医学信息学论文

生物信息学研究现状及就业前景分析

生物技术1班 20117801109

江雪

生物信息学，顾名思义，是一门生物学与数学、计算机科学交叉的学科。最早接触生物信息学是在大二申请SIT项目时，我们的课题是对水稻中内生放线菌拮抗稻瘟病作用的研究，在前期确定研究路线构建研究思路时，我阅读了大量文献，发现相关领域的文献都涉及了系统进化树的构建，彼时，对于那些图的了解我还只停留在可以看出各物种间亲缘关系的远近的层面，而不知道是如何画出来的。而本学期在谭老师的教授下，我不仅对这些软件可以熟练运用，也在谭老师的启蒙下开启了对生物信息学探索的兴趣，以下是我对国内生物信息学研究现状及就业前景的分析，这对我们将来从事相关行业提供客观的基础。 一、内涵

生物信息学是80年代未随着人类基因组计划（Human genome project)的启动而兴起的一门新的交叉学科。它通过对生物学实验数据的获取、加工、存储、检索与分析，进而达到揭示数据所蕴含的生物学意义的目的。由于当前生物信息学发展的主要推动力来自分子生物学，生物信息学的研究主要集中于核苷酸和氨基酸序列的存储、分类、检索和分析等方面，所以目前生物信息学可以狭义地定义为：将计算机科学和数学应用于生物大分子信息的

第五章 医院信息系统

第一节 医院信息系统概述 一、医院信息系统的最基本要素及其功能 医院信息按内容分为医疗临床信息、医院 管理信息；国外有人将管理信息进一步分成医 务管理信息和行政管理信息。 各种类型的数据相互交叉，同一数据由于 用途不同可以代表不同数据类型。 医院管理信息分为两个层次：业务管理层 次与综合管理、计划决策信息。

第五章 医院信息系统

第一节 医院信息系统概述

(一)数据的采集功能 数据采集的核心问题是方便、准确、及时 和完整，数据应该尽量在原始发生地一次性采 集。只有在一线采集，才能保证数据的实时性 和真实性。采集的原始数据和信息要真实、正 确，系统的处理结果才会正确，才有价值。

第五章 医院信息系统

第一节 医院信息系统概述

(二)信息的存储功能 涉及信息的存储问题，要考虑存储量、信息格 式、存储方式、使用方式、存储时间和安全保密等 问题 。(三)信息的加工处理功能 该功能是整个系统功能的主体。对数据的各种 加工处理几乎囊括了从原始数据资料采集到处理结 果输出的全部功能。对同一批数据，由于使用目的 不同，加工方式也不同，得到的结果也不同。

第五章 医院信息系统

第一节 医院信息系统概述 (四)信息的传输功能 网络环境下，信息传输问题解决的好

管理信息试卷一

一、单项选择题（每小题 1.5 分 , 本题共 30 分）

1 、管理信息可按多种方式进行分类，按（ ）分类，可将信息分为：人事信息、物资信息、资金信息等。 A ． 企业决策层次 B. 管理对象 C ． 信息稳定性 D ． 信息来源 2 、系统分析报告的重点内容是（ ）。

A ． 新系统的目标和逻辑模型 B ． 系统开发项目概述 C ． 现行系统的状况 D ． 系统实施计划 3 、下述哪个不是原型法的优点（ ）。

A ． 用户可及时反馈 B ． 省却了阶段性检查 C ． 用户积极参与 D ． 可较早发现错误和漏洞 4 、将用户角度上的概念结构转换为 DBMS 支持下的数据组织模式的过程称为（ ）。 A ． 数据库设计 B ． 数据存储设计 C ． 数据库的逻辑设计 D ． 数据库的物理设计

5 、找出企业的关键成功因素，围绕关键成功因素分析、确定企业的信息需求是什么，并进行管理信息系统的规划。这是制定管理信息系统总体规划的（ ）。

A ．价值链分析 B ．关键成功因素法 C ．企业系统规划法 D ．企业业务优化法 6 、在管理信息系统的编码中，把数据项分为几个组

药物信息学

一、单选题（共 30 道试题，共 60 分。）

V

1. 以下描述错误的是( ) D

A. 信息组织是一种实践活动

B. 中文科技资料目录是我国出版的大型题录型科技文献检索刊物 C. 药物靶点数据库可给出药物与靶点结合的相关信息

D. 国家药品不良反应中心可提供最权威最及时的药品受理注册批准信息查询 满分：2 分

2. 下列哪种文献属于特种文献。 D

A. A期刊 B. 报纸 C. 百科全书 D. 学位论文 满分：2 分

3. 以下描述错误的是( ) D

A. 中国循证医学中心是国际Cochrne协作网的中心之一 B. FDA药品批准表收载了FDA每月最新批准的药物信息 C. 可通过pubmed查阅医学主题词

D. +G10国内还没有有同步汉化版《马丁代尔药物大典》（第35版） 满分：2 分

4. 下列哪条不属于MEDLINE收录的索引来源( ) B

A. Index Medicus B. preMEDLINE

C. International Nursing Index D. Index to dental Literature 满分：2 分

5.

