检测mirna的方法

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miRNA研究方法

标签:文库时间:2024-09-14
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miRNA研究方法

尽管早在1993年,科学家就发现了第一个microRNA,但直到2003年以后,这种小RNA分子的大作用才不断被发现。研究显示:miRNA通过与转录本的相互作用,关闭或抑制基因的表达,影响了30%的基因。miRNA在多个组织中,例如正常和肿瘤组织中差异表达。因此,通过表达谱分析寻找疾病相关miRNA并进行发病机理研究,最终应用于肿瘤诊断和治疗,已经成为目前miRNA研究的重要方向。在研究中,从深度测序、miRNA芯片到通过导入化学合成的mimics/antagomirs等实现miRNA过表达和抑制,都是研究中常用的方法。同时,在miRNA研究中,生物信息学分析扮演着越来越重要的角色。

下表介绍了miRNA研究和应用中科学家关注的主要科学问题以及目前常用的研究方法。

miRNA主要研究技术

深度测序 抽提分离小分子(例如18-30nt)RNA,通过RT-PCR扩增之后,利用solexa深度测序,并进行生物信息学分析,获得miRNA表达谱。深度测序结合生物信息学分析手段,可以对海量数据进行分析,分别统计出已知的miRNA(miRNA-known)、新的miRNA(miRNA-new)以及可能的新miRNA(miRNA-cadida

使用siRNA、miRNA mimic 、pre-miRNA进行miRNA 生物学功能研究的

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已有文献报道表明,等量的miRNA mimics 和pre-miRNA 进入体外或体内时,pre-miRNA能更特异地且高效的形成mature miRNA,并表现出更高的生物学活性。鉴于pre-miRNA 具有高效、低细胞毒性的特点,我们合成了pre-miR-21 和miRNA mimic,以相同剂量转染细胞,然后用RT-PCR 检测miRNA-21 成熟体的形成。试验结果表明效果远优于mimics,因此pre-miRNA在系统多因素的研究中具备其更独特的优势!

使用siRNA、miRNA mimic 、pre-miRNA进行miRNA 生物学功能研究的区别

Frank 20120715

miRNA是一类大小约为22个碱基的小RNA分子。它们在转录后阶段对基因表达进行调控。调控机制是通过与靶基因的mRNA互补序列结合,抑制蛋白质的 翻译或降低mRNA的稳

定性,从而抑制靶基因的表达。科研人员已逐步认识到miRNA在细胞的发育,分化,生长等生命活动中起着非常重要的调控作用,因此越来越多的科研人员把目光聚焦到这一领域,并期待能一窥miRNA的科学奥妙。

成熟的miRNA是由较长的初级转录物经过一系列核酸酶的剪切加工而产生的,初级转录物称为pri-miRN

使用siRNA、miRNA mimic 、pre-miRNA进行miRNA 生物学功能研究的区别

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已有文献报道表明,等量的miRNA mimics 和pre-miRNA 进入体外或体内时,pre-miRNA能更特异地且高效的形成mature miRNA,并表现出更高的生物学活性。鉴于pre-miRNA 具有高效、低细胞毒性的特点,我们合成了pre-miR-21 和miRNA mimic,以相同剂量转染细胞,然后用RT-PCR 检测miRNA-21 成熟体的形成。试验结果表明效果远优于mimics,因此pre-miRNA在系统多因素的研究中具备其更独特的优势!

使用siRNA、miRNA mimic 、pre-miRNA进行miRNA 生物学功能研究的区别

Frank 20120715

miRNA是一类大小约为22个碱基的小RNA分子。它们在转录后阶段对基因表达进行调控。调控机制是通过与靶基因的mRNA互补序列结合,抑制蛋白质的 翻译或降低mRNA的稳

定性,从而抑制靶基因的表达。科研人员已逐步认识到miRNA在细胞的发育,分化,生长等生命活动中起着非常重要的调控作用,因此越来越多的科研人员把目光聚焦到这一领域,并期待能一窥miRNA的科学奥妙。

成熟的miRNA是由较长的初级转录物经过一系列核酸酶的剪切加工而产生的,初级转录物称为pri-miRN

Human miRNA PCR Array

标签:文库时间:2024-09-14
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Human Brain Cancer miRNA PCR Array: MIHS-108Z

Anaplastic Astrocytoma: miR-107, miR-10b-5p, miR-124-3p, miR-125b-5p, miR-127-5p, miR-129-5p, miR-137, miR-138-5p, miR-187-3p, miR-203a, miR-218-5p, miR-296-5p,

miR-31-5p, miR-320a, miR-7-5p.

