猫白介素-18基因的分子克隆、序列分析及其表达研究
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根据GenBank中报道的猫白介素-18基因(IL-18)序列,对用ConA刺激的实验猫外周血单核细胞(PBMCf)进行了RT-PCR扩增;将扩增得到的PCR产物纯化后克隆入pMD18-T中得到重组质粒pTIL-18,进行核苷酸序列测定,并与不同物种的IL-18基因进行了序列比较。结果该基因全长579bp,编码1
农业生物技术学报 JournalofAgriculturalBiotechnology2007,15(2):198~202
· ·研究论文
猫白介素 18基因的克隆、 序列分析及其表达 *
3
乔 军 1,, 夏咸柱 1 **, 杨松涛 1,2 , 鞠会艳 1,2 , 黄 耕 1
(1.解放军军事医学科学院军事兽医研究所,长春130062 2.吉林大学农学部,长春130118
3. 中国农业科学院兰州兽医研究所, 兰州 730046)
摘要:用猫白介素18(interleukin, (ConA) (PBMCf) 刺激后猫外周血单核细胞 总 RNA进 基因特异性引物对刀豆蛋白
但存在 4 个 Cys 氨基酸序列中, 无信号肽序列和潜在的N 联糖基化位点,
分别为 89.8%、 88.6%、 88.4%和
)表达载体 pET28a
行了RTPCR扩增, 并将扩增产物纯化后克隆入 pMD18T 中进行核苷酸序列测定。结果该基因全长 579bp, 编码 192 个氨基 酸(GenBank登录号: DQ100372)。在推导的猫 残基。与不同物种 但与小鼠和鸡 88.1%,
中构建了重组质粒 pET相比,
与犬、 羊、
有明显的种属差异。将目的基因片段进一步亚克隆到大肠杆菌转化大肠杆菌 BL21(, 并用IPTG诱导。结果重组菌菌体裂解物经 SDSPAGE 电泳可检测 DE3)
目的蛋白表达量可占菌体蛋白的 13.6%。 到分子量为 27.5kD的重组目的蛋白。经凝胶薄层扫描,
关键词:猫白介素18基因; 克隆; 序列分析; 大肠杆菌表达
中图分类号: S188 文献标识码: 文章编号:A 10061304(2007)02019805
CloningandSequenceAnalysisofFelineInterleukin18 GeneandItsExpressionin
1,3 1 1,2 1,2 1
QIAOJun ,XIAXianzhu **,YANGSongtao ,JUHuiyan ,HUANGGeng
Accordingtofelineinterleukin18genesequencereportedinGenBank,feline genewasamplifiedby
genewas579
RTPCRfromthefelineperipheralbloodmononuclearcells(PBMCf)stimulatedbyconcanavalin(ConA).ThePCRproductwas purifiedandligaturedwithpMD18T.Therecombinantplasmidwasusedforsequencing.Thefulllengthoffeline paredwith nucleotide sequenceoffeline GenBank.Meanwhile,thefeline wasfurthertransformedinto of
gel scanning.
felineinterleuk18gene cloning sequenceanalysis expressionin
geneshares89.8%、 88.6%、 88.4%and88.1%identitieswith
and porcinerespectively,butdisplayssignificantdifferenceswithmouseandchicken
bp,whichencoded192aminoacids(GenbankaccessionNo.DQ100372).TherewerenosignalpeptideandNglycosylationsites,
genesofotherspecies,the genesofcanine,ovine,bovine genesequencewhichpublishedin
genewassubclonedintotheprokaryoticexpressingvectorpET28aandrecombinantvector
strainBL21(DE3)forexpressionundertheinductionofIPTG.TheresultsofSDSPAGE
revealedthatithadamolecularweightof27.5kD,whichamountsto13.6%inthe totalproteinoftheinducedbacteriabytheassaying
白细胞介素 18 (interleukin18, 子 (Okamura
最初是从 INF酌, 故将其命名为干扰素 酌诱导因子( Interferon gammainducingfactor,IGIF)。随后的研究表明,
IL18 分子结构类似于 IL21 家族而功能类似于
中毒性休克的小鼠肝脏发现的一种细胞免疫调节因
, 1995) , 它能诱导 Th1 等细胞分泌
* 基金项目: 国家林业局野生动植物保护司资助。
** 通讯作者。AuthorforCorrespondence. 中国工程院院士, 博士生导师, 主要从事动物病毒学研究。
Tel: 04316985518 Email:<xia_xzh@>. 20060410 接受日期: 20060518 收稿日期:
根据GenBank中报道的猫白介素-18基因(IL-18)序列,对用ConA刺激的实验猫外周血单核细胞(PBMCf)进行了RT-PCR扩增;将扩增得到的PCR产物纯化后克隆入pMD18-T中得到重组质粒pTIL-18,进行核苷酸序列测定,并与不同物种的IL-18基因进行了序列比较。结果该基因全长579bp,编码1
