简述CTAB法提取DNA的原理
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CTAB法提取DNA原理及步骤、制胶、电泳
CTAB法提取DNA的原理及步骤:
冷冻的植物组织,在低温干燥状态下机械磨碎。通常精提DNA,都要加液氮使材料变脆,易于研磨。低温降低了DNase的活性,利用CTAB(十六烷基三甲基溴化铵)去污剂溶解细胞膜,使核蛋白等解聚,使DNA游离出来。
CTAB作为一种阳离子去污剂,可溶解细胞膜,与核酸形成复合物,可使核酸沉淀出来。通过离心将CTAB-核酸复合物语糖类、蛋白质等分离开来。随后将复合物溶于高盐溶液中,再加乙醇使核酸沉淀,而CTAB溶于乙醇,从而去除CTAB 。
1.研磨
2.加1000ul预处理液,10-15min,4000r,10min,弃上清(重复) 预处理液:Tris-hcl (PH8.0) 提供缓冲环境,防止核酸被破坏。 EDTA (螯合二价阳离子)0.5M 抑制DNase活性。 Nacl 5M 提供高盐环境,使DNA充分溶解。 β-巯基乙醇 抗氧化剂,去除酚,糖,能与酚形成
CTAB法提取DNA原理及步骤、制胶、电泳
CTAB法提取DNA的原理及步骤:
冷冻的植物组织,在低温干燥状态下机械磨碎。通常精提DNA,都要加液氮使材料变脆,易于研磨。低温降低了DNase的活性,利用CTAB(十六烷基三甲基溴化铵)去污剂溶解细胞膜,使核蛋白等解聚,使DNA游离出来。
CTAB作为一种阳离子去污剂,可溶解细胞膜,与核酸形成复合物,可使核酸沉淀出来。通过离心将CTAB-核酸复合物语糖类、蛋白质等分离开来。随后将复合物溶于高盐溶液中,再加乙醇使核酸沉淀,而CTAB溶于乙醇,从而去除CTAB 。
1.研磨
2.加1000ul预处理液,10-15min,4000r,10min,弃上清(重复) 预处理液:Tris-hcl (PH8.0) 提供缓冲环境,防止核酸被破坏。 EDTA (螯合二价阳离子)0.5M 抑制DNase活性。 Nacl 5M 提供高盐环境,使DNA充分溶解。 β-巯基乙醇 抗氧化剂,去除酚,糖,能与酚形成
CTAB法提取DNA原理及步骤、制胶、电泳
CTAB法提取DNA的原理及步骤:
冷冻的植物组织,在低温干燥状态下机械磨碎。通常精提DNA,都要加液氮使材料变脆,易于研磨。低温降低了DNase的活性,利用CTAB(十六烷基三甲基溴化铵)去污剂溶解细胞膜,使核蛋白等解聚,使DNA游离出来。
CTAB作为一种阳离子去污剂,可溶解细胞膜,与核酸形成复合物,可使核酸沉淀出来。通过离心将CTAB-核酸复合物语糖类、蛋白质等分离开来。随后将复合物溶于高盐溶液中,再加乙醇使核酸沉淀,而CTAB溶于乙醇,从而去除CTAB 。
1.研磨
2.加1000ul预处理液,10-15min,4000r,10min,弃上清(重复) 预处理液:Tris-hcl (PH8.0) 提供缓冲环境,防止核酸被破坏。 EDTA (螯合二价阳离子)0.5M 抑制DNase活性。 Nacl 5M 提供高盐环境,使DNA充分溶解。 β-巯基乙醇 抗氧化剂,去除酚,糖,能与酚形成
2×CTAB法植物总DNA提取
2×CTAB法植物总DNA提取
1. 液氮研磨1g左右的植物组织,转移到离心管中。改用研磨枪在冰上研磨,不加β-巯基乙醇
研磨时可加入适量的PVP、β-巯基乙醇。若CTAB准备2-3天内用完,则可将PVP、β-巯基乙醇直接加入其中。
