MEGA软件内部设置
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MEGA软件的使用
MEGA软件的使用
Mega是一款操作十分简便的遗传学分析软件,其界面十分友好,即使初学者也很易上手。
1、数据的录入及编辑
Mega软件能够接受多种数据格式,如FASTA格式、Phylip格式、PAUP数据格式等等。而且Mega软件专门提供了把其他格式的数据转换位Mega数据格式的程序。
首先,打开Mega程序,有如下图所示的操作界面:
单击工具栏中的“File”按钮,会出现如下图所示的菜单:
从上图可以看出,下拉菜单有“Open Data”(打开数据)、“Reopen Data”(打开曾经打开的数据,一般会保留新近打开的几个数据)、“Close Data”(关闭数据)、“Export Data”(导出数据)、“Conver To MEGA Format”(将数据转化为MEGA格式)、“Text Editor”(数据文本编辑)、“Printer Setup”(启动打印)、“Exit”(退出MEGA程序)。单击“Open Data”选项,会弹出如下菜单:
浏览文件,选择要分析的数据打开,单击“打开”按钮,会弹出如下操作界面:
此程序操作界面,提供了三种选择数据选择:Nucleotide Sequences(核苷酸序列)、Protein Seq
Mega软件的使用1 - 图文
MEGA软件的使用
Mega软件输入数据的格式
Mega软件输入数据的格式比较简单,在众多遗传学分析软件中是比较容易制作的一种。
首先,如果输入数据是一般的DNA或RNA序列,则有如下要求:1)文件扩展名以*.meg或*.txt结尾都行;2)输入数据文件,第一行必须有Mega程序所需的特殊标记“#MEGA”;3)“TITLE”位于输入文件的第二行,后边可以跟上一些说明性字符,这些字符在输出结果中会显示出来。在与“Title”同一行上的字符才有效,而且字符总数不能超过128,超过的也会被忽略。4)在“#MEGA”和“TITLE”之后,在分析数据之前可以一行或多行的说明性文字。这些文字可用来说明诸如作者、分析日期、分析目的等信息。5)在每个数据(或每条序列)的名字之前应该有一个“#”,名字的下一行是具体的序列。在同一个数据文件里,不能出现数据名相同的序列。在数据名及具体序列中,空格和TAB是被忽略的。6)在同一数据文件内,所有序列的长度应该保持一致,否则,程序不能执行。 7)对于DNA或RNA序列,Mega软件能够识别A、T、C、G、U五种字符,缺失字符可以用“?”表示,比对时的空缺位点可以用“—”表示。下边是一个数据文件示例:
Fig
Mega软件的使用1 - 图文
MEGA软件的使用
Mega软件输入数据的格式
Mega软件输入数据的格式比较简单,在众多遗传学分析软件中是比较容易制作的一种。
首先,如果输入数据是一般的DNA或RNA序列,则有如下要求:1)文件扩展名以*.meg或*.txt结尾都行;2)输入数据文件,第一行必须有Mega程序所需的特殊标记“#MEGA”;3)“TITLE”位于输入文件的第二行,后边可以跟上一些说明性字符,这些字符在输出结果中会显示出来。在与“Title”同一行上的字符才有效,而且字符总数不能超过128,超过的也会被忽略。4)在“#MEGA”和“TITLE”之后,在分析数据之前可以一行或多行的说明性文字。这些文字可用来说明诸如作者、分析日期、分析目的等信息。5)在每个数据(或每条序列)的名字之前应该有一个“#”,名字的下一行是具体的序列。在同一个数据文件里,不能出现数据名相同的序列。在数据名及具体序列中,空格和TAB是被忽略的。6)在同一数据文件内,所有序列的长度应该保持一致,否则,程序不能执行。 7)对于DNA或RNA序列,Mega软件能够识别A、T、C、G、U五种字符,缺失字符可以用“?”表示,比对时的空缺位点可以用“—”表示。下边是一个数据文件示例:
Fig
进化树软件MEGA最新6.06说明书
MEGA 6.06的简易使用指南
第一步:打开软件
下面介绍菜单的使用:
Data菜单:
Creat a new :创建一个新的数据比对文件,也就是说当我们比对完一组后,想接着
比对另一组,那么使用它就可以不用退出直接把数据文件导入;
Open :打开先前已经比对并保存好的文件,它包含两个子菜单: retive sequence
from file 和saved aligment session ;
Close: 关闭当前的比对数据文件;
MEGA 6.06的简易使用指南
Save session :保存当前比对结果,可以给比对的结果一个文件名;
Export alignment :将当前的序列比对结果输出到指定文件,有两种输入格式可供选
择:MGTA 和FASTA.
