过渡态符号

NEB寻找过渡态专题讨论

概念解释：

NEB（nudged elastic band）是一种已知反应物和产物来寻找鞍点和最小能量路径的方法。用NEB可以计算其扩散路径或扩散势垒、过渡态。NEB方法集合了LUP与PEB方法的优点，其函数形式基于PEB。从PEB方法的讨论可以看出，弹簧势是必须的，它平行于路径切线（R(i)-R(i-1)与R(i+1)-R(i)矢量和的方向）的分量保证结构点均匀分布在MEP上来描述它；但其垂直于路径的分量造成的弊端也很明显，它改变了这个方向的实际的势能面，优化后得到的MEP'就与真实的MEP发生了偏差，造成corner-cutting问题。解决这个问题很简单，在NEB中称为nudge过程，即每个点在平行于路径切线上的受力只等于弹簧力在这个方向分量，每个点在垂直于路径切线方向的受力只等于势能力在此方向上分量。这样弹簧力垂直于路径的分量就被投影掉了，而有用的平行于路径的分量完全保留；势能力在路径方向上的分量也不会再对结构点分布的均匀性产生影响，被保留的它在垂直于路径上的分量将会引导结构点地正确移动。这样优化收敛后结构点就能正确描述真实的MEP，矛盾得到解决。弹簧力常数的设定也比较随意，不会再对结果产生明显影响。但是当平

NEB寻找过渡态专题讨论

概念解释：

NEB（nudged elastic band）是一种已知反应物和产物来寻找鞍点和最小能量路径的方法。用NEB可以计算其扩散路径或扩散势垒、过渡态。NEB方法集合了LUP与PEB方法的优点，其函数形式基于PEB。从PEB方法的讨论可以看出，弹簧势是必须的，它平行于路径切线（R(i)-R(i-1)与R(i+1)-R(i)矢量和的方向）的分量保证结构点均匀分布在MEP上来描述它；但其垂直于路径的分量造成的弊端也很明显，它改变了这个方向的实际的势能面，优化后得到的MEP'就与真实的MEP发生了偏差，造成corner-cutting问题。解决这个问题很简单，在NEB中称为nudge过程，即每个点在平行于路径切线上的受力只等于弹簧力在这个方向分量，每个点在垂直于路径切线方向的受力只等于势能力在此方向上分量。这样弹簧力垂直于路径的分量就被投影掉了，而有用的平行于路径的分量完全保留；势能力在路径方向上的分量也不会再对结构点分布的均匀性产生影响，被保留的它在垂直于路径上的分量将会引导结构点地正确移动。这样优化收敛后结构点就能正确描述真实的MEP，矛盾得到解决。弹簧力常数的设定也比较随意，不会再对结果产生明显影响。但是当平

NEB寻找过渡态专题讨论

概念解释：

NEB（nudged elastic band）是一种已知反应物和产物来寻找鞍点和最小能量路径的方法。用NEB可以计算其扩散路径或扩散势垒、过渡态。NEB方法集合了LUP与PEB方法的优点，其函数形式基于PEB。从PEB方法的讨论可以看出，弹簧势是必须的，它平行于路径切线（R(i)-R(i-1)与R(i+1)-R(i)矢量和的方向）的分量保证结构点均匀分布在MEP上来描述它；但其垂直于路径的分量造成的弊端也很明显，它改变了这个方向的实际的势能面，优化后得到的MEP'就与真实的MEP发生了偏差，造成corner-cutting问题。解决这个问题很简单，在NEB中称为nudge过程，即每个点在平行于路径切线上的受力只等于弹簧力在这个方向分量，每个点在垂直于路径切线方向的受力只等于势能力在此方向上分量。这样弹簧力垂直于路径的分量就被投影掉了，而有用的平行于路径的分量完全保留；势能力在路径方向上的分量也不会再对结构点分布的均匀性产生影响，被保留的它在垂直于路径上的分量将会引导结构点地正确移动。这样优化收敛后结构点就能正确描述真实的MEP，矛盾得到解决。弹簧力常数的设定也比较随意，不会再对结果产生明显影响。但是当平