Glioblastoma: miR-101-3p, miR-107, miR-10b-5p, miR-124-3p, miR-128, miR-129-5p, miR-130a-3p, miR-132-3p, miR-133a, miR-133b, miR-137, miR-138-5p, miR-149-5p, miR-153, miR-16-5p, miR-181a-5p, miR-181b-5p, miR-185-5p, miR-187-3p, miR-191-5p, miR-203a, miR-21-5p, miR-210, miR-218-5p, miR-221-

调控DNA损伤修复的miRNA

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调控DNA损伤修复基因的microRNA

摘要:肿瘤的发生是个多级的过程,正常细胞的基因组受到各种各样的损伤而无法修复时,就有可能发生癌变转化为肿瘤细胞。细胞为了保护其基因组的完整性,会需要一套复杂的DNA损伤修复系统,当细胞的DNA受到损伤时,细胞就会启动该系统,引起细胞周期阻断、凋亡或者进行DNA损伤修复。放、化疗是通过引起DNA损伤而杀死肿瘤细胞的,也是一种主要的肿瘤治疗方法。损伤DNA修复蛋白,使细胞损伤无法修复,就能增加肿瘤放、化疗的效率。近年来,越来越多的证据证明microRNA(miRNA)参与DNA损失修复网络的调控过程。miRNA是一类内源性的小的非编码RNA,能在转录后水平调节基因的表达。由于其本身的特性,miRNA在许多生命进程中扮演着重要角色,本文探讨了miRNA在DNA损伤修复通路和肿瘤中的作用。

关键词:DNA损伤修复通路;miRNA;调控 1、前言

DNA损伤修复(DDR)通路是一个复杂的信号传导通路,在DNA损伤之后被激活。人体基因组DNA每时每刻都在遭受着来自体内外的各种因子的攻击而被损伤,细胞为了保护基因组的完整性,会启动DNA损伤修复系统,使细胞发生周期阻滞,最终细胞被修复或者凋亡[1]。许多研究已证实,

miRNA相关分析网站

标签:文库时间:2024-09-14
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miRNA数据库及靶基因分析软件 1.miRBase: http://www.mirbase.org

miRBase序列数据库是一个提供包括已发表的miRNA序列数据、注释、预测基因靶标等信息的全方位数据库,是存储miRNA信息最主要的公共数据库之一。miRBase提供便捷的网上查询服务,允许用户使用关键词或序列在线搜索已知的miRNA和靶标信息。

2.miRecords: http://mirecords.biolead.org/

动物 mirna的靶相互作用的数据库, 包括人工收集实验验证的, 预测的 miRNA的靶目标. 靶标预测工具DIANA-microT, MicroInspector, miRanda, MirTarget2, miTarget,

NBmiRTar,

PicTar,

PITA,

RNA22,

RNAhybrid,

and

TargetScan/TargertScanS.

3.PMRD: http://BioInformatics.cau.edu.cn/PMRD/ PMRD是一个关于植物microRNA数据库,包括了microRNA序列和它们的靶基因、二级结构、表达谱、基因组搜索等等,并且该数据库尝试着整合大量的关于

miRNA相关分析网站

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miRNA数据库及靶基因分析软件 1.miRBase: http://www.mirbase.org

miRBase序列数据库是一个提供包括已发表的miRNA序列数据、注释、预测基因靶标等信息的全方位数据库,是存储miRNA信息最主要的公共数据库之一。miRBase提供便捷的网上查询服务,允许用户使用关键词或序列在线搜索已知的miRNA和靶标信息。

2.miRecords: http://mirecords.biolead.org/

动物 mirna的靶相互作用的数据库, 包括人工收集实验验证的, 预测的 miRNA的靶目标. 靶标预测工具DIANA-microT, MicroInspector, miRanda, MirTarget2, miTarget,

NBmiRTar,

PicTar,

PITA,

RNA22,

RNAhybrid,

and

TargetScan/TargertScanS.

