细菌分类表(按界门纲目科属种分类)

细菌分类表

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中文名称采用惯例（包括网上搜索途径）以及拉丁名直接意译，部分参考《细菌名称》第二版，拉丁文意译参考原核生物名称(英文)网站。翻译问题欢迎在原文中添加或者在讨论页中提出。

本表列到属级。 后面带*者为尚未被IJSEM杂志确认的分类。 参见：细菌。

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1 酸杆菌门(Acidobacteria)

o 1.

酸杆菌门(Acidobacteria) [编辑] 酸杆菌纲(Acidobacteria) 1. 酸杆菌目(Acidobacteriales)

1. 酸杆菌科(Acidobacteriaceae)

1. 酸杆菌属(Acidobacterium) 2. (Edaphobacter) 3. (Terriglobus)

[编辑] 全噬菌纲(Holophagae) 1. 石鳖杆菌目(Acanthopleuribacterales)

1. 石鳖杆菌科(Acanthopleuribacteraceae)

1. 石鳖杆菌属(Acanthopleuribacter)

2. 全噬菌目(Holophagales)

1. 全噬菌科(Holophagaceae)

1. 地发菌属(Geothrix) 2. 全噬菌属(Holophaga)

[编辑] 放线菌门(Actinobacteria)（高G+C革兰氏阳性菌） [编辑] 放线菌纲(Actinobacteria) 1. 酸微菌亚纲(Acidimicrobidae)

1. 酸微菌目(Acidimicrobiales)

1. 酸微菌亚目(Acidimicrobineae)

1. 酸微菌科(Acidimicrobiaceae)

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中文名称采用惯例（包括网上搜索途径）以及拉丁名直接意译，部分参考《细菌名称》第二版，拉丁文意译参考原核生物名称(英文)网站。翻译问题欢迎在原文中添加或者在讨论页中提出。

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1 酸杆菌门(Acidobacteria)

o 1.1 酸杆菌纲(Acidob

1 产水菌门(Aquificae) 1.1 产水菌纲(Aquificae) 2 热袍菌门(Thermotogae) 2.1 热袍菌纲(Thermotogae)

3 热脱硫杆菌门(Thermodesulfobacteria) 3.1 热脱硫杆菌纲(Thermodesulfobacteria) 4 恐球菌-栖热菌门(Deinococcus-Thermus) 4.1 恐球菌纲(Deinococci) 5 产金菌门(Chrysiogenetes) 5.1 产金菌纲(Chrysiogenetes) 6 绿弯菌门(Chloroflexi) 6.1 绿弯菌纲(Chloroflexi) 6.2 厌氧绳菌纲(Anaerolineae) 7 热微菌门(Thermomicrobia) 7.1 热微菌纲(Thermomicrobia) 8 硝化螺旋菌门(Nitrospira) 8.1 硝化螺旋菌纲(Nitrospira) 9 脱铁杆菌门(Deferribacteres) 9.1 脱铁杆菌纲(Deferribacteres) 10 蓝藻门(Cyanobacteria) 10.1 蓝藻纲(Cyanobacteria) 11 绿菌

环丝菌属(Brochothrix) 李斯特氏菌属(Listeria) (Paenibacillaceae) (Ammoniphilus) (Aneurinibacillus) (Brevibacillus) (Cohnella) (Oxalophagus) (Paenibacillus) (Thermicanus) (Thermobacillus) (Planococcaceae) (Filibacter) (Kurthia)

(Planococcus) (Planomicrobium) (Sporosarcina)

芽孢乳杆菌科(Sporolactobacillaceae) (Marinococcus) (Sinococcus)

芽孢乳杆菌属(Sporolactobacillus) (Tuberibacillus)

葡萄球菌科(Staphylococcaceae) 孪生菌属(Gemella) (Joetgalicoccus) (Macrococcus) (Salinicoccus)

葡萄球菌属(Staphylococcus) (Thermoactinomycetaceae) (Laceyella)

(Mechercharimyces) (P

蔷薇科属种检索表

蔷薇科属种检索表 1、果实为开裂的蓇葖果或蒴果，心皮1–5，各具二至多数胚珠，托叶大多不存在………绣球菊亚科

2、心皮五，连合成五室的子房，蒴果，种子有翅，花大型………………白鹃梅属

一种：白鹃梅（茧子花、金瓜果）E. raeniosa Rehd.

2、心皮一至五，分离或基部重合，蓇葖果，种子无翅，花小型。

3、叶有易脱落之托叶，心皮一至二……………………………………野珠兰属

一种：野珠兰（小米空心木）

3、叶无托叶、心皮五，与萼片相互生…………………………………绣线菊属

4、花浅红于深红色形成复杂而疏松、通常有细毛的伞房花序……………………日本绣线菊

4、花白色。

5、花成无总梗的伞形花序，基部无叶或仅有少数叶。

6、叶椭圆形或锯椭圆形，花常有重瓣…………………………笑靥花

6、叶线状披针形，花单瓣………………………………………喷雪花

5、花在有叶小棱上形成伞形圆锥花序。

7、叶背面有黄色细毛，蓇葖果亦生有细毛………中华绣线菊（铁黑汉条）.

