反转录pcr与常规pcr的异同
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反转录PCR-步骤和方法
反转录PCR
科技名词定义
中文名称:
反转录PCR
英文名称:
reverse transcription PCR;RT-PCR
定义:
扩增mRNA的一种实验技术。先将mRNA反转录成cDNA,然后再以cDNA为模板,用PCR方法加以扩增。
应用学科:
遗传学(一级学科);基因组学(二级学科)
以上内容由全国科学技术名词审定委员会审定公布 目录
一、反转录酶的选择
二、合成cDNA引物的选择 三、操作步骤 四、注意事项
RT-PCR反应原理
反转录PCR(Reverse Transcription-Polymerase Chain Reaction,RT-PCR)又称为逆转录PCR。其原理是:提取组织或细胞中的总RNA,以其中的mRNA作为模板,采用Oligo(dT)或随机引物利用逆转录酶反转录成cDNA。再以cDNA为模板进行PCR扩增,而获得目的基因或检测基因表达。RT-PCR使RNA检测的灵敏性提高了几个数量级,使一些极为微量RNA样品分析成为可能。该技术主要用于:分析基因的转录产物、获取目的基因、
[1]
合成cDNA探针、构建RNA高效转录系统。 RT- PCR(Reverse
Transcription-Pol
反转录PCR-步骤和方法
反转录PCR
科技名词定义
中文名称:
反转录PCR
英文名称:
reverse transcription PCR;RT-PCR
定义:
扩增mRNA的一种实验技术。先将mRNA反转录成cDNA,然后再以cDNA为模板,用PCR方法加以扩增。
应用学科:
遗传学(一级学科);基因组学(二级学科)
以上内容由全国科学技术名词审定委员会审定公布 目录
一、反转录酶的选择
二、合成cDNA引物的选择 三、操作步骤 四、注意事项
RT-PCR反应原理
反转录PCR(Reverse Transcription-Polymerase Chain Reaction,RT-PCR)又称为逆转录PCR。其原理是:提取组织或细胞中的总RNA,以其中的mRNA作为模板,采用Oligo(dT)或随机引物利用逆转录酶反转录成cDNA。再以cDNA为模板进行PCR扩增,而获得目的基因或检测基因表达。RT-PCR使RNA检测的灵敏性提高了几个数量级,使一些极为微量RNA样品分析成为可能。该技术主要用于:分析基因的转录产物、获取目的基因、
[1]
合成cDNA探针、构建RNA高效转录系统。 RT- PCR(Reverse
Transcription-Pol
反转录PCR操作手册1
RT-PCR实验步骤
一.实验器具:
1.移液枪:1ml、200μl、20μl、10μl、2.5μl 2.吸头:1ml、200μl、20μl 3.匀浆管:5ml
4.EP管:1.5ml、500μl、200μl
5.试剂瓶:棕色试剂瓶(广口,放75%乙醇) 6.量筒:100ml 7.容量瓶:1000ml
8.试管架:5ml、1.5ml、20μl 9.铝制饭盒:1-2个 10.大瓷缸:1个 11.锡泊纸:一卷 12.卷纸:2卷
13.三角烧瓶:带盖,稍大
二.实验器具处理
1.塑料制品:(包括枪头、EP管、匀浆管等)先将DEPC水从容量瓶中倒入瓷缸中,将塑料制品逐个浸泡其中(注意:小枪头要充分浸泡,必要时需要针筒打入DEPC水),过夜后取出(注意:DEPC水很难自然晾干,所以建议先将刚取出的DEPC物品甩干,枪头装入枪头盒后甩干,EP管和匀浆管装入饭盒后甩干,然后在37度孵箱烘干)。高压后烤干备用。如果DEPC处理过的物品时间已超过一个星期,再次使用前应再次高压。
2.玻璃制品:泡酸过夜,冲洗干净,先泡1‰DEPC过夜,再蒙锡纸烤干备用。 3.匀浆器:(包括剪刀、镊子)先洗净后,超声消毒即可(不需要泡DE
日本TAKARA公司逆转录和定量PCR体系
逆转录PCR
反应体系如下表: 5×PrimerScript Buffer PrimerScript RT Enzyme Mix Random 6 mers (100 μM) Oligo dT Primer (50 μM) Total RNA RNase Free dH2O Total 反应条件:
