VASP几个计算实例
更新时间:2023-10-07 13:23:01 阅读量: 综合文库 文档下载
用VASP计算H原子的能量
氢原子的能量为 。在这一节中,我们用VASP计算H原子的能量。对于原子计算,我们可以采用如下的INCAR文件 PREC=ACCURATE
NELMDL = 5 make five delays till charge mixing ISMEAR = 0; SIGMA=0.05 use smearing method 采用如下的KPOINTS文件。由于增加K点的数目只能改进描述原子间的相互作用,而在单原子计算中并不需要。所以我们只需要一个K点。 Monkhorst Pack 0 Monkhorst Pack 1 1 1 0 0 0
采用如下的POSCAR文件 atom 1
15.00000 .00000 .00000 .00000 15.00000 .00000 .00000 .00000 15.00000 1 cart
0 0 0
采用标准的H的POTCAR 得到结果如下:
k-point 1 : 0.0000 0.0000 0.0000 band No. band energies occupation 1 -6.3145 1.00000 2 -0.0527 0.00000 3 0.4829 0.00000 4 0.4829 0.00000 我们可以看到,电子的能级不为
。
Free energy of the ion-electron system (eV)
--------------------------------------------------- alpha Z PSCENC = 0.00060791 Ewald energy TEWEN = -1.36188267 -1/2 Hartree DENC = -6.27429270 -V(xc)+E(xc) XCENC = 1.90099128
PAW double counting = 0.00000000 0.00000000 entropy T*S EENTRO = -0.02820948 eigenvalues EBANDS = -6.31447362 atomic energy EATOM = 12.04670449
---------------------------------------------------
free energy TOTEN = -0.03055478 eV
energy without entropy = -0.00234530 energy(sigma->0) = -0.01645004 我们可以看到
也不等于
。
在上面的计算中有个问题,就是H原子有spin,而在上面的计算中我们并没有考虑到spin。所以如果我们改用LSDA近似,在INCAR中用ISPIN=2的tag,则得到如下结果:
k-point 1 : 0.0000 0.0000 0.0000 band No. band energies occupation 1 -7.2736 1.00000 2 -0.1229 0.00000 3 0.4562 0.00000 4 0.4562 0.00000 5 0.4562 0.00000
spin component 2
k-point 1 : 0.0000 0.0000 0.0000 band No. band energies occupation 1 -2.4140 0.00000 2 -0.0701 0.00000 3 0.5179 0.00000 4 0.5179 0.00000 5 0.5179 0.00000
Free energy of the ion-electron system (eV)
--------------------------------------------------- alpha Z PSCENC = 0.00060791 Ewald energy TEWEN = -1.36188267 -1/2 Hartree DENC = -6.68322940 -V(xc)+E(xc) XCENC = 2.38615430
PAW double counting = 0.00000000 0.00000000 entropy T*S EENTRO = 0.00000000 eigenvalues EBANDS = -7.27361676 atomic energy EATOM = 12.04670449
--------------------------------------------------- free energy TOTEN = -0.88526212 eV
energy without entropy = -0.88526212 energy(sigma->0) = -0.88526212
氢原子的能量约等于 。可以看到在LDA中如果限制自旋,使能级大概
提高了 。但是如何理解所得到的能级,由于用到了赝势,本人并不很清
楚如何解释能级意义。
用VASP计算Pd金属的晶格常数
Pd金属的实验上的晶格常数为
。在这里,我们用VASP计算它的晶格常数。
首先将Pd所对应的POTCAR文件拷贝到目录下。然后准备好INCAR和KPOINTS
文件。POSCAR文件我们将通过一个tcsh的script来产生。 KPOINTS文件可以如下:
Monkhorst Pack 0 Monkhorst Pack 11 11 11 0 0 0
INCAR文件可以如下:
SYSTEM = Pd bulk calculation Startparameter for this run: PREC = Accurate
ISTART = 0 job : 0-new 1-cont 2-samecut ICHARG = 2 charge: 1-file 2-atom 10-const ISPIN = 1 spin polarized calculation?