7、叶背面有白绒毛，蓇葖果仅沿腹缝线有细毛………………绒毛绣线菊

1、果实不开裂，叶有托叶。

8、子房上位，

肠杆菌

1.肠杆菌属

产气肠杆菌、阴沟肠杆菌、聚团肠杆菌、阿斯布肠杆菌、河生肠杆菌生物1群、河生肠杆菌生物2群、中间肠杆菌、格高非肠杆菌、阪崎肠杆菌、泰洛肠杆菌

2.埃希菌属

大肠埃希菌、福格森氏埃希菌、不活跃大肠埃希菌、伤口大肠埃希菌、赫尔曼氏埃希菌

3.沙雷菌属

粘质沙雷菌、深红沙雷菌、无花果沙雷菌、泉居沙雷菌、芳香沙雷菌1群、芳香沙雷菌2群、晋城沙雷菌、液化沙雷菌 4.克雷伯菌属

肺炎克雷伯菌、臭鼻克雷伯菌、鼻硬节克雷伯菌、产酸克雷伯菌、解鸟氨酸克雷伯菌

5.变形杆菌属

奇异变形杆菌属、普通变形杆菌、潘尼变形杆菌

6.普罗威登斯菌属

产碱普罗威登菌、斯图普罗威登菌、雷极普罗威登菌、拉氏普罗威登菌

7.沙门菌属

猪霍乱沙门菌、甲型副伤寒沙门菌、伤寒沙门菌、雏白利沙门菌

8.枸橼酸杆菌

弗旁地枸橼酸杆菌、异型枸橼酸杆菌、丙二酸盐阴性枸橼酸杆菌

9.爱文菌属 美洲爱文菌

10.布特维西菌属 水生布特维西菌

11.爱德华菌属

迟缓爱德华菌、保科爱德华菌

12.巴提奥杆菌属

乡间巴提奥杆菌

13.哈夫尼亚菌属

蜂房哈夫菌属

14.西地西菌属

戴氏西地西菌、拉氏西地西菌、奈氏西地西菌

15.摩根菌属

摩根摩根菌

文章编号: 100420366 (2000) 0420033206

甘肃小檗属植物分类检索表

马志刚

(兰州医学院生药学教研室, 甘肃 兰州 730000)

摘 要: 经查阅有关小檗属分类的文献及标本, 结合多年野外调查采集的资料, 初步 整理出甘肃小檗属植物 41 种 4 变种, 并以检索表的形式对其进行了分组和分种鉴定, 同时记载了种的分布。

关键词: 小檗属; 分组分种; 检索表; 甘肃; 分布; 整理

Q 948115+ 1 中图分类号: 文献标识码: A

小檗属 B erberis L. 植物, 全世界约 500 种, 分布于亚洲东部、中部及南美洲, 少数产于北 美、欧洲及北非。中国约 200 种, 主要分布于西南及西北部, 东部及内蒙也有一定分布, 华东、华 南较少1 。 该属植物属阳生性灌木植物的伴生类群, 多生长于林缘路旁、山谷灌丛、山前冲积 扇、溪旁沃土及河岸或较贫瘠的山坡及石崖处, 在炎热的南方多生长于高山上2, 3 。 甘肃省是

小檗属植物的主要分布区之一, 主要分布于陇南、陇东南及陇中地区, 向西、北部

渐稀少。 分布海拔约 500～ 4 000 m 之间, 但以 1 000～ 3 000 m 处较集中2

细菌分类鉴定规程

细菌分类鉴定规程

杜艳、余翔、罗国升

新菌鉴定主要流程：

1、 潜在新菌的确定

拿到拼接好的16Sr RNA gene序列后，进入NCBI blastN (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/)或EzTaxon server 2.1 (http://147.47.212.35:8080/) 进行比较，同源性低于98%的序列(同源性处于98-97%之间的序列最好少于3株)，可初步判断存在新菌的可能。

2、 选择标准菌株构建进化树

选择参考菌株构建三种进化树 (NJ、MP和ML)，构建进化树是需要注意以下几点：1）所选择的序列必须都是在IJSEM上正式发表的序列，2）所选择的参考菌株必须包含新菌所在属的所有标准菌株，3）需要选择新菌所在科的一些与新种所在属相近的属的type species作为参考菌株，4）需要选择一个远源的菌株作为参考菌株，如：E. coli。 3、 购买标准菌株

根据进化树位置和同源性高低选择标准菌株作为参考菌株，联系相关保藏机构购买标准菌株。具体信息可以在http://www.bacterio.cict.fr/ 上查找。

标准菌株的选择需遵循以下几点：1) 如果要用到不同的属但不是用这些

细菌分类鉴定规程

细菌分类鉴定规程

杜艳、余翔、罗国升

新菌鉴定主要流程：

1、 潜在新菌的确定

拿到拼接好的16Sr RNA gene序列后，进入NCBI blastN (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/)或EzTaxon server 2.1 (http://147.47.212.35:8080/) 进行比较，同源性低于98%的序列(同源性处于98-97%之间的序列最好少于3株)，可初步判断存在新菌的可能。

2、 选择标准菌株构建进化树

选择参考菌株构建三种进化树 (NJ、MP和ML)，构建进化树是需要注意以下几点：1）所选择的序列必须都是在IJSEM上正式发表的序列，2）所选择的参考菌株必须包含新菌所在属的所有标准菌株，3）需要选择新菌所在科的一些与新种所在属相近的属的type species作为参考菌株，4）需要选择一个远源的菌株作为参考菌株，如：E. coli。 3、 购买标准菌株

根据进化树位置和同源性高低选择标准菌株作为参考菌株，联系相关保藏机构购买标准菌株。具体信息可以在http://www.bacterio.cict.fr/ 上查找。

标准菌株的选择需遵循以下几点：1) 如果要用到不同的属但不是用这些