chemdraw教程图文

ChemDraw 教程－3

Written by Anan Wu

Xiamen University

Chapter 7 常用绘制技巧及其它功能

7.1 用快捷键标记原子

用ChemDraw快捷键可快速标记原子，原子所属官能团和提供原子的特性。文件CS ChemDraw HotKeys.txt位于\\Program Files\\CambridgeSoft\\ChemOffice2004\\ChemDraw\\ChemDraw Items目录中，包含ChemDraw中提供的快捷键的定义。可以用文本编辑器编辑这个文件来增加或修改快捷键。

用快捷键编辑原子有以下描述的五种方法。

7.1.1 定位快捷标记原子

定位标记原子的方法： ? 绘制一化学结构。

? 将光标移动至原子点出定位，此时出现一蓝色亮斑。

? 按快捷键，标记将被添加到定位的原子处，如果标记为元素，那么系统将自

动添加适当数目的H。见图7-1

图7-1 定位快捷标记原子

7.1.2 选择工具快捷变换原子

用选择工具变换标记原子的快捷方法： ? 绘制一化学结构。

? 用选择工具，然后将光标定位某原子，此时出现选择框。

? 按快捷键，将快捷变换成新标

1）Preference命令

在ChemDraw7.0的版本里，Preference位于File菜单的下拉选项中。各功能罗列入下，如图2-3。

? Units（单位）可以改变标尺，交叉校准线等单位，但一般不需要改动。选择单位有

cm,in(1in=2.54cm)等。

? Tolerance（容差）允许改变的光标快的大小尺寸。Tolerance影响光标去选择和接触

对象的远近和难易程度。

? Include Footer(打印页脚)包括文件名，最后制作的日期和时间，显示在打印文件的左

下角。

? Show 35mm Slide Boundary Guides (35mm幻灯片界限设置)

? Automatic Atom Labels（自动标记原子）建议选择此项功能，可以自动添加氢原子，

标记其它元素，相当于快捷键。

? Print Background Colour（打印背景颜色）去掉为白色。

? Check Structure When Copying to Clipboard or Exporting（拷贝到粘贴板上时的结构检

查）

?

ChemDraw是一个化学结构绘图软件，它是美国CambridgeSoft公司开发的化学软件ChemOffice系列产品中一个重要成员（还有Chem3D和ChemFinder等）。目前最新版本是chemoffice2010。 ChemDraw可以绘制和编辑化学结构图，识别和显示立体结构，将结构名称进行转换，包含NMR数据库，能与Excel集成的功能。我们这里只讲绘制和编辑化学结构功能。

绘制化学图形的软件还有Chemwin和Chemsketch软件。 4.1 ChemDraw8.0软件界面结构和默认设置的变化

包括文件窗口（菜单栏，工具栏，滚动栏，编辑区等）和图形工具板两大结构。

标题栏菜单栏主工具栏子工具板绘图工具栏上下左右滚动条编辑区状态栏图4-1 Chemdraw8.0 界面结构及各种子工具板

4.1.1 图形工具板

图形工具板含有所有能够在文件窗口绘制结构图形的工具，选择了这些工具的图标后，光标将随之改变成相应的工具形状，并在光标的右下方会出现该工具的名称。

选择工具板时，一次只能选一个。在图标右下角有小黑三角的工具图标里，含有进一步的子工具图标板。用鼠标按下含三角的图标(不松开)，子工具板将显示出来。

各工具的图标及作用如下：

p实验一 IDL的介绍和基础知识

目的：了解IDL的构成和基本框架体系；熟练掌握IDL的变量；掌

握IDL的命令书写及数据的输入输出

原理：标量,矢量,数组,结构体；命令书写规则；数据输入输出方法 软件：IDL 内容： 一、介绍IDL

IDL（Interactive Data Language）交互式数据语言是进行数据分析、可视化表现和应用开发的理想软件工具。作为面向矩阵、语法简单的第四代可视化语言。IDL的特性包括：高级图像处理能力、交互式二维和三维图形技术、面向对象的编程方式、OpenGL图形加速、量化可视化表现、集成数学与统计学算法、灵活的数据输入输出方式、跨平台图形用户界面工具包、连接ODBC兼容数据库及多种程序连接工具等。

