微生物鉴定方法几种

土壤微生物的分离与鉴定

组员：阚能涛，户红通，郭晓辉，耿静，孔桂慧，兰欣玉 关键词：土壤微生物，分离鉴定，生理生化， 实验摘要：

土壤是微生物的良好生境，土壤中有多种类群的微生物，它们对自然界物质的转化和循环起着极为重要的作用，对农业生产和环境保护有着不可忽视的影响。根际微生物与植物的关系特别密切，不同的土壤和植物对根际微生物产生显著影响，而不同的根际微生物由于其生理活性和代谢产物的不同，也将对土壤肥力和植物营养产生积极或消极的作用。土壤微生物不仅对土壤的肥力和土壤营养元素的转化起着重要作用，而且对于进入土壤中的农药及其他有机污染物的自净、有毒金属及其化合物在土壤环境中的迁移转化等都起着极为重要的作用。

土壤中微生物的数量因土壤类型、季节、土层深度与层次等不同而异。一般地说，在土壤表面，由于日光照射及干燥等因素的影响，微生物不易生存，离地表10 cm～30 cm的土层中菌数最多，随土层加深，菌数减少。

土壤中微生物以细菌数量最多，为几百万个/克土至几亿个/克土，有各种生理类群，营养类型多属异养型，鉴别染色多为革兰氏阳性。放线菌含量为几万个/克土至几百万个/克土，但其生物量不比细菌低，因为菌丝体积较大。土壤中真菌含量为几千个/克土至几十万个/克

钼矿周围土壤中微生物的分离与鉴定

步骤一 钼矿周围土壤的采集与处理

一、采集地点：河南省、洛阳市、栾川县钼矿区土壤。

二、实验器材：无菌牛皮纸袋，无菌铲，长线，标杆，标签，尺子，冰箱。 三、样本采集及处理方法: 1.取样：2012 年3月于洛阳市栾川县钼矿区土地选择2 个不同的地点进行采样，

分别在4个方向选取3点，每个地点在不同位置各取3 个样，直取5~20cm深度的土壤，每点按1m×1m取样，每点取样量一致，将样点土壤混均后取200 g装入无菌牛皮纸袋中封好，带回实验室放入灭菌的袋中或放在4℃冰箱中暂存备用。 采样注意事项：

(1)样品标记：采集的样品放入统一的灭过菌的牛皮纸袋样中，用铅笔填写好标签，袋内外各具一张。

(2)一个混合土样以取土1公斤左右为宜，如果样品数量太多，可用四分法将多余的土壤弃去（方法是将采集的土壤样品放在洁净的塑料布上，弄碎、混匀，铺成四方形，划对角线将土样分成四份，把对角的两份分别合并成一份，保留一份，弃去一份，果所的样品依然很多，可用四分法处理，直至所需数量为止）。

(3)采样深度，对一般土地采样深度5—30cm即可，采样时深度要垂直，上下取土量要一致，每个采样点的取土深度及采样量应均匀一致，土壤上层与下层的

钼矿周围土壤中微生物的分离与鉴定

步骤一 钼矿周围土壤的采集与处理

一、采集地点：河南省、洛阳市、栾川县钼矿区土壤。

二、实验器材：无菌牛皮纸袋，无菌铲，长线，标杆，标签，尺子，冰箱。 三、样本采集及处理方法: 1.取样：2012 年3月于洛阳市栾川县钼矿区土地选择2 个不同的地点进行采样，

分别在4个方向选取3点，每个地点在不同位置各取3 个样，直取5~20cm深度的土壤，每点按1m×1m取样，每点取样量一致，将样点土壤混均后取200 g装入无菌牛皮纸袋中封好，带回实验室放入灭菌的袋中或放在4℃冰箱中暂存备用。 采样注意事项：

(1)样品标记：采集的样品放入统一的灭过菌的牛皮纸袋样中，用铅笔填写好标签，袋内外各具一张。

(2)一个混合土样以取土1公斤左右为宜，如果样品数量太多，可用四分法将多余的土壤弃去（方法是将采集的土壤样品放在洁净的塑料布上，弄碎、混匀，铺成四方形，划对角线将土样分成四份，把对角的两份分别合并成一份，保留一份，弃去一份，果所的样品依然很多，可用四分法处理，直至所需数量为止）。

(3)采样深度，对一般土地采样深度5—30cm即可，采样时深度要垂直，上下取土量要一致，每个采样点的取土深度及采样量应均匀一致，土壤上层与下层的

钼矿周围土壤中微生物的分离与鉴定

步骤一 钼矿周围土壤的采集与处理

一、采集地点：河南省、洛阳市、栾川县钼矿区土壤。

二、实验器材：无菌牛皮纸袋，无菌铲，长线，标杆，标签，尺子，冰箱。 三、样本采集及处理方法: 1.取样：2012 年3月于洛阳市栾川县钼矿区土地选择2 个不同的地点进行采样，

