sgRNA设计软件

SgRNA设计方法

SgRNA（small guide RNA简称），是CRISPR基因敲除敲入系统中重要的组成部分，早先发现的guide RNA，由两部分组成—tracRNA和crRNA, 两部分融合表达后，即sgRNA也能很好的行使guide的功能，与cas9蛋白结合，引导cas9酶靶向基因组DNA进行剪切。

SgRNA脱靶问题一直备受关注，如何设计特异性好的靶点成为大家关注的焦点，很多实验室开发了不同的设计软件，大体原则如下：

（1）对于sgRNA的长度，一般应为20 nt左右； （2）对于sgRNA序列的碱基组成，可选3'末端含GG的sgRNA，同时sgRNA种子序列尽量避免以4个以上的T结尾，GC%含量最佳为40%~60%；

（3）sgRNA的种子序列与脱靶位点的匹配数尽可能低 （4）如果构建U6或T7启动子驱动sgRNA的表达载体，需考虑sgRNA的5' 碱基为G或GG，以提高其转录效率； （5）对于sgRNA靶向基因的结合位置，如需造成基因移码突变，需尽量靠近基因编码区的ATG下游，最好位于第一或第二外显子；

（6）检查sgRNA靶向结合位点基因组序列是否存在SNPs； （7）如采用Cas9单切口酶，设计paired-gRNA需

Hereditas (Beijing) 2015年11月, 37(11): 1125―1136 www.chinagene.cn

综 述 CRISPR/Cas9系统中sgRNA设计与脱靶效应评估

谢胜松1，张懿2，张利生1，李广磊1，赵长志1，倪攀1，赵书红1

1. 华中农业大学，农业动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室，武汉 430070； 2. 中国人民解放军第161医院妇产科，武汉 430010

摘要： 基于CRISPR/Cas9系统介导的第三代基因组编辑技术，已成功应用于动物、植物和微生物等诸多物种

的基因组改造。如何提高CRISPR/Cas9技术的基因组编辑效率和最大限度降低脱靶风险一直是本领域的研究热点，而使用高效且特异的sgRNA(Small guide RNA)是基因组改造成功的关键性因素之一。目前，已有多款针对CRISPR/Cas9技术的sgRNA设计和/或脱靶效应评估软件，但不同的软件各有优缺点。本文重点对16款sgRNA 设计和脱靶效应评估在线和单机版软件的特点进行了阐述，通过制定38项评估指标对不同软件进行了比较分析，最后对11种用于检测基因组编辑效率和脱靶的实验方法，以及如何筛选高效且特异的sgRNA进行了归纳总结

Inventor软件强度设计

一.Inventor软件的介绍，软件的应该范围

Autodesk Inventor软件是我院采购三维制图软件，Inventor 是AutoCAD 用户的最佳选择。它不仅进入了三维设计，而且与AutoCAD很好的结合，是我们很容易的上手。Inventor软件经过几个版本的发展，功能越来越完善和发展，可以满足我们目前的大部分设计的需要，Inventor 提供了一组全面的设计工具，支持三维设计和各种文档、管路设计和验证设计。Inventor 不仅可以进行一些零部件的设计，还能够创建和验证管路系统设计，包括管材、管件和线束设计，从而节省时间并降低创建原型的成本。 Inventor可以模仿一个完整设计中各个组成部分的运动状态，并且准确地预测瞬间载荷和加速度。此外，集成的有限元分析工具能够帮助工程师完成应力应变和模态分析，以避免相关设计错误。

因此Inventor广泛应用于有关机械的各个行业。 二. Inventor软件的应用 .ipt 零件 .iam 零部件 .idw 工程图

Inventor软件界面的个性化设置 坐标系的介绍

? 草图的创建原则 1、 保持草图的简洁

2、 重复简单的形状来创建比较复杂的形状 3、 绘制草

需求模块设计

文档状态：

[ ] Draft [√] Released 编撰日期： [ ]Modifying 保密级别： 文档版本： 文档编号： 编 撰： 1.0.0

需求名称

XXX项目小组

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模块设计

修订表

编号 1 2 3 4 5

生成版本 修订人 修订章节与内容 修订日期 PAGE 2 OF 12

模块设计

审批记录

版本 1.0.0 审批人 审批意见 审批日期 PAGE 3 OF 12

本科生软件设计论文

目： 名： 院： 业： 级： 号：导教师：

网络游戏资讯查询系统 陈思雷 理学院 信息与计算科学 信科132 23113220 朱毅华 职称： 副教授 2016年7月8日 南京农业大学教务处制

题

姓 学 专

班 学 指

网络游戏资讯查询系统

摘要：从游戏玩家的角度，进行了网络游戏资讯查询系统开发。在Windows 7,Mac OS操作系统下，采用eclipse集成开发系统，用My SQL作为后台数据库的管理程序，使用Java语言编写，实现网络游戏资讯查询。