Electronic Relaxation 1
EDIFF = 0.1E-03 stopping-criterion for ELM LREAL = .FALSE. real-space projection Ionic relaxation
EDIFFG = 0.1E-02 stopping-criterion for IOM NSW = 0 number of steps for IOM
IBRION = 2 ionic relax: 0-MD 1-quasi-New 2-CG ISIF = 2 stress and relaxation
POTIM = 0.10 time-step for ionic-motion TEIN = 0.0 initial temperature
TEBEG = 0.0; TEEND = 0.0 temperature during run
DOS related values:
ISMEAR = 0 ; SIGMA = 0.05 gaussian smear
Electronic relaxation 2 (details)
Write flags
LWAVE = F write WAVECAR LCHARG = F write CHGCAR
产生POSCAR和计算晶格常数的工作可以用以下的PBS script来完成。 #!/bin/tcsh #PBS -S /bin/sh #PBS -l nodes=4:athlon:ppn=2 #PBS -l cput=384:00:00 #PBS -m ae #PBS -o output #PBS -e error.log
# set parameter set EXEC = 'vasp' set SRC = '/usr/common/executable'
# change working directory cd $PBS_O_WORKDIR
# copy fresh executable from depository cp -f $SRC/$EXEC .
# execute mpi program foreach a (3.3 3.4 3.5 3.6 3.7) echo \
cat >POSCAR <
0.5 0.5 0.0 0.0 0.5 0.5 0.5 0.0 0.5 2 direct
0.0 0.0 0.0 0.25 0.25 0.25 !
mpiexec -nostdin ./$EXEC
set E=`tail -2 OSZICAR` echo $a $E >>SUMMARY
end # remove executable rm -f $EXEC
如果不用不需要用PBS script,则更加简单,如下即可。将其命名为lattice。 #!/bin/tcsh foreach a (3.5 3.6 3.7 3.8 3.9 4.0 4.1 4.2) echo \
cat >POSCAR <
0.5 0.5 0.0 0.0 0.5 0.5 0.5 0.0 0.5 1
cartesian 0.0 0.0 0.0 !
./vasp
set E=`tail -1 OSZICAR` echo $a $E >>SUMMARY end
用chmod +x lattice,将其改为可执行文件。然后在命令行里键入./lattice 即可。
以下是用USPP-LDA运行完后的SUMMARY文件。每个计算用时13秒。(在USPP中Pd的截断能量是198.955)
3.5 1 F= -.52384500E+01 E0= -.52371846E+01 d E =-.253072E-02 3.6 1 F= -.58695670E+01 E0= -.58683951E+01 d E =-.234381E-02 3.7 1 F= -.62322232E+01 E0= -.62311104E+01 d E =-.222547E-02 3.8 1 F= -.63932936E+01 E0= -.63921078E+01 d E =-.237151E-02 3.9 1 F= -.64072233E+01 E0= -.64058584E+01 d E =-.272979E-02 4.0 1 F= -.63162916E+01 E0= -.63147061E+01 d E =-.317085E-02 4.1 1 F= -.61523489E+01 E0= -.61504748E+01 d E =-.374817E-02 4.2 1 F= -.59418370E+01 E0= -.59396594E+01 d E =-.435530E-02 用抛物线拟和得到的晶格常数为
。
以下是采用PAW-LDA势运行完以后的SUMMARY文件。每个计算用时20秒。所以相对来说PAW势所需要的时间多一些,这是因为PAW势的energy cutoff相对比较高(在PAW中Pd的截断能量是250.832)。
3.5 1 F= -.52393107E+01 E0= -.52377274E+01 d E =-.316665E-02 3.6 1 F= -.58814938E+01 E0= -.58798653E+01 d E =-.325695E-02 3.7 1 F= -.62451262E+01 E0= -.62437004E+01 d E =-.285149E-02 3.8 1 F= -.64049388E+01 E0= -.64036223E+01 d E =-.263317E-02 3.9 1 F= -.64158100E+01 E0= -.64143798E+01 d E =-.286044E-02 4.0 1 F= -.63210060E+01 E0= -.63194198E+01 d E =-.317251E-02 4.1 1 F= -.61536329E+01 E0= -.61518107E+01 d E =-.364433E-02 4.2 1 F= -.59385695E+01 E0= -.59364165E+01 d E =-.430601E-02 用抛物线拟和得到的晶格常数为
,固体中每个原子的能量 ,固体中每个原子的能量是
可见,PAW-LDA和USPP-LDA给出的晶格常数都和实验吻合的非常好,两者之间的差别也很小。在以下所有的计算中,如果没有特殊声明,我们都默认采用PAW-LDA的势。结合能(cohesive energy)的定义如下:
(104)
单个Pd原子的能量为-1.426eV,所以我们得到Pd每个原子(相对于spin non-polorize的原子)的结合能为4.998eV。如果考虑Pd原子的spin-polarize的修正1.46eV,则结合能为6.458eV。
用VASP计算表面能
做表面计算时,第一步我们需要测试K点的收敛性。通常,在垂直表面方向用1个K点就可以了,在平行表面方向,可以用和体材料类似的K点密度。 其次,我们要测试真空厚度(vacuum thickness)的收敛性。我们构造完一个slab后,将真空厚度逐渐从
增加到
,体系的总能量改变不超过10meV的时
候,可以初步认为真空厚度达到标准。以下是一个3层的(fcc) Pd slab的能量随着真空厚度的变化。其INCAR文件如下:
SYSTEM = undeformed fcc Pd (111) surface calculation Startparameter for this run: PREC = Accurate
ISTART = 0 job : 0-new 1-cont 2-samecut ICHARG = 2 charge: 1-file 2-atom 10-const ISPIN = 1 spin polarized calculation?
