中国肿瘤基因图谱计划

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中国人种基因图谱

标签:文库时间:2024-11-20
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中国人种基因图谱

随着分子人类学数据的不断积累,父系Y染色体与母系mtDNA研究的一系列进展,使得中国人群的多样性结构逐渐明晰。现有的Y染色体数据揭示,现代人出非洲后由东南亚经多次迁徙进入东亚。在旧石器时代,现代人最初定居东亚或东南亚之后,紧接着不断北迁,这奠定了中国人遗传结构的基础。通过了解人类基因的遗传成分,绘制中国人种基因图谱。

中国人种基因图谱:一对为性染色体,XY组合的为男性,XX组合的为女性。Y染色体只在父亲与儿子传代,呈严格的父系遗传,研究Y染色体,可以发现人群在父系关系上的迁徙和发展。母系mtDNA表现为母系遗传。通过检测现代人mtDNA,能弄清各民族、各地人的母系血缘关系。通过研究Y-DNA与mtDNA的重合型,可以揭开中国人的祖先来源之谜。

目录

单倍群

人类父系基因Y-DNA 人类母系基因mtDNA Y-DNA与mtDNA的重合型 中国人起源 华夏族的起源与形成

单倍群

在分子进化的研究中,单倍群或单倍型类群是一组类似的单倍型,

它们有一个共同的单核苷酸多态性祖先。因为单倍群由相似的单倍型组成, 所以可以从单倍型来预测单倍群.单核苷酸多态性试验被用来确认单倍型。单倍群以字母来标记,并且以数字和一些字母来做补充,,例如O

肿瘤基因图谱信息提取和分类方法研究

标签:文库时间:2024-11-20
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全国第七届研究生数学建模竞赛

题 目 肿瘤基因图谱信息提取和分类方法研究

摘 要:

本文讨论了肿瘤基因图谱信息提取方法,主要工作是提取结肠癌基因表达谱的特征基因信息,并利用神经网络进行分类识别。

对于问题一、二,本文采用了一种致癌基因信息提取与分类方法,该方法主要由四步构成:(1)利用Bhattacharyya距离法滤除无关基因;(2)采用两两冗余分析,剔除强相关冗余基因;同时,采用主成分分析方法对所选择的基因样本数据进行降维处理,得到样本的主成分量;(3)对特征提取后的基因数据采用四种神经网络(BP神经网络及三种径向基神经网络)进行分类学习,训练获得分类网络模型;(4)采用获得的分类网络模型对测试肿瘤样本进行分类,并采用留一交叉检验法和独立检验法评估四种神经网络分类器性能。结果表明:本文所采用的特征提取方法能有效提出与肿瘤相关的信息基因,选取的特征基因子集包含9个基因,且采用概率神经网络(PNN)的分类识别准确率(77.27%)最高。

对于问题三,采用小波去噪方法消除基因信息采集过程中的随机误差。为最大限度地消除噪声并保证原始数据信息损失最小,本文分别采用db3、db5、sym8、haar等不同小波基进行去噪,通过对概率

肿瘤基因突变检测

标签:文库时间:2024-11-20
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肿瘤基因突变检测

癌症是一类难以预防的疾病,中晚期癌症治愈的可能性又很小,而早期癌症的治愈率可

达65%以上,有些肿瘤可达90%以上,因此,战胜癌症的关键是早期发现癌症。由于癌症

早期常无特殊症状,甚至毫无症状,故癌症的早期发现、早期诊断主要是通过定期健康体检

和人群筛查完成。目前筛查癌症的方法主要是通过化验血肿瘤指标及B超、CT、MRI、PET-CT

等检查,但这些方法的敏感性和特异性均不高,发现有异常时往往已是中晚期。

17种常见高发肿瘤,包括乳腺癌(breast cancer)、结肠癌(colorectalcancer)、子宫癌

(endometrial cancer)、脑胶质瘤(glioma)、白血病(leukemia)、肺癌(lungcancer)、淋巴

癌(lymphoma)、成神经管细胞瘤(medulloblastoma)、黑色素癌(melanoma)、间皮瘤

(mesothelioma) 、多性骨髓瘤(multiple myeloma) 、卵巢癌(ovarian cancer)、胰腺癌(pancreatic

cancer) 、真性红细胞增多(polycythemia vera) 、前列腺癌(prostatecancer) 、肾细胞癌(renal

肿瘤基因检测的解读流程

标签:文库时间:2024-11-20
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范文范例参考

从临床进入基因检测流程是入口,检测结果结合临床信息进行合理解读是出口,这一入一出之间需经历检测前临床咨询部分、实验室部分、信息分析部分、临床解读部分共四个环节。其中的第四部分临床解读部分即是根据检测结果、患者信息、医生共识综合判断,临床和遗传咨询有效衔接、充分沟通,最终出具临床解读报告。

