vasp参数
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vasp计算参数设置
软件主要功能:
采用周期性边界条件(或超原胞模型)处理原子、分子、团簇、纳米线(或管)、薄膜、晶体、准晶和无定性材料,以及表面体系和固体
l 计算材料的结构参数(键长、键角、晶格常数、原子位置等)和构型 l 计算材料的状态方程和力学性质(体弹性模量和弹性常数)
l 计算材料的电子结构(能级、电荷密度分布、能带、电子态密度和ELF) l 计算材料的光学性质 l 计算材料的磁学性质
l 计算材料的晶格动力学性质(声子谱等)
l 表面体系的模拟(重构、表面态和STM模拟) l 从头分子动力学模拟
l 计算材料的激发态(GW准粒子修正)
计算主要的四个参数文件:INCAR ,POSCAR,POTCAR ,KPOINTS,下面简要介绍,详细权威的请参照手册 INCAR文件:
该文件控制VASP进行何种性质的计算,并设置了计算方法中一些重要的参数,这些参数主要包括以下几类:
l 对所计算的体系进行注释:SYSTEM
l 定义如何输入或构造初始的电荷密度和波函数:ISTART,ICHARG,INIWAV l
VASP使用总结
VASP计算的理论及实践总结
一、赝势的选取 二、收敛测试
1、VASP测试截断能和K 点 2、MS测试
三、结构弛豫
四、VASP的使用流程(计算性质)
1、VASP的四个输入文件的设置 2、输出文件的查看及指令 3、计算单电能
(1) 测试截断能 (2) 测试K点 4、进行结构优化 5、计算弹性常数 6、一些常用指令
一、赝势的选取
VASP赝势库中分为:PP和PAW两种势,PP又分为SP(标准)和USPP(超软)。
交换关联函数分为:LDA(局域密度近似)和GGA(广义梯度近似)。GGA又分为PW91和PBE。
在VASP中,其中pot ,pot-gga是属于超软势(使用较少)。Paw, paw-pbe ,和paw-gga是属于PAW。采用较多的是PAW-pbe 和PAW-gga。
此外vasp 中的赝势分为几种,包扩标准赝势(没有下标的)、还有硬(harder)赝势(_h)、软(softer)赝势(_s), 所谓的硬(难以赝化),就是指该元素原子的截断动能比较大,假想的势能与实际比较接近,计算得到的结果准确,但比较耗时,难以收敛。软(容易赝化),表示该元素原子的截断动能比较小,赝势模型比较粗糙,但相对简单,可以使计算很快收
vasp攻略
打包压缩命令:tar zcvf 文件名.tar.gz 源文件名
采用link方式避免重复的文件浪费内存:ln –s 源文件 命名
Eg:ln –s ../optic/MME ./EuO.mme
交互式绘图工具gnuplot: 命令行打:gnuplot进入 格式:plot “文件名” 退出:quit
求磁矩:getmag
如果由于节点掉线在提交任务后秒退,不输出outcar可以指定节点提交任务 LJRS -l nodes=c0104:ppn=4
chmod +x 名称——使脚本可以执行 构造potcar,以A和B元素为例:
如果是以Z为拓展名的文件: zcat A/POTCAR.Z B/POTCAR.Z > POTCAR 如果是解压后的potcar文件: cat A/POTCAR B/POTCAR > POTCAR
INCAR中的RWIGS通过POTCAR文件获得
单位晶胞体积:grep “vol” OUTCAR
自动计算加应力情况下的最优化情况:
C/a :vaspcaopt softmode-e -=*(画曲线)
如果要看某种材料是FM还是AFM
VASP-POTCAR
实例1
VASP赝势文件POTCAR详解 VASP赝势文件POTCAR详解
POTCAR 赝势文件
可以理解为分子力学模拟中的力场文件 但包括的信息更多 VASP4.6将各元素优化的INCAR里的参数也包括在这里了,作为支持PREC的缺省选择 通常各元素的POTCAR已经包括在软件包里了
我们只需要按照POSCAR里的顺序,将各元素的POTCAR按顺序连接起来就可以了 如以下命令:
cat file1 file2 file3 > POTCAR
软件包自带的绝大多数赝势是超软赝势(US-PP)了,但不少元素有两个版本,如何 选取呢?