过渡态、反应路径的计算方法及相关问题

Sobereva

Department of Chemistry, University of Science and Technology Beijing, Beijing

100083, China

前言：本文主要介绍过渡态、反应路径的计算方法，并讨论相关问题。由于这类算法极多，可以互相组合，限于精力不可能面面俱到展开，所以只介绍常用，或者实用价值有限但有启发性的方法。文中图片来自相关文献，做了一定修改。由于本文作为帖子发布，文中无法插入复杂公式，故文中尽量将公式转化为文字描述并加以解释，这样必然不如公式形式严谨，而且过于复杂的公式只能略过，但我想这样做的好处是更易把握方法的梗概，有兴趣可以进一步阅读原文了解细节。对于Gaussian中可以实现的方法，文中对其在Gaussian中的使用进行了一些讨论，希望能纠正一些网上流传的误区。虽然绝大多数人不专门研究计算方法，其中很多方法也不会用到，但多了解一下对开阔思路是很有好处的。

文中指的“反应”包括构象变化、异构化、单分子反应等任何涉及到过渡态的变化过程。“反应物”与“产物”泛指这些过程的初态和末态。“优化”若未注明，包括优化至极小点和优化至过渡态。势

过渡态简单点说就是化学反应中瞬间形成的高自由能的不稳定复合物，形象点说就是就是反应势能面上的一个鞍点，所谓的找过渡态也就是要找到这个反应势能面上的这个鞍点，这里以DA反应作为例子简单说下我用gaussian找过渡态的经验。

Gaussian里面找过渡态主要有3种方法：TS、QST2以及QST3。这里套用gaussian手册里的说明。TS是进行过渡态而不是局部最小值的优化计算。QST2是使用STQN 方法寻找过渡态结构。这个选项需要输入反应物和产物分子结构，先后通过两组连续的标题和分子说明部分定义。注意在这两个结构中的原子顺序必需一致。TS 不能和QST2 合用。QST3是使用STQN 方法寻找过渡态结构。这个选项需要输入反应物，产物和最初的过渡态结构，先后由三组连续的标题和分子说明部分定义。注意在这三个结构中的原子顺序必需一致。TS 不能和QST3 合用。接下来贴出几个例子来说明下TS、QST2和QST3的输入文件该怎么写

%chk=c2h4_c4h6_ts %nproc=1

%mem=200mb

# opt=(ts,calcfc) freq=noraman b3lyp/6-31g* Title Card Required 0 1

C

上次我们学习了日语的“五大态”的“可能态”“被动态”。这次继续学习“使役态”、“自发态”和“被役态”。

三、使役态

表示让别人作某种动作的表现手法。 形式：动词的未然形 ＋ せる/させる

构成： 五段动词：把词尾「う」段上的假名变成其所在行「あ」段上的假名加「せる」。如： 書く→書かせる 買う→買わせる 飲む→飲ませる 呼ぶ→呼ばせる 持つ→持たせる 一段动词：去掉词尾「る」加「させる」。如： 寝る→寝させる 食べる→食べさせる サ变动词：「する」的未然形「さ」加「せる」。如：

勉強する→勉強させる 練習する→練習させる カ变动词：只有一个词。如： 来る→来させる

用法：根据谓语动词词性的不同，将使役态的句型大致可以分成两大类。也就是“他动词的使役态句型”和“自动词的使役态句型”。如下表所示。

他动词的使役态句型：（甲）は（乙）に…を＋动词的使役态 注：这里的「に」表示被使役的对象。「を」表示动词的作用对象。 自动词的使役态句型：（甲）は（乙）を…＋动词的使役态

注：这里的「を」表示被使役的对象。

例：◇おばあさんは妹に新聞を読ませた。 ◇母は弟に薬を飲ませた。

◇李先生は

篇一：小学四年级阅读训练-找出文章的过渡句

找出文章的过渡句 阅读方法点拨：

过渡句是提示文章前后之间存在联系的语句，在文中起着承上启下的作用。找到过渡句，就找到了连接前后内容的线索。

过渡的形式大致有以下几种：

一、连贯式过渡

例：下课的铃声响了，同学们立刻走出教室，来到操场上，开展各种各样的体育活动或游戏。我和小兰拿绳用力地摇，其他同学站成一排，一个接一个地进行“鱼贯式”跳绳。大家都小心翼翼地跳着，生怕因为自己跳不好而影响大家。

二、承接式

例：于是我又回忆起另一个画面，这就是所谓的“黄土高原”。

三、总分式过渡

例：小兰爱干净，这一点谁都知道。她穿的衣服，哪怕是旧衣服，也总是洗得干干净净的；她用的文具、玩的玩具总是一尘不染；她还经常剪指甲、洗头、洗脚，并且饭前便后坚持洗手呢！

