蛋白质组学在疾病研究中的应用

在国际市场上,08年以后waters、PE公司、Bio-Rad的Maldi TOF相继停产后,市场主要的MALDI TOF生产;/厂家实际就只有三家：Bruker、AB、岛津。最近两年,由于仪器性能获得肯定、技术上不断取得突破,Bruker在全球MALDI TOF市场更是取得了极大的成功,目前已在欧洲成功占据了80%以上的市场份额,在美国占据了60%以上的市场份额。毋庸置疑,Bruker已是目前全球MALDI TOF领域当之无愧的行业领袖。

MALDI-TOF/TOF质谱的原理及其在临床蛋白质组学中的应用

目 录

一、MALDI-TOF/TOF质谱的基本原理

二、布鲁克公司MALDI-TOF/TOF质谱的仪器特点和性能优势

宽域离子聚焦PAN 专利技术

靶上浓缩AnchorChip 专利技术

全新的离子源自动清洗SourceShower 专利技术

氮气激光与固体激光优点完美结合的Smartbeam 激光专利技术

激光光束的直径大小可调

支持所有同位素标记技术

Top-down测序技术

三、解决方案

解决方案一：双向电泳-MALDI TOF/TOF技术路线 解决方案二：LC-MALDI TOF/TOF技术路线 解决方案三：ClinPr

AB SCIEX公司最新发布全新的高分辨液相色谱质谱联用系统——TripleTOF 5600是在享有盛名的API 5500三重四极杆系统和QSTAR Elite(QqTOF)系统这两个技术平台的基础上开发出来的。TripleTOF 5600高分辨液相色谱质谱联用系统能够对复杂的蛋白质组学样品进行高通量分析,并能同时提供高质量的定性和定量结果。为评估这款仪器的性能,设计基于纳升液相色谱和TripleTOF 5600联用系统

现代仪器 ( www. d r isr .r .n mo enn t o gc ) s

A CE ie O 6 0在蛋白质组学研究中的应用 B I Tp T F 0 S X rl 5靳文海。郭立海谢永明 高醇新 B iie i n C r t u t 3 r t mo s hii H ne g tS se r上海 2 03 0 2 3) ( . B S E公司亚太技术支持中心 1A CIX

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T rno Ca a a) oo t, n d

F se t, ai ri, S o tr y C l na U A) Ci f

第38卷第5期2011年09月

文章编号:1002-8110（2011）05-0027-04

酿LIQUOR

酒MAKING

Vol.38.№.5Sep.，2011

蛋白质组学技术在鉴定啤酒浑浊蛋白中的初步研究

贾

娟，王德良

（中国食品发酵工业研究院，北京100027）

摘要:啤酒中包含多种大麦蛋白，制麦和酿造过程中受到化学方式或酶的修饰，影响最终的啤酒浑浊稳定

vulgare

L.)，这些蛋

性。从啤酒中分离出的浑浊活性蛋白主要来自大麦储藏蛋白或大麦醇溶蛋白(Hordeum待进一步确认。

关键词：蛋白质组学；鉴定；啤酒浑浊蛋白中图分类号：TS262.5；TS201.2

文献标识码：B

白有富含脯氨酸，由许多不同分子量的片段组成。尽管对啤酒浑浊的研究时间较长，但是对于其特性方面的有

PreliminaryStudyoftheIdentificationofBeerTurbidityCausingProteins

byProteomicsTechnology

JIAJuan,WANGDe-liang

(ChinaNationalResearchInstituteofFoodandFermentationIndustries,Beijing100027，China)

Abstract

第38卷第5期2011年09月

文章编号:1002-8110（2011）05-0027-04

酿LIQUOR

酒MAKING

Vol.38.№.5Sep.，2011

蛋白质组学技术在鉴定啤酒浑浊蛋白中的初步研究

贾

娟，王德良

（中国食品发酵工业研究院，北京100027）

摘要:啤酒中包含多种大麦蛋白，制麦和酿造过程中受到化学方式或酶的修饰，影响最终的啤酒浑浊稳定

vulgare

L.)，这些蛋

性。从啤酒中分离出的浑浊活性蛋白主要来自大麦储藏蛋白或大麦醇溶蛋白(Hordeum待进一步确认。

关键词：蛋白质组学；鉴定；啤酒浑浊蛋白中图分类号：TS262.5；TS201.2

文献标识码：B

白有富含脯氨酸，由许多不同分子量的片段组成。尽管对啤酒浑浊的研究时间较长，但是对于其特性方面的有

PreliminaryStudyoftheIdentificationofBeerTurbidityCausingProteins

byProteomicsTechnology

JIAJuan,WANGDe-liang

(ChinaNationalResearchInstituteofFoodandFermentationIndustries,Beijing100027，China)

