有关pcr的考点
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有关PCR习题
一、选出一个最符合题意的答案(最佳答案)。 1.以下哪种物质在PCR反应中不需要( )
A.Taq DNA聚合酶 B.dNTPs C.Mg2+ D.RNA酶 E.合适pH缓冲液 2.以下哪种酶可耐高温( )
A.Taq DNA聚合酶 B.Hind Ⅲ C.T4连接酶 D.RNA酶 E.Klenow片段 3.PCR反应正确过程应为( )
A.退火→变性→延伸 B.变性→退火→延伸 C.退火→延伸→变性 D.变性→延伸→退火E.延伸→变性→退火
4. PCR技术的本质是( )
A. 核酸杂交技术 B. 核酸重组技术C. 核酸扩增技术 D. 核酸变性技术 E. 核酸连接技术 5.Taq DNA聚合酶酶促反应最适温度为( )
A.37℃ B.50℃~55℃ C.70℃~75℃ D.80℃~85℃ E.94℃~95℃ 6.能在细胞内进行PCR扩增的PCR仪为( )
A.普通PCR仪 B.梯度PCR仪 C.原位PCR仪 D.荧光PCR仪 E.实时PCR仪 7.在下列哪种PCR仪扩增样品可以了解样品中DNA原始拷贝数( )
A.普通PCR仪 B.梯度PCR仪 C.原位PCR仪 D.荧光实时PCR仪E.定性PCR仪 8.
DMSO in PCR
1. 如果要增加特异性,要考虑是否升温,复性时候的较高温度有利于筛选特定片段,减少其他GC丰富片段的竞争。
2. 考虑使用甘油:加甘油也可以的,一般终浓度在10%左右.我的实验也曾遇到过GC高达73%的情况,加过甘油非特异性改善了很多,你不妨试一下.
3. 使用甜菜碱:
DMSO can usually give results in GC-rich regions when used at a final
concentration of 5%, although there are reports in the literature of
genes which required 10% DMSO, so a bit of experimentation may be
necessary to optimise the concentration for your genes. Alternatively,
addition of Betaine to concentrations of 1M in reactions can also be
beneficial in GC-rich regions.
There was a comparison pub
PCR步骤
RT-PCR实验步骤
一、总RNA提取
1)试剂配制
1. 0.1TPC水:1000mL双蒸水中加入1mLDEPC,室温下静置4小时。(①用来泡使用
器具处理12小时;②在120℃下高压灭菌30分钟后室温放置备用用来溶解RNA。) 2. 氯仿 3. 异丙醇
4. 75%乙醇:用无水乙醇和高压后的DPEC水配制,现配现用。
2)操作步骤:
1. 样品处理
a. 组织:将组织放在液氮中磨碎(低温处理)。每50-100mg组织加1mL裂解液TRZOL,
用匀浆仪进行匀浆处理。样品体积不应超过裂解液TRZOL体积的十分之一。 b. 单层培养细胞;直接在培养板上加入裂解液TRZOL裂解细胞,每10cm2面积加1mL
TRZOL。用取样器抽打几次。(注意:裂解液RZ的加入量根据培养瓶面积决定,不是由细胞数决定。如果加量不足,可能导致提取的RNA中有DNA污染。)
c. 细胞悬液:离心取细胞,弃上清。每5-10×106动物细胞和植物细胞加入1mL裂解液RZ。
加裂解液RZ前不要洗涤细胞,以免降解RNA。
d. 血液:直接取新鲜血液,加入3倍体积RZ(推荐0.25mL血液+0.75mLRZ),充分震荡
混匀。
2. 将裂解样品在室温放置5分钟,使得核酸蛋白质复合
实时定量PCR 的操作流程
用于检测细胞基因转录水平的实时定量PCR的操作流程
(Real Time Quantitative PCR Protocol For Detection of Gene Expression)
第一部分 原理