3.PMRD: http://BioInformatics.cau.edu.cn/PMRD/ PMRD是一个关于植物microRNA数据库,包括了microRNA序列和它们的靶基因、二级结构、表达谱、基因组搜索等等,并且该数据库尝试着整合大量的关于

水中余氯的检测方法

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水质检测作业指导书

余氯的测定

1、目的

余氯是指水经加氯消毒,接触一定时间后,余留在水中的氯。余氯有三种形式:总余氯:包括HOC1,NH2Cl,NHCl2等。化合余氯:包括NH2Cl,NHCl2及其他氯胺类化合物。游离余氯:包括HOCl及OCl—等。本指导书提供用 3,3′,5,5′四甲基联苯胺比色法测定饮用水总氯。也可以使用美国哈希公司生产的便携式余氯仪来测定总氯。 2、检测方法与依据

四甲基联苯胺比色法 GB/T5750.11-2006《生活饮用水标准检验方法》 3、应用范围

3.1 本法适用于测定生活饮用水总氯。 3.2 本法最低检测浓度为0.005mg/L余氯 4、原理

在pH值小于2的酸性溶液中,余氯与3,3′,5,5′四甲基联苯胺(以下简称四甲基联苯胺)反应,生成黄色的醌式化合物,用目视比色法定量。本法可用重铬酸钾溶液配制永久性余氯标准色列。 5、仪器 50ml比色管 6、试剂及其配制

6.1 氯化钾-盐酸缓冲溶液:称取3.7g经过100-110℃干燥至恒重的氯化钾溶于纯水中,再加入0.56mL浓盐酸,加纯水稀释至1000mL。

6.2 盐酸溶液(1+4)

6.3 3,3′,5,5′四甲基联苯胺溶液(0.

miRNA与肺癌关系的研究进展

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东南国防医药 2 0 1 4年1月第 1 6卷第 1期

M i l i t a r y M e d i c a 1 J o u n r a l o f S o u t h e a s t C h i n a, V o 1 . 1 6, N o . 1, J a n . 2 0 1 4

7 3

m i R N A与肺癌关系的研究进展许德兵,吴凌云综述,宋勇 审校

[摘要] m i R N A是一类长约 2 1~ 2 5个核苷酸的小分子非编码 R N A,能调节转录后靶基因的表达,它在机体内对生长发

育、细胞繁殖、代谢、凋亡等生理过程发挥着重要作用。mi R N A具有癌基因或抑癌基因的双重作用,其表达水平的变化与肿瘤形成密切相关。肺癌是危害人类健康的恶性肿瘤之一,由于常常不能及时诊断,大部分肺癌患者发现时多已经是晚期,因而预后较差。近年来, mi R N A与肺癌的关系备受关注。 [关键词]肺癌; mi R N A;诊断[中图分类号] R 6 0 5 . 9 7 [文献标志码] A d o i: 1 0 . 3 9 6 9/ j . i s s n . 1 6 7 2— 2 7 1 X . 2 0 1 4 . 0 1 . 0 2 4

微弱信号检测方法的研究

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本科生毕业论文设计

题目 微弱信号检测方法的研究

作者姓名 田纪光_____________ 指导教师 ____________________ 所在学院 河北师范职技学院____ 专业(系)电气工程及其自动化__ 班级(届) 2012届_________

完成日期 年 月 日

目录

摘要、关键词 .......................................................................................... I 英文摘要、关键词 ................................................................................. II 第1章 引言 .............................................................................