Electronic Relaxation 1
NELM = 90; NELMIN= 8; # of ELM steps EDIFF = 0.1E-03 stopping-criterion for ELM LREAL = .FALSE. real-space projection NBANDS = 40
Ionic relaxation
EDIFFG = 0.1E-2 stopping-criterion for IOM NSW = 0 number of steps for IOM
IBRION = 2 ionic relax: 0-MD 1-quasi-New 2-CG ISIF = 2 stress and relaxation
POTIM = 0.10 time-step for ionic-motion TEIN = 0.0 initial temperature
TEBEG = 0.0; TEEND = 0.0 temperature during run
DOS related values:
ISMEAR = 1 ; SIGMA = 0.20 broadening in eV -4-tet -1-fermi 0-gaus
Electronic relaxation 2 (details)
Write flags
LWAVE = F write WAVECAR LCHARG = F write CHGCAR LVTOT = .TRUE.
其中因为Pd是金属,ISMEAR设置为method of Methfessel-Paxton。我们在最后的计算结果中必须保证entropy T*S这一项在OUTCAR中可以忽略不计(
)。
POSCAR文件如下:
Pd surface Calculation 3.875000000000000
0.7071067800000000 0.0000000000000000 0.0000000000000000 -0.3535533900000000 0.6123724000000000 0.0000000000000000 0.0000000000000000 0.0000000000000000 5.1961520000000000 4
Selective Dynamics Direct
0.0000000000 0.000000000 0.0000000000 F F F 0.3333333333 0.666666667 0.1111111111 F F F 0.6666666667 0.333333333 0.2222222222 F F F 0.0000000000 0.000000000 0.3333333333 F F F
如果对Direct的指定方法不熟的话,也可以用如下的POSCAR,和上面的完全等价。
Pd surface Calculation 1.0000
2.740038777 0.000000000 0.000000 -1.370019389 2.372943188 0.000000 0.000000000 0.000000000 20.135089 4
Selective Dynamics Cartesian
0.0000000000 0.000000000 0.0000000000 F F F 0.0000000000 1.581962035 2.2372321073 F F F 1.3700193841 0.790981017 4.4744642247 F F F
0.0000000000 0.000000000 6.7116963320 F F F KPOINTS文件如下:
fcc Pd K points 0 Monkhorst Pack 11 11 1 0 0 0 下表列出了采用上面的参数设置,当真空层厚度从函数的变化: Table 4.1: 总能及功函数*随真空厚度的变化 K points sampling : 真空厚度总能 (4 6 8 10 12 14 16 18 30 50 -24.33686665 -24.21333801 -24.21287283 -24.2141146 -24.2127766 -24.2134478 -24.21455433 -24.21265095 -24.21363636 -24.21344003 5.6100 5.6286 5.7525 5.7249 5.7717 5.8566 5.8556 5.8700 5.9055 5.6518 功函数(eV) 总能 功函数(eV) K points sampling : 增大到
时总能及功
*Pd(111)面功函数实验值为5.6。但是由于我们只用了4层原子,并且没有弛豫表面原子,所以并不能和实验直接对照。
我们可以看到,真空厚度大约为
时,体系的总能量就已经收敛。而如果要保
左右。
证功函数的收敛,则真空厚度要加大到
首先我们要弛豫表面原子。弛豫的时候可以在INCAR中设置以下的参数。 POTIM=0.5 NSW=25 IBRION=2 EDIFFG=-0.03 MAXMIX=40
另外,为了得到正确的结果,我们还需测试表面计算,特别是表面能是否收敛。我们必须保证实际计算中用到的slab模型足够厚,slab内部原子具有体材料的
性质。如何判断slab内部原子具有体材料的性质呢?一个重要的标准就是当slab的层数N增加时,表面能的变化很小。 表面能的定义为
(105)
A指的是每个表面上的原子数,2是因为我们有两个表面.表面能表示原子形成表面是所需要的能量,所以表面能越小的表面越稳定。
在slab计算中,一个很常用的用来计算表面能的公式是Boettger Equation(PRB 49:23)
(106)
这里, 指的是N层的slab的总能量。前面一个2指的是两个表面。后面两个2指的是stacking period。在逐渐增加slab层数的时候,还要注意同时保持超晶胞大小的一致。正如VASP手册上说的
It is almost impossible to compare two calculations which differ in the number of k-points and in the size of the supercell.