分别在4个方向选取3点，每个地点在不同位置各取3 个样，直取5~20cm深度的土壤，每点按1m×1m取样，每点取样量一致，将样点土壤混均后取200 g装入无菌牛皮纸袋中封好，带回实验室放入灭菌的袋中或放在4℃冰箱中暂存备用。 采样注意事项：

(1)样品标记：采集的样品放入统一的灭过菌的牛皮纸袋样中，用铅笔填写好标签，袋内外各具一张。

(2)一个混合土样以取土1公斤左右为宜，如果样品数量太多，可用四分法将多余的土壤弃去（方法是将采集的土壤样品放在洁净的塑料布上，弄碎、混匀，铺成四方形，划对角线将土样分成四份，把对角的两份分别合并成一份，保留一份，弃去一份，果所的样品依然很多，可用四分法处理，直至所需数量为止）。

(3)采样深度，对一般土地采样深度5—30cm即可，采样时深度要垂直，上下取土量要一致，每个采样点的取土深度及采样量应均匀一致，土壤上层与下层的

土壤微生物测定

土壤微生物活性表示土壤中整个微生物群落或其中的一些特殊种群状态，可以反映自然或农田生态系统的微小变化。土壤微生物活性的表征量有:微生物量、C/N、土壤呼吸强度和纤维呼吸强度、微生物区系、磷酸酶活性、酶活性等。

测定指标：

1、土壤微生物量 (Mierobia lBiomass，MB)

能代表参与调控土壤能量和养分循环以及有机物质转化相对应微生物的数量，一般指土壤中体积小于5Χ103um3的生物总量。它与土壤有机质含量密切相关。

目前，熏蒸法是使用最广泛的一种测定土壤微生物量的方法阎，它是将待测土壤经药剂熏蒸后，土壤中微生物被杀死，被杀死的微生物体被新加人原土样的微生物分解(矿化)而放出CO2，根据释放出的CO2:的量和微生物体矿化率常数Kc可计算出该土样微生物中的碳量。因此碳量的大小就反映了微生物量的大小。

此外，还有平板计(通过显微镜直接计数)、成份分析法、底物诱导呼吸法、熏蒸培养法(测定油污染土壤中的微生物量—碳。受土壤水分状况影响较大，不适用强酸性土壤及刚施用过大量有机肥的土壤等)、熏蒸提取法等，均可用来测定土壤微生物量。

熏蒸提取-容量分析法 操作步骤： （1）土壤前处理和熏蒸 （2）提取

将熏蒸土壤无损地转移到20

环境中微生物的检测

微生物体积小、重量轻，因此可以到处传播以致达到“无孔不入”的地步。微生物种类繁多，对外界环境的适应能力又很强，只要生活条件合适，它们就可以迅速繁殖起来。因此，它们是自然界分布最广的一群生物。无论是南极、北极、高山、海洋、陆地、淡水，还是土壤、空气、动植物体内外，几乎到处都有它们的踪迹。

空气、水是维持人类生命不可或缺的物质。它们直接进入人体或与人接触。如果带有病原微生物，将成为传染疾病的媒介。通过空气和水中微生物的检验，对环境质量进行控制。

1.1 土壤中的微生物

1.1.1 土壤是微生物生活的良好环境

在自然界，土壤是微生物生活的良好环境。因为土壤具有微生物生长繁殖所必需的各种环境条件。 1.1.1.1 营养

土壤中有大量动植物残体、植物根系的分泌物、人和动物的排泄物，这些有机物为微生物提供了良好的碳源、氮源和能源；土壤中丰富的矿质元素可以满足微生物对矿质营养的要求。 1.1.1.2 水分和渗透压

