nf kb信号通路与炎症

NF-kappaB是一个大家族，包括：RelA(p65)、c-Rel、RelB、NF-kappaB1 (p50/p105)、NF-kappaB2 (p52/p100)。其中以RelA(p65)研究最为深入。

通常所说的是左边的经典途径，大致意思是这样：非激活状态下，RelA(p65)与一种名为IkappaB的蛋白结合，停留在胞浆中，不发挥转录活性。当炎症因子等刺激时，IkappaB的上游激酶IkappaB kinase（IKK）磷酸化而激活。IKK使IkappaB降解。p50有核定位信号，没有了IkappaB的束缚，p50会拽着RelA(p65)往核里面跑。RelA(p65)识别特定的DNA序列，并结合上去，从而调控靶基因的转录（这些基因的启动子上含有RelA(p65)的结合序列：5’-GGG(A/G)(C/A/T)T(C/T)-3’）。

一般来说，NF-kappaB的激活促进细胞生长，许多抗肿瘤药物以NF-kappaB为靶点，有兴趣的战友可以找些相关文献来看看。然而，某些情况下NF-kappaB的激活却有诱导凋亡的作用。

本信号转导涉及的信号分子主要包括：

BCR，TCR，TLRs，IL-1R，TNFR，GF-Rs，LTβR，CD

生命科学

letterstonature

AcknowledgementsWethankS.H.Ahn,D.Allis,M.Reyland,U.Siebenlist,theRockefellerUniversityGenotypingResourceCenterandtheMSKCCGenomicsCoreLaboratoryfor

providingcells,vectors,reagentsandtechnicalassistance.WealsothankE.Besmerforhelpwithmanuscriptpreparation,andA.PatkeandmembersoftheTarakhovskylaboratoryfordiscussions.ThisworkwassupportedbyTheIreneDiamondFund/ProfessorshipProgram(A.T.),theNIH(A.T.)andTheS.L.E.Foundation(I.M.).

CompetinginterestsstatementTheauthorsdeclarethattheyhavenocompeting nancialinterests.

Co

去泛素化在NF-κB信号通路调节中的作用

Edward W Harhaj1, Vishva M Dixit2

1Department of Microbiology and Immunology, Sylvester Comprehensive Cancer Center, The University of Miami, Miller School of Medicine, 1550 NW 10 Avenue, Miami, FL 33136, USA; 2Department of Physiological Chemistry, Genentech Inc., 1 DNA Way,South San Francisco, CA 94080, USA

核因子kappa B（NF-κB）是一种非常关键的调控因子，参与多种生物功能，包括先天和适应性的免疫以及细胞的生存等。NF-κB的激活严格受到一种慢性信号的调节，这一信号会导致持续性的炎症以及癌症。由关键信号分子E3连接酶介导的泛素化途径对NF-κB信号通路具有重要的调控作用。去泛素化(DUBs)可抵抗E3连接酶，因此在下调NF-κB信号通路以及维持稳态时，其有重要的作用。通过特异的去泛

Hedgehog信号通路在哺乳动物生殖系统中的作用

1. Hedgehog信号通路

Nusslein-Volhard和Wieschaus在对果蝇进行影响幼虫表皮层图式形成的突变体筛选时发现了 hedgehog 基因(hh)，果蝇和其他动物一样身体分成多个节段，幼虫的每个节段内一部分有毛、一部分无毛，hh 基因突变使无毛部分变成有毛部分，所以被戏称为“刺猬”基因，随后 Hedgehog 信号通路的组成成分和具体途径在果蝇中被确定。果蝇 Hedgehog 信号通路中的组成成分(主要包括 hh、ptch 和 Gli 家族转录因子 ci)及其功能被高度保守和复杂化的存在于哺乳动物中。果蝇只有一个 hh 基因，哺乳动物中发现其同源基因有 3 个，分别为 Sonic hedgehog(Shh)、Indian hedgehog (Ihh)和 Desert hedgehog (Dhh)，研究较多的是 Shh，因其在哺乳动物中作用最为广泛[2]。经典的哺乳动物 Hedgehog 信号通路是由 Hh 配体、跨膜蛋白质受体 Patched(Ptch1 和 Ptch2)和 Smoothened(Smo)组成的受体复合物、下游转录因子 Gli 蛋白(Gli-1、Gl

