真核生物启动子特点
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常见真核启动子及原核启动子特点
真核启动子
RNA转主要用途 录本 启动子 描述 表达 备注 CMV 常规表达用 人类巨细胞病毒来mRNA 源的强哺乳动物表达启动子 组成型 可能包含一个增强子,在某些细胞中会沉默 EF1a
常规表达用
人延长因子1α来源
mRNA
的强哺乳动物表达启动子
组成型
表达水平十分稳定,与细胞类型无关
SV40 常规表达用 猿猴空泡病毒40来mRNA 源的哺乳动物表达启动子 组成型 可能包含一个增强子 PGK1 (人/小鼠)
常规表达用
磷酸甘油酸酯激酶
mRNA
基因来源的哺乳动物启动子
组成型
广泛表达,但可能因细胞类型而异。由于甲基化或脱乙酰作用,倾向于抵抗启动子下调。
Ubc 常规表达用 人类泛素C基因来mRNA 源的哺乳动物启动子 组成型 顾名思义,该启动子无处不在 human beta actin
常规表达用
β-肌动蛋白基因来
mRNA
源的哺乳动物启动子
组成型
无处不在,鸡的启动子常用与启动子杂交
CAG 常规表达用 mRNA 强杂交哺乳动物启动子 组成型 包含CMV的增强子,鸡的beta actin启动子和兔的beta-globin剪接受体 TRE
常规表达用
mRNA
四环素响应元件启动子
被四环素或
者类似
真核生物三类启动子
真核生物启动子有三类,分别由RNA聚合酶Ⅰ、Ⅱ和Ⅲ进行转录。 类别Ⅰ(class Ⅰ)启动子:
只控制rRNA前体基因的转录,转录产物经切割和加工后生成各种成熟rRNA。 类别Ⅰ启动子由两部分保守序列组成:
核心启动子(core promoter):位于转录起点附近,从-45至+20; 上游控制元件(upstream control element,UCE):位于-180至-107;
RNA聚合酶Ⅰ对其转录需要2种因子参与:
UBF1:一条M为97000的多肽链,结合在上述两部分的富含GC区;
1个TBP,即TATA结合蛋白(TATA-binding protein,TBP);
SL1:一个四聚体蛋白,含有 3个不同的转录辅助因子TAFⅠ;
在SL1因子介导下RNA聚合酶Ⅰ结合在转录起点上并开始转录。 类别Ⅱ(class Ⅱ)启动子:
类别Ⅱ启动子涉及众多编码蛋白质的基因表达的控制。 该类启动子包含4类控制元件:
基本启动子(basal promoter):序列为中心在-25至-30左右的7 bp保守区,TATAAAA/T,
称为TATA框或Goldberg-Hogness 框。与RNA聚合酶的定位有关,DNA双链在此解开并决定转录的起点位置
真核生物三类启动子
真核生物启动子有三类,分别由RNA聚合酶Ⅰ、Ⅱ和Ⅲ进行转录。 类别Ⅰ(class Ⅰ)启动子:
只控制rRNA前体基因的转录,转录产物经切割和加工后生成各种成熟rRNA。 类别Ⅰ启动子由两部分保守序列组成:
核心启动子(core promoter):位于转录起点附近,从-45至+20; 上游控制元件(upstream control element,UCE):位于-180至-107;
RNA聚合酶Ⅰ对其转录需要2种因子参与:
UBF1:一条M为97000的多肽链,结合在上述两部分的富含GC区;
1个TBP,即TATA结合蛋白(TATA-binding protein,TBP);
SL1:一个四聚体蛋白,含有 3个不同的转录辅助因子TAFⅠ;
在SL1因子介导下RNA聚合酶Ⅰ结合在转录起点上并开始转录。 类别Ⅱ(class Ⅱ)启动子:
类别Ⅱ启动子涉及众多编码蛋白质的基因表达的控制。 该类启动子包含4类控制元件:
基本启动子(basal promoter):序列为中心在-25至-30左右的7 bp保守区,TATAAAA/T,
称为TATA框或Goldberg-Hogness 框。与RNA聚合酶的定位有关,DNA双链在此解开并决定转录的起点位置
如何找一个基因的启动子序列呢? - 图文
1、 UCSC
(1)网址:http://genome.ucsc.edu/cgi-bin/hgNear
