ncRNA非编码RNA

ncRNA(非编码RNA)的知识z

2010-07-31 10:36:54| 分类： Biology | 标签：rna |举报|字号 订阅

目录

一、核糖核酸（RNA） 二、转运RNA(tRNA) 三、信使RNA(mRNA) 四、核糖体RNA（rRNA） 五、小核RNA（snRNA） 六、RNA干扰（RNAi） 七、反义RNA（atRNA） 八、核仁小分子RNA（snoRNA） 九、细胞质小分子RNA(scRNA) 十、不均一核RNA（hnRNA）

十一、干扰mRNA的互补RNA(miRNA) 十二、非编码RNA（ncRNA） 十三、短发夹RNA(shRNA) 十四、短干扰RNA(siRNA) 十五、核酸酶（RNase）

十六、核糖核酸酶抑制剂（RNasin） 十七、向导RNA（gRNA） 一、核糖核酸（RNA） 1 概述

核糖核酸(RiboNucleic Acid ) ，简称RNA。由至少几十个核糖核苷酸通过磷酸二酯键连接而成的一类核酸，因含核糖而得名。RNA普遍存在于动物、植物、微生物及某些病毒和噬菌体内。RNA和蛋白质生物合成有密切的关系。在RNA病毒和噬菌体内，RNA是遗传信息的载体。RNA一般是单链线形分子，也有双链的如

1. 非编码RNA的分类及概念 1.1 分类

非编码RNA(non-coding RNA)是指转录组中不翻译为蛋白质的RNA分子。 包括相对分子量较小的 核内小分子RNA(small nuclear RNA，snRNA)、

核仁小分子RNA(small nucleolar RNAs，snoRNA)、 微RNA(microRNA，miRNA)、 piwi-interacting RNA(piRNA)

干扰小RNA（Small interfering RNA，siRNA）

以及相对分子量较大的 长非编码RNA(long non-coding RNA，lncRNA)等。 1.2 概念：

snRNA：核内小分子RNA(small nuclear RNA)，它是真核生物转录后加工过程中RNA剪接

体（spliceosome）的主要成分，参与mRNA前体的加工过程。

snoRNA：核仁小分子RNA（small nucleolar RNAs），它在核糖体RNA 的生物合成中发挥

作用，另外还能够指导snRNA、tRNA 和mRNA 的转录后修饰。

miRNAs：微小RNA（microRNAs），是一类由内源基因编码的长度约为22 个核苷酸的非编

码单链RNA

1. 非编码RNA的分类及概念 1.1 分类

非编码RNA(non-coding RNA)是指转录组中不翻译为蛋白质的RNA分子。 包括相对分子量较小的 核内小分子RNA(small nuclear RNA，snRNA)、

核仁小分子RNA(small nucleolar RNAs，snoRNA)、 微RNA(microRNA，miRNA)、 piwi-interacting RNA(piRNA)

干扰小RNA（Small interfering RNA，siRNA）

以及相对分子量较大的 长非编码RNA(long non-coding RNA，lncRNA)等。 1.2 概念：

snRNA：核内小分子RNA(small nuclear RNA)，它是真核生物转录后加工过程中RNA剪接

体（spliceosome）的主要成分，参与mRNA前体的加工过程。

snoRNA：核仁小分子RNA（small nucleolar RNAs），它在核糖体RNA 的生物合成中发挥

作用，另外还能够指导snRNA、tRNA 和mRNA 的转录后修饰。

miRNAs：微小RNA（microRNAs），是一类由内源基因编码的长度约为22 个核苷酸的非编

码单链RNA

1. 非编码RNA的分类及概念 1.1 分类

非编码RNA(non-coding RNA)是指转录组中不翻译为蛋白质的RNA分子。 包括相对分子量较小的 核内小分子RNA(small nuclear RNA，snRNA)、

核仁小分子RNA(small nucleolar RNAs，snoRNA)、 微RNA(microRNA，miRNA)、 piwi-interacting RNA(piRNA)