Abstract

表面等离子体共振技术在蛋白质_蛋白质相互作用研究中的应用

第28卷第11期分析测试学报Vol128No111　　　　　　　　　　　　　　　　　　2009年11月FENXICESHIXUEBAO(JournalofInstrumentalAnalysis)1344～1350综　述

表面等离子体共振技术在蛋白质-蛋白质

相互作用研究中的应用

杨　彦,戴　宗,邹小勇

(中山大学　化学与化学工程学院,广东　广州　510275)

摘　要:表面等离子共振(SPR)近年来迅速发展为用于分析生物分子相互作用的一项技术。该技术无需标

记、特异性强、灵敏度高、样品用量小,可实现在线连续实时检测。目前SPR已被广泛应用于免疫学、蛋白

质组学、药物筛选、细胞信号转导、受体/配体垂钓等领域。感器的基本原理和技术流程,综述了SPR在蛋白质-蛋白质相互作用动力学研究、、蛋白质突变和碎片分析、信号转导中的应用以及SPR。指

出SPR通过与光谱、电化学等多技术联用后,。

关键词:表面等离子体共振;蛋白质-;中图分类号:O629173;1::1004-4957(2009)11-1344-07

doi:101j111IProtein-ProteinInteractionsbySurfacePlasmo

山师限选课答案

1， 基因组：一个细胞或病毒所包含的全部基因。

2， 蛋白质组(Proteome)的概念最先由Marc Wilkins提出。定义：蛋白质组是由一个细胞，一个组织或一

个机体的基因组所表达的全部相应的蛋白质。是一个整体概念。 3， 蛋白质组学：是一门以全面的蛋白质性质研究(如表达水平、转录修饰、相互作用等)为基础，在蛋白质水平对疾

病机理、细胞模式、功能联系等方面进行探索的科学，包括表达蛋白质组学，细胞谱蛋白质组学以 3， 等电聚焦：分离两性分子，特别是分离蛋白质的一种技术。根据在一个电场的影响下这些两性

分子在ph梯度上的分布情况进行分离

等电聚焦技术：在一个pH梯度和外加电场下，蛋白质有移向pH梯度中使其净电荷为零的点的倾向。（带正电荷移向阴极，带负电荷移向阳极）。IEF可以基于极微小的电荷差异而分离蛋白，具有高分辨率。 4， 负染就是用重金属盐（如磷钨酸、醋酸双氧铀）对铺展在载网上的样品进行染色；吸去染料，

样品干燥后，样品凹陷处铺了一薄层重金属盐，而凸的出地方则没有染料沉积，从而出现负染效果（图2-15），分辨力可达1.5nm左右

5， 质谱（又叫质谱法）是一种与并列

山师限选课答案

1， 基因组：一个细胞或病毒所包含的全部基因。

2， 蛋白质组(Proteome)的概念最先由Marc Wilkins提出。定义：蛋白质组是由一个细胞，一个组织或一

个机体的基因组所表达的全部相应的蛋白质。是一个整体概念。 3， 蛋白质组学：是一门以全面的蛋白质性质研究(如表达水平、转录修饰、相互作用等)为基础，在蛋白质水平对疾

病机理、细胞模式、功能联系等方面进行探索的科学，包括表达蛋白质组学，细胞谱蛋白质组学以 3， 等电聚焦：分离两性分子，特别是分离蛋白质的一种技术。根据在一个电场的影响下这些两性

分子在ph梯度上的分布情况进行分离

等电聚焦技术：在一个pH梯度和外加电场下，蛋白质有移向pH梯度中使其净电荷为零的点的倾向。（带正电荷移向阴极，带负电荷移向阳极）。IEF可以基于极微小的电荷差异而分离蛋白，具有高分辨率。 4， 负染就是用重金属盐（如磷钨酸、醋酸双氧铀）对铺展在载网上的样品进行染色；吸去染料，