real time PCR 是普通PCR的一项改进,使用了针对扩增DNA的荧光物质,使得DNA的数量与检测到的荧光强度成线性关系,大致得到DNA的扩增曲线(如,图一)。
图一:引自美国应用生物系统中国公司网站——实时荧光定量的定量方法。
名词解释:
PCR ——一种科学准确
Rn:一个反应管经n次热循环后,测得的荧光强度。 Rn+:反应管含有模板DNA。 Rn-:反应管含有模板DNA。
无模板对照:No template control,Rn-,理想情况下,是一条平线,只具有背景荧光数值。 Threshold: 荧光(Rn)超过本底时的临界数值。 Ct: threshold cycle,临界循环数,threshold 横线与扩增曲线相交,所得交点所对应的循环数。 基线:baseline, 是背景曲线的一段,范围——从反应开始不久荧光值开始变得稳定,直到所有反应管的荧光都将要,但是还未,超出背景。
仪器:热循环仪器(GeneAmp Thermal Cycl
RT-PCR的具体步骤
RT-PCR实验步骤 一.实验器具:
1.移液枪:1ml、200μl、20μl、10μl、2.5μl 2.吸头:1ml、200μl、20μl 3.匀浆管:5ml
4.EP管:1.5ml、500μl、200μl
5.试剂瓶:棕色试剂瓶(广口,放75%乙醇) 6.量筒:100ml 7.容量瓶:1000ml
8.试管架:5ml、1.5ml、20μl 9.铝制饭盒:1-2个 10.大瓷缸:1个 11.锡泊纸:一卷 12.卷纸:2卷
13.三角烧瓶:带盖,稍大 二.实验器具处理
1.塑料制品:(包括枪头、EP管、匀浆管等)先将DEPC水从容量瓶中倒入瓷缸中,将塑料制品逐个浸泡其中(注意:小枪头要充分浸泡,必要时需要针筒打入DEPC水),过夜后取出(注意:DEPC水很难自然晾干,所以建议先将刚取出的DEPC物品甩干,枪头装入枪头盒后甩干,EP管和匀浆管装入饭盒后甩干,然后在37度孵箱烘干)。高压后烤干备用。如果DEPC处理过的物品时间已超过一个星期,再次使用前应再次高压。
2.玻璃制品:泡酸过夜,冲洗干净,先泡1‰DEPC过夜,再蒙锡纸烤干备用。 3.匀浆器:(包括剪刀、镊子)先洗净后,超声消毒即可(不需要泡DEPC)。 三.试剂配制
1.DEPC水:吸
PCR试题要点
【A型题】 在五个选项中选出一个最符合题意的答案(最佳答案)。 1.以下哪种物质在PCR反应中不需要( )
A.Taq DNA聚合酶 B.dNTPs C.Mg2+ D.RNA酶 E.合适pH缓冲液 2.以下哪种酶可耐高温( )
A.Taq DNA聚合酶 B.Hind Ⅲ C.T4连接酶 D.RNA酶 E.Klenow片段
3.PCR反应正确过程应为( )
A.退火→变性→延伸 B.变性→退火→延伸 C.退火→延伸→变性 D.变性→延伸→退火 E.延伸→变性→退火 4. PCR技术的本质是( )
A. 核酸杂交技术 B. 核酸重组技术
C. 核酸扩增技术 D. 核酸变性技术 E. 核酸连接技术
5.Taq DNA聚合酶酶促反应最适温度为( )
A.37℃ B.50℃~55℃ C.70℃~75℃ D.80℃~85℃ E.94℃~95℃
6.温度均一性较好的PCR仪为( )
A.水浴锅PCR基因扩增仪和压缩机PCR基因扩增仪 B.半导体PCR基因扩增仪和离心式空气加热PCR基因扩增仪 C.压缩机PCR基因扩增仪和半导体PCR基因扩增仪 D.压缩机PCR基因扩增仪和离心式空气加热PCR基因扩增仪 E.水浴锅PCR基因扩增仪和离心式空气加热
PCR 引物设计的原则和要点
PCR 引物设计的原则和要点
PCR 引物设计的原则和要点
http://www.77cn.com.cn 2005-5-13 9:13:57 来源:生物中国人
引物设计有3 条基本原则:首先引物与模板的序列要紧密互补,其次引物与引物之间避免形成稳定的二聚体或发夹结构,再次引物不能在模板的非目的位点引发DNA 聚合反应(即错配)。引物设计应注意如下要点:
1 引物的长度一般为15-30 bp,常用的是18-27 bp,但不应大于38,因为过长会导致其延伸温度大于74℃,不适于Taq DNA 聚合酶进行反应。