医学专业 生物信息学

第五章 分子进化分析Molecular Evolution Analysis 哈尔滨医科大学 李霞

医学专业 生物信息学

第一节 引 言 分子进化开始于20世纪60年代，近20年来由于分子遗传学 资料的迅速积累，成为计算生物学和生物信息学等新兴学科 的重要组成部分。 尤其人类基因组测序后，推动了分子进化的进一步发展，序 列保守性，基因表达和网络的进化等研究内容不断的出现在 最新的研究中，充实了生物信息学的研究范围。

医学专业 生物信息学

第二节 系统发生分析与重建一、核苷酸置换模型及氨基酸置换模型(一)DNA序列进化分析DNA序列的进化演变比蛋白质序列的演变更复杂， 因为有多种多样的DNA区域，如蛋白质编码区、非编 码区、外显子、内含子、侧翼区、重复DNA序列和插 入序列等。因此，弄清所研究的DNA类型和功能是十 分重要的。即便我们单独考虑蛋白质编码区，密码子 第一、二和三位的核苷酸替代式样也不尽相同。何况， 某些区比其他区更易受到自然选择的影响，使得DNA 的不同区域呈现不同的进化模式。

医学专业 生物信息学

1. 两个序列间的核苷酸差异对于一种同源的核酸分子来说，它在亲缘关系越近 的生物之间差异就越小，相反差异 就越大，即两同源

信息的含义：信息论的创始人申龙指出：一个系统所接受的信息“是能够用来消除不确定性的东西”。信息时通信的内容。从哲学的高度看，信息是物质的一种普遍的、本质的属性。 信息的性质 ：1普遍性2依附性3可度量性4可识别性5可处理性6可传递性7可共享性。 可识别性：信息时物质的一种普遍属性，是事物的本质、特征和运动规律的反映。信息在宇宙中普遍存在。人类可以通过自己的感觉器官（或借助于各种仪器设备）来感知它、接受它，进而识别它。信息时客观存在的，人类就是通过感知、识别事物的信息来认识事物的。信息时客观存在的，但人类感知、识别信息的能力总是有限的，这就是信息的不完全性。由于种种原因，人类在感知、接收、识别（或借助于仪器）事物信息的过程中会产生错误，客观信息的错误识别导致人们对于客观事物认识的错误，判断和决策的过程。信息的不完全性、可伪性，派生于信息的可识别性。随着科学技术，特别是信息技术的高度发展，人类感觉、接收、识别信息的能力不断增强，信息的不完全性、可伪性将不断减少，但不可能被完全消除。 可处理性：信息时可以加工的。人类对于客观世界的认识，就是通过对信息的加工处理而获得的。人类为了更好地对信息进行加工处理，创造了一系列的仪器、技术和方法。信息是可以

会议论文检索试题

1. 在万方数据库中检索2008年召开的会议（高级检索），题目中包含“可持续发展”的会

议论文有625篇。

链接：材料\\1-zhengque-万方数据知识服务平台签约站点.png

2. 在中国知网中检索2008年召开的会议（高级检索），题目中包含“可持续发展”的会议论文有356篇。

链接：材料\\2-zhengque-会议论文—中国知网.png

3. 在中国知网会议数据库中检索题名“世界金融危机与中国经济走势”的会议文献的作者

高辉清，召开的地点：中国山东济南。会议的名称：2008’国际棉花棉纺织高层论坛暨供需洽谈会。会议的时间是：2008-10。

链接：材料\\3-世界金融危机与中国经济走势 - 国际会议论文全

文数据库.png

材料\\3-世界金融危机与中国经济走势_高辉清.pdf

4. 会议论文《WTO金融服务法中的承认制度及其实践》，是刘轶作者参加中国法学会世界贸易组织法研究会二OO七年年会会议时的参会论文，会议地点是中国湖北武汉，会议时间是2007年。

链接：材料\\4-2-WTO金融服务法中的承认制度及其实践 - 中国

重要会议论文全文数据库.png

5. 在《中国重要会议论文全文数据库中》，查找1987年8月主办单位

■一、选择题: 1. 2. 3. 4. 5. 6.