在Genome里选择物种,比如human,search里输入你的基因名PTEN,点击Go (2)出现新的页面,看到“Known Gene Names”下面的PTEN了吧,点它 (3)又回到了和(1)类似的页面,此时,点击sequence
(4)出现一个新的页面,选中promoter,同时可以输入数值修改具体的序列区域,比如Promoter including 2000 bases upstream and 100 downstream,即表示启动子-2000~+100区域
(5)点击“get sequence”,出现页面中最上面的序列“>uc001kfb.1 (promoter 2000 100) PTEN - phosphatase and tensin homolog”就是你要的人PTEN启动子-2000~+100区域的序列了
2、Ensembl
(1)网址:http://www.ensembl.org/index.html
在“Search Ensembl“标题下search后的下拉框中选中物种名homo sapiens(人),fo
原核生物和真核生物基因表达调控复制、转录、翻译特点的比较
原核生物和真核生物基因表达调控、复制、转录、翻译特点的比较
1.相同点:转录起始是基因表达调控的关键环节
①结构基因均有调控序列;
②表达过程都具有复杂性,表现为多环节; ③表达的时空性,表现为不同发育阶段和不同组织器官上的表达的复杂性;
2.不同点:
①原核基因的表达调控主要包括转录和翻译水平。真核基因的表达调控主要包括染色质活化、转录、转录后加工、翻译、翻译后加工多个层次。 ②原核基因表达调控主要为负调控,真核主要为正调控。 ③原核转录不需要转录因子,RNA聚合酶直接结合启动子,由sita因子决定基因表的的特异性,真核基因转录起始需要基础特异两类转录因子,依赖DNA-蛋白质、蛋白质-蛋白质相互作用调控转录激活。 ④原核基因表达调控主要采用操纵子模型,转录出多顺反子RNA,实现协调调节;真核基因转录产物为单顺反子RNA,功能相关蛋白的协调表达机制更为复杂。 ⑤真核生物基因表达调控的环节主要在转录水平,其次是翻译水平。原核生物基因以操纵子的形式存在。转录水平调控涉及到启动子、sita因子与RNA聚合酶结合、阻遏蛋白、负调控、正调控蛋白、倒位蛋白、RNA聚合酶抑制物、衰减子等。翻译水平的调控涉及SD序列、mRNA的稳定性不稳定(5
原核生物和真核生物基因表达调控复制、转录、翻译特点的比较
原核生物和真核生物基因表达调控、复制、转录、翻译特点的比较
1.相同点:转录起始是基因表达调控的关键环节
①结构基因均有调控序列;
②表达过程都具有复杂性,表现为多环节; ③表达的时空性,表现为不同发育阶段和不同组织器官上的表达的复杂性;
2.不同点:
①原核基因的表达调控主要包括转录和翻译水平。真核基因的表达调控主要包括染色质活化、转录、转录后加工、翻译、翻译后加工多个层次。 ②原核基因表达调控主要为负调控,真核主要为正调控。 ③原核转录不需要转录因子,RNA聚合酶直接结合启动子,由sita因子决定基因表的的特异性,真核基因转录起始需要基础特异两类转录因子,依赖DNA-蛋白质、蛋白质-蛋白质相互作用调控转录激活。 ④原核基因表达调控主要采用操纵子模型,转录出多顺反子RNA,实现协调调节;真核基因转录产物为单顺反子RNA,功能相关蛋白的协调表达机制更为复杂。 ⑤真核生物基因表达调控的环节主要在转录水平,其次是翻译水平。原核生物基因以操纵子的形式存在。转录水平调控涉及到启动子、sita因子与RNA聚合酶结合、阻遏蛋白、负调控、正调控蛋白、倒位蛋白、RNA聚合酶抑制物、衰减子等。翻译水平的调控涉及SD序列、mRNA的稳定性不稳定(5
葡萄逆境胁迫诱导启动子的克隆及其表达载体的构建 - 图文
青岛农业大学 毕 业 论 文(设计)
题 目: 葡萄逆境胁迫诱导启动子的克隆
及其表达载体的构建
姓 名: 刘丽雪 学 院: 生命科学学院 专 业: 生物技术 班 级: 2007级4班 学 号: 20072833 指导教师: 薛仁镐
2010年6月17日
目 录
