真核生物启动子的保守序列

真核启动子

RNA转主要用途 录本 启动子 描述 表达 备注 CMV 常规表达用 人类巨细胞病毒来mRNA 源的强哺乳动物表达启动子 组成型 可能包含一个增强子，在某些细胞中会沉默 EF1a

常规表达用

人延长因子1α来源

mRNA

的强哺乳动物表达启动子

组成型

表达水平十分稳定，与细胞类型无关

SV40 常规表达用 猿猴空泡病毒40来mRNA 源的哺乳动物表达启动子 组成型 可能包含一个增强子 PGK1 (人/小鼠)

常规表达用

磷酸甘油酸酯激酶

mRNA

基因来源的哺乳动物启动子

组成型

广泛表达,但可能因细胞类型而异。由于甲基化或脱乙酰作用，倾向于抵抗启动子下调。

Ubc 常规表达用 人类泛素C基因来mRNA 源的哺乳动物启动子 组成型 顾名思义，该启动子无处不在 human beta actin

常规表达用

β-肌动蛋白基因来

mRNA

源的哺乳动物启动子

组成型

无处不在，鸡的启动子常用与启动子杂交

CAG 常规表达用 mRNA 强杂交哺乳动物启动子 组成型 包含CMV的增强子，鸡的beta actin启动子和兔的beta-globin剪接受体 TRE

常规表达用

mRNA

四环素响应元件启动子

被四环素或

者类似

真核生物启动子有三类，分别由RNA聚合酶Ⅰ、Ⅱ和Ⅲ进行转录。 类别Ⅰ（class Ⅰ）启动子：

只控制rRNA前体基因的转录，转录产物经切割和加工后生成各种成熟rRNA。 类别Ⅰ启动子由两部分保守序列组成：

核心启动子（core promoter）：位于转录起点附近，从-45至+20； 上游控制元件（upstream control element，UCE）：位于-180至-107；

RNA聚合酶Ⅰ对其转录需要2种因子参与：

UBF1：一条M为97000的多肽链，结合在上述两部分的富含GC区；

1个TBP，即TATA结合蛋白（TATA-binding protein，TBP）；

SL1：一个四聚体蛋白，含有 3个不同的转录辅助因子TAFⅠ；

在SL1因子介导下RNA聚合酶Ⅰ结合在转录起点上并开始转录。 类别Ⅱ（class Ⅱ）启动子：

类别Ⅱ启动子涉及众多编码蛋白质的基因表达的控制。 该类启动子包含4类控制元件：

基本启动子（basal promoter）：序列为中心在-25至-30左右的7 bp保守区，TATAAAA/T，

称为TATA框或Goldberg-Hogness 框。与RNA聚合酶的定位有关，DNA双链在此解开并决定转录的起点位置

真核生物启动子有三类，分别由RNA聚合酶Ⅰ、Ⅱ和Ⅲ进行转录。 类别Ⅰ（class Ⅰ）启动子：

只控制rRNA前体基因的转录，转录产物经切割和加工后生成各种成熟rRNA。 类别Ⅰ启动子由两部分保守序列组成：

核心启动子（core promoter）：位于转录起点附近，从-45至+20； 上游控制元件（upstream control element，UCE）：位于-180至-107；

RNA聚合酶Ⅰ对其转录需要2种因子参与：

UBF1：一条M为97000的多肽链，结合在上述两部分的富含GC区；

1个TBP，即TATA结合蛋白（TATA-binding protein，TBP）；

SL1：一个四聚体蛋白，含有 3个不同的转录辅助因子TAFⅠ；

在SL1因子介导下RNA聚合酶Ⅰ结合在转录起点上并开始转录。 类别Ⅱ（class Ⅱ）启动子：

类别Ⅱ启动子涉及众多编码蛋白质的基因表达的控制。 该类启动子包含4类控制元件：

基本启动子（basal promoter）：序列为中心在-25至-30左右的7 bp保守区，TATAAAA/T，

称为TATA框或Goldberg-Hogness 框。与RNA聚合酶的定位有关，DNA双链在此解开并决定转录的起点位置

1、 UCSC

（1）网址：http://genome.ucsc.edu/cgi-bin/hgNear

在Genome里选择物种，比如human，search里输入你的基因名PTEN，点击Go （2）出现新的页面，看到“Known Gene Names”下面的PTEN了吧，点它 （3）又回到了和（1）类似的页面，此时，点击sequence