IDL是完全面向矩阵的，相比常用语言它具有快速分析超大规模数据的能力，而相比于同样面向矩阵的其他软件，它又能够更容易实现图形对象的交互操作和图形、图像的高级处理。

IDL的用户群分布很广。它不但可以为科学研究人员提供交互式浏览和分析数据的环境，为程序员提供快速源程序开发及跨平台发布的高级编程语言，还可以为三维动画制作人员和三维地理信息系统应用人员提供良好的软件应用平台。

在国外IDL已经被列为大学的标准课程，其功能

GOCAD综合地质与储层建模软件

简易操作手册

美国PST油藏技术公司

PetroSolution Tech,Inc.

目 录

第一节 GOCAD综合地质与储层建模软件简介┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉1

一、GOCAD特点┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉1 二、GOCAD主要模块┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉1 第二节 GOCAD安装、启动操作┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉2

一、GOCAD的安装┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉2 二、GOCAD的启动┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉3 第三节 GOCAD数据加载┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉5

一、井数据加载┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉5 二、层数据加载┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉11 三、断层数据加载┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉11 四、层面、断层面加载┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉12 五、地震数据加载┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉┉12 第四节 GOCAD构造建模┉┉┉┉┉┉

人都买了光盘刻录机，但由于对刻录操作不太精通，刻录功能的使用率并不高，造成了功能浪费。其实光盘刻录并不复杂，只要掌握不同文件的刻录方法即可轻松搞定，下面就为大家介绍几个常见的刻录方法。

一、 刻录数据光盘

如果你只需要把文档、图片和音乐等文件以数据方式刻录到光盘上（数据光盘只能在电脑上打开，不能用VCD和DVD机播放，主要用来存储和备份文件），无须使用专业的刻录软件，用系统自带的刻录功能即可满足需要。

⒈如果使用的是Windows XP系统，则按照下面的方法来快速刻录数据光盘。 第一步：在“我的电脑”文件夹中双击刻录光驱盘符打开光驱文件夹，将准备刻录的文件全部复制到该文件夹中，会自动生成一个“准备写入到CD上的文件”列表。

图1

第二步：用右键单击文件夹空白处选择“将这些文件写入CD”选项打开“CD写入向导”对话框。

图2

第三步：在“CD名称”框中输入要刻录的光盘名称，将刻录盘放入光驱中，点击“下一步”按钮即可自动将文件刻录到光盘中了。

图3

⒉如果使用是的Windows Vista系统，其刻录功能已经直接集成到了资源管理器中，操作更为简便，并且功能也更为全面。

第一步：将刻录盘放入光驱后，打开刻录文件所在文件夹，选中文件或文件夹，在工具

人都买了光盘刻录机，但由于对刻录操作不太精通，刻录功能的使用率并不高，造成了功能浪费。其实光盘刻录并不复杂，只要掌握不同文件的刻录方法即可轻松搞定，下面就为大家介绍几个常见的刻录方法。

一、 刻录数据光盘

如果你只需要把文档、图片和音乐等文件以数据方式刻录到光盘上（数据光盘只能在电脑上打开，不能用VCD和DVD机播放，主要用来存储和备份文件），无须使用专业的刻录软件，用系统自带的刻录功能即可满足需要。

⒈如果使用的是Windows XP系统，则按照下面的方法来快速刻录数据光盘。 第一步：在“我的电脑”文件夹中双击刻录光驱盘符打开光驱文件夹，将准备刻录的文件全部复制到该文件夹中，会自动生成一个“准备写入到CD上的文件”列表。