在做成临床解读报告之前,首先需要将解读的各个环节进行明确,包括解读的步骤流程,解读的技术细节。这样才有可能真正的做到解读的规范化,使解读过程有据可依,有章可循,才能出具一份好的临床解读报告,基因检测才能更好的服务患者和临床医生。从大的框架讲,基因检测数据解读可分为三个步骤:原始数据→分析数据、基于数据库的解读→与患者个体表征/临床病例结合的解读。

1、读懂原始数据

将测序的原始序列数据(FASTQ)去除接头及低质量序列,经BWA软件比对至GRCh37/38(NCBI版本)或hg19/hg38(UCSC版本)人类基因组参考序列上,Picard去除重复序列,使用GATK检测SNV与Indel变异,使用ANNOVAR进行变异注释。最后获得一份.vcf文件(图1)。

50个肿瘤核心基因 - 图文

标签:文库时间:2024-11-20
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50个肿瘤核心基因

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ABL1

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全名:Abelson murine leukemia viral oncogene homolog 1。ABL1基因位于第9号染色体上

临床作用:当BRA基因与ABL1基因型成BRA-ABL1融合基因的时候,新的BRA-ABL1融合蛋白就会使细胞的增生脱离细胞因子的控制,细胞癌化 BRA-ABL1融合基因是慢性粒细胞性白血病的一个重要病因

治疗药物:依马替尼(Imatinib mesylate)是针对BRA-ABL1融合基因的抑制剂,也是治疗此种癌症的靶向治疗药物 AKT1

全名:RAC-alpha serine/threonine-protein kinase。位于第14号染色体上。

AKT1是细胞分裂、生长的正调控元件。AKT1可以抑制细胞的凋亡,促进细胞生长在横纹肌实体瘤中有发现AKT1过表达

抑制剂:Selleck公司出品的“MK-2206 2HCl”是一种高度选择性的Akt1/2/3抑制剂。 ALK

全名:Anaplastic lymphoma kinase,位于2号染色体上 功能:ALK在神经发育过程中起重要作用,是正调控元件

与肿瘤的关系:EML4-ALK融合基因占非小细胞肺癌中的3~5%,E

转基因在中国 - 中国转基因现状

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中国转基因作物现状

201013020427杨艳艳

摘要:上世纪八十年代,转基因烟草开始在中国种植,迄今为止,中国已有20年转基因作物种植历史。

当前,全球转基因作物研发和产业化迅猛发展,中国也紧随其后,商业化的转基因作物种植铺展开来。与此同时,公众对转基因作物的质疑不断,公众要求去转基因化的呼声也愈来愈高。转基因作物是否就如专家所说的那样对人体、环境有益而无害?

关键词:转基因作物;中国;现状

21世纪伊始,作为生物革命前沿的转基因农作物日益成为全球化进程中的热点与焦点问。围绕着转基因技术及产品的讨论与争端,诸如进出口贸易、生物安全、食品安全、知识产权等一系列问题,不仅频频出现在科技、经济领域,也成为政治、社会领域中纷争不断的话题。转基因技术被视为一种全球化的生物技术革命,而它在不同的国家,因各自不同的政治体制、社会构成与文化传统,又遭遇不同的市场反映。有着不同的命运。

而在中国,转基因农作物不断遭到质疑。跨国企业的垄断,转基因作物对环境,人类健康的危害等问题一直是人们热议的话题。本文将对转基因作物对中国所带来的一些问题进行探讨。

