常见细胞实验流程
更新时间:2023-11-04 22:05:01 阅读量: 综合文库 文档下载
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实验前准备
? 根据自己实验的情况提前预定超净台 ? 进入细胞室之前必须穿鞋套,戴手套
? 将实验所需要的实验仪器放入超净台内紫外照射灭菌15-20min
高压灭菌操作
将所需灭菌的枪头,EP管等仪器放入枪头盒或饭盒中,并用报纸将枪头盒包好。
将仪器放入灭菌锅之前,首先要检测一下锅内的水位是否超过锅底的圆圈,若没有超过则需加水。
检测水位之后,将包好的器材放入锅内,盖上锅盖并拧紧螺丝。 插上电源,先将电压调至250V,目的在于排尽锅内的空气,(当排气阀有白气冒出时,说明空气已排尽)空气排尽后,关闭排气阀。
关闭排气阀后指针上升,当指针竖直时,将电压调至125V,保持锅内压力的稳定。
开始计时,灭菌30min。结束时关闭电源,等至指针慢慢降下即可。 拿出锅内的器材放入恒温烘箱中烘干,2天后即可拿出。
(组织内)蛋白质提取过程
对癌组织和癌旁正常组织进行称重,记录数值。
根据RIPA裂解液Ⅲ说明书(每100mg组织中加入1ml溶液A,1ul溶液B,5ul溶液C)按照组织块得大小配好ABC混合液。
将组织块加入匀浆器中,并加入相应量得ABC混合液,冰上静置5-10min,开始研磨。
将研磨好的组织液倒入事先准备好的EP管中,12000rpm/5min. 离心结束后,收集上清液,弃去沉淀,上清即为所要的蛋白。
蛋白质浓度测定
1、 取96孔板冲洗干净后超声处理30min,之后用去离子水冲洗干净烘干即可 2、配制BCA标准蛋白液:
浓度 原液体积 去离子水体积 A管: 2000ug /ul 30ul 0ul B管: 1500ug/ul 37.5ul 12.5ul C管: 1000ug/ul 25ul 25ul D管: 750ug/ul 18.75ul 31.25ul E管: 500ug/ul 12.5ul 37.5ul F管: 125ug/ul 3.125ul 46.875ul G管: 25ug/ul 0.625ul 49.375ul H管: 0 0ul 50ul
?取8个EP管,分别标上以上字母,并按上表加入相应的原液蛋白和
去离子水
?先向96孔板内加入200ul的绿色底物溶液(根据实验计算所需要用
孔的个数加入底物液)
?加完后,将配好的A,B,C,D,E,F,G,H标准液10ul按照96孔板上第1列
上的字母标记依次加入
?之后在其他的孔内加入10ul蛋白样品(每个样品应重复2次)
?加好样品后取保鲜膜将96孔板封闭好,以防止蛋白浓度发生变化,
之后将板放入保温箱中静置30min
?30min后将96孔板拿出放入测量仪器内(应按照仪器使用说明进行
操作)
?数据测完后另建文件夹,保存数据,之后插入尤盘拷取数据
?在获得的数据结果中,根据BCA的标准蛋白浓度梯度值和560nm下
对应的OD值计算可得出一个OD值与浓度相关的标准曲线:y=ax+b(计算机上操作)
?将测得的蛋白样品的OD值带入公式,即可求出蛋白样品的浓度 ?若实验有实验组和对照组,应将两组的蛋白浓度标准化,即是两组
的蛋白浓度相同(相同浓度下的两组实验才具可比性)
?将浓度标准化的样品蛋白与loading buffer 混匀至100ul(混合液中
loading buffer应为1X的,但实验室的一般为5X),稀释方法:取20ul 5Xloading buffer +80ul 样品蛋白混匀即可 ?在加样做western blot之前,蛋白样品需变性:
将与loading buffer混匀好的蛋白样品放入100度金属浴内高温变性10min(EP管上要加帽以防止温度过高EP管盖会冲开)
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(组织内)RNA提取过程
将组织放入匀浆器中,加入1ml的Trizol,冰上静置10min,进行研磨。 将匀浆好的上清转移至1.5ml EP管中,进行离心12000rpm/5min.
离心后收集上清液于新的EP管中,加入200ul氯仿,剧烈摇匀后静置5min,然后12000rpm/5min.
离心后取上清于另一新的EP管中,取液时不要取到中间层的蛋白。之后按1:1的比例加入异丙醇,摇匀后静置15min,进行离心12000rpm/10min。 离心后倒掉上清(可看到白色RNA沉淀),加入1ml 75%乙醇DEPC水溶液温和震荡,悬浮沉淀,3000rpm/5min.
