荧光定量PCR仪实验报告

RT-qPCR比较不同样本中miR-21的相对表达差异

一、实验目的

1、掌握实时荧光定量PCR的实验原理。

2、掌握实时荧光定量PCR相对定量的分析方法。

二、实验原理

实时荧光定量PCR (Quantitative Real-time PCR)是一种在DNA扩增反应中，以荧光化学物质测每次聚合酶链式反应(PCR)循环后产物总量的方法。通过内参或者外参法对待测样品中的特定DNA序列进行定量分析的方法。荧光定量PCR 最常用的方法是DNA 结合染料SYBR Green Ⅰ的非特异性方法和Taqman 水解

探针的特异性方法。本实验中采用非特异性SYBR Green I 染料法，SYBR Green I 是一种结合于所有ds DNA 双螺旋小沟区域的具有绿色激发波长的染料，在游离状态下会发出微弱的荧光，但一旦与双链DNA 结合后，荧光大大增强。因此，SYBR Green I 的荧光信号强度与双链DNA 的数量相关，可以根据荧光信号检测出PCR 体系存在的双链DNA 数量。

三、实验仪器、材料和试剂

实验仪器：PCR仪、荧光定量PCR仪

实验材料：MCF7细胞

实验试剂：逆转录试剂盒、SYBR GREEN试剂盒

四、实验步骤

MCF7细胞RNA提取（RNAiso Plu

实时荧光定量PCR原理和实验 所属分类: 基因检测 更多见 www.infobio.org 无论是对遗传病(如地中海贫血和血友病)、传染病(如肝炎和艾滋病)或肿瘤进行基因诊断，还是研究药物对基因表达水平的影响，或者监控药物和疗法的治疗效果，定量PCR技术都可以发挥很大作用。定量PCR技术的最新进展是实时荧光定量。该技术借助于荧光信号来检测PCR产物，一方面提高了灵敏度，另一方面还可以做到PCR每循环一次就收集一个数据，建立实时扩增曲线，准确地确定CT值，从而根据CT值确定起始DNA拷贝数，做到了真正意义上的DNA定量。这是DNA定量技术的一次飞跃。 根据最终得到的数据不同，定量PCR可以分为相对定量和绝对定量两种。典型的相对定量如比较经过不同方式处理的两个样本中基因表达水平的高低变化，得到的结果是百分比；绝对定量则需要使用标准曲线确定样本中基因的拷贝数或浓度。根据所使用的技术不同，荧光定量PCR又可以分为TaqMan探针和SYBR Green I荧光染料两种方法。比较而言，探针杂交技术在原理上更为严格，所得数据更为精确；荧光染料技术则成本更为低廉，实验设计更为简便。在选择实验方案时要根据实验目的和对数据精度的要求来决定。

实时荧光定量PCR检测技术与其应用

微生物131 沈涛 201301220132

摘 要：实时荧光定量PCR（Real time quantitative polymerase chain reaction, RT-qPCR）是在PCR反应体系中加入荧光染料或荧光探针，利用荧光信号积累实时监测整个PCR反应进程，最后通过标准曲线对未知模板进行定量分析。具有特异性强、灵敏度高、重复性好、定量准确、速度快、全封闭反应等优点，被广泛应用于基础研究、疾病研究、病毒检测和食品安全检测等方面，是分子生物学研究中的重要工具。本文对RT-qPCR技术的原理、检测流程及其应用进行了综述。

关键词： RT-qPCR 原理 应用

1 背 景

RT-qPCR技术于1996年由美国Applied Biosystems公司推出，由于该技术不仅实现了PCR从定性到定量的飞跃，而且与常规PCR相比，它具有特异性更强、灵敏度高、重复性好、定量准确、自动化程度高、全封闭反应等优点成为分子生物学研究中的重要工具，能够实时检测记录PCR扩增产物的增加，克服了终点法定量PCR产物的不足，使准确定量RNA成为现实。然而受制于相关仪器、荧光

CFX96实时荧光定量PCF仪操作流程及注意事项

开始运行仪器

打开电脑

打开定量PCR仪底座开关

启动CFX Manager软件

放置样品

将PCR反应体系加入到0.2ml低缘八联管，盖上管盖；或加入低缘96孔板，用光学级封膜封好。注意，必须带一次性塑料手套，不要让手指接触到反应管表面。将反应管按顺序放入仪器的加热孔中。

设置程序，运行实验

定量PCR软件操作基本步骤为：a.设置热循环程序文件(Protocol Tab ) b.设置反应板文件

(Plate Tab )。C.点击“ Start RUn "键，运行程序热循环程序文件( Protocol Tab )设置指南：点击Edit (编辑)或Create NeW (创建新程序)。