2. 加入500μl的2*CTAB (60℃或65℃预热) ,颠倒混合均匀后在60℃或65℃水浴30m-1h小时,其间要上下颠倒混匀数次。
3.取出离心管,加入等体积的24:1(三氯甲烷:异戊醇),上下颠倒充分混合。 若量多,则可以直接侧立于摇床上晃动10分钟。
4.12000转速离心5-10min。将离心管动作轻缓的取出转子,放置于离心管架上。 a.离心后溶液分三层:上层为水相;中层为碎片和蛋白相;底层为氯仿 b.迅速进入下一步,以免各相混合
5.用移液枪吸取管中上层水相,动作一定要轻缓,不可搅动其它两层。 a.此步骤要宁舍不贪多,尽量避免吸取到下层液体。
b.若上步骤中中间层较厚,则继续加入等体积24:1,再次抽提一次,直至中间层较薄。 6. 在抽提出的水相中加入1/3体积的5M的KAc及等体积的异丙醇(4℃预冷),轻轻晃动混合均匀后在-20℃沉淀。沉淀至少15分钟至过夜。
6-1 在抽提出的水
CTAB配方及植物DNA提取方法
主要试剂的配制
参考(美)萨姆布鲁克(Sambrook,J.)等.分子克隆实验指南(下册)配置如下[94]:
(1)0.5 mo1/L EDTA(pH 8.0):称取EDTA-Na2 18.61 g,加80 mL双蒸水,磁力搅拌器上剧烈搅拌。加入7 mL 10 mo1/L NaOH调至pH 8.0再用双蒸水定容到100 mL,在1.03×105Pa下高压灭菌20 min。
(2)5 mol/L NaCl溶液:称取NaCl 29.22 g,溶解于90 mL的双蒸水,加热到80℃溶解,冷却,再用双蒸水定容100 mL,在高压灭菌20 min。
(3)10 mol/L NaOH溶液:称取40.00 g NaOH溶于80 mL的双蒸水,搅拌,定容到100 mL。 (4)1 mol/L Tris-HC1溶液(pH 8.0):称取12.114 gTris碱,溶于80 mL的双蒸水,加入浓HC1 4.2 mL,调整PH值到8.0,加水定容到100 mL,高压灭菌20min。 (5)10%CTAB(m/v):称取CTAB 10.00 g,溶解于80 mL的双蒸水,加热促进溶解,加双蒸水定容到100 mL,室温保存。
(6)5 mo1/L KAc溶液(pH 4
酚氯仿法提取DNA的原理
酚氯仿法提取DNA的原理
作者: 渭水凡夫 (站内联系TA) 发布: 2013-04-06
最近在博客上看到的一篇 可以作为入门级 《分子生物学十万个为什么》 和大家分享一下
用酚抽提细胞DNA时,有什么作用?
使蛋白质变性,同时抑制了DNase的降解作用。用苯酚处理匀浆液时,由于蛋白与DNA 联结键已断,蛋白分子表面又含有很多极性基团与苯酚相似相溶。蛋白分子溶于酚相,而DNA溶于水相。
使用酚的优点:1. 有效变性蛋白质;2. 抑制了DNase的降解作用。
缺点:1. 能溶解10-15%的水,从而溶解一部分poly(A)RNA。2. 不能完全抑制RNase的活性。 氯仿的作用?
氯仿:克服酚的缺点;加速有机相与液相分层。
最后用氯仿抽提:去除核酸溶液中的迹量酚。(酚易溶于氯仿中)
用酚-氯仿抽提细胞基因组DNA时,通常要在酚-氯仿中加少许异戊醇,为什么? 异戊醇:减少蛋白质变性操作过程中产生的气泡。异戊醇可以降低表面张力,从而减少气泡产生。另外,异戊醇有助于分相,使离心后的上层含DNA的水相、中间的变性蛋白相及下层有机溶剂相维持稳定。
用乙醇沉淀DNA时,为什么加入单价的阳离子?