（4）出现一个新的页面，选中promoter，同时可以输入数值修改具体的序列区域，比如Promoter including 2000 bases upstream and 100 downstream，即表示启动子-2000～＋100区域

（5）点击“get sequence”，出现页面中最上面的序列“>uc001kfb.1 (promoter 2000 100) PTEN - phosphatase and tensin homolog”就是你要的人PTEN启动子-2000～＋100区域的序列了

2、Ensembl

（1）网址：http://www.ensembl.org/index.html

在“Search Ensembl“标题下search后的下拉框中选中物种名homo sapiens（人），fo

青岛农业大学 毕 业 论 文（设计）

题 目: 葡萄逆境胁迫诱导启动子的克隆

及其表达载体的构建

姓 名: 刘丽雪 学 院: 生命科学学院 专 业： 生物技术 班 级： 2007级4班 学 号： 20072833 指导教师： 薛仁镐

2010年6月17日

目 录

中文摘要···························································································································1 Abstract······························································································································2

棉花SUPERMAN类锌指蛋白基因GZFP的启动子及功能分析

棉花学报CottonScience2011，23（6）：483~489

研究与进展

棉花SUPERMAN类锌指蛋白基因GZFP的

启动子及功能分析

杨郁文1，周建武2，张保龙1*，范晓慧1，任永哲1，陈天子1

（1.江苏省农业科学院农业生物技术研究所/江苏省农业生物学重点实验室,江苏南京210014；2.扬州大学生物科学与技术学院，江苏扬州225009）

摘要：GZFP是来源于陆地棉的一个SUPERMAN类锌指蛋白基因。为了进一步了解该基因功能，本研究通过染色体步移（Genomewalking）获得其启动子区域，并构建该片段与GUS连接的重组载体pBI-pGZFP-5::GUS，通过花浸染法转化拟南芥。转基因植株的GUS染色结果表明GUS基因主要在根部以及花器官表达，而叶片中的表达量很低，并且根部的表达量在整个生育期都很强。通过半定量RT-PCR分析不同诱导下GZFP基因的表达变化，发现ABA、干旱、盐胁迫诱导可以提高其表达量。构建GZFP过量表达载体并通过叶盘法转化烟草，烟草转化株的表型无明显变化，但是转化株中NtOPBP1和NtERD10的表达量较未转化株明显增强，而这两个基因都参与了植物的

