circRNA

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circRNA

标签:文库时间:2024-11-05
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环状RNA:非编码RNA中的一颗明星

摘要:circRNAs是一种共价闭合环状RNA,高频率出现于真核生物转录本中。最近在哺乳动物细胞中发现了成千中内源的circRNAs。circRNAs由内含子或外显子序列产生,,反向重复序列和RBPs对于circRNAs的形成是必要的。绝大多数circRNAs在不同物种间具有保守性、稳定性,对RNas P具有抗性,常表现组织或发育阶段表达特异性。最近研究已经表明circRNAs可以以miRNA 海绵发挥作用,调控剪切或转录及亲本基因的表达。已有研究证明circRNAs在 动脉粥样硬化血管疾病、神经紊乱、玩病毒感染疾病和癌症中具有重要作用,在直肠癌和胰腺管恶性肿瘤中异常表达,这暗示circRNAs可以作为预测或检测某些疾病的生物标记分子。与miRNA和lncRNA相似,circRNAs已经成为RNA研究领域的一大热点,广泛参与到生命的各个反应中。本人简要介绍了一下circRNAs的形成机制、性质、功能以及它们在疾病中的重要意义。 关键词:环状RNA;选择性环化;MicroRNA 海绵;基因表达调控;生物标记

Circular RNA: A new star of noncoding RNAs

Chunlai

circrna数据库再更新,这次不只有肿瘤了

标签:文库时间:2024-11-05
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circrna数据库再更新,这次不只有肿瘤了

关于circRNA相关的数据库,我们已经专门写文章介绍过了:环状RNA研究有哪些好用的数据库,下面我们介绍两个新的数据:

第一个是CSCD: a database for cancer-specific circular RNAs.Nucleic Acids Res. 2018 Jan 4;46(D1):D925-D929.地址:http://gb.whu.edu.cn/CSCD/这个数据库是肿瘤与circRNA相关的:左侧是搜索框,右侧是显示框,比如我们可以在左侧第二个输入框选择细胞类型,比如肺癌细胞系A549:在右下方可以看到miRNA应答原件(MRE)和RNA结合蛋白(RBP)的信息:

第二个是circRNADisease:a manually curated database of experimentally supported circRNA-disease associations.Cell Death Dis. 2018 Apr 27;9(5):475. 网址:

http://cgga.org.cn:9091/circRNADisease/这个数据库收录了48种疾病和330条