测序结果峰图如何分析

测序常见峰图及原因说明

1.PCR产物电泳检测条带单一，为什么测序结果说模板杂？ 2. 什么是碱基缺失？ 3. 什么是引物不纯？

4. 重复结构对测序有哪些影响？ 5. 什么是模板不单一？

6. Poly结构的测序结果是怎样的？

7. 含有回文结构的模板测序结果是怎样的？ 8. 测序峰图为前双峰的结果是什么样的？ 9. 测序峰图为后双峰是什么样的？

10. 无信号的结果：信号值(ATGC的平均值)皆小于100

11. 飘峰：这是由于用3.0特殊试剂盒时碱基产生替代而出现碱基位移 12. 没有任何干扰的结果

Q-1.PCR产物电泳检测条带单一，为什么测序结果说模板杂？ 返回顶端 A-1.PCR产物电泳检测的结果只是一个粗略的定性结果。对于与目的片段条带大 小只相差几个碱基的非特异性PCR扩增产物是无法用肉眼区分开的。但是DNA测序反应敏感而客观，可以直接反应出模板本身的情况。需要强调的是，高质量的 PCR产物才可能得到高质量的测序结果，如果您对PCR产物的纯度不很确定，希望您可以将PCR产物进行克隆处理，以确保得到好的测序结果。以下图为例： 该反应的背景信号较高，不利于碱基的判读。 查看大图

解决办法：改变PCR条件，重新扩增。或者可以将该

具体实例教你如何做LoadRunner结果分析

1．前言:

LoadRunner最重要也是最难理解的地方--测试结果的分析.其余的录制和加压测试等设置对于我们来讲通过几次操作就可以轻松掌握了.

针对 Results Analysis我用图片加文字做了一个例子,希望通过例子能给大家更多的帮助.

这个例子主要讲述的是多个用户同时接管任务,测试系统的响应能力,确定系统瓶颈所在.客户要求响应时间是1个人接管的时间在5S内.

2．系统资源:

2.1 硬件环境：

CPU：奔四2.8E

硬盘：100G

网络环境：100Mbps

2.2 软件环境：

操作系统：英文windowsXP

服务器：tomcat服务

浏览器：IE6.0

系统结构：B/S结构

3．添加监视资源

下面要讲述的例子添加了我们平常测试中最常用到的一些资源参数.另外有些特殊的资源暂时在这里不做讲解了.我会在以后相继补充进来。

Mercury Loadrunner Analysis中最常用的5种资源.

1. Vuser

2. Transactions

3. Web Resources

4. Web Page Breakdown

5. System Resources

在Analysis中选择“Add graph”或“New graph”就可

人类基因组计划

一、HGP：人类基因组计划(Human Genome Project) 二、基因组测序 三、基因组分析

四、其他基因组的测序与分析

人的基因这么少，却能行使复杂的功能的原因： 1. 一个基因对应多个产物：可变剪切和蛋白修饰 2. 垃圾基因的功能：非蛋白编码基因的重要功能

任务与进展

完成四张图：遗传图谱、物理图谱、转录图谱、序列图谱

(一) 遗传图谱（Genetic map） 1. 定义

又称连锁图谱（linkage map)或遗传连锁图谱(genetic linkage map) ，是指人类基因组内基因以及专一的多态性DNA标记(marker)相对位置的图谱，其研究经历了从经典的遗传图谱到现代遗传图谱的过程。

2. 经典的遗传图谱（以基因表型为标记） 3. 现代遗传图谱（以DNA为标记）

多态性（polymorphism）：人的DNA序列上平均每几百个碱基会出现一些变异（variation），并按照孟德尔遗传规律由亲代传给子代，从而在不同个体间表现出不同，因而被称为多态性。

? 第一代多态性标记：限制性片段长度多态性-RFLP

? 第二代多态性标记：短的串联重复序列：小卫星DNA、微卫星DNA ? 第

如何正确分析判断结构设计电算结果

李志锋

(北京义盛建筑设计所 北京 101300 IndustrialConstructionVol137,Supplement,2007

工业建筑 2007年第37卷增刊429)