关键词：网络游戏；数据库设计；Java

软件设计是从软件需求规格说明书出发，根据需求分析阶段确定的功能设计软件系统的整

实验七：书写软件综合设计报告 附录A：软件综合设计报告格式

[封面] （注：每个同学的报告都要有封面，独占一页。用小四号宋体，行距18

－22磅，报告中可加上适当的小图形）

软件综合设计报告

设计题目：人机五子棋游戏软件

浙江师范大学 数理与信息工程学院 班级：计算机科学与技术121

报告人姓名： 王丹妮 学号：12190111 承担角色： 组员

同组组长： 涂文婷 同组其他成员：无

课程教师： 贾泂 实验指导教师：贾泂

实验地点：20-206

完成起止日期：2015/6/16—2015/6/23

[正文]

一、课程设计概述(目的、任务、开发环境、参考资料)

1.目的

五子棋是起源于中国古代的传统的黑白棋中之一。它不仅能增强思维能力，提高智力，而且富含哲理，有助于修身养性。随着社会的发展，越来越多人接触和使用计算机，网上进行的棋类运动也随之普及。许多人喜欢上了下棋，但有时又苦于没有对手。作为一个计算机专业的学生，我对五子棋有很浓厚的兴趣，对计算机人机对弈智能算法如何与人脑对抗产生了极大的兴

趣，当然人机对弈的算法有很多种，许多人也对此有所研究。有些算法的智能程度甚至已经与人脑不相上下。这类程序的

Inventor软件强度设计

一.Inventor软件的介绍，软件的应该范围

Autodesk Inventor软件是我院采购三维制图软件，Inventor 是AutoCAD 用户的最佳选择。它不仅进入了三维设计，而且与AutoCAD很好的结合，是我们很容易的上手。Inventor软件经过几个版本的发展，功能越来越完善和发展，可以满足我们目前的大部分设计的需要，Inventor 提供了一组全面的设计工具，支持三维设计和各种文档、管路设计和验证设计。Inventor 不仅可以进行一些零部件的设计，还能够创建和验证管路系统设计，包括管材、管件和线束设计，从而节省时间并降低创建原型的成本。 Inventor可以模仿一个完整设计中各个组成部分的运动状态，并且准确地预测瞬间载荷和加速度。此外，集成的有限元分析工具能够帮助工程师完成应力应变和模态分析，以避免相关设计错误。

因此Inventor广泛应用于有关机械的各个行业。 二. Inventor软件的应用 .ipt 零件 .iam 零部件 .idw 工程图

Inventor软件界面的个性化设置 坐标系的介绍

? 草图的创建原则 1、 保持草图的简洁

2、 重复简单的形状来创建比较复杂的形状 3、 绘制草

实验七：书写软件综合设计报告 附录A：软件综合设计报告格式

[封面] （注：每个同学的报告都要有封面，独占一页。用小四号宋体，行距18

－22磅，报告中可加上适当的小图形）

软件综合设计报告

设计题目：人机五子棋游戏软件

浙江师范大学 数理与信息工程学院 班级：计算机科学与技术121

报告人姓名： 王丹妮 学号：12190111 承担角色： 组员

同组组长： 涂文婷 同组其他成员：无

课程教师： 贾泂 实验指导教师：贾泂

实验地点：20-206

完成起止日期：2015/6/16—2015/6/23

[正文]

一、课程设计概述(目的、任务、开发环境、参考资料)

1.目的

五子棋是起源于中国古代的传统的黑白棋中之一。它不仅能增强思维能力，提高智力，而且富含哲理，有助于修身养性。随着社会的发展，越来越多人接触和使用计算机，网上进行的棋类运动也随之普及。许多人喜欢上了下棋，但有时又苦于没有对手。作为一个计算机专业的学生，我对五子棋有很浓厚的兴趣，对计算机人机对弈智能算法如何与人脑对抗产生了极大的兴

趣，当然人机对弈的算法有很多种，许多人也对此有所研究。有些算法的智能程度甚至已经与人脑不相上下。这类程序的

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目录

1

概述 ·················································································································································

一 ：.各种性能指标及如何到达各种性能指标的方法 二 ：常用的中间件有那几种类型 答：(1)常见的对象请求代理架构 （2）面向消息的中间件

(3)Java2 Enterprise Edition (4)消息代理

(5)业务过程代理

三 ：有那些常见架构风格

1.管道和过滤器架构风格 适用于需要定义一系列的执行规则数据的独立运算。 组件在输入时读数据流，在输出时产生数据流。

组件：称为过滤器，应用于对局部的输入流的转换，经常增长的计算，因此，在

输入结束前输出就开始了。 .

连接器：称为管道，给流提供管道，把一个过滤器的输出传输到另一个输入。 2.面向对象风格 适用于主要问题是识别和保护信息的相关主体。 数据代理和它们相关的操作封装在一个抽象数据类型里面。 组件：对象 连接器：功能和过程调用（方法）

3.隐式调用风格

应用于涉及到组件的松耦合集，其中的每一个都执行一些操作，还可能允许其他的操作。 尤其对必须很快重新配置的应用很有用、改变服务的供应商、可能的或是不可能的

能力 ，不是直接的引用过程 ，一个组件能发