1 我国已发放安全证书的转基因作物种类

1.1已发放安全证书的转基因作物种类

截至目前为止,我国已为7种转基因

中国淡水鱼类图谱

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中国淡水鱼类图谱

中国淡水鱼的种类

不同时期,不同著作中统计结果差异较大。据最近出版的《中国脊椎动物大全》和正在编印的《中国动物志》粗略统计,分布在中国的淡水(包括沿海河口)的鱼类共有1050种,分属于18目52科294属。其中纯淡水鱼类967种,海河洄游性鱼类15种,河口性鱼类68种。在这一千另五十种鱼类中,大体可分属下列四大类:

1、圆口类:这一类鱼是最原始的鱼形脊椎动物。鱼口没有真正的上下颚,口器形成吸盘,过着寄生或半寄生生活。身上没有真正的脊椎,祗有脊索。从进化的时期而论,圆口类首先发见于中奥陶纪,在志留纪及下泥盆纪最为发达,至下泥盆纪则渐趋绝灭,仅有少数种类遗留至今。在我国淡水中,仅七鳃鳗属的3个种生活于东北地区黑龙江至辽河诸河流中。 2、软骨鱼类:软骨鱼类从上泥盆纪发现,至石炭纪最为发达,随着再继续进化以成为现代的鲨类与鳐类。此类鱼全身骨胳均为软骨,鳞片为细小盾鳞,肠内有螺旋瓣。这是一群低等的真正鱼类,现生软骨鱼类几乎都是生活在海洋中,仅有极个别种类生活于淡水中,其中赤魟除大量生活于海洋外,有一小群体定居于我国广西南宁至龙州的西江水系左江中,从其进化史看,赤魟为海产鱼类。据古地质考证,广西原为海洋,由于地壳的造山运动,

中国农田常见207种杂草图谱

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001 双星藻科 水绵

002 木贼科 问荆

003 木贼科 节节草

004 萍科 萍

005 槐叶萍科 槐叶萍

006 粟米草科 粟米草

007 苋科 空心莲子草

008 苋科 莲子草

009 苋科 凹头苋

010 苋科 反枝苋

011 苋科 刺苋

012 苋科 皱果苋

013 苋科 青葙

014 萝摩科 鹅绒藤

015 萝摩科 地梢瓜

016 萝摩科 萝摩

017 紫草科 斑种草

018 紫草科 麦家公

019 紫草科 附地菜

020 石竹科 蚤缀

021 石竹科 簇生卷耳

022 石竹科 粘毛卷耳

023 石竹科 薄蒴草

024 石竹科 牛繁缕

025 石竹科 米瓦罐

026 石竹科 雀舌草

027 石竹科 繁缕

028 石竹科 王不留行

029 藜科 藜

030 藜科 灰绿藜

031 藜科 小藜

032 藜科 地肤

033 藜科 猪毛菜

034 菊科 胜红蓟

035 菊科 豚草

036 菊科 黄花蒿

037 菊科 猪毛蒿

038 菊科 鬼针草

039 菊科 三叶鬼针草

040 菊科 狼把草

041 菊科 飞廉

042 菊科 大蓟

043 菊科 小蓟

中国移动营销市场公司图谱

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现今从事移动互联网领域的各大知名企业名单

中国移动营销市场公司图谱China Mobile Marketing Market Map应用市场和门户

2012.2.18

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白英抗肿瘤相关基因及信号通路的研究_王文静

标签:文库时间:2024-11-20
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辽宁中医杂志2014年第41卷第9期

·1861·

DOI∶10.13192/j.issn.1000-1719.2014.09.028

白英抗肿瘤相关基因及信号通路的研究

12

王文静,齐元富

(1.山东中医药大学,山东济南250011)山东济南250014;2.山东中医药大学附属医院,

要:白英具有清热利湿、消肿解毒的功效,现代药理学研究表明其具有抗肿瘤、增强免疫、抗氧化等作用。近年

来白英在恶性肿瘤疾病中应用较为广泛,其对肺癌、胃癌、肝癌等有一定的临床疗效。现结合近年来的实验研究就白英

抗肿瘤的相关基因及信号通路作一综述。

关键词:白英;Fas/FasL;Notch;Bcl-2/bax

中图分类号:R285

文献标志码:A

1719(2014)09-1861-02文章编号:1000-ResearchonRelatedGenesandPathwaysofSolanumlyratumThumbaboutAnti-Tumor

WANGWenjing1,QIYuanfu2

(1.ShandongUniversityofTCM,Ji'nan250014,Shandong,China;

2.TheAffiliatedHospitalofShandongUniv