37 ℃,15 min逆转录反应;85 ℃,5 s逆转录酶的失活反应;4℃,反应结束,产物为cDNA。若短期内不使用cDNA,应将其放于-80 ℃冰箱保存备用。
荧光定量PCR
反应体系如下表:
SYBR? Premix Ex TaqTM( 2×) PCR Primer Forward、 Reverse (10 μM) Rox
RNase Free dH2O cDNA template Total 反应条件:
95 ℃预变性30 s,95 ℃变性5 s,60 ℃退火30 s,72 ℃延伸30 s,共40个循环。扩增产物于4 ℃冰箱保存。
0.5 μL 9 μL 2 μL 25 μL 12.5 μL 各0.5 μL
2 μL 0.5 μL 0.5 μL 0.5 μL
(500 ng/RNA的浓度) μL
补至10 μL
10 μL
DMSO in PCR
1. 如果要增加特异性,要考虑是否升温,复性时候的较高温度有利于筛选特定片段,减少其他GC丰富片段的竞争。
2. 考虑使用甘油:加甘油也可以的,一般终浓度在10%左右.我的实验也曾遇到过GC高达73%的情况,加过甘油非特异性改善了很多,你不妨试一下.
3. 使用甜菜碱:
DMSO can usually give results in GC-rich regions when used at a final
concentration of 5%, although there are reports in the literature of
genes which required 10% DMSO, so a bit of experimentation may be
necessary to optimise the concentration for your genes. Alternatively,
addition of Betaine to concentrations of 1M in reactions can also be
beneficial in GC-rich regions.
There was a comparison pub
PCR步骤
RT-PCR实验步骤
一、总RNA提取
1)试剂配制
1. 0.1TPC水:1000mL双蒸水中加入1mLDEPC,室温下静置4小时。(①用来泡使用
器具处理12小时;②在120℃下高压灭菌30分钟后室温放置备用用来溶解RNA。) 2. 氯仿 3. 异丙醇
4. 75%乙醇:用无水乙醇和高压后的DPEC水配制,现配现用。
2)操作步骤:
1. 样品处理
a. 组织:将组织放在液氮中磨碎(低温处理)。每50-100mg组织加1mL裂解液TRZOL,
用匀浆仪进行匀浆处理。样品体积不应超过裂解液TRZOL体积的十分之一。 b. 单层培养细胞;直接在培养板上加入裂解液TRZOL裂解细胞,每10cm2面积加1mL
TRZOL。用取样器抽打几次。(注意:裂解液RZ的加入量根据培养瓶面积决定,不是由细胞数决定。如果加量不足,可能导致提取的RNA中有DNA污染。)
c. 细胞悬液:离心取细胞,弃上清。每5-10×106动物细胞和植物细胞加入1mL裂解液RZ。
加裂解液RZ前不要洗涤细胞,以免降解RNA。
d. 血液:直接取新鲜血液,加入3倍体积RZ(推荐0.25mL血液+0.75mLRZ),充分震荡
混匀。
2. 将裂解样品在室温放置5分钟,使得核酸蛋白质复合
qPCR与RT-PCR
虽然Real-time PCR(实时荧光定量PCR)和Reverse transcription PCR(反转录PCR)看起来都可以缩写为RT-PCR,但是,国际上的约定俗成的是:RT-PCR特指反转录PCR,而Real-time PCR一般缩写为qPCR(quantitative real-time PCR)。
更正楼主的观点:qPCR不一定与反转录相关,除了可以用cDNA作为模板,也可以用基因组DNA等作为模板。而反转录PCR也不一定非要与荧光定量相关,从mRNA中反转录得到cDNA,然后PCR扩增出目的基因,这也是反转录PCR。