以下哪一个是mRNA条目序列号： A. J01536

■. NM_15392

C. NP_52280 B. Entrez

D. AAB134506

D. PCR

确定某个基因在哪些组织中表达的最直接获取相关信息方式是： ■. Unigene 一个基因可能对应两个Unigene簇吗？ ■可能 下面哪种数据库源于mRNA信息： ■ dbEST 下面哪个数据库面向人类疾病构建： A. EST

B. 不可能

C. LocusLink

B. PDB

C. OMIM D. HTGS

D. HTGS

B. PDB ■. OMIM

Refseq和GenBank有什么区别： A. Refseq包括了全世界各个实验室和测序项目提交的DNA序列B. GenBank提供的是非冗余序列

■. Refseq源于GenBank，提供非冗余序列信息D. GenBank源于Refseq 7. 8.

如果你需要查询文献信息，下列哪个数据库是你最佳选择： A. OMIM

B. Entrez

■ PubMed

D. PROSITE

比较从Entrez和ExPASy

果蝇属麦芽糖酶的鉴定

摘要：本文通过应用生物信息学的研究方法，对已报道的12种果蝇的麦芽糖酶进行了研究，揭示了果蝇属麦芽糖酶基因家族的进化史。科学界已经对果蝇属中另一种相近的糖苷水解酶-α-淀粉水解酶的分子进化进行了较长时间的详尽的研究，α-淀粉水解酶也被用作研究多基因家族进化的一个模型。然而，对麦芽糖酶的研究却很少。因此，本研究作者通过对比氨基酸序列以及分析同源基因的内含子和外显子的组成，对果蝇属麦芽糖酶基因在基因组中的空间分布进行了研究。结果发现在果蝇的两条染色体上分布着两个基因簇共十种基因。这两个基因簇是远古一系列基因重复的结果，这大约发生在3.5亿至六千万年前，远在现有果蝇种类形成之前。在这两个基因簇中有一些特别的麦芽糖酶基因，其组成具有显著的内含子/外显多样性。 关键词：果蝇属，麦芽糖酶，生物信息学，进化

1前言

麦芽糖酶属于α-葡糖苷酶，是一类在淀粉的酶解过程中催化麦芽糖水解生成葡萄糖的酶。原来是对可使麦芽糖水解生成2分子葡萄糖的酶所用的名称，但现在一般地是作为作用于结合各种配糖基的a-D-葡萄糖苷的a-葡萄糖苷酶的别名来使用。麦芽糖 （maltose）指2分子D-葡萄糖α-1，4成键的二糖。按化学系统命名法称为4-O-a-D

果蝇属麦芽糖酶的鉴定

摘要：本文通过应用生物信息学的研究方法，对已报道的12种果蝇的麦芽糖酶进行了研究，揭示了果蝇属麦芽糖酶基因家族的进化史。科学界已经对果蝇属中另一种相近的糖苷水解酶-α-淀粉水解酶的分子进化进行了较长时间的详尽的研究，α-淀粉水解酶也被用作研究多基因家族进化的一个模型。然而，对麦芽糖酶的研究却很少。因此，本研究作者通过对比氨基酸序列以及分析同源基因的内含子和外显子的组成，对果蝇属麦芽糖酶基因在基因组中的空间分布进行了研究。结果发现在果蝇的两条染色体上分布着两个基因簇共十种基因。这两个基因簇是远古一系列基因重复的结果，这大约发生在3.5亿至六千万年前，远在现有果蝇种类形成之前。在这两个基因簇中有一些特别的麦芽糖酶基因，其组成具有显著的内含子/外显多样性。 关键词：果蝇属，麦芽糖酶，生物信息学，进化

1前言

麦芽糖酶属于α-葡糖苷酶，是一类在淀粉的酶解过程中催化麦芽糖水解生成葡萄糖的酶。原来是对可使麦芽糖水解生成2分子葡萄糖的酶所用的名称，但现在一般地是作为作用于结合各种配糖基的a-D-葡萄糖苷的a-葡萄糖苷酶的别名来使用。麦芽糖 （maltose）指2分子D-葡萄糖α-1，4成键的二糖。按化学系统命名法称为4-O-a-D