重组质粒dna的转化及筛选实验报告
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重组质粒的构建、转化、筛选和鉴定
重组质粒的构建、转化、筛选和鉴定
实验目的:
1. 学习在实现DNA体外重组过程中,正确选择合适的载体和限制性内切酶并能对限制性核
酸内切酶对载体和目的DNA进行切割,产生利于连接的合适末端。
2. 学习设计构建重组DNA分子的基本方法,掌握载体和外源目的DNA酶切的操作。 3. 学习利用T4DNA连接酶把酶切后的载体片段和外源目的DNA片段连接起来,构建体外DNA
分子的技术,了解并掌握几种常用的连接方式。 4. 掌握利用Cacl2 感受态细胞的方法。
5. 学习掌握热击法转化E.coli的原理和方法。
6. 掌握α互补筛选法和PCR检测法筛选重组子的方法。并鉴定体外导入目的DNA片段的大
小。
7. 学习和掌握PCR反应的基本原理和操作技术,了解引物设计的基本要求。
实验原理:
外源DNA与载体分子的连接即为DNA重组技术,这样重新组合的DNA分子叫做重组子。重组的DNA分子式在DNA连接酶的作用下,有Mg2+、ATP存在的连接缓冲系统中,将分别经限制性内切酶酶切的载体分子和外源DNA分子连接起来。将重组质粒导入感受态细胞中,将转化后的细胞在选择性培养基中培养,可以通过α互补筛选法筛选出重组子,并可通过酶切电泳及PCR检验的方法进行重组子的
重组质粒的构建转化筛选和鉴定(2)
DNA的酶切、连接、转化和重组子的筛选与鉴定
摘要
本实验通为了验证重组质粒的类型,进行了如下实验:PUC19的单酶切、连接、转化、重组子的筛选与鉴定、转化子的菌落PCR、平板复证、琼脂糖凝胶电泳等。所用的酶有Hind Ⅲ核酸内切酶,T4连接酶和Taq酶。由于Hind Ⅲ单酶切质粒产生的片段多样,需要通过一系列的筛选、副证与电泳鉴定来最终确定酶切片段的类型。
关键字 酶切 连接 转化 重组子琼脂糖凝胶电泳
引言
重组DNA技术是指将一种生物体(供体)的基因与载体在体外进行拼接重组,然后转入另一种生物体(受体)内,使之按照人们的意愿稳定遗传并表达出新产物或新性状的DNA体外操作程序,也称为分子克隆技术。因此,供体、受体、载体是重组DNA技术的三大基本元件。本实验的供体是λ DNA,受体是E.coliDH5α,载体是PUC19。
DNA的酶切通常是DNA重组技术的第一步,酶切是指将不同来源的DNA上将待克隆的DNA片段特异性切下,同时在载体DNA分子(一般为质粒DNA)上打开相应的缺口,然后将两者连接成重组DNA分子。这一特异性的切割过程常由特定的限制性核酸内切酶来完成。目前在细菌中发现有600多种限制性核酸内切酶,根据其性质的不同可分为三大类
重组质粒的转化(转菌)
重组质粒的转化
重组质粒的转化(热休克法)
本方案不仅适合于转化连接体系,同样适合于转化已有的质粒(一般1~2μl质粒即可)。 本流程以α-互补鉴定为例。适用于含有?-半乳糖苷酶基因(LacZ)的载体(如T载体),载体含有LacZ的调控序列和头146个氨基酸的编码信息。不能使用α-互补鉴定的载体可以使用含相应抗生素的平板鉴定(即直接使用LB/Amp或LB/Kana等,不用加IPTG/X-Gal)。
㈠试剂及材料:
1. IPTG溶液(异丙基硫代-?-D-半乳糖苷,200mg/ml): 2g IPTG溶于8ml双蒸去离子水中,用双蒸去离子水调节体积至10ml,0.22um滤器过滤除菌,分装1ml/管,-20℃保存。 2. X-Gal(5-溴-4氯-3吲哚-?-D-半乳糖苷):已购入,铝箔纸包裹避光,-20℃保存。 3. LB液体培养基(无抗生素)。
4. 含有ampicillin/IPTG/X-Gal的LB培养板(LB/Amp/IPTG/X-Gal): 在含有ampicillin的LB培养板表面加入4μl 200mg/ml IPTG和16μl 50mg/ml X-Gal,用无菌玻璃涂布器均匀涂布平板表面,37℃×30min可完全吸收,即可使用。
质粒DNA的提取、定量、酶切与PCR鉴定实验报告
质粒DNA的提取、定量、酶切与PCR鉴定
一、实验目的
1.学习并掌握用碱裂解法提取质粒DNA的方法; 2.学习并掌握了解质粒酶切鉴定的方法;