摘 要:结合SATWE软件的参数输入,通过对计算结果进行分析,判断出其正确与否。确定是否需要对设计方案或输入数据进行修改,以及应从哪些方面进行修改,使下一步的设计更加有针对性。从而避免设计工作中的盲目性,提高工作效率和设计的准确性。

关键词:建筑结构设计 计算结果 分析 判断

HOWTOANALYSEANDJUDGETHESTRUCTURALDESIGN CALCULATIONRESULTSOFBUILDING LiZhifeng

(ArchitecturalDesignInstituteofBeijingYisheng Beijing 101300)

Abstract:ThenecessityonanalysisandidentificationofcalculationresultsforbuildingdesignisexplainedwiththeSATWEstructuralsoftware,whichcanavoid

正交实验如何数据分析

我们把在试验中考察的有关影响试验指标的条件称为因素（也叫

因子），把在试验中准备考察的各种因索的不同状态(或配方)称为水平。在研究比较复杂的工程问题中，往往都包含着多个因素，而且每个因素要取多个水平。

对于包含五个因素、五个水平的工程项目，理论计算必须进行55＝3125次试验。显然，所需要的试验次数太多了，工作量太大。实践告诉我们，合理安排试验和科学分析试验，是试验工作成败的关键。

试验方案设计的好，试验次数就少，周期也短，这样不仅节省了大量人力、物力、财力和时间，而且可以得到理想的结果。相反，如果试验设计安排的不好，即使进行了很多次试验，浪费了大量材料、人力和时间，也不一定能够得到预期的结果。

正交试验法，就是在多因素优化试验中，利用数理统计学与正交性原理，从大量的试验点中挑选有代表性和典型性的试验点，应用“正交表”科学合理地安排试验，从而用尽量少的试验得到最优的试验结果的一种试验设计方法。

正交试验法也叫正交试验设计法，它是用“正交表”来安排和分析多因素问题试验的一种数理统计方法。这种方法的优点是试验次数少，效果好，方法筒单，使用方便，效率高。

由于试验次数大大减少，使得试验数据处理非常重要。我们可以从所有的试验

正交实验如何数据分析

我们把在试验中考察的有关影响试验指标的条件称为因素（也叫

因子），把在试验中准备考察的各种因索的不同状态(或配方)称为水平。在研究比较复杂的工程问题中，往往都包含着多个因素，而且每个因素要取多个水平。

对于包含五个因素、五个水平的工程项目，理论计算必须进行55＝3125次试验。显然，所需要的试验次数太多了，工作量太大。实践告诉我们，合理安排试验和科学分析试验，是试验工作成败的关键。

试验方案设计的好，试验次数就少，周期也短，这样不仅节省了大量人力、物力、财力和时间，而且可以得到理想的结果。相反，如果试验设计安排的不好，即使进行了很多次试验，浪费了大量材料、人力和时间，也不一定能够得到预期的结果。

正交试验法，就是在多因素优化试验中，利用数理统计学与正交性原理，从大量的试验点中挑选有代表性和典型性的试验点，应用“正交表”科学合理地安排试验，从而用尽量少的试验得到最优的试验结果的一种试验设计方法。

正交试验法也叫正交试验设计法，它是用“正交表”来安排和分析多因素问题试验的一种数理统计方法。这种方法的优点是试验次数少，效果好，方法筒单，使用方便，效率高。

由于试验次数大大减少，使得试验数据处理非常重要。我们可以从所有的试验

测序常见问题及其分析 Collected by RobertoRun,12.10.2008

(From: http://biology.aweb.com.cn/news/2007/9/5/14270898.shtml)

