基因与编码区的关系

PCR引物设计流程

（以扩增鹅PHIP基因编码区序列为例）

一． 流程图

二． 确定模板 1. 确定模板来源物种

近亲物种 ：原鸡，绿头野鸭，鸽，雀，鹦鹉，蜂鸟等

常用物种 ：灵长类（人，大猩猩，恒河猴），哺乳类（大鼠，小家鼠，猪，牛，羊，狗），爬行类（鳄，龟），两栖类（蛙，蟾蜍），鱼类（斑马鱼，亚马逊帆鱼）

一般在每一类常用物种中选择一个物种，在近亲物种中选择2种以上作为模板。如，扩增鹅PHIP基因选择以下物种序列为引物设计模板：鸡，鸭，人，小鼠，蟾蜍，斑马鱼。 2. 利用NCBI得到各物种需扩增基因的模板序列

A. 进入NCBI主页 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/ ，选定搜索范围为“Gene”，关键词为“PHIP”，得到如下图搜索结果（也可在关键词中包含物种名，如“PHIP Anser”，物种的英文名和拉丁学名在搜索时都可使用）。

B. 点击所需物种的PHIP基因，进入该基因的报告页面（以人PHIP基因为例）。基因报告页面中部Refseq条目中显示该基因在NCBI中的参考序列，该条目下可得到mRNA序列。如下图。另，关于RefSeq条目的相关名词解释参考 http://www.ncbi.nlm.nih.gov

PCR引物设计流程

（以扩增鹅PHIP基因编码区序列为例）

一． 流程图

二． 确定模板 1. 确定模板来源物种

近亲物种 ：原鸡，绿头野鸭，鸽，雀，鹦鹉，蜂鸟等

常用物种 ：灵长类（人，大猩猩，恒河猴），哺乳类（大鼠，小家鼠，猪，牛，羊，狗），爬行类（鳄，龟），两栖类（蛙，蟾蜍），鱼类（斑马鱼，亚马逊帆鱼）

一般在每一类常用物种中选择一个物种，在近亲物种中选择2种以上作为模板。如，扩增鹅PHIP基因选择以下物种序列为引物设计模板：鸡，鸭，人，小鼠，蟾蜍，斑马鱼。 2. 利用NCBI得到各物种需扩增基因的模板序列

A. 进入NCBI主页 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/ ，选定搜索范围为“Gene”，关键词为“PHIP”，得到如下图搜索结果（也可在关键词中包含物种名，如“PHIP Anser”，物种的英文名和拉丁学名在搜索时都可使用）。

B. 点击所需物种的PHIP基因，进入该基因的报告页面（以人PHIP基因为例）。基因报告页面中部Refseq条目中显示该基因在NCBI中的参考序列，该条目下可得到mRNA序列。如下图。另，关于RefSeq条目的相关名词解释参考 http://www.ncbi.nlm.nih.gov

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MC1R基因编码区的系统发育分析和正选择位点检测

作者：李丽莎 李祥龙 周荣艳 李兰会 张永改 马梦云 张秀玲 来源：《江苏农业科学》2016年第03期

摘要： 黑素皮质素受体1（melanocortin 1 receptor，MC1R）基因在黑色素细胞的表达上发挥重要作用，并与皮肤色素沉积密切相关。MC1R基因的选择压力分析对识别重要的功能位点具有深远影响。为研究不同动物MC1R基因在进化过程中是否受到正选择作用，基于位点模型对MC1R基因进行研究。结果表明，动物MC1R基因主要经历中性漂变和纯化选择作用，并且发现MC1R基因受到正选择作用的是编码29、191、253、304氨基酸的位点。本研究从分子进化的角度为MC1R基因调控黑色素的形成提供了一个新的思路。 关键词： MC1R；分子进化；亲缘关系；系统发育；正选择

中图分类号： Q756 文献标志码： A 文章编号：1002-1302（2016）03-0044-04 黑素皮质素受体1（melanocortin 1 receptor，MC1R）基因，也称为促黑素细胞激

通过PCR—SSCP方法对种公牛群体雄激素受体(AR)基因5’非翻译区(5’UTR)多态性进行检测,结果表明：AR基因5'UTR含有多态性位点;测序结果显示5'UTR-1575处存在T—G碱基突变;用最小二乘分析方法对该基因型和生产性状相关分析显示遗传多态性与精子密度性状呈显著相关,AA型显著高于AB型(P=0.025),对其他性状的影响差异不显著。本实验为研究种公牛体内AR的生物学作用奠定