用乙醇沉淀DNA时,通常要在溶液中加入单价的阳离子,
CTAB方法提取RNA
CTAB方法提取RNA
叶片RNA的提取
(1)取叶片材料两克,液氮中研磨成细粉末。
(2)每管加入10ml65℃预热的CTAB提取液和500 l β-巯基乙醇,剧烈涡旋匀浆,65℃水浴温育30min。
(3)每管加入10ml氯仿:异戊醇(24:1),涡旋混匀,冰浴10min。4℃,12000rpm离心10min。
(4)取上清,加入1∕3体积的8M LiCl和500 l β-巯基乙醇,-20℃沉淀过夜。
(5)4℃,12000rpm离心20min。
(6) 弃上清,沉淀用4ml异硫氰酸胍变性液溶解,加入120 l β-巯基乙醇和880 l 2M Na Ac (pH4.0),混匀后加入5ml的酚:氯仿:异戊醇(25:24:
1), 涡旋混匀,冰浴5min。4℃,12000rpm离心10min。
(7)取上清,加入等体积酚:氯仿:异戊醇(25:24:1),涡旋混匀,冰浴5min。4℃,12000rpm离心10min。
(8)取上清,加入等体积氯仿:异戊醇(24:1),涡旋混匀,冰浴5min。4℃,12000rpm离心10min。
(9)取上清,加入1∕10体积的3M NaAc(pH5.2)和2.5倍体积的无水乙醇,-20℃放置过夜。
(10)4℃,14000rpm离心
质粒DNA的提取
质粒DNA的提取、纯化与纯度鉴定
李笃财 生科
1班 201200140048
【实验目的】
1、掌握碱变性提取法的原理及各种试剂的作用。 2、掌握碱变性法提取质粒DNA的方法。
3、学习并掌握凝胶电泳进行DNA分离纯化的实验原理。 【实验原理】
1. 质粒DNA的提取——碱变性提取法:
提取和纯化质粒DNA的方法很多,目前常用的有:碱变性提取法、煮沸法、羟基磷灰石柱层析法、EB-氯化铯密度梯度离心法和Wizard法等。其中,碱变性提取法最为经典和常用,适于不同量质粒DNA的提取。该方法操作简单,易于操作,一般实验室均可进行。提取质粒DNA纯度高,可直接用于酶切、序列测定及分析。
碱变性法提取质粒DNA一般包括三个基本步骤:培养细菌细胞以扩增质粒;收集和裂解细胞;分离和纯化质粒DNA。
在细菌细胞中,染色体DNA以双螺旋结构存在,质粒DNA以共价闭合环状形式存在。细胞破碎后,染色体DNA和质粒DNA均被释放出来,但两者变性与复性所依赖的溶液pH值不同。在pH值高达12.0的碱性溶液中,染色体DNA氢键断裂,双螺旋结构解开而变性;共价闭合环状质粒DNA的大部分氢键断裂,但两条互补链不完全分离
DNA提取的操作
基因组DNA提取
基因组DNA提取试剂盒简介
DNA是遗传信息的载体,是最重要的生物信息分子,是分子生物学研究的主要对象,为了进行测序、杂交、基因表达、文库构建等试验,获得高分子量和高纯度的基因组DNA是非常重要的前提,因此基因组DNA的提取也是分子生物学试验技术中最重要、最基本的操作之一。 一、基因组DNA提取的原则
1、保证核酸一级结构的完整性(因为遗传信息全部储存在核酸一级结构中,故完整的一级结构是保证核酸结构与功能研究的基层)。
2、排除其它分子(如蛋白质、多糖,、脂类、有机溶剂等)的污染,使下游试验顺利进行。
二、基因组DNA提取的原理和方法
DNA与组蛋白构成核小体,核小体缠绕成中空的螺旋管状结构,即染色丝,染色丝再与许多非组蛋白形成染色体。染色体存在于细胞核中,外有核膜及胞膜。从组织中提取DNA必须先将组织分散成单个细胞,然后破碎胞膜及核膜,使染色体释放出来,同时去除与DNA结合的组蛋白及非组蛋白。 1、样品预处理
从各种不同来源的样品(如细菌、酵母、血液、动植物组织细胞等)中提取高纯度的基因组DNA,因细胞结构及所成分不同,样品预处理方式也不同,以下简单介绍常用提取材料的预处理方式,若需详细了解,请参考本公司各基因组DNA提取
总DNA的提取
第二章 材料与方法
2.2总DNA的提取
土壤中存在着大量的腐植酸、蛋白质等杂质都将会影响以下实验步骤,而过多的纯化的步骤又会造成DNA的大量损失和DNA片段的破碎。土壤总DNA的质量直接决定实验着是否能够准确的反应微生物的实际群落组成结构,实验证明不同提取方法获得的DNA,经DGGE分析会产生不同的群落结构指纹图谱
错误!未找到引用源。
,因此选用合适的DNA 提取方法
是十分重要的;,所以必须在在DNA的质量和纯度上做出最佳的平衡选择,Krsek和Welington
错误!未找到引用源。
认为玻珠+溶菌酶+SDS的组合可从土壤中获较高产量和纯度的DNA。
错误!未找到引用源。
直接提取法参照Krsek和Welington 步骤方法如下:
实验试剂:
的试验方法并略作改变,具体使用试剂和
DNA提取液(1%(W/V) CTAB(十六烷基三乙基溴化铵) 1.5mol/lNaCl、100mM磷酸钠、100mM Tris-HCl、100mM EDTA、PH=8);20mg/ml蛋白酶K;50mg/ml溶菌酶;10%SDS;饱和酚;酚/氯仿/异戊醇(25:24:1 V/+V);氯仿;100%乙醇;70%乙醇;异丙醇。
提取步骤:
1.称取1g土样放入2.0