肺腺癌基因检测14位点

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复里亏提(医学版)F dn u a Unv J i Me si d c 19 6

乳腺癌基因芯片数据分析蒋锋峻定高赵耐 青(复旦大学公共卫生学院卫生统计与社会医学教研室上海 203 ) 0 0 2

【摘要】目的以乳腺癌病人的表达谱芯片数据为基础， 探寻乳腺癌复发的相关基因。方法对标化芯片数据进行缺失值处理后，分别用单因素 C X回归模型和综合了聚类及多因素 C X回归的综合法来筛选兴趣基因， O O 然后通过兴趣基因对病人做样品聚类，以灵敏度、特异度、约登指数和 K pa . i法评价分类效果，后结合 a l Me r n e最文献和蛋白质数据库探寻乳腺癌复发的相关基因。结果出的 1 5个 P<0 0 1的基因预测效果最差。结论 .0为进一步的生物学研究提供待选基因。

综合法筛出的 3 O个 P<0 0, 1的基因对乳腺癌病人复

发状况的预测效果最佳；因素 C X回归筛出的 1 2个 P<0 0单 O 0, 1的基因的预测效果较差；因素 C X回归筛单 0综合法筛选得到的 3 O个基因可用来评价病人的预后状况，

【关键词】乳腺癌；基因芯片；聚类分析； C X回归模型 O 【中国图书馆分类法分类号】 R 779 02

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复里亏提(医学版)F dn u a Unv J i Me si d c 19 6

乳腺癌基因芯片数据分析蒋锋峻定高赵耐 青(复旦大学公共卫生学院卫生统计与社会医学教研室上海 203 ) 0 0 2

【摘要】目的以乳腺癌病人的表达谱芯片数据为基础， 探寻乳腺癌复发的相关基因。方法对标化芯片数据进行缺失值处理后，分别用单因素 C X回归模型和综合了聚类及多因素 C X回归的综合法来筛选兴趣基因， O O 然后通过兴趣基因对病人做样品聚类，以灵敏度、特异度、约登指数和 K pa . i法评价分类效果，后结合 a l Me r n e最文献和蛋白质数据库探寻乳腺癌复发的相关基因。结果出的 1 5个 P<0 0 1的基因预测效果最差。结论 .0为进一步的生物学研究提供待选基因。

综合法筛出的 3 O个 P<0 0, 1的基因对乳腺癌病人复

发状况的预测效果最佳；因素 C X回归筛出的 1 2个 P<0 0单 O 0, 1的基因的预测效果较差；因素 C X回归筛单 0综合法筛选得到的 3 O个基因可用来评价病人的预后状况，

【关键词】乳腺癌；基因芯片；聚类分析； C X回归模型 O 【中国图书馆分类法分类号】 R 779 02

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第20章 癌基因、抑癌基因与生长因子

学习要求

1．掌握癌基因、病毒癌基因、细胞癌基因、抑癌基因与生长因子的概念；病毒癌基因致病机理；细胞癌基因特点及分类；原癌基因活化机制；抑癌基因p53、Rb作用机制。 2．熟悉原癌基因表达产物及功能；抑癌基因与生长因子的分类及作用机制。

3．了解癌基因、抑癌基因与生长因子三者的关系；癌基因、抑癌基因及生长因子与疾病的关系；细胞凋亡的概念。

基本知识点

癌基因可分为病毒癌基因和细胞癌基因（又称原癌基因），前者包括DNA肿瘤病毒的癌基因和RNA病毒的癌基因。病毒癌基因源于细胞癌基因。病毒癌基因能使宿主细胞发生恶性转化，形成肿瘤。原癌基因正常情况下处于静止或低表达状态，其表达产物对细胞正常生长分化起正调节作用。原癌基因被激活可导致细胞恶变形成肿瘤。原癌基因被激活的方式有：①获得启动子和（或）增强子；②染色体易位；③原癌基因扩增；④点突变等。原癌基因表达产物按其在细胞信号传递系统中的作用可分为：①细胞外的生长因子；②跨膜的生长因子受体；③细胞内信号传导体；④核内转录因子。

抑癌基因是一类能抑制细胞过度生长、增殖从而遏制肿瘤形成的基因。抑癌基因丢失、突变或失活，会导致细胞癌变。在机体内，抑癌基因与原癌基因协调

致癌基因调控的真相

美国波士顿Beth Israel Deaconess医学中心（BIDMC）的科学家发现了调控着致癌基因MDM2的基因。MDM2又调控着肿瘤抑制蛋白质p53。但是这组科学家发现，这些基因并不是MDM2基因的“通断”开关，而更像一个调光器开关，这提示了一个更复杂的信号传导路径，它对于变化的环境敏感。 在8月17日出版的《癌细胞》（Cancer Cell）杂志上报告的这项关于上游基因的新发现涉及了p53细胞信号传导路径，该发现可能指出了帮助杀死肿瘤的新的药物靶标。这项发现还指出了可能的癌症风险生物标记，有朝一日它们可能有助于患者采取针对癌症的预防措施。

p53防止身体出现肿瘤，在50%的癌症中它出了问题。p53被称为基因组的卫士，它是一个由各种蛋白质组成的完善的防御系统的一部分。它通过暂停正常的细胞分裂周期而让细胞有时间修复日常环境攻击造成的DNA损伤，从而防止癌症出现。如果这种损伤太严重而无法修复，p53就会触发细胞死亡。 Beth Israel Deaconess医学中心和哈佛大学医学院的病理学助理教授Wenyi Wei说，由于p53具有破坏性，它以“阴阳”的方式存在——就像和对立面保持平衡。“当DNA受到破坏之后，MDM2