牧草与饲料 2 1, ( ) 3 0 1 5 4:6~3 9文章编号：N 0 1 3 2 1 )4 0 3— 4 J O— ( 0 0— 0 6 0 8 1

Jun l f oae&F e o ra o rg F ed

牛A R基因 5 U R S 析及与精液品质关系’ T P分 N秦立红，李海燕(. 1吉林省农业科学院畜牧科学分院，吉林公主岭， 3 10;. 16 0 2吉林省农业科学，长春 10 3 ) 3 0 3摘要：通过 P R S C C— S P方法对种公牛群体雄激素受体 ( R)因 5 A基’非翻译区( T多态性进行检测， 5 R) U 结果表明： R基因 5 T A’ R含有多态性位点；序结果显示 5 T一 5 5处存在 T G碱

基因树和物种树的关系及建树方法 一 .基因树和物种树 1. 2.

概念 二者关系

二 构建基因树或分子树

1. 2. 3. 4.

同源DNA排序问题 分子生物学数据类型(2种类型) 数据转换

建树方法(主要介绍四种方法)

非加权组平均法(UPGMA法) 邻接法(NJ法) 最大简约法(MP法) 最大似然法(ML法)

5.

几种建树方法的比较

一 基因树和物种树

gene tree

分子树(molecular tree)： 依据分子数据构建的反映分子系统发育的树 物种树(species tree)： 反映物种实际种系发生的树

系统发育（Phylogeny）：是指一群有机体发生或进化的历史.

系统发育树(Phylogenetic tree): 就是描述这一群有机体发生或进化顺序的拓朴结构。根据系统发育树的具体表达形式,可分为

基因树(Gene tree): 当一个分子系统树是根据某一个基因数据构建而来的,称为基因树.

物种树(Species tree): 是指代表一组物种进化过程的系统树.

基因树与物种树的关系

分子系统学的目的,就是通过分子树来推测物种树.

基因树和物种树的关系及建树方法 一 .基因树和物种树 1. 2.

概念 二者关系

二 构建基因树或分子树

1. 2. 3. 4.

同源DNA排序问题 分子生物学数据类型(2种类型) 数据转换

建树方法(主要介绍四种方法)

非加权组平均法(UPGMA法) 邻接法(NJ法) 最大简约法(MP法) 最大似然法(ML法)

5.

几种建树方法的比较

一 基因树和物种树

gene tree

分子树(molecular tree)： 依据分子数据构建的反映分子系统发育的树 物种树(species tree)： 反映物种实际种系发生的树

系统发育（Phylogeny）：是指一群有机体发生或进化的历史.

系统发育树(Phylogenetic tree): 就是描述这一群有机体发生或进化顺序的拓朴结构。根据系统发育树的具体表达形式,可分为

基因树(Gene tree): 当一个分子系统树是根据某一个基因数据构建而来的,称为基因树.

物种树(Species tree): 是指代表一组物种进化过程的系统树.

基因树与物种树的关系

分子系统学的目的,就是通过分子树来推测物种树.

曼彻斯特编码与差分曼彻斯特编码

曼彻斯特编码（Manchester Encoding），也叫做相位编码(PE)是一个同步时钟编码技术，被物理层用来编码一个同步位流的时钟和数据；常用于局域网传输。在曼彻斯特编码中， 每一位的中间有一跳变，位中间的跳变既作时钟信号，又作数据信号,就是说主要用在数据同步传输的一种编码方式。

但在不同的书籍中，曼彻斯特编码中，电平跳动表示的值不同，这里产生很多歧义：

1、在网络工程师考试以及与其相关的资料中，如：雷振甲编写的《网络工程师教程》中对曼彻斯特编码的解释为：从低电平到高电平的转换表示1，从高电平到低电平的转换表示0，模拟卷中的答案也是如此，张友生写的考点分析中也是这样讲的。

位中间电平从高到低跳变表示\； 位中间电平从低到高跳变表示\。

2、在一些《计算机网络》书籍中，如《计算机网络（第4版）》中（P232页）则解释为高电平到低电平的转换为1，低电平到高电平的转换为0，《数据通信与网络（第三版）》，《计算机网络（第4版）》采用如下方式：