一个简单的办法是看后缀
标准的没有后缀 _h 硬一点 _s 软一点
_pv,_sv,_d 就是说semi-core的p,s或者d也当做价态处理了 如果是数字的话,表示的可能是不同的半径截距
也可以参考各版本同目录下的V_RHFIN file ,PSCTR file 这两个文件告知该版本的赝势是如何生成的。比如: V_RHFIN file Sc: 6p d2 s1
8 21. .002000 44.95590 125. .2
vasp=CASTEP 文档
VASP和CASTEP的参数设置区别
请问大家:再用VASP计算的时候,K点应该怎么选取呢?我用CASTEP默认的那个设置算的,有的会提示说 VERY BAD NEWS! internal error in subroutine IBZKPT: Tetrahedron method fails for NKPT<4. NKPT =2:貌似是说我的K点设置的不合理吧,那我应该用什么办法选取K点呢?在文献上找不到跟我的模型一样的,没办法参考别人的。 第二个问题是计算能带结构的时候高对称点有应该怎么选取呢, 建立不同大小的超晶胞选用的截断能和高对称点应该一样吗?
我一直搞不清楚这个问题,就是VASP计算的时候选用的势函数、截断能可以按照CASTEP默认的来吗?我自己测试的截断能和CASTEP默认的怎么相差特别大呢?
1. VASP中采用Tetrahedron method 时,k点不能少于4个。解决方法:可以选ISMEAR=0;SIGMA=0.1
2. 计算能带时的高堆成点可用CASTEP提供的,即CASTEP计算能带时用的k特殊点。不同超晶胞选用的截断能不能一样啊,要不然超晶胞太大导致无法运算,不是吗
3. vasp计算的时候选用的势函数、截断能可以用CASTEP默认的来,但是不一定精确,所以一般还是要自己测试之后才用。以测试得到的结果为准。
谢谢你的回答,我还想在请问一下,你的意思就是说:VASP就直接采用CASTEP默认的K点吗?我看好多人用的跟默认的还不一样,这是怎么选的呢?
还有
VASP-POTCAR
实例1
VASP赝势文件POTCAR详解 VASP赝势文件POTCAR详解
POTCAR 赝势文件
可以理解为分子力学模拟中的力场文件 但包括的信息更多 VASP4.6将各元素优化的INCAR里的参数也包括在这里了,作为支持PREC的缺省选择 通常各元素的POTCAR已经包括在软件包里了
我们只需要按照POSCAR里的顺序,将各元素的POTCAR按顺序连接起来就可以了 如以下命令:
cat file1 file2 file3 > POTCAR
软件包自带的绝大多数赝势是超软赝势(US-PP)了,但不少元素有两个版本,如何 选取呢?