中文摘要···························································································································1 Abstract······························································································································2
棉花SUPERMAN类锌指蛋白基因GZFP的启动子及功能分析
棉花SUPERMAN类锌指蛋白基因GZFP的启动子及功能分析
棉花学报CottonScience2011,23(6):483~489
研究与进展
棉花SUPERMAN类锌指蛋白基因GZFP的
启动子及功能分析
杨郁文1,周建武2,张保龙1*,范晓慧1,任永哲1,陈天子1
(1.江苏省农业科学院农业生物技术研究所/江苏省农业生物学重点实验室,江苏南京210014;2.扬州大学生物科学与技术学院,江苏扬州225009)
摘要:GZFP是来源于陆地棉的一个SUPERMAN类锌指蛋白基因。为了进一步了解该基因功能,本研究通过染色体步移(Genomewalking)获得其启动子区域,并构建该片段与GUS连接的重组载体pBI-pGZFP-5::GUS,通过花浸染法转化拟南芥。转基因植株的GUS染色结果表明GUS基因主要在根部以及花器官表达,而叶片中的表达量很低,并且根部的表达量在整个生育期都很强。通过半定量RT-PCR分析不同诱导下GZFP基因的表达变化,发现ABA、干旱、盐胁迫诱导可以提高其表达量。构建GZFP过量表达载体并通过叶盘法转化烟草,烟草转化株的表型无明显变化,但是转化株中NtOPBP1和NtERD10的表达量较未转化株明显增强,而这两个基因都参与了植物的
真核微生物试题
第二章 真核微生物
一、名词解释
1、无性繁殖 2、假根 3、菌丝体 4、子实体 5、有性繁殖 6、准性生殖 7、真菌 8、同宗结合 9、异宗结合 10、锁状联合 二、填空
1、Neurospora在分类上属于________亚门的真菌。 2、Auricularia在分类上是属于________亚门的真菌。 3、双孢蘑菇在分类上是属于________亚门的真菌。 4、Rhizopus在分类上属于________亚门的真菌。
5、真菌无性繁殖孢子的种类主要有________,________,________,________和________等五种。 6、真菌的有性孢子种类有________,________,________和________。 7、酵母菌的无性繁殖方式主要有________和________。 8、真菌细胞的线粒体是________的细胞器。
9、丝状真菌的无隔菌丝是由________细胞组成,有隔菌丝是由________细胞组成。 10、真菌菌丝有两种类型,低等真菌的菌丝是________,高等真菌的菌丝是________。 11、有一类真菌,由于仅发现
真核生物基因表达的调控
课次:19
教学目的:使学生了解真核基因表达调控的特点、转录前的调控,掌握增强子的作用特点和反式作用因子
的DNA结合域的结构花式。
重点:增强子和反式作用因子的DNA结合域的结构花式。 难点:反式作用因子的DNA结合域的结构花式。 复习旧课:提问2人,了解教学效果。 导入新课:
第八章 真核生物基因表达的调控
第一节 概述
真核生物细胞中由核膜将核和细胞质分隔开,转录和翻译并不偶联;基困组是由多条染色体组成。 真核基因的调节分为: 真核基因表达调控的特点:
第二节 转录前的调控
一. DNA的甲基化与去甲基化
真核DNA中的胞嘧啶约有5%被甲基化为5-甲基胞嘧啶(5-methylcytidine,m5C),而活跃转录的DNA段落中胞嘧啶甲基化程度常较低。
甲基化可使基因失活,去甲基化又可使基因恢复活性。 二 染色质结构对真核基因转录的调控 1.染色质结构影响基因转录
常染色质中的基因可以转录,异染色质(heterochromatin),无基因转录表达。 2. 组蛋白的作用
? 组蛋白扮演了非特异性阻遏蛋白的作用,
? 非组蛋白成分起到特异性的去阻遏促转录作用。 ? 核小体结构影响基因转录。
三 基因重排和基因扩增对基因表达的影