我们从3层开始一层层增加Pd的层数,以研究需要几层Pd原子才能达到收敛。在计算过程中,我们保持超晶胞大小的一致。
Table 4.2: 表面能收敛测试* K points sampling : K points sampling : N 3 4 -17.763625 1.6454 1.5307 -24.2333-6.469609 84 5 -30.6743-6.441013 6 7 8 9 04 1.4591 51.9037 1.6584 51.8983 1.5163 51.8987 -37.1009-6.426698 85 -43.5608-6.459897 99 -50.0004-6.439595 98 *在上述计算中,超晶胞大小不变。表面原子并未弛豫。包含弛豫后,表面能将降低。
采用VASP如何计算晶体的弹性常数
弹性常数的概
念 [#!RavindranP:Denftc:1998!#,#!Grimvall:tp:1999!#]
弹性常数描述了晶体对外加应变 的响应的刚度。在应变很小的情况下,体系的内能与应变的大小存在二次线性关系(胡克定律),弹性常数次线性项的系数。采用Voigt标记:
。 应变张量 定义为:
,
就是描述这种二次线性关系,即二,
,
,
和
(107)
应力张量 定义为:
(108)
二阶绝热弹性常数为:
(109)
在应变较小的情况下,应变后体系的总能 按应变张量 进可按泰勒级数展开为:
(110)
其中
应变前的基矢
是应变前体系的总能,
之间的关系为:
(111)
是应变前原胞的体积。另外,应变后基矢
与
其中 为单位矩阵。
因此选取特定的应变 ,计算出在一组不同幅度时应
变前后体系总能的变化( ),再根据总能的变化-应变幅度对应的一组数据点,进行二次函数拟合得到二次项系数。即可得到晶体的某个弹性常数或弹性常数的组合。对不同的晶系的晶体,因为对称性的关系,它独立的弹性常数是确定的。比如对六角晶系的晶体,它独立的弹性常数为:
,
,
和
。
,
六角晶体的弹性应变能与应变关系
对六角晶系的晶体,其原胞基矢可以取为:
(112)
其中 和 是晶体的晶格常数。
可以施加这样的应变 来计算
[#!WangSQ:Abiec:2003!#]:
(113)
施加应变
来得到
:
(114)
对于
,施加应变
来得到:
(115)
对于
,施加应变
来得到:
(116)
最后,施加应变
得到
、
、
和
的组合:
(117)
由此可见,通过施加五个特定的应变,选取一系列幅度 的应变,得到 数据点,再分别按上面五个关系式对相应的 进行拟合得到二次项系数,最后联立方程得到求出六角晶系晶体的独立弹性常数。
具体计算步骤
在计算时,有几点要特别注意的:a),原胞内原子在应变是否驰豫;b),k点网格大小是否足够,因为在应变后,原胞的对称性会发生变化,即使同样的k点网格,在简约布里渊区产生的k点数目是不同的。因此,k点网格大小要取得足够,以保证弹性常数计算的精确性;c),应变幅度 要取得适中,如果太小的话,得到的应变能(应变前后体系的变化)很小,在计算弹性常数时,会引起计算误差。
下面以计算六角AlN(纤锌矿结构)为例,在计算过程考虑了应变后原子的位置需要驰豫,具体步骤如下:
?
