AFLP分析

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AFLP简介方法、及所用引物

标签:文库时间:2024-11-17
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AFLP(扩增片段长度多态性)分子标记实验

扩增片段长度多态性Amplified fragment length polymorphism(AFLP)是在随机扩增多态性(RAPD)和限制性片段长度多态性(RFLP)技术上发展起来的DNA 多态性检测技术,具有RFLP技术高重复性和RAPD技术简便快捷的特点,不需象RFLP分析一样必须制备探针,且与RAPD标记一样对基因组多态性的检测不需要知道其基因组的序列特征,同时弥补了RAPD技术重复性差的缺陷。同其他以PCR为基础的标记技术相比,AFLP技术能同时检测到大量的位点和多态性标记。此技术已经成功地用于遗传多样性

研究,种质资源鉴定方面的研究,构建遗传图谱等。

其基本原理是:以PCR(聚合酶链式反应)为基础,结合了 RFLP、RAPD的分子标记技术。把DNA进行限制性内切酶酶切,然后选择特定的片段进行PCR扩增(在所有的限制性片段两端加上带有特定序列的“接头”,用与接头互补的但3-端有几个随机选择的核苷酸的引物进行特异PCR扩增,只有那些与3-端严格配对的片段才能得到扩增),再在有高分辨力的测序胶上分开这些扩增产物,用放射性法、荧光法或银染染色法均可检测之。

一、 实验材料

采用青稞叶片提取总DNA。

二、

用AFLP技术分析四川核桃资源的遗传多样性_陈良华

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植物生态学报 2008, 32 (6) 1362~1372 Journal of Plant Ecology (Chinese Version)

用AFLP技术分析四川核桃资源的遗传多样性

陈良华 胡庭兴* 张 帆 李国和

(四川农业大学林学园艺学院, 四川雅安 625014)

摘 要 利用AFLP分子标记技术, 运用EcoRⅠ/MseⅠ双酶切组合, 选用多态性高、分辨力强的4对选择性扩增引物组合E32/M48、E33/M61、E35/M61、E33/M62分别对四川省3个野生核桃(Juglans regia)种群和1个野生铁核桃(J. sigillata)种群共46个样品进行遗传多样性分析、居群遗传结构分析及种属关系探讨。结果表明: 1)共扩增出244个遗传位点, 其中146个多态位点, 多态率为59.84%; 核桃群体组和铁核桃群体的多态性百分率分别为55.33%和52.05%, 两个物种遗传多态性水平相当; 核桃群体组所检出的位点平均有效等位基因数Ae、Nei’s基因多样度H、平均Shannon信息指数I分别为1.322 9

AFLP分子标记技术及其在水产动物中的应用

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AFLP分子标记技术及其在水产动物中的应用

第 24 卷 第 7 期2009 年 7 月现 代 渔 业 信 息

MODERN FISHERIES INFORMATIONVol.24 No.7Jul., 2009

AFLP分子标记技术及其在水产动物中的应用

姚红伟 袁霞 付鑫

(大连水产学院生命科学与技术学院)

中国大连市黑石礁街52号 邮编:116023

景娜娜

(山西师范大学)

中国山西省临汾市贡院街1号 邮编:041004

【提要】 AFLP分子标记技术是DNA指纹技术的重大突破,由于其快速、简便、有效,因而在医学、农业、林业、畜牧业、渔业等领域中得到了广泛的应用。近年来人们不断地将这一技术完善和发展,使得AFLP成为迄今为止最有效的分子标记。本文简述了AFLP技术的基本原理、技术流程以及在水产动物中的应用情况。

姚红伟等,2009。AFLP分子标记技术及其在水产动物中的应用,《现代渔业信息》杂志,24(7):22-24。

关键词:AFLP 水产动物 应用

扩增长度片段多态性(Amplified Fragment Length Polymorphism,AFLP)是1992年由荷兰Keygene公

如何用NTsys构建0、1数据(AFLP)进化树

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NTSYS-PC使用说明

NTSYS是一个聚类分析的软件,可以用来分析AFLP,RAPD等电泳带型,也可用于微生物群落多样性的相似性分析。下面简单介绍一下其用法:

1.先建立一个0,1构成的矩阵:在excel中,按如下规则输入数据,A1=1表示有带记为1,B1=535表示AFLP样本数, C1=19表示有19个带型,D1=0表示无带记为0。第二行表示的是样本名称。从第三行开始的A列表示带型名称。见下图:

2.选择另存为,在其中的保存类型中选择“文本文件(制表符分隔)” 然后点保存,确认。

3.打开NTSYS软件点“Similarity”下拉选择”“Qualitative date”在“input file”中选择刚才保存的.txt文件,在“output file”中输入保存文件名。“Byrows”一项不选×,“coefficient”中选择J,点compute进行运算。

4.点软件左边第二项选择“SAHN”在“input file”中选择上一步运算出来的文件在“output tree file”中输入保存文件名。点compute进行运算。

5.选择左边第二项中的“Cophenetic Values”在

语法分析-自上而下分析

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编译原理 第四章 语法分析—自上而下分析

第四章 语法分析—自上而下分析

知识结构:

带回溯分析法 回溯

自上而下分析 面临的问题 左递归 问题的解决

语法分析- 求FIRST、FOLLOW集合的算法 自上而下分析 LL(1)分析法 证明LL(1)文法 构造LL(1)分析表

递归子程序的构造思想 递归子程序法 递归子程序的特点 递归子程序的设计

第一节 语法分析综述 一、语法分析的任务

按照语言即定的语法规则,对字符串形式的源程序进行语法检查,并识别出相应的语法成分。即语法结构是否符合语法规则。 二、语法分析器在编译程

食品分析试卷 - 食品分析

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食品分析试卷

一、填空题(每空1分,共30分)

1、食品分析是 的一门科学。 2、处理食品样品采用有机物破坏法,分

为 和 两类。 3、食品感官检验的种类

有: 、 、 、 。感官检验良好的食品,其理化、卫生指标 符合标准。 4、液态食品相对密度的测定方法

有: 、 、 。其中最准确的方法是 ____ 。

5、测定下列样品的水分宜采用什么方法:(1)受潮发粘的面粉 ;(2)蜂蜜 ;(3)绿豆香精(粉末状) ;(4)浓缩过程中的液体麦芽糊精 。 6、测灰分时,如何进行碳化操

财务分析表分析 - 图文

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万科上市公司财务报表的初步解

纵向分析

1 资产负债表分析 项目名称 货币资金 应收账款 存货 流动资产 资产总计 2011-12-31 余额(万元) 百分比% 3423951 2974581 20833549 282,646,65 296,208,44 11.5 10.0 70.3 95.4 2010-12-31 余额(万元) 3781693 1692377 13333345 20552073 21563755 2011-12-31 29620844 20833549 3423951 2974581 百分比% 17.5 7.8 61.8 95.3 2010-12-31 21563755 13333345 2009-12-31 余额(万元) 2300192 713,19 9008529 13032327 13760855 百分比% 16.7 0.5 65.4 94.7 变动幅度 37.36% 56.25% -0.09% 75.76% 项目 资产总额 存货 货币资金 应收账款 3781693 1692377 图一:万科近三年资产结构及变动表

近三年数据显示万科流动资产比例分别为95.4%,95.3%,94.7

ANSYS热分析分析指南

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ANSYS热分析指南

目 录

第一章 简介……………………………………………………………………….1

一、热分析的目的…………………………………………………………1 二、ANSYS的热分析………………………………………………………1 三、ANSYS热分析分类……………………………………………………1 四、 耦合分析…………………………………………………………….1 第二章 基础知识…………………………………………………………………2

一、 符号与单位………………………………………………………….2 二、 传热学经典理论回顾………………………………………………2 三、 热传递的方式………………………………………………………3 四、 稳态传热……………………………………………………………3 五、 瞬态传热……………………………………………………………4 六、 线性与非线性………………………………………………………4 七、 边界条件、初始条件…………………………………………………4 八、 热分析误差估计……………………………………………………4 第三章 稳态传热分析……………………………………………………………5

一、 稳态传热的定义………

财务分析表分析 - 图文

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万科上市公司财务报表的初步解

纵向分析

1 资产负债表分析 项目名称 货币资金 应收账款 存货 流动资产 资产总计 2011-12-31 余额(万元) 百分比% 3423951 2974581 20833549 282,646,65 296,208,44 11.5 10.0 70.3 95.4 2010-12-31 余额(万元) 3781693 1692377 13333345 20552073 21563755 2011-12-31 29620844 20833549 3423951 2974581 百分比% 17.5 7.8 61.8 95.3 2010-12-31 21563755 13333345 2009-12-31 余额(万元) 2300192 713,19 9008529 13032327 13760855 百分比% 16.7 0.5 65.4 94.7 变动幅度 37.36% 56.25% -0.09% 75.76% 项目 资产总额 存货 货币资金 应收账款 3781693 1692377 图一:万科近三年资产结构及变动表

近三年数据显示万科流动资产比例分别为95.4%,95.3%,94.7

证券投资分析-案例分析

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美国家得宝公司(Home Depot) 案例分析

公司简介:全球最大的家居建材零售商,美国第二大零售商 。成立于1978年。销售各类建筑材料、家居用品以及草坪花 园产品,并提供各类与之相关的服务。其标准店甚至配有 2138平方米的户外花园产品区域。 家得宝公司拥有种类繁多的商品,努力以低廉的价格提 供高质量的服务。顾客在购买设备之前,可以先以租赁的方 式试用。多年来,公司的服务水准也有所进步。它的每一家 分店都设有设计中心,配置受过专业训练的工作人员并免费 提供有关家庭装潢的建议,还包括了电脑辅助的厨房和浴室 设计。每家分店在周末都开设工作室,免费辅导成人自己动 手设计制作相关装潢,同时还有对儿童开放的工作室。

Home Depot 案例分析

公司及产业背景资料

公司主要业务 仓储式的连锁零售商场 销售的商品主要为家居装修材料 DIY(do it yourself) 中低档的品牌商品 销售对象

Home Depot 案例分析

公司大事记 1978创建(Bernard Marcus & Arthur Blank) 1979拥有3个商场,收入700万美元 1981股票进入一级半市场交易 1984纽约证券交易所上市