构建系统发育树的三大方法

序列文件准备

第一行 序列总数量 最长序列的bp数 第二行 >序列名称 第三行 无空格的序列 第一个序列往往是外群 然后是自己的序列 最后是外源序列

Clustal 2.0应用程序

File→load sequences 选多序列 mode→multiple Alignment mode

Alignment→iteraction→iterate each alignment step

Alignment→output formut options→phylip format(选中)→close→do complete Alignment→align 找出相似bp的头部，把前边的从文本中切掉，后边的类似（n尽量少） File→load sequences

Alignment→output formut options→phylip format(选中)→close→do complete Alignment→align 将生成的.phy文件复制到简单路径中 1、phylip→exe→seqboot（应用程序），输入文件的路径名（.phy） 改参数： Y 回车

101 回车（随机数） 生成“outfile文件”改名

构建系统发育树需要注意的几个问题

1 相似与同源的区别：只有当序列是从一个祖先进化分歧而来时，它们才是同源的。

2 序列和片段可能会彼此相似，但是有些相似却不是因为进化关系或者生物学功能相近的缘故，序列组成特异或者含有片段重复也许是最明显的例子；再就是非特异性序列相似。

3 系统发育树法：物种间的相似性和差异性可以被用来推断进化关系。 4 自然界中的分类系统是武断的，也就是说，没有一个标准的差异衡量方法来定义种、属、科或者目。

5 枝长可以用来表示类间的真实进化距离。

6 重要的是理解系统发育分析中的计算能力的限制。任何构树的实验目的基本上就是从许多不正确的树中挑选正确的树。

7 没有一种方法能够保证一颗系统发育树一定代表了真实进化途径。然而，有些方法可以检测系统发育树检测的可靠性。第一，如果用不同方法构建树能得到同样的结果，这可以很好的证明该树是可信的；第二，数据可以被重新取样(bootstrap)，来检测他们统计上的重要性。

分子进化研究的基本方法

对于进化研究，主要通过构建系统发育过程有助于通过物种间隐含的种系关系揭示进化动力的实质。

表型的(phenetic)和遗传的(cladistic)数据有着明显差异。Sneath

社会工作三大方法（社区、小组、个案）的相关知识理论 社区工作

一.社区工作的目标 1、罗斯曼分发

事工目标：解决一些特定的社会问题，完成具体的事工，达到社会福利目标，满足社区需要。如，修桥筑路、安置无家可归者。

过程目标：促进社区居民一般能力的提高，建立社区内不同群体的合作关系，发掘和培养社区领袖参与社区事务，加强居民对社区事务的了解，以期增强解决问题的能力、信心和技巧等。 2、托马斯分发

分配资源：组织居民就日常的切身事情争取合理而平均的资源调配，从而使权益得到保障。

发动居民：培养基层市民的政治责任感；培养居民的“社区凝聚力”。 二、社区工作主要工作模式 （一）地区发展模式 主要观点：

提高居民的民主参与意识，挖掘、培养当地人才。鼓励居民关心、了解本社区问题，进行讨论，采取行动。通过自助、互助去解决社区问题。常用于比较简单的社区，较少引进外来资源。 基本改变策略：

把所有的人团结在一起，然后讨论、决定。 方法：

进入社区——调查研究——建立和发展居民组织——社区项目管理 （二）社会策划模式 主要观点：

是一种由上而下的方法。依靠专家的意见，通过有关专家的调研、论证、计划，然后落实、推行，去解决社区内的问题。居民

常用现代设计十大方法

一）计算机辅助设计(CAD-Computer Aided Design)

利用计算机及其图形设备帮助设计人员进行设计工作。简称CAD。 在工程和产品设计中，计算机可以帮助设计人员担负计算、信息存储和制图等项工作。在设计中通常要用计算机对不同方案进行大量的计算、分析和比较，以决定最优方案；各种设计信息，不论是数字的、文字的或图形的，都能存放在计算机的内存或外存里，并能快速地检索；设计人员通常用草图开始设计，将草图变为工作图的繁重工作可以交给计算机完成；由计算机自动产生的设计结果，可以快速作出图形显示出来，使设计人员及时对设计作出判断和修改；利用计算机可以进行与图形的编辑、放大、缩小、平移和旋转等有关的图形数据加工工作。CAD能够减轻设计人员的劳动，缩短设计周期和提高设计质量。