干扰小RNA（Small interfering RNA，siRNA）

以及相对分子量较大的 长非编码RNA(long non-coding RNA，lncRNA)等。 1.2 概念：

snRNA：核内小分子RNA(small nuclear RNA)，它是真核生物转录后加工过程中RNA剪接

体（spliceosome）的主要成分，参与mRNA前体的加工过程。

snoRNA：核仁小分子RNA（small nucleolar RNAs），它在核糖体RNA 的生物合成中发挥

作用，另外还能够指导snRNA、tRNA 和mRNA 的转录后修饰。

miRNAs：微小RNA（microRNAs），是一类由内源基因编码的长度约为22 个核苷酸的非编

码单链RNA

Perspectives前沿评述生物化学与生物物理进展

ProgressinBiochemistryandBiophysics2014,41(10):997~1009

www.pibb.ac.cn

长非编码RNA研究进展*

陈晓敏张栋栋

骆健俊

陈润生＊＊

(中国科学院生物物理研究所，中国科学院核酸生物学重点实验室，北京100101)

摘要长非编码RNA是指一类长度大于200个核苷酸、不编码蛋白质的非编码RNA．越来越多的研究表明，人类基因组中

高达90%的非编码蛋白质的区段同样具有重要作用，而不是所谓的“转录噪声”．针对长非编码RNA的功能研究表明，其在转录起始的调控、转录及转录后的调控中均发挥着重要作用，因而影响着各种各样的生物学过程．本综述围绕近几年长非编码RNA的研究成果，总结了长非编码RNA的起源与进化、新型的长非编码RNA类型、典型的长非编码RNA作用机制以及长非编码RNA在发育与细胞重编程过程中的研究，同时也概述了长非编码RNA与表观遗传调控和癌症的关系以及长非编码RNA研究的相关技术．系统发现长非编码RNA并阐明其功能机制，将对现代生命科学具有重大的意义．关键词

长非编码RNA，作用机制，发育与细胞重编程，表观遗传调控，研究技术

DOI:10.37

长链非编码RNA与肿瘤的相关研究进展

李铸鹏;苏丹;毛伟敏

【期刊名称】《医学研究杂志》

【年(卷),期】2015(044)004

【摘要】随着基因组学和转录组学基因测序的发展,长链非编码RNA(long non coding RNA,LncRNA)得到了越来越多的的关注. 大量研究表明LncRNA不仅仅是DNA和蛋白质之间的媒介,而且是调节细胞功能的重要角色. LncRNA可以通过多种途径调节基因表达,包括染色体重塑、转录和转录后加工. 而且LncRNA的异常调控逐渐和很多疾病联系起来,特别是肿瘤. 在这里笔者总结一下LncRNA领域的快速发展,描述一下LncRNA的异常调控和人类肿瘤的关系,重点关注的是长链非编码RNA的异常调控在肿瘤的特殊作用.

【总页数】4页(156-159)

【关键词】长链非编码RNA;肿瘤;基因组学

【作者】李铸鹏;苏丹;毛伟敏

【作者单位】温州医科大学第一临床学院心胸外科325000;温州医科大学第一临床学院心胸外科 325000;温州医科大学第一临床学院心胸外科 325000

【正文语种】中文

【中图分类】R73

【相关文献】

1.长链非编码RNA与mTOR在肿瘤中的相关研究进展 [J], 于健鹏

2.长链非编码RNA与肿瘤相关信号通路

长链非编码RNA与肿瘤的相关研究进展

李铸鹏;苏丹;毛伟敏

【期刊名称】《医学研究杂志》

【年(卷),期】2015(044)004

【摘要】随着基因组学和转录组学基因测序的发展,长链非编码RNA(long non coding RNA,LncRNA)得到了越来越多的的关注. 大量研究表明LncRNA不仅仅是DNA和蛋白质之间的媒介,而且是调节细胞功能的重要角色. LncRNA可以通过多种途径调节基因表达,包括染色体重塑、转录和转录后加工. 而且LncRNA的异常调控逐渐和很多疾病联系起来,特别是肿瘤. 在这里笔者总结一下LncRNA领域的快速发展,描述一下LncRNA的异常调控和人类肿瘤的关系,重点关注的是长链非编码RNA的异常调控在肿瘤的特殊作用.