土壤中具有一定的持水性，可为微生物提供水分；土壤的渗透压对微生物是等渗或低渗环境，有利于微生物摄取营养。 1.1.1.3 空气

土壤团粒结构中的小孔隙充满空气，土壤中氧的含量比大气少，平均为土壤空气体积的7%-8%。通气良好的

微生物限度/无菌方法学验证流程

1.：提交单位购买申请菌种的购买：需要1.5个月

单位介绍信证明工作用途等文件，并向中检院网站提交申请，接到申请后一个月后中检院会把有

的菌种邮寄到使用单位，中检院菌种经常缺货并不是很齐全，不能一次买齐所需要的8种菌一次性买齐，

2. 每种从菌复活、分离、纯化复壮：共需要30天

药典规定进行药品检验所需8种标准阳性菌，购买中检院冻干菌粉后进行复活与保藏

1大肠埃希菌 2金黄色葡萄球菌 3枯草芽孢杆菌 4生孢梭菌 5铜绿假单胞菌 6沙门菌

（细菌每种冻干菌粉复活到分离纯化保藏各需要3-4天时间） 7白色念珠菌 8黑曲霉菌

（霉菌酵母菌冻干菌粉从复活到分离纯化制备孢子菌悬液需要至少7天时间）

3.培养基适用性/灵敏度验证：需要60-80天

实验中使用的培养基需要进行与中检院提供的标准培养基进行培养基适用性验证 每种培养基不同批号之间也需要进行验证之后方可以进行微生物检验用

药检室现有培养基种类20余种，每种培养基验证需要3-4天，完成所有培养基适用性验证需要60-80天。

恩替卡韦分散片微生物限度方法学适用性验证：

1. 回收率验证：回收率验证实验共需要26天

（若回收率达不

微生物限度/无菌方法学验证流程

1.：提交单位购买申请菌种的购买：需要1.5个月

单位介绍信证明工作用途等文件，并向中检院网站提交申请，接到申请后一个月后中检院会把有

的菌种邮寄到使用单位，中检院菌种经常缺货并不是很齐全，不能一次买齐所需要的8种菌一次性买齐，

2. 每种从菌复活、分离、纯化复壮：共需要30天

药典规定进行药品检验所需8种标准阳性菌，购买中检院冻干菌粉后进行复活与保藏

1大肠埃希菌 2金黄色葡萄球菌 3枯草芽孢杆菌 4生孢梭菌 5铜绿假单胞菌 6沙门菌

（细菌每种冻干菌粉复活到分离纯化保藏各需要3-4天时间） 7白色念珠菌 8黑曲霉菌

（霉菌酵母菌冻干菌粉从复活到分离纯化制备孢子菌悬液需要至少7天时间）

3.培养基适用性/灵敏度验证：需要60-80天

实验中使用的培养基需要进行与中检院提供的标准培养基进行培养基适用性验证 每种培养基不同批号之间也需要进行验证之后方可以进行微生物检验用

药检室现有培养基种类20余种，每种培养基验证需要3-4天，完成所有培养基适用性验证需要60-80天。

恩替卡韦分散片微生物限度方法学适用性验证：

1. 回收率验证：回收率验证实验共需要26天

（若回收率达不

微生物鉴定中的生理生化试验

一．实验目的

1. 证明不同微生物对各种有机大分子物质的水解能力不同，从而说明不同微生物有着不

同的酶系统。

2. 掌握进行微生物大分子物质水解试验的原理和方法。

3. 了解糖发酵的原理，掌握通过糖发酵鉴别不同微生物的方法。 4. 了解吲哚和甲基红试验的原理以及其在肠道细菌鉴定中的意义和方法。

二．实验原理

由于各种微生物具有不同的酶系统，所以他们能利用的底物不同，或虽利用相同的底物但产生的代谢产物却不同，因此可以利用各种生理生化反应来鉴别不同的细菌，尤其是在肠杆菌科细菌的鉴定中，生理生化试验占有重要的地位。具体的原理如下：

1. 大分子水解试验

微生物对大分子物质如淀粉、蛋白质和脂肪不能直接利用，必须依靠产生的胞外酶将大分子物质分解后，才能被微生物利用。胞外酶主要为水解酶，通过加水裂解大分子物质为较小化合物，使其能被运输至细胞内。如淀粉酶水解淀粉为小分子的糊精、双糖和单糖，脂肪酶水解脂肪为甘油和脂肪酸，蛋白酶水解蛋白质为氨基酸等，这些过程均可通过观察细菌菌落周围的物质变化来证实。如淀粉遇碘液会产生蓝色，但细菌水解淀粉的区域，用碘液测定时，不再产生蓝色，表明细菌产生淀粉酶。脂肪水解后产生脂肪酸可改变培养基的pH，使

微生物基因分型鉴定系统

背景：

分子生物学技术在近几年的迅速发展和普及，使得微生物学鉴定得以摆脱传统生化鉴定方法的局限，跨入新的历史进程。较上世纪已经出现的生化鉴定法，基于分子生物学技术的微生物鉴定系统的优越性主要表现为：可鉴定的种属范围均大大扩展；可靠性和灵敏度显著提升；整体检测时间降低。ThermoFisher 公司的MicroSEQ?自动微生物基因分型鉴定系统分型系统是目前技术最为成熟、应用最为广泛的基因分析鉴定系统，现已广泛应用在药品、食品及工业微生物的鉴定分析上，以下内容将对这一系统做更为全面的介绍。

2015版药典中指出，测序是微生物鉴定的最终解释方法

1.在药品微生物鉴定领域的应用

2008年度全球排名前25位的制药集团中，有22家集团已经将ThermoFisher公司的MicmSEQ?自动微生物基因分析鉴定系统用于其日常微生物检测中。

美国FDA在对生产无菌制剂和生物药品的指导性纲要《工业指南用无菌工艺生产的无菌产品一现行GMP》中更是明确提出“快速遗传类型测定方法被建议用于鉴别目的，因为这种方法已经证明比生物化学方法和表型技术更精确和准确。”除美国之外，澳大利亚、日本及欧盟的药典中也已明确推荐使用基因分析的方法用于微生物的鉴定。

2.微生