发展概况 20世纪50年代在美国诞生第一台计算机绘图系统，开始出现具有简单绘图输出功能的被动式的计算机辅助设计技术。60年代初期出现了CAD的曲面片技术，中期推出商品化的计算机绘图设备。70年代，完整的CAD系统开始形成，后期出现了能产生逼真图形的光栅扫描显示器，推出了手动游标、图形输入板等多种形式的图形输入设备，促进了CAD技术的发展。

研发成本：就是研发项目支出的第三方外协外购成本和期间费用。

设计成本：是指设计出的产品的生产成本，主要是材料成本，如要考虑制造工艺(在设计中，产品的可制造性，也是影响成本的一个重要因素)，则加上制造费用，从而形成产品的生产成本。

一般重点在于控制设计成本，以及研发成本中的人力资源成本，即人员投入与进度。项目管理论坛 IPD强调以市场需求作为产品开发的驱动力，将产品开发作为一项投资来管理，通过市场重组、产品重组和流程重组，实现产品开发的准确、快速、低成本。

通过长期实践，我们总结出，通过IPD有效控制项目成本的八大操作方法。 方法一：通过控制需求，降低成本

客户需求的$APPEALS模型八大要素中，如果将各项需求胡子眉毛一把抓，则真正客户关注的重要需求，反而淡化了;开发周期漫长，迟迟不能交付;同时，在过程中，客户需求总是在变，总也收不了尾，导致成本居高不下。

因此，首先要将客户需求，按照八大要素进行分解与定义，并进行重要性分类，分为：基本需求、更满意的竞争需求，以及更具吸引力的可有可无需求。

经过与各类客户群反复验证，制订产品开发路标规划，首先满足基本需求，推出第一个版本，抢占市场;再满足更满意的竞争需求，推出第二个

简述水处理的十大方法（一）

在环保越来越受到重视的当今，在关于水处理方面也是相当重视。在水处理技术上更要符合当今时代的要求，就具备高效、环保、节能、稳定等逐多方面的要求。 软化法水处理技术

软水机常用的软水技术有两种，一种是通过离子交换树脂去除水中的钙、镁离子，降低水质硬度;另外一种是纳米晶技术，即Template Asisted Crystallization(模块辅助结晶)，利用纳米晶产生的高能量，把水中游离的钙、镁、碳酸氢根离子打包成纳米级的晶体，从而阻止游离离子生成水垢。 蒸馏法水处理技术

蒸馏法是指将水煮沸，然后收集蒸汽，使之冷却和凝结成液体。蒸馏水是极安全的饮用水，但有一些问题要进一步探讨。由于蒸馏水不含矿物质，这成为反对者提出人的寿命容易老化的理由。另外利用蒸馏法成本较高，耗费能源，不能去除水中挥发性物质。 煮沸法水处理技术

煮沸法是指自来水煮沸后饮用，这是一种古老的方法，在国内普遍地应用。水煮沸可杀死细菌，但对一些化学物质和重金属不能去除，即使其含量极低，所以饮用仍是不安全的。 磁化法水处理技术

磁化法是指利用磁场效应处理水，称为水的磁化处理。磁化处理的过

汽车轮胎的检查方法 6大方法帮到你

轮胎作为汽车的“脚”，平时一直默默地为主人服务，然而就是这么关键的部位却最容易遭人“冷落”，今天我们就教您几个自检轮胎的注意事项。

轮胎作为汽车的“脚”，平时一直默默地为主人服务，然而就是这么关键的部位却最容易遭人“冷落”，今天我们就教您几个自检轮胎的注意事项。扎洞您的爱车轮胎被扎过吗?如果有，那么是多长时间前的事了呢?其实对于已经补完胎的车来说，即使暂时用起来没问题，在极限负载下的承受力也会大不如前。

另外，如果同一条轮胎上已经扎了3个以上的洞，建议您还是尽快把胎换掉吧。鼓包汽车以高速驶过凹坑、障碍物及马路沿时，轮胎局部在巨大的撞击力下将发生严重变形，内部压力瞬间增大，这样的直接后果就是造成轮胎鼓包。已经发生鼓包的轮胎必须立即更换，否则就有爆胎的危险。