HTUTU

UUTTH

1、PCR产物测序时出现重叠峰

问题图1（模板中有碱基缺失，往往是单一位点（1-1）或两个位点（1-2）碱基缺失导致测序结果移码）

图1-1

图1-2

解决方法：将PCR产物克隆到质粒（如T载体）中挑单克隆测序，或将PCR产物进行PAGE纯化（至少琼脂糖充分电泳后切胶纯化）后再进行测序。

问题图2（PCR产物不纯，含部分序列一致的两种以上的片段，长度不一）

图2

解决方法：主要原因是PCR产物没有纯化，含有部分序列一致的两种以上长度不一的片段，将PCR产物进行PAGE纯化（至少琼脂糖充分电泳后切胶纯化）后再进行测序，便可解决。

问题图3（测序引物有碱基缺失）

测序引物有碱基缺失（一般是引物的5'端缺失），和模板的碱基缺失即图1有些类似，所不同的是模板碱基缺失一般是在一段正常测序序列后才出现移码，而引物碱基缺失的话，则从测序一开始就出现移码，表面在图形上便是一开始就是严重的

测序常见问题及其分析 Collected by RobertoRun,12.10.2008

(From: http://biology.aweb.com.cn/news/2007/9/5/14270898.shtml)

HTUTU

UUTTH

1、PCR产物测序时出现重叠峰

问题图1（模板中有碱基缺失，往往是单一位点（1-1）或两个位点（1-2）碱基缺失导致测序结果移码）

图1-1

图1-2

解决方法：将PCR产物克隆到质粒（如T载体）中挑单克隆测序，或将PCR产物进行PAGE纯化（至少琼脂糖充分电泳后切胶纯化）后再进行测序。

问题图2（PCR产物不纯，含部分序列一致的两种以上的片段，长度不一）

图2

解决方法：主要原因是PCR产物没有纯化，含有部分序列一致的两种以上长度不一的片段，将PCR产物进行PAGE纯化（至少琼脂糖充分电泳后切胶纯化）后再进行测序，便可解决。

问题图3（测序引物有碱基缺失）

测序引物有碱基缺失（一般是引物的5'端缺失），和模板的碱基缺失即图1有些类似，所不同的是模板碱基缺失一般是在一段正常测序序列后才出现移码，而引物碱基缺失的话，则从测序一开始就出现移码，表面在图形上便是一开始就是严重的

PKPM电算结果分析

二 振型曲线的评定

结构基本自振周期的计算方法有三种：能量法，等效质量法，顶点位移法。但是有钢筋混凝土框架的经验公式值：第一振型T1=(0.12-0.15)n，第二振型T2=(1/3-1/5) T1，第三振型T3=(1/5-1/7) T1。详见《高层建筑混凝土结构技术规程》4.2.3，调入PKPM电算结果： 考虑扭转耦联时的振动周期(秒)、X,Y 方向的平动系数、扭转系数

振型号 周 期 转 角 平动系数 (X+Y) 扭转系数 1 0.6323 92.50 0.88 ( 0.00+0.87 ) 0.12 2 0.6194 29.58 0.41 ( 0.31+0.10 ) 0.59 3 0.6159 168.83 0.72 ( 0.69+0.03 ) 0.28 4 0.2030 93.38 0.87 ( 0.00+0.87 ) 0.13 5

PKPM电算结果分析

二 振型曲线的评定

结构基本自振周期的计算方法有三种：能量法，等效质量法，顶点位移法。但是有钢筋混凝土框架的经验公式值：第一振型T1=(0.12-0.15)n，第二振型T2=(1/3-1/5) T1，第三振型T3=(1/5-1/7) T1。详见《高层建筑混凝土结构技术规程》4.2.3，调入PKPM电算结果： 考虑扭转耦联时的振动周期(秒)、X,Y 方向的平动系数、扭转系数

振型号 周 期 转 角 平动系数 (X+Y) 扭转系数 1 0.6323 92.50 0.88 ( 0.00+0.87 ) 0.12 2 0.6194 29.58 0.41 ( 0.31+0.10 ) 0.59 3 0.6159 168.83 0.72 ( 0.69+0.03 ) 0.28 4 0.2030 93.38 0.87 ( 0.00+0.87 ) 0.13 5