四、转折式过渡

例：小兰虽然对自己要求十分严格，节俭得很，但是对班里生活有困难的同学却毫不吝啬，慷慨大方。

五、递进式过渡。

例：小兰不但自己刻苦钻研，学习成绩很好，（这是在说上一段）而且还能主动帮助别的同学搞好学习，提高成绩。（引出下一段内容）

阅读拓展训练：

蝉的一生

夏天到了，知了即将唱起歌来了。我在夏至到来的前五天听见了一只知了来到院子里的槐树上开始唱歌，时间与法布尔《昆虫记》所说的内容

过渡、磨合与创新

——对实行作业长制的几点思考

马桢亚

马钢以“新系统、新体制、新机制”为出发点，在一钢厂、热轧板厂、冷轧板厂率先引进宝钢的作业长制，这是一次涉及面甚广的管理变革，对马钢的影响将是深远的。

宝钢的作业长制与马钢现行的基层管理模式有很大的区别，推行作业长制必将经历一个艰难的、复杂的过程。笔者认为，总体上看，要经历过渡期、磨合期与创新期。过渡期指的是在不完全具备条件的情况下，如没有建立计划值系统使“五制”不配套、信息化技术不能全面覆盖导致集中一贯和网络管理难以实施等，我们一方面积极创造条件，一方面仍沿着作业长制的路子去走，显然要采取一些过渡性措施。磨合期指的是在条件基本具备的情况下，新的管理模式与我们的管理系统应该有一段时间的磨合。创新期指的是，为取得实效，使新的管理模式真正融入马钢的血液，促进马钢的管理转型，我们对作业长制不能教条式地照搬，在消化吸收宝钢的先进管理经验的基础上，必须进行自主创新。过渡、磨合与创新又是互相交叉、渗透的，过渡期有磨合，在过渡和磨合过程中，就贯穿着创新。

针对实行作业长制存在过渡、磨合与创新过程这一分析，我认为我们应该进行务实思考、系统思考和前瞻思考。其必要性在于，改进管理既要体现先进性，又要有可行性，

过渡金属离子颜色

过渡金属离子颜色

李蔚妮 成慧明 刘 玥 郑 萃

我们处在五彩缤纷的世界里，绚丽的大自然往往让我们惊叹不已。这一切的颜色的由来，自然是由于各种化合物丰富多彩的颜色的组合。而在有色化学物质家族中，无机金属离子无疑是里面最大的一个旁支。本文讨论几种有趣的使无机金属离子的化合物的颜色转变的方法。

一、物质显色机理

处在低能级的电子吸收某个波段的光向高能级跃迁，如果吸收的光波恰好在可见光区，则物质显出吸收光颜色的互补色。这就是化合物具有千千万万颜色的根本原因。所以要改变物质颜色，从根本上说是要改变某原子或离子的电子排布。

颜色是一种感觉，是人眼对一定波长范围的光的感性辨识。其本质是光，更本质一点说是能量。

各色光对应的电磁波长（单位：nm）：

紫色：400-430，蓝色：430-480，青色：480-500，绿色：500-560，黄色：560-590 橙色：590-620，红色：620-760；

物质之所以能够呈现出颜色是因为它们能够选择性地吸收并发射出某特定波长的电磁波，当这种电磁波的波长处在一定范围中时就会显出相应的颜色。

组成物质的分子（离子、原子）中，电子在一定的轨道范围内运动，而这种运动并不是十分稳定的，因为不同轨道的电子所具有的能

1、同学们，你们想知道这个小秘密吗？好，那请同学们认真观察，四个小组的同学一起寻找，看哪组最先找到。

2、请同学们再想一想，除了直接剪拼之外，还有没有其它方法？

3、通过刚才的学习，同学们不仅知道了平均数的含义，而且会求平均数了，你们觉得学了这些知识，能解决哪些问题？

4、刚才老师给同学们设计了一份练习，同学们做得挺好，大家能不能利用今天整理的这些常用的计量单位，联系生活实际，以小组为单位来设计一些精彩题目呢？

5、例一的内容同学们掌握的很好，老师相信，仿照刚才的学习方法，你一定会很快学会例2 6、为了测量物体的长短，我们需要用长度单位；为了测量物体表面的大小，我们就要——面积单位。

7、同学们通过动手操作发现圆里的知识还真不少，数学家们把这些知识都规定为不同的名称，你们想知道吗？请同学们自学课本第4一9小节，自学圆里各部分名称。

8、同学们由上往下观察，知道了小数点向右移动引起小数大小变化的规律。现在我们由下往上观察，能发现什么规律呢？

9、同学们真爱动脑筋，猜想了圆有这么多特征，但是你们的猜想都对吗？你自己能不能想一个办法来验证一下，试试看，看谁最棒。

10、看同学们这么聪明，分数的意义就让大家自己来总结，好吗？ 11、为帮助我们更清楚地