位中间 电平从高到低跳变表示\； 位中间电平从低到高跳变表示\。

在清华大学出版的《计算机通信与网络教程》也是这么说的，就以此为标准，我们就叫这为标准曼彻斯编码。至于第一种

教学过程：

一、谈话设疑，激趣导入。

1、仔细观察大屏幕，（幻１）你们能从大屏幕上捕捉到什么信息？

你们谁能介绍一下老师吗？（生借助大屏幕找到答案） 在生说我名字时，展示幻2。

2、那么，说“古丹”就一定是我吗？

在搜搜中输入“古丹”的名字，有34800条都是关于“古丹”的信息。（边讲边展示幻４）其中在朋友网共找到197个古丹。我们一起来看看能不能找到我？

3、用什么证件来证明自己的身份最有效？（让生自由发言）引出身份证。

每个公民一出生，就有一个身份号码，公民身份号码是每个公民唯一的，终身不变的身份代码。它由公安机关按照公民身份号码国家标准编制的。

4、身份证在我们生活中有广泛的应用，思考：平时哪些地方要用到身份证？（银行开户存钱时，做火车飞机时，等你们长大了参加一些考试也要身份证，等等）

5、身份证为人们提供了安全、便捷的生活服务。由于它隐含着许多个人信息，所以请一定要妥善保管，不能随意借用他人。

二、梳理问题，探究解决。

1、 这是我的身份证，（展示幻１１）谁来读一读我的身

份号码，并数数它有多少位？（１８位）

2、 仔细观察我的身份证上面有些什么信息？（性别、民

族、出生年月日、家庭住址、身份号码）（用红笔圈

出出生年月日和号码，让生自己通过比较猜想出生年

月日与身

《数字与编码》说课稿

一、说教材

1、教材的地位与作用 《数字与编码》是新人教版数学三年级上册第四单元后面的一个综合实践内容。是新课程改革新增加的一节实践活动课。学生对数的广泛应用已经有了初步认识，这节课就是让学生知道数不仅可以用来表示数量和顺序，还可以用来编码。本节课主要以探究身份证编码和邮政编码的组成规律，体会数字编码在日常生活中的应用，并通过实践活动进行简单的数字编码，培养学生的数学思维能力和创新意识。

2、教学目标

知识目标：通过对身份证号码的探索，初步体会数字编码的编排特点，知道数字编码在生活中的应用，并能用数字进行编码。

能力目标：培养学生收集信息的能力和观察、比较、抽象概括能力。

情感目标：使学生体会到数学与现实生活的紧密联系，激发学生对数学的学习兴趣，同时养成与人合作和应用信息技术帮助学习的良好习惯。

3、教学重难点

本节课的重点和难点是：探索身份证号码的编排方法，体会数字编码的编排特点，初步学会科学合理地编码。

二、说教法和学法 1、说教法

本节课，我从学生已有的生活经验和知识基础出发，采用如下教学方法： 情境创设法。教学情境的创设要立足于学生的现实生活，贴近学生的生活经验和知识背景。因此，课前一周，我布置学生通过各种方式

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基因突变与基因重组

第五章基因突变与其他变异第一节基因突变与基因重组一、知识结构二、教材分析1.本节在引言部分，指出生物的变异具有普遍性，变异可以分为可遗传变异和不遗传变异，可遗传的变异有三种来源。2.本小节介绍了基因突变的概念、意义和特点，人工诱变在育种上的应用，以及基因重组的概念和意义。教材从实例引入基因突变的概念 第五章 基因突变与其他变异

第一节 基因突变与基因重组 一、知识结构

二、教材分析

1.本节在引言部分，指出生物的变异具有普遍性，变异可以分为可遗传变异和不遗传变异，可遗传的变异有三种来源。 2.本小节介绍了基因突变的概念、意义和特点，人工诱变在育种上的应用，以及基因重组的概念和意义。

教材从实例引入基因突变的概念，是为了便于学生理解抽象的概念。

在介绍基因突变的普遍性、随机性、自然突变率低、有害性和不定向性等特点时，教材也举了具体的实例。

旁栏设置的思考题和小资料，也有助于学生加深对基因突变特点的理解。

2016全新精品资料-全新公文范文-全程指导写作 –独家原创

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人工诱变在育种上有重要用途，教材通过介绍我国