花纹一般来说，正常使用的家用轿车可以每6万公里或两年更换一次轮胎，但花纹磨损严重的轮胎则应提早更换。现在的维修店都有花纹磨损标尺，车主可以买一把，随时检测自己轮胎的花纹磨损状况。

此外，胎面裂纹增多也是轮胎老化严重的标志，平时车主可以适当喷一些轮胎保护蜡，还有就是开车时尽量不要压到腐蚀性的液体。气压对于前驱车来说由于发动机、变速箱等重要驱动部件都压在前部，所以前轮有

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MC1R基因编码区的系统发育分析和正选择位点检测

作者：李丽莎 李祥龙 周荣艳 李兰会 张永改 马梦云 张秀玲 来源：《江苏农业科学》2016年第03期

摘要： 黑素皮质素受体1（melanocortin 1 receptor，MC1R）基因在黑色素细胞的表达上发挥重要作用，并与皮肤色素沉积密切相关。MC1R基因的选择压力分析对识别重要的功能位点具有深远影响。为研究不同动物MC1R基因在进化过程中是否受到正选择作用，基于位点模型对MC1R基因进行研究。结果表明，动物MC1R基因主要经历中性漂变和纯化选择作用，并且发现MC1R基因受到正选择作用的是编码29、191、253、304氨基酸的位点。本研究从分子进化的角度为MC1R基因调控黑色素的形成提供了一个新的思路。 关键词： MC1R；分子进化；亲缘关系；系统发育；正选择

中图分类号： Q756 文献标志码： A 文章编号：1002-1302（2016）03-0044-04 黑素皮质素受体1（melanocortin 1 receptor，MC1R）基因，也称为促黑素细胞激

一株反硝化光合细菌的生物学特性及系统发育分析

摘要:【目的】养殖水体中亚硝酸盐的过量积累会对养殖生物产生毒害作用，应用脱氮细菌去除亚硝酸盐是养殖水质调控的重要手段之一，本文意在得到一株高效去除亚硝酸盐的光合细菌。【方法】采用软琼脂稀释法分离纯化光合细菌菌株，通过电镜观察、生理生化试验研究其生物学特性、依据 16S rDNA 和光合反应中心 M 亚基基因(Gene coding for photosynthetic reaction center subunit M，pufM)序列对其做系统发育分析。【结果】从淡水养殖塘中分离筛选到一株高效还原亚硝氮的光合细菌菌株 wps。该菌株为革兰氏阴性菌，细胞杆状，大小为 0. 4 － 0. 6μm × 1. 5 － 4. 0 μm，极生丛生鞭毛，片层状光合内膜，兼性厌氧光照条件生长，单菌落及液体培养物呈红色，含细菌叶绿素 a 和类胡萝卜素。最适生长 pH 范围为 5. 5 － 8. 5，最适生长盐度范围为0 － 2% ，最适生长温度范围为 25℃ － 38℃ 。菌株 wps 与 Rhodopseudomonas palustris 的 16S rDNA 序列相似性为 98. 9% ，光合反应中心 M 亚

第十二章 微生物的进化、系统发育和分类鉴定

地球大约是在45亿年前形成的。地质学、古生物学和地球化学直接或间接证据都表明：大约在地球形成10亿年之后，我们这个星球开始出现生命，主要是些类似简单杆状细菌的原始生物。但在同期的、另外一些被认为是由光合微生物与沉积物形成的片层状化石--叠层石(stromatolites)资料中，也发现存在形态较多样的微生物，综合分析认为，它们类似于绿硫细菌和多细胞丝状绿菌，这似乎表明：不产氧光合细菌的起源也很早。这些原始生命大概都是厌氧型的。含有产氧型光合细菌--蓝细菌的叠层石则发现于25-30亿年前的地质年代中 ，蓝细菌的出现，给地球带来了氧气。而后，各种真核生物才随之出现。

根据现代生物进化论观点，地球上的生命是在地球历史早期的特殊环境条件下，通过\前生命的化学进化\过程，由非生命物质产生的。这些最原始的生命经过漫长的进化历程，产生了千姿百态的生物种类。所谓进化(evolution)是生物与其生存环境相互作用过程中，其遗传系统随时间发生一系列不可逆的改变，在大多数情况下，导致生物表型改变和对生存环境的相对适应。所以，今天仍生存在地球上的生物种类，彼此之间都有或远或近的历史渊源。 研究微生物的系统发育(phy