癌症之所以让人们感觉到害怕，不仅是因为它本身，而是癌症会给患者带来很多的并发症，往往令患者痛苦不堪，特别是发展到晚期的患者，肺腺癌是肺癌的一种，属于非小细胞癌。其隐匿性强，早期症状很难被发现。而大部分患者有了明显症状时，病情往往已到了中晚期，错过了最佳的治疗时机，肺腺癌晚期死时会痛苦吗？下面一起来看一下。

肺腺癌晚期死时会痛苦吗？肺腺癌在早期并没有什么特殊症状，仅为一般 呼吸系统疾病 所共有的症状，如咳嗽 、 痰血 、低热、胸痛、气闷等，很容易忽略。但是发展到晚期往往症状也是比较明显的，疼痛是肺癌晚期患者经常表现出来的症状，大多数已发生胸内区域性播散的肺癌患者均有胸痛的症状。声音嘶哑是肺癌晚期症状之一。控制左侧发音功能的 喉 返神经由颈部下行至 胸 部，绕过心脏的大血管返行向上至喉，从而支配发音器官的左侧。因此，若肿瘤侵及 纵隔 左侧，使喉返神 经受到压迫，声嘶便产生了，但却无咽痛及上呼吸道感染的其它症状。 面、颈部水肿也是肺癌晚期症状中比较常见的，若肿瘤侵及 纵隔 右侧压迫上腔 静脉 ，最初会使颈脉因回流不畅而怒张，最后还会导致面、颈部水肿，此外患者还会出现气促、胸腔积液等晚期症状。

肺腺癌晚期并发症这么多，患者一定要积极的治疗，选择合适的

公卫执业助理医师考试辅导《生物化学》

第 十 单元 癌基因与抑癌基因

（1）癌基因的概念 （2）抑癌基因的概念

第一节 癌基因

一、癌基因概念

细胞内控制细胞生长和分化的基因，它的结构异常或表达异常，可以引起细胞癌变。

二、病毒癌基因

在病毒（主要是逆转录病毒）中存在的能引起脊椎动物细胞转化、 癌变的基因。 它不编码病毒的结构成分，对病毒复制也没有作用，但可以使细胞持续增殖。

如鸡的ROUS肉瘤病毒RSV中含有4个基因： gag、 pol、 env、 src，前三个是编码病毒核心蛋白、逆转录酶和被膜蛋白的，而src的表达产物可引起细胞转化导致肉瘤。

三、细胞癌基因

存在于生物正常细胞基因组中的癌基因，或称原癌基因。

正常情况下这些基因不表达或只是限制性表达，其表达产物参与细胞的生长发育和分化的调控，当受到致癌因素的影响使其活化并异常表达时，可导致细胞癌变。

四、癌基因（或原癌基因）的表达产物 1.细胞外生长因子sis。

2.跨膜的生长因子受体c-src、c-abl、c-mos、c-raf。

3.细胞内信号传导体 c-src、c-ab

检测项目名称 基因位点 01CYP2C19*2(G>A) 细胞色素氧化酶2C19*2型，代谢酶 02CYP2C19*3(G>A) 细胞色素氧化酶2C19*3型，代谢酶 60CYP2C19*17(C>T) 细胞色素氧化酶2C19*17型，代谢酶 152PON1(A>G) 对氧磷酶1，代谢酶 01CYP2C19*2(G>A) 细胞色素氧化酶2C19*2型，代谢酶 02CYP2C19*3(G>A) 细胞色素氧化酶2C19*3型，代谢酶 69VKORC1(1639G>A) 维生素K环氧化物还原酶复合物1亚单位，靶点 检测意义 氯吡格雷 预测氯吡格雷抵抗风险，给出个体合适剂量，提高氯吡格雷疗效，降低无效用药风险。 氯吡格雷为前药，体外无活性，口服经肠(ABCB1)吸收,入肝脏，经肝药酶CYP2C19*2、*3、*17代谢激活，其活性代谢产物，再经过PON1激活，才能发挥抗血小板的功效。CYP2C19*2、*3、*17及PON1酶活性决定了氯吡格雷的疗效。 其中，CYP2C19*17突变后，氯吡格雷活性增强，敏感度高，出血风险高，需高度关注出血风险，尤其是蛛网膜下腔出血。 氯吡格雷简化版 （只测两个位点） 仅仅判断氯吡格雷抵抗风险，只能测出部分抵抗患者

肺癌是当前最常见的恶性肿瘤之一，其发病率和死亡率逐年升高。由于大多数肺癌患者临床确诊时已属晚期，其中50%以上患者不能手术，而绝大部分非小细胞肺癌（nsclc）患者（占肺癌的75%～80%，包括鳞癌、腺癌、大细胞癌等）对现行放疗和化疗又不够敏感，因此肺癌的 治疗 成为临床治疗一大难题。近来人们 研究 的热点集中到肺癌的基因治疗上，并取得了许多重要进展。现主要对肺癌的基因治疗 方法 之一棗抑癌基因治疗肺癌的研究新进展作一综述。

一、抑癌基因及其与细胞周期关系 抑癌基因（tumor suppressor gene）指正常细胞内存在的，能抑制细胞转化和肿瘤发生的一类基因群，当它们受到各种因子的作用失活后，细胞的生长分化失控，增加了细胞恶性转化的可能性。 目前 已分离克隆的抑癌基因有rb、p53、p16、p33ing1、nm23、timp、kai1、aph、mcc、apc、dcc、brca1等，最近被认为候选抑癌基因的有fhit、pten/mmac1/tep1等。 rb基因又名成视网膜细胞瘤基因, 是最早发现的一种抑癌基因, 定位于人染色体13q14上，编码的一组dna结合蛋白与细胞分化的过程有关，具有抑制细胞转化的能力。与人类肿瘤