综上,那RT-qPCR(也有人写成qRT-PCR)就很好理解了,就是结合了荧光定量技术的反转录PCR:先从RNA反转录得到cDNA(RT),然后用Real-time PCR进行定量分析(qPCR)。 有兴趣的话可以看看维基百科:
http://en.wikipedia.org/wiki/Reverse_transcription_polymerase_chain_reaction Reverse transcription polymerase chain reaction (RT-PCR) is a varia
有关PCR习题
一、选出一个最符合题意的答案(最佳答案)。 1.以下哪种物质在PCR反应中不需要( )
A.Taq DNA聚合酶 B.dNTPs C.Mg2+ D.RNA酶 E.合适pH缓冲液 2.以下哪种酶可耐高温( )
A.Taq DNA聚合酶 B.Hind Ⅲ C.T4连接酶 D.RNA酶 E.Klenow片段 3.PCR反应正确过程应为( )
A.退火→变性→延伸 B.变性→退火→延伸 C.退火→延伸→变性 D.变性→延伸→退火E.延伸→变性→退火
4. PCR技术的本质是( )
A. 核酸杂交技术 B. 核酸重组技术C. 核酸扩增技术 D. 核酸变性技术 E. 核酸连接技术 5.Taq DNA聚合酶酶促反应最适温度为( )
A.37℃ B.50℃~55℃ C.70℃~75℃ D.80℃~85℃ E.94℃~95℃ 6.能在细胞内进行PCR扩增的PCR仪为( )
A.普通PCR仪 B.梯度PCR仪 C.原位PCR仪 D.荧光PCR仪 E.实时PCR仪 7.在下列哪种PCR仪扩增样品可以了解样品中DNA原始拷贝数( )
A.普通PCR仪 B.梯度PCR仪 C.原位PCR仪 D.荧光实时PCR仪E.定性PCR仪 8.
RNA提取和反转录
RNA提取实验方法
1、准备工作:a、按照2.1.3.2收样方法,收取PH-1野生型分生孢子、菌丝(6h、12h、24h、36h)、9d子囊壳。b、200℃高温对研钵和研磨棒灭菌。c、电泳槽用3%的H2O2浸泡过夜后用去离子水洗净待用。d、用70%酒精将超净工作台和研磨样品所需的桌面擦洗干净。
2、将样品倒入液氮预冷的研钵中,迅速研磨(3次),待将要液氮挥发完全时,将样品粉末倒入RNA专用离心管内。加入1ml Trizol,涡旋震荡至混合均匀。
3、静置10min后,加入200μL氯仿上下翻转至混合均匀。 4、4℃,1000rpm离心15min
5、将上部澄清液转移到新的无菌的1.5ml离心管中,然后加入等体积与管内溶液的异戊醇。
6、静置15min后,4℃离心机10000rpm,15min。 7、倒去上清,加入1ml的75%乙醇。洗涤沉淀。
8、7500rpm,4℃,离心5min,倒去上部澄清液,置于超净台中吹干。 9、加入100-200μL的DEPC水溶解沉淀。 10、溶解后取5μL稀释10倍测RNA浓度。 11、电泳检测。 DNA的消解
1、在1.5ml离心管中配制以下反应体系:
Total RNA
10×DNaseI reacting
PCR试题要点
【A型题】 在五个选项中选出一个最符合题意的答案(最佳答案)。 1.以下哪种物质在PCR反应中不需要( )
A.Taq DNA聚合酶 B.dNTPs C.Mg2+ D.RNA酶 E.合适pH缓冲液 2.以下哪种酶可耐高温( )
A.Taq DNA聚合酶 B.Hind Ⅲ C.T4连接酶 D.RNA酶 E.Klenow片段
3.PCR反应正确过程应为( )
A.退火→变性→延伸 B.变性→退火→延伸 C.退火→延伸→变性 D.变性→延伸→退火 E.延伸→变性→退火 4. PCR技术的本质是( )
A. 核酸杂交技术 B. 核酸重组技术
C. 核酸扩增技术 D. 核酸变性技术 E. 核酸连接技术
5.Taq DNA聚合酶酶促反应最适温度为( )
A.37℃ B.50℃~55℃ C.70℃~75℃ D.80℃~85℃ E.94℃~95℃
6.温度均一性较好的PCR仪为( )
A.水浴锅PCR基因扩增仪和压缩机PCR基因扩增仪 B.半导体PCR基因扩增仪和离心式空气加热PCR基因扩增仪 C.压缩机PCR基因扩增仪和半导体PCR基因扩增仪 D.压缩机PCR基因扩增仪和离心式空气加热PCR基因扩增仪 E.水浴锅PCR基因扩增仪和离心式空气加热