更特异地且高效的形成mature miRNA,并表现出更高的生物学活性。鉴于pre-miRNA 具有高效、低细胞毒性的特点,我们合成了pre-miR-21 和miRNA mimic,以相同剂量转染细胞,然后用RT-PCR 检测miRNA-21 成熟体的形成。试验结果表明效果远优于mimics,因此pre-miRNA在系统多因素的研究中具备其更独特的优势!

使用siRNA、miRNA mimic 、pre-miRNA进行miRNA 生物学功能研究的区别

Frank 20120715

miRNA是一类大小约为22个碱基的小RNA分子。它们在转录后阶段对基因表达进行调控。调控机制是通过与靶基因的mRNA互补序列结合,抑制蛋白质的 翻译或降低mRNA的稳

定性,从而抑制靶基因的表达。科研人员已逐步认识到miRNA在细胞的发育,分化,生长等生命活动中起着非常重要的调控作用,因此越来越多的科研人员把目光聚焦到这一领域,并期待能一窥miRNA的科学奥妙。

成熟的miRNA是由较长的初级转录物经过一系列核酸酶的剪切加工而产生的,初级转录物称为pri-miRN

使用siRNA、miRNA mimic 、pre-miRNA进行miRNA 生物学功能研究的区别

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已有文献报道表明,等量的miRNA mimics 和pre-miRNA 进入体外或体内时,pre-miRNA能更特异地且高效的形成mature miRNA,并表现出更高的生物学活性。鉴于pre-miRNA 具有高效、低细胞毒性的特点,我们合成了pre-miR-21 和miRNA mimic,以相同剂量转染细胞,然后用RT-PCR 检测miRNA-21 成熟体的形成。试验结果表明效果远优于mimics,因此pre-miRNA在系统多因素的研究中具备其更独特的优势!

使用siRNA、miRNA mimic 、pre-miRNA进行miRNA 生物学功能研究的区别

Frank 20120715

miRNA是一类大小约为22个碱基的小RNA分子。它们在转录后阶段对基因表达进行调控。调控机制是通过与靶基因的mRNA互补序列结合,抑制蛋白质的 翻译或降低mRNA的稳

定性,从而抑制靶基因的表达。科研人员已逐步认识到miRNA在细胞的发育,分化,生长等生命活动中起着非常重要的调控作用,因此越来越多的科研人员把目光聚焦到这一领域,并期待能一窥miRNA的科学奥妙。

成熟的miRNA是由较长的初级转录物经过一系列核酸酶的剪切加工而产生的,初级转录物称为pri-miRN

miRNA与肿瘤研究进展 - 图文

标签:文库时间:2024-09-14
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分子生物学进展综述

miRNA与肿瘤的研究进展

摘要 微小RNA(miRNA)是一类长约22 nt 的非编码单链RNA,由前体经酶作用而得,它是细胞的内源性物质,普遍存在于动植物中,高度保守。miRNA参与早期胚胎发育、细胞增殖与凋亡、细胞分化、脂肪代谢等一系列重要的生命活动。近几年的许多研究表明miRNA与肿瘤的发生关系密切。本文主要就miRNA简介及其与肿瘤的关系作一简要综述。

关键字 miRNA;肿瘤;进展

Research progress of the relationship between

miRNA and cancer

[Abstract] MicroRNAs (miRNAs) is a class of non-protein coding single-stranded small molecular RNA with a size of about 22 bases,which is cut by the enzyme from the precursor.It is Highly conserved cell endogenous substances. miRNAs involve tum

miRNA与肿瘤研究进展 - 图文

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分子生物学进展综述

miRNA与肿瘤的研究进展

摘要 微小RNA(miRNA)是一类长约22 nt 的非编码单链RNA,由前体经酶作用而得,它是细胞的内源性物质,普遍存在于动植物中,高度保守。miRNA参与早期胚胎发育、细胞增殖与凋亡、细胞分化、脂肪代谢等一系列重要的生命活动。近几年的许多研究表明miRNA与肿瘤的发生关系密切。本文主要就miRNA简介及其与肿瘤的关系作一简要综述。

关键字 miRNA;肿瘤;进展

Research progress of the relationship between

miRNA and cancer

[Abstract] MicroRNAs (miRNAs) is a class of non-protein coding single-stranded small molecular RNA with a size of about 22 bases,which is cut by the enzyme from the precursor.It is Highly conserved cell endogenous substances. miRNAs involve tum

miRNA与肿瘤研究进展 - 图文

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分子生物学进展综述

miRNA与肿瘤的研究进展

摘要 微小RNA(miRNA)是一类长约22 nt 的非编码单链RNA,由前体经酶作用而得,它是细胞的内源性物质,普遍存在于动植物中,高度保守。miRNA参与早期胚胎发育、细胞增殖与凋亡、细胞分化、脂肪代谢等一系列重要的生命活动。近几年的许多研究表明miRNA与肿瘤的发生关系密切。本文主要就miRNA简介及其与肿瘤的关系作一简要综述。