先对六角AlN体材料的晶格参数(晶格常数和原子位置)优化好,这样得到未应变时的POSCAR,并把它拷贝成下面defvector.f需要用到的一个的输入文件OLDPOS,并对OLDPOS做一个处理。因为OLDPOS在格式上有特殊要求:
a
、在OLDPOS的第一行,在title的字符串之后,至少空一格再加上OLDPOS中原子的种类数目,比如AlN中有两类原子,title写为AlN,那么就OLDPOS的第一行就是\。 b
、OLDPOS的格式与POSCAR的类似,但是它最好是分数坐标来写出原子的位置。 以六角AlN为例,这个OLDPOS的内容如下:
towidth 0.8pt height 0cm depth 0.25cmwidth 1.025height 0cm depth 0.8ptwidth 0.8pt height 0cm depth 0.25cm 1.0 AlN 2 3.11553
1.000000 0.000000 0.000000 -0.500000 0.866025 0.000000 0.000000 0.000000 1.605000 2 2 Direct
0.00000000 0.00000000 0.00000000 0.333333333 0.666666667 0.50000000 0.00000000 0.00000000 0.381483673 0.333333333 0.666666667 0.881483673
towidth 0.8pt height 0.25cm depth 0cmwidth 1.025height 0.8pt depth 0cmwidth 0.8pt height 0.25cm depth 0cm
?
对特定的应变,在下面的defvector.f中\部分,把特定的应变通过给strain(i)矩阵赋值。比如对上面提到的
用来计算
,
那么就对defvect.f中的\改写成如下的形式:
towidth 0.8pt height 0cm depth 0.25cmwidth 1.025height 0cm depth 0.8ptwidth 0.8pt height 0cm depth 0.25cm 1.0 C%%%%%%%%% Define the strain %%%%%%%%%%%%%% strain(1)=delta strain(2)=delta strain(3)=0.0
strain(4)=0.0 strain(5)=0.0 strain(6)=0.0
towidth 0.8pt height 0.25cm depth 0cmwidth 1.025height 0.8pt depth 0cmwidth 0.8pt height 0.25cm depth 0cm
其中整个defvector.f是用来得到某个应变后,新的POSCAR。应变的类型按\the strain\的部分来定义,而 应变的幅度需在程序编译后,运行编译得到的模块时输入。defvect.f的内容如下:
towidth 0.8pt height 0cm depth 0.25cmwidth 1.025height 0cm depth 0.8ptwidth 0.8pt height 0cm depth 0.25cm 1.0
C%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%
C >this simple program to get the primitive vectors after C $\\delta$ strain, in order to calculate the independent C
elastic constants of solids. C usage: C!!!!! Please first prepare the undeformed POSCAR in OLDPOS C >defvector.x C >type defvector.x > create new POSCAR in file fort.3
C%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%
program defvector
real*8 privect,strvect,delta,strten,strain,pos, alat dimension
privect(3,3),strvect(3,3),strten(3,3),strain(6) dimension pos(50,3)
character*10 bravlat, title, direct integer i,j,k,ntype, natomi, nn dimension natomi(10)
C%%%%%%%%% Read the undeformed primitive vector and atomic postion %%%%%%%
open(7,file='OLDPOS')
C%% In first line of OLDPOS, please add the number C%% of the type of atoms after the title
read(7,*) title, ntype read(7,*) alat do i=1,3
read(7,*) (privect(i,j),j=1,3) write(*,*) (privect(i,j),j=1,3) enddo
read(7,*) (natomi(i),i=1,ntype)
nn=0
do i =1, ntype
nn=nn+natomi(i) enddo
read(7,*) direct do i=1, nn
read(7,*) (pos(i,j),j=1,3) enddo
C%%%%%%%%% Read the amti of strain %%%%%%%%%%%%%%% read(*,*) delta
C%%%%%%%%% Define the strain %%%%%%%%%%%%%% strain(1)=delta strain(2)=0.0 strain(3)=0.0 strain(4)=0.0 strain(5)=0.0 strain(6)=0.0
C%%%%%%%%% Define the strain tensor %%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%% strten(1,1)=strain(1)+1.0 strten(1,2)=0.5*strain(6) strten(1,3)=0.5*strain(5) strten(2,1)=0.5*strain(6) strten(2,2)=strain(2)+1.0 strten(2,3)=0.5*strain(4) strten(3,1)=0.5*strain(5) strten(3,2)=0.5*strain(4) strten(3,3)=strain(3)+1.0
C%%%%%%%%% Transform the primitive vector to the new vector under strain%%%%%
C strvect(i,j)=privect(i,j)*(I+strten(i,j))
do k=1,3 do i=1,3
strvect(i,k)=0.0 do j=1,3
strvect(i,k)=strvect(i,k)+privect(i,j)*strten(j,k) enddo enddo
enddo
C%%%%%%%% Write the new vector under strain%%%%%%%%%%%% do i=1,3
write(*,100)(strvect(i,j),j=1,3) enddo
100 format(3f20.15)
C%%%%%%%%% Create the POSCAR for total energy calculation %%%%%%%%%%%%%%5
write(3,'(A10)') title write(3,'(f15.10)') alat do i=1,3
write(3,100)(strvect(i,j),j=1,3) enddo
write(3,'(10I4)') (natomi(i), i=1,ntype) write(3,'(A6)') Direct do i=1, nn
write(3,100) (pos(i,j),j=1,3) enddo C%%%%%%% end
towidth 0.8pt height 0.25cm depth 0cmwidth 1.025height 0.8pt depth 0cmwidth 0.8pt height 0.25cm depth 0cm
在defvector.f中,原子种类的数目由变量ntype来定义的,最大为10,如果原子的种类数目太大,需自己手动调大数组natomi(10)以及输出时\write(3,'(10I4)') (natomi(i), i=1,ntype)\的格式\。 在defvector.f中设置好了特定的应变后,就可以编译defvector.f(使用g77 -o defector.x defector.f)得到模块defvector.x。
?