3.学习并掌握紫外吸收检测DNA浓度和纯度的原理和方法; 4.学习并掌握PCR基因扩增的实验原理和操作方法; 5.学习并掌握水平式琼脂糖凝胶电泳的原理和使用方法。
二、实验原理
1.PCR(多聚酶链式反应)
在DNA聚合酶催化下,可以DNA为模板,以特定引物为延伸起点,以dNTP为原料,通过变性、退火、延伸等步骤, 在体外(缓冲液中)复制DNA,使目的DNA按2n方式呈指数形式扩增。
PCR一次循环的具体反应步骤为:
A.变性:加热反应系统至95℃,使模板DNA在高温下完全变性,双链解链 。 B.退火:逐渐降低溶液温度,使合成引物在低温(35-70℃,一般低于模板Tm值的5℃左右),与模板DNA互补退火形成部分双链。
C.延伸:溶液反应温度升至中温72℃,在 Taq酶作用下,以dNTP为原料,引物为复制起点,模板DNA的一条单链在解链和退火之后延伸为一条双链。
2.质粒DNA的提取与制备 (1).碱裂解法:
染色体DNA与质粒DNA的变性与复性存在差异: A.高碱性条件下,染色体DN
质粒DNA的提取、定量、酶切与PCR鉴定实验报告
质粒DNA的提取、定量、酶切与PCR鉴定
一、实验目的
1.学习并掌握用碱裂解法提取质粒DNA的方法; 2.学习并掌握了解质粒酶切鉴定的方法;
3.学习并掌握紫外吸收检测DNA浓度和纯度的原理和方法; 4.学习并掌握PCR基因扩增的实验原理和操作方法; 5.学习并掌握水平式琼脂糖凝胶电泳的原理和使用方法。
二、实验原理
1.PCR(多聚酶链式反应)
在DNA聚合酶催化下,可以DNA为模板,以特定引物为延伸起点,以dNTP为原料,通过变性、退火、延伸等步骤, 在体外(缓冲液中)复制DNA,使目的DNA按2n方式呈指数形式扩增。
PCR一次循环的具体反应步骤为:
A.变性:加热反应系统至95℃,使模板DNA在高温下完全变性,双链解链 。 B.退火:逐渐降低溶液温度,使合成引物在低温(35-70℃,一般低于模板Tm值的5℃左右),与模板DNA互补退火形成部分双链。
C.延伸:溶液反应温度升至中温72℃,在 Taq酶作用下,以dNTP为原料,引物为复制起点,模板DNA的一条单链在解链和退火之后延伸为一条双链。
2.质粒DNA的提取与制备 (1).碱裂解法:
染色体DNA与质粒DNA的变性与复性存在差异: A.高碱性条件下,染色体DN
实验一 质粒DNA的微量制备
实验一 质粒DNA的微量制备(4学时)
实验目的
(1) 了解质粒的特性及其在分子生物学研究中的作用。 (2) 掌握碱裂解法分离、纯化质粒DNA的方法。
实验原理
质粒(Plasmid)是一种双链的共价闭环状的DNA分子,它是染色体外能够稳定遗传的因子。质粒具有复制和控制机构,能够在细胞质中独立自主的进行自身复制,并使子代细胞保持它们恒定的拷贝数。目前,质粒已广泛的用作基因工程中目的基因地运载工具—载体。从大肠杆菌中提取质粒DNA,是一种分子生物学最基本的方法。
质粒DNA分离纯化方法有多种,但其原理和步骤都大同小异。本实验着重介绍碱裂解法制备微量DNA。
在EDTA存在的条件下,用溶菌酶破坏细菌细胞壁,同时经过NaOH和阴离子去污剂SDS处理,使细胞膜崩解,从而达到菌体充分的裂解。此时,细菌染色体DNA缠绕附着在细胞膜碎片上,离心时易被沉淀出来。而质粒DNA则留在上清液内,其中还含有可溶性蛋白质、核糖核蛋白和少量染色体DNA,实验中加入蛋白质水解酶和核糖核酸酶,可以使它们分解,通过碱性酚(pH8.0)和氯仿-异戊醇混合液的抽提可以除去蛋白质。异戊醇的作用是降低表面张力,可以减少抽提过程中产生的泡沫,并能使离心后水层、变性蛋白层和有
质粒DNA的提取
质粒DNA的提取、纯化与纯度鉴定
李笃财 生科
1班 201200140048
【实验目的】
1、掌握碱变性提取法的原理及各种试剂的作用。 2、掌握碱变性法提取质粒DNA的方法。
3、学习并掌握凝胶电泳进行DNA分离纯化的实验原理。 【实验原理】
1. 质粒DNA的提取——碱变性提取法:
提取和纯化质粒DNA的方法很多,目前常用的有:碱变性提取法、煮沸法、羟基磷灰石柱层析法、EB-氯化铯密度梯度离心法和Wizard法等。其中,碱变性提取法最为经典和常用,适于不同量质粒DNA的提取。该方法操作简单,易于操作,一般实验室均可进行。提取质粒DNA纯度高,可直接用于酶切、序列测定及分析。