关键字 miRNA;肿瘤;进展

Research progress of the relationship between

miRNA and cancer

[Abstract] MicroRNAs (miRNAs) is a class of non-protein coding single-stranded small molecular RNA with a size of about 22 bases,which is cut by the enzyme from the precursor.It is Highly conserved cell endogenous substances. miRNAs involve tum

miRNA与肺癌关系的研究进展

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东南国防医药 2 0 1 4年1月第 1 6卷第 1期

M i l i t a r y M e d i c a 1 J o u n r a l o f S o u t h e a s t C h i n a, V o 1 . 1 6, N o . 1, J a n . 2 0 1 4

7 3

m i R N A与肺癌关系的研究进展许德兵,吴凌云综述,宋勇 审校

[摘要] m i R N A是一类长约 2 1~ 2 5个核苷酸的小分子非编码 R N A,能调节转录后靶基因的表达,它在机体内对生长发

育、细胞繁殖、代谢、凋亡等生理过程发挥着重要作用。mi R N A具有癌基因或抑癌基因的双重作用,其表达水平的变化与肿瘤形成密切相关。肺癌是危害人类健康的恶性肿瘤之一,由于常常不能及时诊断,大部分肺癌患者发现时多已经是晚期,因而预后较差。近年来, mi R N A与肺癌的关系备受关注。 [关键词]肺癌; mi R N A;诊断[中图分类号] R 6 0 5 . 9 7 [文献标志码] A d o i: 1 0 . 3 9 6 9/ j . i s s n . 1 6 7 2— 2 7 1 X . 2 0 1 4 . 0 1 . 0 2 4

Human miRNA PCR Array

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Human Brain Cancer miRNA PCR Array: MIHS-108Z

Anaplastic Astrocytoma: miR-107, miR-10b-5p, miR-124-3p, miR-125b-5p, miR-127-5p, miR-129-5p, miR-137, miR-138-5p, miR-187-3p, miR-203a, miR-218-5p, miR-296-5p,

miR-31-5p, miR-320a, miR-7-5p.

Glioblastoma: miR-101-3p, miR-107, miR-10b-5p, miR-124-3p, miR-128, miR-129-5p, miR-130a-3p, miR-132-3p, miR-133a, miR-133b, miR-137, miR-138-5p, miR-149-5p, miR-153, miR-16-5p, miR-181a-5p, miR-181b-5p, miR-185-5p, miR-187-3p, miR-191-5p, miR-203a, miR-21-5p, miR-210, miR-218-5p, miR-221-

miRNA实验技术及与肿瘤关系研究进展

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miRNA实验技术及与肿瘤关系研究进展 The Research Progress of miRNA experimental

technique and carcinoma

摘要 miRNA是一类新近发现的内源性非蛋白编码的单链小分子RNA,长度

约为20-25 nt,广泛存在于真核生物中。在人类已发现的300多个miRNA中有许多与肿瘤的发生有着密切的关系,研究人员通过实验手段和生物信息学方法研究了一些miRNA与肿瘤的关系,以期望寻找到治疗肿瘤的新方法。

关键词:miRNA;肿瘤; miRNA抑制;miRNA过表达;生物信息学 1.miRNA概述

miRNA是一类新近发现的内源性非蛋白编码的单链小分子RNA,长度约为20-25 nt,广泛存在于真核生物中,进化上相对保守,具有时序性和组织特异性。1993年 Lee等[1]在对秀丽新小杆线虫(C-elegans)进行突变体的遗传分析中首次发现非编码蛋白质能时序调控其胚胎后期发育基因表达的RNA:Lin-4。2000

[2]年Reinhart 在线虫中发现了另一种重要的具有转录后调节作用的miRNA:let-7,

从而拉开了miRNA的研究序幕。成熟的miRNA在5’端有-HP0

miRNA相关分析网站

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miRNA数据库及靶基因分析软件 1.miRBase: http://www.mirbase.org

miRBase序列数据库是一个提供包括已发表的miRNA序列数据、注释、预测基因靶标等信息的全方位数据库,是存储miRNA信息最主要的公共数据库之一。miRBase提供便捷的网上查询服务,允许用户使用关键词或序列在线搜索已知的miRNA和靶标信息。

2.miRecords: http://mirecords.biolead.org/

动物 mirna的靶相互作用的数据库, 包括人工收集实验验证的, 预测的 miRNA的靶目标. 靶标预测工具DIANA-microT, MicroInspector, miRanda, MirTarget2, miTarget,

NBmiRTar,

PicTar,

PITA,

RNA22,

RNAhybrid,

and

TargetScan/TargertScanS.

3.PMRD: http://BioInformatics.cau.edu.cn/PMRD/ PMRD是一个关于植物microRNA数据库,包括了microRNA序列和它们的靶基因、二级结构、表达谱、基因组搜索等等,并且该数据库尝试着整合大量的关于