准备好VASP计算的输入文件KPOINTS和POTCAR。以及进行原子位置驰豫计算的INCAR.relax,它的内容如下:
towidth 0.8pt height 0cm depth 0.25cmwidth 1.025height 0cm depth 0.8ptwidth 0.8pt height 0cm depth 0.25cm 1.0
SYSTEM = AlN ENCUT = 400 ISTART = 0 ICHARG = 2 ISMEAR = 0; SIGMA =
0.2 NSW = 60; IBRION = 2 EDIFF = 1E-5 EDIFFG = -1E-2 ISIF = 2 POTIM = 0.2 PREC = Accurate LWAVE = .FALSE.
towidth 0.8pt height 0.25cm depth 0cmwidth 1.025height 0.8pt depth 0cmwidth 0.8pt height 0.25cm depth 0cm
另外在准备对优化得到的结构进行总能进行的INCAR.static,它的内容如下:
towidth 0.8pt height 0cm depth 0.25cmwidth 1.025height 0cm depth 0.8ptwidth 0.8pt height 0cm depth 0.25cm 1.0
SYSTEM = AlN ENCUT = 400 ISTART = 0 ICHARG = 2 ISMEAR = -5 EDIFF =
1E-5 PREC = Accurate LWAVE = .FALSE.
towidth 0.8pt height 0.25cm depth 0cmwidth 1.025height 0.8pt depth 0cmwidth 0.8pt height 0.25cm depth 0cm
总的说来,就是先对应变后的POSCAR进行固定基矢,只对原子位置的优化,再对优化得到的结构进行静态总能计算得到应变体系后的总能
。其中应变后的初始POSCAR通过defvector.x来得到。
?
对一系列幅度 的特定应变进行上一步的计算。最后得到一组
数据。然后对它进行二次函数拟合得到二次项的系数。
注意: 是未应变是体系的总能, 是未应变体系的体积。在VASP
计算中它们的数值单位是eV和? 。1 eV/? = 160.2 GPa。
前面的原子位置优化和总能计算等可以通过一个bash脚本来进行,如: towidth 0.8pt height 0cm depth 0.25cmwidth 1.025height 0cm depth 0.8ptwidth 0.8pt height 0cm depth 0.25cm 1.0
#!/bin/sh for i in -0.018 -0.015 -0.012 -0.09 -0.06 -0.03 0.00 \\
0.03 0.06 0.09 0.012 0.015 0.018 do echo $i | defvector.x cp fort.3 POSCAR
#### cat > INCAR <
ISMEAR = 0; SIGMA = 0.2 NSW = 60; IBRION = 2 EDIFF = 1E-5 EDIFFG =
-1E-2 ISIF = 2 POTIM = 0.2 PREC = Accurate LWAVE = .FALSE. LCHARG =.FALSE. !
echo \
cp CONTCAR pos.$i cp CONTCAR POSCAR
cat > INCAR <
echo \
E=`grep \out.$i | tail -1 | awk '{printf \\\n\$5 }'` echo $i $E >>SUMMARY
done
towidth 0.8pt height 0.25cm depth 0cmwidth 1.025height 0.8pt depth 0cmwidth 0.8pt height 0.25cm depth 0cm
?
对其他特定的应变,按上面第2和3步再做一系列的计算得到相应的一组
数据,以及拟合。
对其他晶系(比如正交晶体)的弹性应变能、应变和弹性常数的关系,可以参考文献 [#!RavindranP:Denftc:1998!#,#!Hou05!#]。
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