Wnt/Wg信号通路简介 【1】主要功能

参与发育过程中的细胞分化。Wnt/Wg是重要的morphogen(形态生成素)，它可以借Ca信号通过引发细胞极性通路发挥作用，也可以通过调节Armadillo的稳定性来（常规地）发挥作用。

1.在果蝇的胚胎发育过程中，engrailed(en)和Wg作为体节极性基因发挥功能。

Wg和en受pair-rule基因调控激活。en在even-skipped（Eve）或Fushi tarazu（Ftz）蛋白含量较高的细胞中表达，同时受到Odd-skipped, Runt,或Sloppy-paired的抑制。Wg在两者（Eve & Ftz）均不表达（表达sloppy-paired基因）的细胞中表达。

Wg蛋白表达后扩散到周围细胞，在表达en的细胞中，Wg和Ftz/Lrp6结合，经Wg信号通路激活en的表达。en蛋白激活en自身及hh基因的表达，hh扩散到周围细胞，和Patch受体结合，增强Wg基因的表达。[正反馈] hh/wg的相互作用，确定了denticle表达的边界。若Wg/Hh信号通路受到影响，则denticle会布满整个体节。Hedgehog，Porcupine，Arma

1 JAK-STAT信号通路 1) JAK与STAT蛋白

JAK-STAT信号通路是近年来发现的一条由细胞因子刺激的信号转导通路，参与细胞的增殖、分化、凋亡以及免疫调节等许多重要的生物学过程。与其它信号通路相比，这条信号通路的传递过程相对简单，它主要由三个成分组成，即酪氨酸激酶相关受体、酪氨酸激酶JAK和转录因子STAT。

(1) 酪氨酸激酶相关受体（tyrosine kinase associated receptor）

7）、GM-CSF（粒细胞/巨噬细胞集落刺激因子）、GH（生长激素）、EGF（表皮生长因子）、PDGF?7（IL-2?许多细胞因子和生长因子通过JAK-STAT信号通路来传导信号，这包括白介素2 （血小板衍生因子）以及IFN（干扰素）等等。这些细胞因子和生长因子在细胞膜上有相应的受体。这些受体的共同特点是受体本身不具有激酶活性，但胞内段具有酪氨酸激酶JAK的结合位点。受体与配体结合后，通过与之相结合的JAK的活化，来磷酸化各种靶蛋白的酪氨酸残基以实现信号从胞外到胞内的转递。 (2) 酪氨酸激酶JAK（Janus kinase）

很多酪氨酸激酶都是细胞膜受体，它们统称为酪氨酸激酶受体（receptor tyrosine

Hippo信号通路简介

名字的由来：其关键组成成员蛋白激酶Hippo突变能使组织增生，在果蝇中的表型看上去很像河马。

The Hippo signaling pathway, also known as the Salvador/Warts/Hippo (SWH) pathway。 【1】主要功能

参与细胞的增殖及程序性死亡的调控。参与癌症的形成。

1.Yki/YAP/TAZ是原癌基因。YAP过表达可以解除细胞的接触抑制(contact inhibition)。

多种癌症中可以发现Hippo signaling的基因突变（如 乳腺癌中可发现Fat4突变）…… 2.调控生物体器官的大小。(器官再生)

在小鼠肝脏过表达Yap，发现其因为细胞增生，大小扩大了3倍左右。停止过表达Yap，肝脏能恢复正常大小。

¤- 将细胞膜上的信号(细胞与细胞贴近的程度等)传递到细胞核中。和细胞极性及细胞骨架相关。

【2】信号通路的成员

Fat(FAT1-4 - mammals) ☆

功能：receptor [ps 配体未知]

类别：跨膜蛋白，atypical cadherin Dachsous (Ds) ☆ 功能：未知

信号转导通路在细胞代谢、生长、增殖、应激、发育和凋亡等生命活动中具有极为重要的作用。干扰这些通路将可能影响细胞的正常发育, 甚至导致肿瘤。MicroRNA(miRNA)是近年来在真核生物中发现的、在转录后水平负调节基因表达的一类长度约22个核苷酸的非编码小RNA, 其靶基因数目众