一个简单的办法是看后缀
标准的没有后缀 _h 硬一点 _s 软一点
_pv,_sv,_d 就是说semi-core的p,s或者d也当做价态处理了 如果是数字的话,表示的可能是不同的半径截距
也可以参考各版本同目录下的V_RHFIN file ,PSCTR file 这两个文件告知该版本的赝势是如何生成的。比如: V_RHFIN file Sc: 6p d2 s1
8 21. .002000 44.95590 125. .2
VASP使用总结
VASP计算的理论及实践总结
一、赝势的选取 二、收敛测试
1、VASP测试截断能和K 点 2、MS测试
三、结构弛豫
四、VASP的使用流程(计算性质)
1、VASP的四个输入文件的设置 2、输出文件的查看及指令 3、计算单电能
(1) 测试截断能 (2) 测试K点 4、进行结构优化 5、计算弹性常数 6、一些常用指令
一、赝势的选取
VASP赝势库中分为:PP和PAW两种势,PP又分为SP(标准)和USPP(超软)。
交换关联函数分为:LDA(局域密度近似)和GGA(广义梯度近似)。GGA又分为PW91和PBE。
在VASP中,其中pot ,pot-gga是属于超软势(使用较少)。Paw, paw-pbe ,和paw-gga是属于PAW。采用较多的是PAW-pbe 和PAW-gga。
此外vasp 中的赝势分为几种,包扩标准赝势(没有下标的)、还有硬(harder)赝势(_h)、软(softer)赝势(_s), 所谓的硬(难以赝化),就是指该元素原子的截断动能比较大,假想的势能与实际比较接近,计算得到的结果准确,但比较耗时,难以收敛。软(容易赝化),表示该元素原子的截断动能比较小,赝势模型比较粗糙,但相对简单,可以使计算很快收
vasp 安装心得
VASP5.2安装心得
2014-05-07 来源:小木虫作者: yysskk
花了五天时间终于学会怎么装VASP了,在此写下心得体会,供后人参考。个人觉得最难的一步就是makefile文件,网上流传着各种各样的版本,每个人都说自己编译成功了,却又各不相同,也说不清为什么,给新手极大的困扰。在此会详细介绍makefile的文件结构。其余大部分内容都是参考前人的,就不一一注明出处了。
一、系统、编译程序及准备工作
我用的是centos6.5+icc2011+ifort2011+openmpi1.6.5 1.1编译器安装
系统安装不说了,网上教程多得是。Icc和ifort可以申请免费非商业版本,icc和ifort都各自带了一个MKL,使用的时候别搞混了。装2011的时候会缺组件,用yum都可以免费下载。装编译器的时候会要求关闭selinux,按照给出的步骤关闭即可。之后会说系统不兼容,但是可以继续装,默认安装路径是在/opt下面。装完之后会有提示,把安装目录/bin/ifortvars.sh 写到环境变量中,注意32/64位系统的参数不一样。C语言编译器建议用icc,毕竟是intel出品,针对自家cpu肯定有大量优化,效率上高于gcc是肯定的。
VASP使用总结
VASP计算的理论及实践总结
一、赝势的选取 二、收敛测试
1、VASP测试截断能和K 点 2、MS测试
三、结构弛豫
四、VASP的使用流程(计算性质)
1、VASP的四个输入文件的设置 2、输出文件的查看及指令 3、计算单电能
(1) 测试截断能 (2) 测试K点 4、进行结构优化 5、计算弹性常数 6、一些常用指令
一、赝势的选取
VASP赝势库中分为:PP和PAW两种势,PP又分为SP(标准)和USPP(超软)。
交换关联函数分为:LDA(局域密度近似)和GGA(广义梯度近似)。GGA又分为PW91和PBE。
在VASP中,其中pot ,pot-gga是属于超软势(使用较少)。Paw, paw-pbe ,和paw-gga是属于PAW。采用较多的是PAW-pbe 和PAW-gga。
此外vasp 中的赝势分为几种,包扩标准赝势(没有下标的)、还有硬(harder)赝势(_h)、软(softer)赝势(_s), 所谓的硬(难以赝化),就是指该元素原子的截断动能比较大,假想的势能与实际比较接近,计算得到的结果准确,但比较耗时,难以收敛。软(容易赝化),表示该元素原子的截断动能比较小,赝势模型比较粗糙,但相对简单,可以使计算很快收
VASP几个计算实例
用VASP计算H原子的能量
氢原子的能量为 。在这一节中,我们用VASP计算H原子的能量。对于原子计算,我们可以采用如下的INCAR文件 PREC=ACCURATE
NELMDL = 5 make five delays till charge mixing ISMEAR = 0; SIGMA=0.05 use smearing method 采用如下的KPOINTS文件。由于增加K点的数目只能改进描述原子间的相互作用,而在单原子计算中并不需要。所以我们只需要一个K点。 Monkhorst Pack 0 Monkhorst Pack 1 1 1 0 0 0
采用如下的POSCAR文件 atom 1
15.00000 .00000 .00000 .00000 15.00000 .00000 .00000 .00000 15.00000 1 cart
0 0 0
采用标准的H的POTCAR 得到结果如下:
k-point 1 : 0.0000 0.0000 0.0