反应板设置文件(Plate Tab )设置指南：选择本次实验所要使用的荧光染料种类；单击样品类型；

如要某些反应孔第一荧光染料对应的样品类型为标准品( Standard )，点击“ DiIUtiOn SerieS "键可设置其标准品浓度及稀释倍数。

点击“ Start Run"键。单击OPen lid (打开热盖)或Close lid (关闭热盖)放置样品；单击Start Run,保存文件，开始运行程序。

结果分析

PCR反应结束后，软件会

实时荧光定量PCR技术

1 样品RNA的抽提

①取冻存已裂解的细胞，室温放置5分钟使其完全溶解。

②两相分离 每1ml的TRIZOL试剂裂解的样品中加入0.2ml的氯仿，盖紧管盖。手动剧烈振荡管体15秒后，15到30℃孵育2到3分钟。4℃下12000rpm离心15分钟。离心后混合液体将分为下层的红色酚氯仿相，中间层以及无色水相上层。RNA全部被分配于水相中。水相上层的体积大约是匀浆时加入的TRIZOL试剂的60%。

③RNA沉淀 将水相上层转移到一干净无RNA酶的离心管中。加等体积异丙醇混合以沉淀其中的RNA，混匀后15到30℃孵育10分钟后，于4℃下12000rpm 离心10分钟。此时离心前不可见的RNA沉淀将在管底部和侧壁上形成胶状沉淀块。 ④RNA清洗 移去上清液，每1mlTRIZOL试剂裂解的样品中加入至少1ml的75%乙醇（75%乙醇用DEPCH2O配制），清洗RNA沉淀。混匀后，4℃下7000rpm离心5分钟。

⑤RNA干燥 小心吸去大部分乙醇溶液，使RNA沉淀在室温空气中干燥5-10分钟。 ⑥溶解RNA沉淀 溶解RNA时，先加入无RNA酶的水40μl用枪反复吹打几次，使其完全溶解，获得的RNA溶液保存于-80℃待用。 2 RNA

实时荧光定量PCR技术

1 样品RNA的抽提

①取冻存已裂解的细胞，室温放置5分钟使其完全溶解。

②两相分离 每1ml的TRIZOL试剂裂解的样品中加入0.2ml的氯仿，盖紧管盖。手动剧烈振荡管体15秒后，15到30℃孵育2到3分钟。4℃下12000rpm离心15分钟。离心后混合液体将分为下层的红色酚氯仿相，中间层以及无色水相上层。RNA全部被分配于水相中。水相上层的体积大约是匀浆时加入的TRIZOL试剂的60%。

③RNA沉淀 将水相上层转移到一干净无RNA酶的离心管中。加等体积异丙醇混合以沉淀其中的RNA，混匀后15到30℃孵育10分钟后，于4℃下12000rpm 离心10分钟。此时离心前不可见的RNA沉淀将在管底部和侧壁上形成胶状沉淀块。 ④RNA清洗 移去上清液，每1mlTRIZOL试剂裂解的样品中加入至少1ml的75%乙醇（75%乙醇用DEPCH2O配制），清洗RNA沉淀。混匀后，4℃下7000rpm离心5分钟。

⑤RNA干燥 小心吸去大部分乙醇溶液，使RNA沉淀在室温空气中干燥5-10分钟。 ⑥溶解RNA沉淀 溶解RNA时，先加入无RNA酶的水40μl用枪反复吹打几次，使其完全溶解，获得的RNA溶液保存于-80℃待用。 2 RNA

天为时代核酸系列讲座之院

华中科技大学同济医学

实时荧光定量PCR技术的原理及应用(Real time Quantitative PCR)北京天为时代科技有限公司 欧阳志荃 2005-05-20

讲 座 提 纲

实时荧光定量PCR原理 实时荧光定量PCR的几种方法介绍 实时荧光定量PCR医学和科研中的应用

实时荧光定量PCR定义

在PCR反应体系中加入荧光基团，利用荧光 信号累积实时监测整个PCR进程，最后通过标 准曲线对未知模板进行定量分析的方法

实时荧光定量PCR 原理常 规 PCR技术：

实时原理

对PCR扩增反应的终点产物进行定量和定性分析无法对起始模板准确定量，无法对扩增反应实时检测 实时定量PCR技术： 利用荧光信号的变化实时检测PCR扩增反应中每 一个循环扩增产物量的变化，通过Ct值和标准曲线 的分析对起始模板进行定量分析