碱变性法提取质粒DNA一般包括三个基本步骤:培养细菌细胞以扩增质粒;收集和裂解细胞;分离和纯化质粒DNA。
在细菌细胞中,染色体DNA以双螺旋结构存在,质粒DNA以共价闭合环状形式存在。细胞破碎后,染色体DNA和质粒DNA均被释放出来,但两者变性与复性所依赖的溶液pH值不同。在pH值高达12.0的碱性溶液中,染色体DNA氢键断裂,双螺旋结构解开而变性;共价闭合环状质粒DNA的大部分氢键断裂,但两条互补链不完全分离
碱裂解法提取质粒DNA和质粒DNA的纯化
实验一、碱裂解法提取质粒DNA和质粒DNA的纯化
一、实验目的
学习并掌握基因工程操作技术中最常用的载体质粒DNA的提取方法和进一步的纯化技术。
二、实验原理
在碱性溶液中,双链DNA氢键断裂,DNA双螺旋结构遭破坏而发生变性,但由于质粒DNA分子量相对较小,且呈环状超螺旋结构,即使在高碱性pH条件下,两条互补链也不会充分分离,当加入中和缓冲液时,变性质粒DNA又恢复到原来的够型;而线性的大分子量细菌染色体DNA则不能复性,与细胞碎片、蛋白质、SDS等形成不溶物,通过离心沉淀可被除去,而质粒DNA及小分子量的RNA则留在上清液中。混杂的RNA可用RNaseA酶消除,再用酚/氯仿处理,可除去残留的蛋白质,达到纯化质粒DNA的目的。
三、实验材料
大肠杆菌DH5α(含重组了约800bp DNA片断的pMD18-T质粒,Amp抗性)
四、实验仪器、用具
高压灭菌锅、超净工作台、恒温摇床、台式离心机、涡旋振动器、培养管、移液器、离心管、吸管头、量筒、紫外观测仪
五、实验试剂
LB培养基、3mol/L醋酸钠(pH5.2)、TE缓冲液(pH8.0)、无水乙醇、75%乙醇、RNaseA(10mg/ml)、goldview DNA染色剂、氯仿、琼脂糖 抽提质粒DNA所需的溶液:
质粒DNA的小量制备
实验一 质粒DNA的小量制备
(碱裂解法)
一、
实验原理
所有分离质粒DNA的方法都含有以下3个步骤:
①细菌培养物的生长;②细菌的收获和裂解;③质粒DNA的提取与纯化。
本实验以碱性SDS快速法小量制备pUC质粒。碱裂解法对于以前应用的所有大肠杆菌均卓有成效。该方法的特点是:加溶菌酶可破坏菌体细胞(小量制备可省略不用溶菌酶),去污剂SDS可使细胞裂解,并使蛋白质变性,在碱性条件下,破坏碱基配对,可使宿主的线状染色体DNA变性,但闭环质粒DNA链由于处于拓扑缠绕状态而彼此不分开。当条件恢复正常时(加入酸性试剂中和),质粒DNA链迅速得到准确配置,重新形成完全天然的超螺旋分子。细菌染色体DNA缠绕附着在细胞壁碎片上,离心时易被沉淀下来而质粒DNA则留在上清液中,乙醇沉淀后可得到质粒DNA。如需进一步纯化,可应用聚乙二醇沉淀或氯化铯一溴化乙锭梯度平衡法。
环状双链的质粒DNA分子具有三种不同的构型:当其两条多核苷酸链均保持着完整的环行结构时,称之为共价闭合环状DNA(cccDNA),这样的DNA通常呈现超螺旋SC构型;如果两条多核苷酸中只有一条保持着完整的环形结构,另一条出现有一至数个缺口时,称之为开环DNA(ocDNA),
质粒DNA的小量制备
实验一 质粒DNA的小量制备
(碱裂解法)
一、
实验原理
所有分离质粒DNA的方法都含有以下3个步骤:
①细菌培养物的生长;②细菌的收获和裂解;③质粒DNA的提取与纯化。
本实验以碱性SDS快速法小量制备pUC质粒。碱裂解法对于以前应用的所有大肠杆菌均卓有成效。该方法的特点是:加溶菌酶可破坏菌体细胞(小量制备可省略不用溶菌酶),去污剂SDS可使细胞裂解,并使蛋白质变性,在碱性条件下,破坏碱基配对,可使宿主的线状染色体DNA变性,但闭环质粒DNA链由于处于拓扑缠绕状态而彼此不分开。当条件恢复正常时(加入酸性试剂中和),质粒DNA链迅速得到准确配置,重新形成完全天然的超螺旋分子。细菌染色体DNA缠绕附着在细胞壁碎片上,离心时易被沉淀下来而质粒DNA则留在上清液中,乙醇沉淀后可得到质粒DNA。如需进一步纯化,可应用聚乙二醇沉淀或氯化铯一溴化乙锭梯度平衡法。
环状双链的质粒DNA分子具有三种不同的构型:当其两条多核苷酸链均保持着完整的环行结构时,称之为共价闭合环状DNA(cccDNA),这样的DNA通常呈现超螺旋SC构型;如果两条多核苷酸中只有一条保持着完整的环形结构,另一条出现有一至数个缺口时,称之为开环DNA(ocDNA),