2 引物序列在模板内应当没有相似性较高,尤其是3’端相似性较高的序列,否则容易导致错配。引物3’端出现3 个以上的连续碱基,如GGG 或CCC,也会使错误引发机率增加[2]。 3 引物3’端的末位碱基对Taq 酶的DNA 合成效率有较大的影响。不同的末位碱基在错配位置导致不同的扩增效率,末位碱基为A 的错配效率明显高于其他3 个碱基,因此应当避免在引物的3’端使用碱基A[3][4]。另外,引物二聚体或发夹结构也可能导致PCR 反应失败。5’端序列对PCR 影响不太大,因此常用来引进修饰位点或标记物[2]。 4 引物序列的GC 含量一般为40-60
临床PCR实验室的建设
关于临床PCR实验室的建设陕西区 技术支持 潘长浩
手机:15991279010 邮箱:15991279010@
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临床基因扩增检验实验室的设计要求依据中华人民共和国卫生部卫医发[2002 ]10 号 《临床基因扩增检验实验室管理暂行办法》 卫生部办公厅关于印发[2010 ]194 号 《医疗机构临床基因扩增检验实验室管理办法》
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内容提要一、硬件要求: ①分区 ②设备二、软件要求:
①SOP文件 ②实验室工作开展
三、实验室的认证
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临床PCR实验室的分区试剂储存和准备
标本制备区扩增区 产物分析区本版权归中山大学达安基因股份有限公司所有
临床PCR实验室设计的一般原则 各区独立 注意方向 因地制宜 方便工作
“十六字口诀”
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理想的PCR实验室分区设计模式
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PCR实验室各区的设备配置表分区器材选配
PCR① 试剂区
PCR② 制备区
PCR③ 扩增区√★
PCR④ 分析区
PCR仪器 生物安
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内容提要一、硬件要求: ①分区 ②设备二、软件要求:
①SOP文件 ②实验室工作开展
三、实验室的认证
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“十六字口诀”
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PCR① 试剂区
PCR② 制备区
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PCR 引物设计的原则和要点
PCR 引物设计的原则和要点
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http://www.77cn.com.cn 2005-5-13 9:13:57 来源:生物中国人
引物设计有3 条基本原则:首先引物与模板的序列要紧密互补,其次引物与引物之间避免形成稳定的二聚体或发夹结构,再次引物不能在模板的非目的位点引发DNA 聚合反应(即错配)。引物设计应注意如下要点:
1 引物的长度一般为15-30 bp,常用的是18-27 bp,但不应大于38,因为过长会导致其延伸温度大于74℃,不适于Taq DNA 聚合酶进行反应。
2 引物序列在模板内应当没有相似性较高,尤其是3’端相似性较高的序列,否则容易导致错配。引物3’端出现3 个以上的连续碱基,如GGG 或CCC,也会使错误引发机率增加[2]。 3 引物3’端的末位碱基对Taq 酶的DNA 合成效率有较大的影响。不同的末位碱基在错配位置导致不同的扩增效率,末位碱基为A 的错配效率明显高于其他3 个碱基,因此应当避免在引物的3’端使用碱基A[3][4]。另外,引物二聚体或发夹结构也可能导致PCR 反应失败。5’端序列对PCR 影响不太大,因此常用来引进修饰位点或标记物[2]。 4 引物序列的GC 含量一般为40-60