实时荧光定量PCR原理如何对起始模板定量？

定量原理

通过Ct值和标准曲线对起始模板进行定量分析

介绍三个概念： 扩增曲线、荧光阈值、Ct值

实时荧光定量PCR 原理 ----------- 扩增曲线

荧光基团

荧光检测元件

扩增曲线图：横坐标：扩增循环数(Cycle);纵坐标：荧光强度 每个循环进行一次荧光信号的收集

实时荧光定量

天为时代核酸系列讲座之院

华中科技大学同济医学

实时荧光定量PCR技术的原理及应用(Real time Quantitative PCR)北京天为时代科技有限公司 欧阳志荃 2005-05-20

讲 座 提 纲

实时荧光定量PCR原理 实时荧光定量PCR的几种方法介绍 实时荧光定量PCR医学和科研中的应用

实时荧光定量PCR定义

在PCR反应体系中加入荧光基团，利用荧光 信号累积实时监测整个PCR进程，最后通过标 准曲线对未知模板进行定量分析的方法

实时荧光定量PCR 原理常 规 PCR技术：

实时原理

对PCR扩增反应的终点产物进行定量和定性分析无法对起始模板准确定量，无法对扩增反应实时检测 实时定量PCR技术： 利用荧光信号的变化实时检测PCR扩增反应中每 一个循环扩增产物量的变化，通过Ct值和标准曲线 的分析对起始模板进行定量分析

实时荧光定量PCR原理如何对起始模板定量？

定量原理

通过Ct值和标准曲线对起始模板进行定量分析

介绍三个概念： 扩增曲线、荧光阈值、Ct值

实时荧光定量PCR 原理 ----------- 扩增曲线

荧光基团

荧光检测元件

扩增曲线图：横坐标：扩增循环数(Cycle);纵坐标：荧光强度 每个循环进行一次荧光信号的收集

实时荧光定量

实时荧光定量PCR技术

1 样品RNA的抽提

①取冻存已裂解的细胞，室温放置5分钟使其完全溶解。

②两相分离 每1ml的TRIZOL试剂裂解的样品中加入0.2ml的氯仿，盖紧管盖。手动剧烈振荡管体15秒后，15到30℃孵育2到3分钟。4℃下12000rpm离心15分钟。离心后混合液体将分为下层的红色酚氯仿相，中间层以及无色水相上层。RNA全部被分配于水相中。水相上层的体积大约是匀浆时加入的TRIZOL试剂的60%。

③RNA沉淀 将水相上层转移到一干净无RNA酶的离心管中。加等体积异丙醇混合以沉淀其中的RNA，混匀后15到30℃孵育10分钟后，于4℃下12000rpm 离心10分钟。此时离心前不可见的RNA沉淀将在管底部和侧壁上形成胶状沉淀块。 ④RNA清洗 移去上清液，每1mlTRIZOL试剂裂解的样品中加入至少1ml的75%乙醇（75%乙醇用DEPCH2O配制），清洗RNA沉淀。混匀后，4℃下7000rpm离心5分钟。

⑤RNA干燥 小心吸去大部分乙醇溶液，使RNA沉淀在室温空气中干燥5-10分钟。 ⑥溶解RNA沉淀 溶解RNA时，先加入无RNA酶的水40μl用枪反复吹打几次，使其完全溶解，获得的RNA溶液保存于-80℃待用。 2 RNA

实时荧光定量PCR系统 1、技术参数：

1.1、*样本通量（孔）：可支持2种模块（可选），96孔0.1ml模块、96孔0.2ml模块 1.2、*反应体系：96孔0.1ml模块：10-30uL ；96孔0.2 ml模块：10-100uL； 1.3、*温控模块最高升降温速率：6.5℃/秒 1.4、温度均一性：0.4℃

1.5、*精确数码温控模块：96孔0.1ml和0.2ml模块均支持3个独立的精确数码温控区域，一次实验可运行3个不同温度； 1.6、热循环系统：Peltier半导体 1.7、反应运行时间：<30分钟运行 1.8、线性动态范围：10 logs

1.9、分辨率：在单重反应中可区分1.5倍拷贝数差异 1.10、灵敏度：最低 1 拷贝

1.11、*支持的染料：FAM?/SYBR? Green, VIC?/JOE?/HEX?/TET?, ABY?/NED?/TAMRA?/Cy?3, JUN?, ROX?/Texas Red?，以上染料出厂前进行校正

1.12、*仪器自带存储：不小于10GB，（相当于2000-2500运行文件) 1.13、光源类型：高亮度白光半导体光源(工作寿命>5年)

1.14、*荧光通道数：96孔模块支持不少于4色激发光通道和4色检测光通道 1.15、光学激发检测范围：45