倒掉上清,在滤纸上空干。然后加入20ul DEPC水溶解沉淀,并吹打均匀。(如果RNA量较多,可相应的加更多的DEPC水,40ul 甚至60ul) 测定RNA浓度,取1ul RNA+99ul DEPC水于EP管中(相当于稀释100倍),另取一EP管放100ul的DEPC 水用于定标。定标后倒掉,用去离子水冲洗比色皿,然后测定RNA OD值和浓度,记下数据。 RNA电泳(用于检测提取的RNA是否已降解)
? 配胶(1%的胶):取0.2g 琼脂糖+ 20ml TAE +1ul EB ? 制胶时,应让液体沸腾3次,冷却后加入EB混匀(每20ml加1ulEB),
胶制好后倒入板中凝固,并垂直地插入梳子,静置30min 后拔下梳子(可提前用梳子划动下胶,使得胶更均匀)。 ? 取1ul的Loading buffer和样本RNA混匀,加样
正确的电泳结果应有3条带:28S 、18S、5S。28S亮度应为18S亮度的
8.
2倍,5S条带越宽越代表RNA降解越多。如果加样孔内有残留代表蛋白污染,如果离加样孔很近的地方有条带代表DNA污染。
细胞冻存
? 首先向培养瓶内加入胰酶(1ml)消化细胞
? 显微镜下观察细胞形态,当细胞变圆脱落时,即可用适量培养基中止消
化,之后将细胞液吸入15ml的管内(动作要快,防止胰酶损害细胞) ? 将管内1/3的细胞液放回培养瓶继续培养(剩余的细胞液平均冻存两管) ? 离心剩余的细胞液,1200rpm,5min(用等量的PBS配平)
? 离心后弃上清,得白色沉淀。可在试管台上轻轻来回划动试管,使得沉
淀松动更易于悬浮
? 用配好的3ml冻存液悬浮沉淀,吹打混匀,使得细胞为单个细胞
? 分别取1.5ml放入两冻存管内,在冻存管上做好标记:细胞类型,代数,
日期等
? 标记好后4°冰箱放置30min(切勿超过30min),计时 ? 之后-20°冰箱中放置30min
? 最后放入-80°冰箱内可保存半年。若半年后还没有使用则需要将细胞拿
出来复苏,长满后再冻存起来。
? 冻存液的配制方法:
血清(20%)+DMSO(10%,超净台上锡纸包裹的)+培养基(70%)
例如配3ml冻存液:
血清=600ul;DMSO=300ul;培养基=2100ul
细胞复苏
? 将实验所需要的仪器提前放入超净台内紫外灭菌15-20min ? 在整个复苏过程中冻存的细胞都应保持在37°水浴中
? 烧杯中放入37°水,将从冰箱内拿出的细胞用镊子夹住放入烧杯内摇晃
使细胞慢慢融化
? 细胞融化后,用酒精浸湿的纸擦干冻存管 ? 之后在超净台内将细胞液吸取到放有适量(例10ml)PBS的15ml管内吹
打均匀(在取细胞之前提前在管内倒入PBS) ? 1200rpm,5min离心,离心后弃上清得沉淀
? 将得到的细胞沉淀用适量的培养基悬浮,并吹打均匀,使细胞单个存在 ? 吹打均匀后,用吸管将细胞液吸入培养瓶中(大/小培养瓶根据自己的实
验而定)
? 最后向培养瓶内加入适量的培养基 ? 显微镜下观察细胞情况
? 最后将培养瓶盖子拧松,放入37°培养箱培养
Western Blotting
Western blot 实验过程中所需要配制的试剂: ? 1 X TBST: (用于洗膜)
100ml 10X TBS +900ml 去离子水+1ml Tween 20 ? 5%牛奶:
取5g牛奶溶于1000ml 1XTBST中混匀 ? 1X Running: (用于跑电泳)
10XRunning 100ml 溶于900ml 去离子水中 ? 1X transfer: (用于转膜)
10XTransfer 100ml +100ml无水甲醇+800ml去离子水 ? 一抗:
用5%牛奶将一抗稀释2000倍(稀释倍数根据自己实验而定),若抗体由甘油保存,稀释一抗应取所计算体积的2倍。 ? 二抗:
用5%牛奶将二抗稀释10000倍(牛奶封闭性更好)
具体操作流程:
1. 清洗玻璃板
? 一只手扣紧玻璃板,另一只手蘸点洗衣粉轻轻擦洗。两面都要洗净,
之后先用自来水冲洗干净,再用去离子水冲洗干净,立在桌面上晾干。