DNA sequence :使用它来选择输入的数据 DNA 序列,这里需要说明的是如果你输入的
数据是氨基酸序列的话,比对窗口只显示一个标签,若是 DNA 序列的话则显示两个标
签,一个是 DNA 序列的,另一个是氨基酸序列的。
Protein sequences :选择输入的氨基酸序列,选择后,所以的位点就被当作氨基酸残
基位点来对待。
Translate/untranslate :只有比对的序列是
用友软件打印设置
用友软件凭证帐簿打印设置
打印机介绍 非套打设置 套打设置 套打窍门
1、针式打印机---连续纸型 2、激光打印机---非连续纸型 3、喷墨打印机 4、激光喷墨一体机品牌:针式分宽窄行,EPSON AR-star 激光喷墨分A4和A3, hp canon
A4或其他非连续纸张,打印凭证或帐簿的样式一 般不需改动,只需根据打印效果调整边距。 如何修改凭证非套打模板 如何设置非套打模式下的帐薄打印式样 用特定规格的纸张打印,则需要先根据纸张大小 定义自定义纸张,打印时选择该纸张。如纸张太 小打印不下或太大影响打印效果,可通过UFO简 板来调整凭证模板大小,非套打凭证模板路径: C:\WINNT\system32\UFCOMSQL\glpzje5 非套打帐簿路径: 具体调整方式和UFO报表调整方式一致。
什么是套打? 用友套打纸类型及适用产品 套打设置过程
套打是指将数据与格式分离开,进行分别处理的一 种方式。格式上根据不同业务需求,将表示业务的基础 信息、关键业务流程等信息固化提炼出来,预先印刷。 并同时考虑使用需求、打印性能、存档需要及防伪特性 等一系列问题,以便用规范的结构化的表单对数据与业 务流程进行描述与管理。而数据是按
HP DP备份软件设置
HP DP备份软件设置指南
目录
一、添加客户机 ............................................................................................................................... 2 二、带库的磁带操作与磁带组的建立 ........................................................................................... 5 三、建立文件的备份策略 ............................................................................................................. 10 四、建立ORACLE的备份策略 ...................................................................................................... 15 五、文件的恢复操作 ......
HP DP备份软件设置
HP DP备份软件设置指南
目录
一、添加客户机 ............................................................................................................................... 2 二、带库的磁带操作与磁带组的建立 ........................................................................................... 5 三、建立文件的备份策略 ............................................................................................................. 10 四、建立ORACLE的备份策略 ...................................................................................................... 15 五、文件的恢复操作 ......
排队机软件设置 - 图文
智能排队管理系统
排队管理系统硬件使用手册排队机用户手册智能排队管理系统
排队管理系统使用手册(version2.0)1
1
智能排队管理系统
目 录
第一章 排队叫号系统安装.................................................................................................................................................... 6 1.1 准备工作 .......................................................................................................................................
中控机软件设置手册
网络中央控制系统设置手册
WISE网络中央控制系统设
置程序使用手册
北京华讯博通科技发展有限公司
第 1 页 共 50 页
网络中央控制系统设置手册
目 录
1 2 3
、概述.............................................................................................................................................. 3 、运行环境 ...................................................................................................................................... 3 、安装和卸载 .................................................................................................................................. 3 3.1 、程序安装 .
中控机软件设置手册
网络中央控制系统设置手册
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置程序使用手册
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1 2 3
、概述.............................................................................................................................................. 3 、运行环境 ...................................................................................................................................... 3 、安装和卸载 .................................................................................................................................. 3 3.1 、程序安装 .