实验记录
更新时间:2024-01-11 04:02:01 阅读量: 教育文库 文档下载
实验名称:EGFR基因突变的检测 实验标本:D13229、D13230
实验目的:检测样品是否存在EGFR突变
实验试剂:QIAGEN DNA FFPE Tissue Kit、人EGFR基因突变检测试剂盒(Taqman-ARMS
法)(为真,20种突变类型)
实验仪器:Roche LightCycler 480荧光定量PCR、Nanodrop2000分光光度计、生物安全柜、
离心机、恒温金属浴。
实验方法:探针法 实验步骤:一、DNA提取
1、 切取5μm厚度的组织片3片,放入EP管中;
2、 加入1ml二甲苯振荡混匀,充分溶解石蜡,14000rpm离心2min,吸去上清; 3、 加入无水乙醇1ml,14000rpm离心2min,吸尽上清,开盖挥发(约10min); 4、 加入180μlATL和20μl蛋白酶K,震荡混匀; 5、 56℃1h 6、 90℃1h
7、 短暂离心,加入200μl AL,震荡混匀; 8、 短暂离心,加入200μl无水乙醇,震荡混匀;
9、 短暂离心,将液体移入收集柱中,8000rpm离心1min,更换新的收集管; 10、 加入500μl AW1漂洗液,离心8000 rpm,1min,更换新的收集管; 11、 加入500μl AW2漂洗液,离心8000rpm,1min,更换新的收集管; 12、 离心14000rpm,3min,丢弃收集管,更换成1.5ml离心管; 13、 加入ATE(洗脱液)50μl,室温静置2min; 14、 离心14000rpm,1min,收集洗脱液。 二、DNA浓度调整
1、用分光光度计检测DNA样品,记录样品浓度、260/280值; 2、DNA样本统一稀释浓度为5ng/μl,共20μl。 三、检测
1、取八联管、DNA聚合酶、纯化水、阳性质控品、稀释后的DNA样品置于4℃冰箱中;
2、八联管、阳性质控品、样品混匀后稍离心,置于冰上;DNA聚合酶、纯化水
稍离心后置于冰上;
3、按每管:1.64μl DNA聚合酶、63.96μl 纯化水、16.4μl 样品;混匀成总体积82μl的MIX混合液。混匀后稍离心;
4、八联管中每孔加入10μl MIX混合液,一条八联管对应一个样品;加样完成后,轻混匀后稍离心; 5、程序设置:
第一阶段:95℃,5min,1循环;
第二阶段:95℃,20s、63℃,40s,45循环; 第三阶段:40℃,10s,1循环。 四、结果分析
1、NTC无扩增曲线升起,或Ct≥40; 2、阳性质控Ct≤30;
3、Control,FAM通道,Ct≤35;
4、结果判定:阴性:无扩增曲线,或Ct≥40; 阳性:曲线呈S型且Ct≤38。
实验结果:
提取的DNA浓度 260/280比值 结果
D13229 D13230
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