2. 配胶(区别于RNA 电泳胶)
? 玻璃板对齐后放入夹中卡紧。然后垂直卡在架子上准备灌胶。
? 先按照10% Gel (10ml)比例配下层的分离胶,加入TEMED后立即摇匀
即可灌胶。
? 灌胶时可用10ml枪吸取5ml胶沿玻璃缓慢放出,待胶面升到绿带中间线
高度即可,然后加入100ml异丙醇封闭 ? 静置等待胶凝固,(若试管内剩余的胶凝固代表玻璃板内的胶已经凝固
了)凝固后倒掉异丙醇,用去离子水冲洗干净,并用吸水纸将水吸干,并避免刮破胶
? 再按照5ml的比例配上层的浓缩胶,加入TEMED后立即摇匀后即可灌胶。
将配好的胶灌满剩余的空间,之后垂直缓慢地将梳子插入浓缩胶中,避免产生气泡
? 胶凝固后即配胶结束 配胶注意事项:
? 若配好的胶不立即使用,可以保存在4度冰箱内,但保存时间不宜过长
(用卫生纸包裹玻璃板,浸湿卫生纸,放入一次性塑料手套内即可,此时不要拔下梳子)
? 蛋白胶分为两层,上层为浓缩胶,下层为分离胶。
? 按照10% Gel的方法进行配胶。注意:选择玻璃板时要看清玻璃板上的
大小标记,一般用10ml的。玻璃板一定要用去离子水洗干净,之后室温晾干。
? 浓缩胶和分离胶配制所用Tris-Hcl的PH值是不同的,分别为7.8和6.8 3.跑电泳与上样
? 配制(1000ml)1XRunning 电泳缓冲液:(实验室现有的是10X)
取100ml 10 X Running 缓冲液溶于900ml 去离子水中即可得到1XRunning 缓冲液
? 将配好的胶板放在电泳槽内,注意正负电极的准确连接,两手分别捏住
梳子的两边竖直向上轻轻将其拔出
? 倒入配好的电泳缓冲液,若使用的是两块胶,加入的电泳液液面应超过
“2Gel”字符线(电泳液也要灌满玻璃板)
? 加蛋白上样量:测完蛋白含量后,计算含20-50ug蛋白(根据自己的实
验需要进行选择,没有固定的量)的溶液体积即为上样量。
? 用10ul枪头进行加样,将枪头插入加样孔缓慢加入样品,加样过快的话
容易使样品冲出加样孔(注意同一实验和对照组所加的上样量应该相等,这样才具有可比性),同时加入2-3ul Marker作为条带分子量大小的对照 ? 加样完毕后,盖上电泳槽盖,连接电源,先调电压至120V,按start开
始跑电泳
? 当样品被压成同一水平的线时,可以降低电压至100V或80V左右,电
泳至样品内的溴酚蓝刚跑出即可终止电泳,关闭电源,进行转膜
4. 转膜
? 转膜前先用镊子捏住两张硝酸纤维素膜的一边浸泡在无水甲醇中 ? 配制1X transfer(转膜缓冲液):
取10x transfer 100ml +100ml无水甲醇 +100ml去离子水混匀即可
? 将转膜液倒入搪瓷盘内,并放入转膜所需的夹子(夹子具有黑白两面)、两
块海绵垫(海面上带有滤纸)、小绿板和浸过的膜
? 将夹子打开使黑的一面位于底部保持水平,在其上垫一张海绵垫,用小绿板
来回擀几次排除其内的气泡。
? 要先将玻璃板撬掉才可剥胶,撬的时候动作要轻,除去小玻璃板后,将浓缩
胶用小绿板轻轻刮取,要避免不要把分离胶刮破。
? 小心剥下分离胶盖于滤纸上,用手调整使其与滤纸对齐,轻轻用小绿板擀去
气泡。
? 之后将另一海绵垫平铺在胶上,用手压住,并用小绿板赶走气泡,注意动作
要轻柔,避免胶与膜发生错位。
? 气泡赶净后就可以合起夹子(整个过程都要在转膜液中进行)。 ? 另外一块胶按照形同的过程进行操作
? 之后将夹子放入转移槽中,要使黑色的面对槽的黑面,夹子的白面对槽的红
面。
? 由于在转膜的过程中会产生热量,所以将整个转膜槽放入装有冰块的桶内进
行。
? 插上电源,调电压至80V,转膜2h(转膜时电极方向注意是膜正胶负) ? 转膜结束后,可看到膜上有明显的Marker条带,用丽春红染色液让膜显色,
之后可以看到膜上蛋白的条带
? 将膜放入一平皿内于摇床上脱色,放入1xTBST洗三次,每次10min。 ? 若事先知道目的蛋白的分子量,可以用保鲜膜将膜包裹,之后将膜修剪
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