【总页数】4页(156-159)

【关键词】长链非编码RNA;肿瘤;基因组学

【作者】李铸鹏;苏丹;毛伟敏

【作者单位】温州医科大学第一临床学院心胸外科325000;温州医科大学第一临床学院心胸外科 325000;温州医科大学第一临床学院心胸外科 325000

【正文语种】中文

【中图分类】R73

【相关文献】

1.长链非编码RNA与mTOR在肿瘤中的相关研究进展 [J], 于健鹏

2.长链非编码RNA与肿瘤相关信号通路

龙源期刊网 http://www.qikan.com.cn

长链非编码RNA在食管鳞癌中的研究进展

作者：陈琳 孟丽 史卫红

来源：《科技创新导报》2015年第31期

摘 要：长链非编码RNA是人体基因中不具备蛋白编码功能的核酸序列。随着人体基因工程科研项目的开展，长链非编码RNA逐渐被证实并非转录噪音，其所具有的多种生物学功能在很大程度上影响人类健康。既往有研究证实，长链非编码RNA表达异常与肿瘤疾病相关，该文将以次为基础，针对食管鳞癌总结近期在这一领域内长链非编码RNA的研究进展并对其临床意义进行分析和探讨，旨在为鳞癌的分子诊断与治疗提供参考。 关键词：长链非编码RNA 食管鳞癌 研究进展 临床意义

中图分类号：R735 文献标识码：A 文章编号：1674-098X（2015）11（a）-0253-02 鳞癌即鳞状细胞癌，因其多发病于人体组织中有鳞状上皮覆盖的表皮，故又称为表皮癌，常见发病部位为皮肤、口腔、食管、阴道等处。食管鳞癌多指原发性食道癌，属鳞癌中常见癌症种类，其主要发病原因为食管鳞状上皮异常增生。我国是食管癌高发国家，其中尤以河南、河北、江苏、山西等地的发生率、病死

1.1 RNAi及发现

双链RNA介导的一序列特异的转录后基因沉默的过程称为RNAi（RNA interference）。Fire等在1998年在华丽新小杆线虫（Cancorhabditis elegans）首先发现了RNAi效应，随后在许多动物中陆续发现了RNAi效应的存在，如果蝇、锥虫、蜗虫、线虫等。Wiang等在研究鼠卵母细胞及胚胎早期发育过程中也发现存在RNAi效应，最近Sagda等在实验中发现哺乳动物细胞（如人胚肾细胞、Hela细胞等）同样存在RNAi效应，并且发现具有对称性突出2个核苷酸的约21nt siRNAs双链复合物（Short interfering RNAs duplex）可诱导RNAi，但较长的dsRNA由于可以诱发细胞内干扰素系统，从而表现出广泛的非特异性阻抑效应。动物中的RNAi效应与植物中外源性RNA导入细胞后发生PTGS（转录后基因沉默效应），及quelling现象也非常相似。

随着对RNAi的大量研究，人们发现它在许多生物体有着广泛的生理作用。Hiroaki等用华丽新小杆线虫做表型缺失突变时发现，转座子静寂可能是RNAi的一种自然功能，即RNAi可以抑制转座子运动，Keetting认为也可能是保护生殖腺细胞以

哺乳动物组织样品RNA的抽提

哺乳动物组织样品RNA的抽提最基本的要素是防止RNA在抽提过程中降解，以及尽可能得到最高的RNA抽提效率。以下介绍我们实验室认为最符合以上两个要素的抽提方法。

关键词：抽提 样品 哺乳动物组织 样品RNA

哺乳动物组织样品RNA的抽提最基本的要素是防止RNA在抽提过程中降解，以及尽可能得到最高的RNA抽提效率。以下介绍我们实验室认为最符合以上两个要素的抽提方法。 一、实验材料：

Trizol试剂（Invitrogen公司）

研钵，匀浆器，镊子，铝箔都高温灭菌即可； 二、具体过程：

1、样品在离体后应迅速冷冻在液氮中，若是比较大块的组织，要尽量把组织剪切成黄豆大小的块，使液氮迅速渗透到组织内部而防止组织内部的RNA降解。组织用铝箔包好或放入冻存管中，并做好记号，注意不要把记号写在纸上，以防纸被组织的血水渗透而导致记号模糊。可以把铝箔放入纱布袋并储存在液氮中。

2、在抽提RNA前，先把研钵预冷，往研钵内反复加入液氮，至少4-5次，使研钵充分预冷。从液氮罐中取出样本后，把组织块放入已预冷的研钵中进行研磨，边研磨边加液氮，整个过程都不要使液氮挥干。一次研磨的组织块重量不要超过300mg。

3、研磨到组织样品成粉末状后