图1

第二步：用右键单击文件夹空白处选择“将这些文件写入CD”选项打开“CD写入向导”对话框。

图2

第三步：在“CD名称”框中输入要刻录的光盘名称，将刻录盘放入光驱中，点击“下一步”按钮即可自动将文件刻录到光盘中了。

图3

⒉如果使用是的Windows Vista系统，其刻录功能已经直接集成到了资源管理器中，操作更为简便，并且功能也更为全面。

第一步：将刻录盘放入光驱后，打开刻录文件所在文件夹，选中文件或文件夹，在工具

一 ：

1. 你的第一个CEGUI程序

2. 强烈建议仔细研究CEGUISample程序！因为那里介绍了它的一些基本用法，其实最后在游戏当中出现的，也就是这些例子的变化而已。 3. 这里我会引导你写一个第一个自己的简单的CEGUI程序，它使用CEGUISampleHelper提供的框架，使用OpenGL渲染。

4. 这是在CEGUI自己给的Sample程序基础上简化、简化、再简化得出的，目的是让大家对CEGUI程序有一个简单明了的认识，其实就是这么简单。里面只定义了一个背景，一个静态文本，写着“Hello！CEGUI”。 5. 具体的，有几块重要的东西。有一些包含在框架里了，如下： 6. DefaultResourceProvider，这个是CEGUI的一个全局的东西，可以在任何地方操作它的指针，但是一般只需要在一开始操作它。 7. 在CEGuiOpenGLBaseApplication当中，你可以看见下面这样的代码，这就是在使用DefaultResourceProvider的指针在设置资源的路径，你可以毫不客气地复制粘贴到你的工程里 8. CEGUI::DefaultResourceProv

一、认识“我家我设计”软件

【我家我设计6.0】是一款免费、简单易用的家居效果设计软件，即学即会。

V6.0 版针对家居设计方面在功能及图库方面都有很大的提升。近万个模型供下载使用，包括桌子、沙發、椅子、洁具、电脑、地板等各类家居配置。完成平面图后可直接輸出 jpg图片或通过打印机列印彩色图紙，同時系统可生成家具及铺砖数量统计計列表。适合室內设计业、对室內设计有兴趣者、有意自行布置家居人士及用于教学用途等。

点击下载：我家我设计三维版 V6.0（最新版本）

1、简单易用，约十分钟学会

内置设计导航，让你一步步的按指示完成整个设计。

2、独特描图功能，按实际需要建立墙体

利用扫描器把房子平面图(如售楼书或手稿的平面图)储存为jpg格式，再由本软件调整房间正确大小，即可进行描图建立各个房间(如写书法般按底稿平面图绘画所有墙体)。如不使用描图建墙方法，亦可直接建立墙体、单房间，按实际需要选择计算基准(墙外、墙中、墙内线)及柱子，计算大小更准确。

3、自由建立门、窗、窗台等(不同款式)

轻松建立单门、双开门、窗台及窗等设计，并可随意更改大小

4、建立不同的地板、木纹

大量地面铺设材料供任意选用

5

目录

1. 怎样阅读教程

2. 怎样准备结构来进行静电势计算

2.1PQR格式 2.2XML格式

2.3由PDB文件生成PQR文件（PDB2PQR） 3.怎样观察生物大分子周围的静电势 3.1VMD 3.2PyMOL 3.3PMV

4.怎样计算溶剂化能

4.1极性溶剂化 4.2非极性溶剂化

5.怎样计算结合能

5.1溶剂化能对结合的贡献

５.2包括库仑力贡献

5.3不行!配体没有设置参数

5.4一个配体结合的例子 ６.怎样计算溶剂化力 7.怎样计算PKa?

7.1概况 7.2介绍

7.3应用于溶菌酶

8.我的计算需要的内存太大了!

8.1并行计算:一个例子 8.2异步时序计算

9.如何将APBS用于分子动力学软件(MM/PBSA等)? 10.怎样通过网络运行APBS?(Gemstone)

10.1得到Gemstone

10.2用PDB2PQR来准备结构 10.3用APBS进行静电计算

11.更多例子??

12.所有这些没有回答我的问题-??

图像清单

3.1 .弓形阻遏物的等势线(在VMD中) 3.2.弓形阻遏物表面势能(在VMD中) 3.