课次：19

教学目的：使学生了解真核基因表达调控的特点、转录前的调控，掌握增强子的作用特点和反式作用因子

的DNA结合域的结构花式。

重点：增强子和反式作用因子的DNA结合域的结构花式。 难点：反式作用因子的DNA结合域的结构花式。 复习旧课：提问2人，了解教学效果。 导入新课：

第八章 真核生物基因表达的调控

第一节 概述

真核生物细胞中由核膜将核和细胞质分隔开，转录和翻译并不偶联；基困组是由多条染色体组成。 真核基因的调节分为： 真核基因表达调控的特点：

第二节 转录前的调控

一. DNA的甲基化与去甲基化

真核DNA中的胞嘧啶约有5%被甲基化为5-甲基胞嘧啶(5-methylcytidine,m5C)，而活跃转录的DNA段落中胞嘧啶甲基化程度常较低。

甲基化可使基因失活，去甲基化又可使基因恢复活性。 二 染色质结构对真核基因转录的调控 1.染色质结构影响基因转录

常染色质中的基因可以转录，异染色质(heterochromatin)，无基因转录表达。 2. 组蛋白的作用

? 组蛋白扮演了非特异性阻遏蛋白的作用，

? 非组蛋白成分起到特异性的去阻遏促转录作用。 ? 核小体结构影响基因转录。

三 基因重排和基因扩增对基因表达的影

目的研究乙型肝炎病毒(HBV)核心基因启动子(BCP)变异与e抗原(HBeAg)及病毒载量的关系。方法(1)研究对象为176例HBV慢性感染者(轻、中、重度慢性乙型病毒性肝炎,肝炎肝硬化,慢性重型肝炎和原发性肝癌)。(2)研究方法：①采用PCR微板核酸杂交结合ELISA检测显示技术,对患者血清进行检测HBVBCP区核苷酸(nt)1762碱基A→T和1764G→A联合突变。②采用PCR结合荧光探针检测

维普资讯

广西医学 2 0 0 6年 1 第 2 0月 8卷第 1 0期

19 43

●论

著

乙型肝炎病毒核心基因启动子变异与血清 HB A e g及病毒载量关系的探讨▲广西医科大学第一附属医院感染性疾病科 (南宁 502 )玉艳红 30 1黄力毅宣伟军※庞 辉#

[摘要]目的研究乙型肝炎病毒( B核心基因启动子( ) H V) I变异与 e P抗原( eg及病毒载量的关系。方法 ( ) BA ) 1研究对象为 1 6 I V慢性感染者(、重度慢性乙型病毒性肝炎，炎肝硬化， 7例 - t B轻中、肝慢性重型肝炎和原发性肝癌) 2研究方法：。( ) ①采用 P R微板核酸杂交结合 E IA检测显示技术，患者血清进行检测 H V C C LS对 B B P

第二章 真核微生物

一、名词解释

1、无性繁殖 2、假根 3、菌丝体 4、子实体 5、有性繁殖 6、准性生殖 7、真菌 8、同宗结合 9、异宗结合 10、锁状联合 二、填空

1、Neurospora在分类上属于________亚门的真菌。 2、Auricularia在分类上是属于________亚门的真菌。 3、双孢蘑菇在分类上是属于________亚门的真菌。 4、Rhizopus在分类上属于________亚门的真菌。

5、真菌无性繁殖孢子的种类主要有________，________，________，________和________等五种。 6、真菌的有性孢子种类有________，________，________和________。 7、酵母菌的无性繁殖方式主要有________和________。 8、真菌细胞的线粒体是________的细胞器。

9、丝状真菌的无隔菌丝是由________细胞组成，有隔菌丝是由________细胞组成。 10、真菌菌丝有两种类型，低等真菌的菌丝是________，高等真菌的菌丝是________。 11、有一类真菌，由于仅发现

原核生物和真核生物基因表达调控、复制、转录、翻译特点的比较

1.相同点：转录起始是基因表达调控的关键环节

①结构基因均有调控序列；

②表达过程都具有复杂性，表现为多环节； ③表达的时空性，表现为不同发育阶段和不同组织器官上的表达的复杂性；

2.不同点:

①原核基因的表达调控主要包括转录和翻译水平。真核基因的表达调控主要包括染色质活化、转录、转录后加工、翻译、翻译后加工多个层次。 ②原核基因表达调控主要为负调控，真核主要为正调控。 ③原核转录不需要转录因子,RNA聚合酶直接结合启动子,由sita因子决定基因表的的特异性，真核基因转录起始需要基础特异两类转录因子，依赖DNA-蛋白质、蛋白质-蛋白质相互作用调控转录激活。 ④原核基因表达调控主要采用操纵子模型，转录出多顺反子RNA，实现协调调节；真核基因转录产物为单顺反子RNA，功能相关蛋白的协调表达机制更为复杂。 ⑤真核生物基因表达调控的环节主要在转录水平，其次是翻译水平。原核生物基因以操纵子的形式存在。转录水平调控涉及到启动子、sita因子与RNA聚合酶结合、阻遏蛋白、负调控、正调控蛋白、倒位蛋白、RNA聚合酶抑制物、衰减子等。翻译水平的调控涉及SD序列、mRNA的稳定性不稳定(5