样品干燥后，样品凹陷处铺了一薄层重金属盐，而凸的出地方则没有染料沉积，从而出现负染效果（图2-15），分辨力可达1.5nm左右

5， 质谱（又叫质谱法）是一种与并列

蛋白质组学研究中的液相色谱、生物质谱及Mascot原理与应用

¾生物质谱原理与仪器类型

¾色谱分离原理及应用

¾液质联用技术应用实例

¾Mascot 与质谱数据分析

¾生物质谱原理与仪器类型

¾色谱分离原理及应用

¾液质联用技术应用实例

¾Mascot 与质谱数据分析

质谱的基本概念一、质谱(Mass Spectromety)是什么？特殊的天平：称量离子的质量。质谱学：是一门研究气相离子结构、性质及反应行为的科学。二、质谱能做什么？定性：化合物的结构定量：混合物的组成领域：化学、生物学、医学、药学、环境、物理、材料、能源等三、质谱的独到之处是什么？ 4S特性：Sensitivity灵敏 Speed快速 Specificity特异 Stoichiometry化学计量

254.2 100 507.3

% 194.2 0 100 200 300 400 500 600 334.3 399.7 m/z

质谱学的发展历史

质谱学领域的诺贝尔奖

1906年：物理奖

J. I. Thomson

贡献：正电荷离子束在磁场中的偏转 磁质谱仪的基

础同位素分析

1989年：物理奖

W. Paul

贡献：离子阱技术的发明

20

蛋白质组学研究中的液相色谱、生物质谱及Mascot原理与应用

¾生物质谱原理与仪器类型

¾色谱分离原理及应用

¾液质联用技术应用实例

¾Mascot 与质谱数据分析

¾生物质谱原理与仪器类型

¾色谱分离原理及应用

¾液质联用技术应用实例

¾Mascot 与质谱数据分析

质谱的基本概念一、质谱(Mass Spectromety)是什么？特殊的天平：称量离子的质量。质谱学：是一门研究气相离子结构、性质及反应行为的科学。二、质谱能做什么？定性：化合物的结构定量：混合物的组成领域：化学、生物学、医学、药学、环境、物理、材料、能源等三、质谱的独到之处是什么？ 4S特性：Sensitivity灵敏 Speed快速 Specificity特异 Stoichiometry化学计量

254.2 100 507.3

% 194.2 0 100 200 300 400 500 600 334.3 399.7 m/z

质谱学的发展历史

质谱学领域的诺贝尔奖

1906年：物理奖

J. I. Thomson

贡献：正电荷离子束在磁场中的偏转 磁质谱仪的基

础同位素分析

1989年：物理奖

W. Paul

贡献：离子阱技术的发明

20

功能性油脂的研究现状

功能性油脂的概念【1】

功能性油脂是一类具有特殊生理功能的油脂，是对人体有一定保健功能、药用功能以及有益健康的一类油脂，是指那些属于人类膳食油脂，为人类营养、健康所需要，并对人体一些相应缺乏症和内源性疾病，特别是现今社会文明病如高血压、心脏病、癌症、糖尿病等有积极防治作用的一大类脂溶性物质。主要包括有多不饱和脂肪酸：亚油酸，α-亚麻酸， γ-亚麻酸，二十碳五烯酸（EPA）和二十碳六烯酸（DHA）;磷脂：卵磷脂、脑磷脂、肌醇磷脂、丝氨酸磷脂等;及现在新兴起的结构油脂。

1、多不饱和脂肪酸【1,2】

多不饱和脂肪酸（PUFA）是功能性油脂研究和开发的主体，它们一般是指含两个或两个以上双键、碳链长度在18或18以上的脂肪酸，根据其结构又分为n-6和n-3两大系列。前者主要有亚油酸(18:2) ，γ-亚麻酸(18:3)，花生四烯酸(20:4)等；后者主要有α-亚麻酸(18:3)，二十碳五烯酸(EPA， 20:5)，二十二碳六烯酸(DHA，22:6)等。 1.1多不饱和脂肪酸对免疫功能的影响

n-6 PUFA在免疫同时具有抑制和刺激作用。亚油酸在体内能被代谢为花生四烯酸，可以进一步氧化为二十烷类，如PGE2、白三烯、血栓烷等，对免