HEREDITAS (Beijing)

2007年12月, 29(12) : 1419―1428 ISSN 0253-9772 http://www.77cn.com.cn

综 述

DOI: 10.1360/yc-007-1419

MicroRNA与肿瘤相关的信号转导通路

吴易阳, 李岭

中国医科大学基础医学院医学遗传学教研室, 沈阳 110001

摘要: 信号转导通路在细胞代谢、生长、增殖、应激、发育和凋亡等生命活动中具有极为重要的作用。干扰这些通路将可能影响细胞的正常发育, 甚至导致肿瘤。MicroRNA(miRNA)是近年来在真核生物中发现的、在转录后水平负调节基因表达的一类长度约22个核苷酸的非编码小RNA, 其靶基因数目众多, 生物学功能广泛。在多种肿瘤中发现了miRNA的异常表达, 提示后者与肿瘤发生有关, 可能机制为调控癌基因或肿瘤抑制基因的表达。此外亦

经典信号通路之PI3K-AKT-mTOR信号通路

PI3K是一种胞内磷脂酰肌醇激酶，与v．src和v．ras等癌基因的产物相关，且PI3K本身具有丝氨酸/苏氨酸(Ser/Thr)激酶的活性，也具有磷脂酰肌醇激酶的活性。由调节亚基p85和催化亚基p110构成。

磷脂酰肌醇3-激酶(PI3Ks)蛋白家族参与细胞增殖、分化、凋亡和葡萄糖转运等多种细胞功能的调节。PI3K活性的增加常与多种癌症相关。PI3K磷 酸化磷脂酰肌醇PI(一种膜磷脂)肌醇环的第3位碳原子。PI在细胞膜组分中所占比例较小，比磷脂酰胆碱、磷脂酰乙醇胺和磷脂酰丝氨酸含量少。但在脑细胞膜中，含量较为丰富，达磷脂总量的10%。

PI的肌醇环上有5个可被磷酸化的位点，多种激酶可磷酸化PI肌醇环上的4th和5th位点，因而通常在这两位点之一或两位点发生磷酸化修饰，尤其发生在质膜内侧。通常，PI-4,5-二磷酸(PIP2)在磷脂酶C的作用下，产生二酰甘油(DAG)和肌醇-1,4,5-三磷酸。PI3K转移一个磷酸基团至位点3，形成的产物对细胞的功能具有重要的影响。譬如，单磷酸化的PI-3-磷酸，能刺激细胞迁移(cell trafficking)，而未磷酸化的则不能。PI-3,4-二磷酸则可促进

信号通路相关文献挖掘与分析方法研究摘要

‘摘要

生物信息学是以计算机为工具对生物信息进行储存、检索和分析的科学。随着生物医学文献的爆炸式增长，运用数据挖掘方法从文献中发现新知识受到越来越多的学者的关注。生物信息学研究的一个重要应用是开发信息检索的工具，对分散在文献里的有用信息进行系统整理。相对于传统的文献检索方法，这些方法具有速度快、自动化程度高的优点，尤其适用于大规模文献分析。

信号通路是生物对外界刺激做出反应的物质基础，几乎参与所有的细胞生命活动：代谢、分裂、分化、行使功能、凋亡等。近年来，与信号通路有关的研究如火如茶，但是大量的珍贵研究成果散落在海量的生物医学文献中，因此搜集、整理与信号通路有关的信息，对于全面理解生物进行复杂调控的机制具有重要意义。本文主要以信号通路的研究为背景，对蛋白磷酸化和基因转录调控这两个关键环节的文献进行搜集整理，并利用获得的文献数据预测蛋白磷酸化位点、推断癌症芯片中的转录因子和信号通路，旨在揭示信号通路的磷酸化机制以及信号通路在疾病、特别是癌症的产生和发展过程中的作用机制。

本文完成的有特色的研究工作主要包括：

Ｉ．基因的表达调控是信号通路中的重要环节，是信号通路的输出结果之一。本文提出了一种采用贝叶斯统计方法挖掘基因