第 2 期 乔 军等:猫白介素 18基因的克隆、 序列分析及其表达
199
IL12 家族,
除能诱导 INF酌大量分泌, 还可促进 T、 B 淋巴细胞的分化、激活 NK 细胞以及诱导产生
IL22等, 在抗微生物感染和肿瘤免疫中具有重要的 作用 (Dinarello, 1999; Zhang, 1999; LebelBinay 2000)
。鉴于 IL18 具有广泛的生物学活性和潜 在的开发前景(Biet
, 2002 Ohkusu 2000),
因此成为众多细胞因子中的研究热点之一。 虎、 狮和 豹等均属于国家重点保护的大型猫科动物,积极开 展猫 IL18 研究对于珍稀猫科野生动物病毒性感染 的防治具有重要的意义。本实验对猫
基因进
行扩增及序列测定, 并在大肠杆菌中进行了表达。
1 材料和方法
1.1 主要试剂、 质粒及菌株
DNA 聚合酶、 DNAgelExtractionKit 和 dNTPs 购自上海生物工程公司。 TrizoL 购自
Invitrogen 公司 (美国)。反转录酶 MMLV、 RNasin、 T4 DNA 连接酶、
限制性内切酶和 pMD18T 载体购 自大连 TaKaRa 公司。DMEM培养基为 GIBCO(美 国) 产品;大肠杆菌表达载体
pET28a(+)、
克隆宿主菌 JM109 和表达宿主菌 BL21 (DE3)由本室保存。
1.2 猫外周血淋巴细胞的制备及总 RNA 的提取
对健康的实验猫进行心脏采血,
肝素抗凝, 用淋 巴细胞分离液分离猫外周血单核细胞 (PBMCf), 用
Hank's 液洗涤 3 次后进行计数,调整 PBMCf 至
1.5伊10 6 个 /mL, 用 DMEM 培养液 (内含 8%的牍牛 血清, 10mg/LConA(A 伴刀豆球蛋白)以及青、 链霉 素 1000IU/mL) 进行培养。37 ℃下培养 24h 后, 用
TrizoL 按常规方法提取 ConA 刺激后 PBMCf 的总 RNA。
1.3 引物的设计与合成
根据 GenBank 中已发表的猫 cDNA 序
列, 设计了 1 对特异性引物 P1 和 P2, 预期扩增长度
为 579bp。
上游引物P1:
5'ACCGAATTCATGAGAATTTCGAAACCGTATCTGAG3'
下游引物P2:
5'ACCAAGCTTTCAAGGAGAATTGATGAACATTTG3'。
为下一步克隆需要, 分别在上、
下游引物中引入 玉和 芋酶切位点,并加有 3 个保护性碱 基。引物由大连 TaKaRa公司合成。
1.4 猫
基因 RTPCR 扩增、 克隆及序列测定
以提取的总 RNA为模板,以 P2 和 OligoT 为 引物按常规方法用反转录酶 MMLV 进行 RT 反 应。取 RT 产物 2 滋L , 10伊PCRbuffer5 滋L 、
25 mmol/LMgCl 2 4 滋L
、引物 P1(25pmol/滋L )、 P2( 25 pmol/滋L ) 各 1 滋L , 2.5mmol/LdNTPs 4 滋L , 水 32.7 滋应条件为: L DNA96 聚合酶 ℃预变性 (5U/200 滋Ls ; ) 94 0.3℃ 滋,40L 混匀。
s 56 ℃PCR,30 反 s
72 ℃,50s, 35 个循环;然后 72℃ 再延伸 10min。 PCR 产物用 1.2%琼脂糖凝胶电泳分析。切下目的 DNA 片段,按凝胶回收试剂盒进行回收。取回收 DNA 片段,
与 pMD18T 载体 16 ℃连接过夜; 将连 接产物转化大肠杆菌 JM109, 然后用 Amp 琼脂平板 上筛选, 并用限制性内切酶酶切和 PCR 方法鉴定获 得重组质粒 (命名为 pET, 送上海联合基因生
物公司进行序列测定。所测序列用 DNAMAN 和
DNAstar 软件分析,并 对不同生物物种 基因
进行遗传进化分析。 1.5 的构建
用
玉和 芋同时分别双酶切 pET和 pET28a, 然后回收目的片段和载体片段, 用 T 4 连 接酶连接进行定向克隆,构建原核表达载体
pET并用酶切和 PCR 进行鉴定。
1.6 在大肠杆菌中的表达及表
达产物的鉴定
将 pET转化于感受态菌 BL21(DE3 )后,
挑 选单菌落, 接种含卡那霉素 (30mg/L) 的 LB 培养基 中, 37 ℃摇荡培养至
0.6~1.0, 加 IPTG(终浓
度为 1mmol/L)诱导 6h。离心收集菌体,重悬于 200 滋L TE 中, 加等体积 2 倍 SDS 凝胶加样缓冲
液, 100 ℃煮沸变性 5min,在 12%的凝胶上进行 SDSPAGE 电泳以检测目的蛋白的表达,并用双波 长非点扫描仪对上述凝胶电泳的蛋白带进行扫描。
2 结果
2.1 猫
基因 RTPCR 扩增结果
经 1.2%琼脂糖凝胶电泳 , 猫
基因
RTPCR 产物为 579bp,
与预期结果相符 (图 1)。 2.2 的鉴定
以重组子 pET为模板,用 PCR 方法进行 鉴定, 可扩增得到 579bp 的核酸片段, 与预期的一
致。将重组质粒 pET用
玉和 芋双酶 切, 可得到 2692 和 579bp2 个片段, 与预期结果一 致 (图 2), 表明目的基因已克隆到 T 载体中。 2.3 猫 基因 cDNA 序列测定结果及推导的氨
基酸序列
经序列测定表明, 猫
cDNA 的阅读框全
长 579bp,编码 192 个氨基酸。此信息已被 Gen Bank 收录, 登录号为 DQ100372。与 GenBank 中报 道的猫
相比,两者核苷酸和氨基酸的同源性
根据GenBank中报道的猫白介素-18基因(IL-18)序列,对用ConA刺激的实验猫外周血单核细胞(PBMCf)进行了RT-PCR扩增;将扩增得到的PCR产物纯化后克隆入pMD18-T中得到重组质粒pTIL-18,进行核苷酸序列测定,并与不同物种的IL-18基因进行了序列比较。结果该基因全长579bp,编码1
200农 业 生 物 技 术 学 报 2007 年
均为 100%。用 SignalIP 软件分析表明, 在推导的猫
氨基酸序列中没有信号肽; PROSITE 软件分 析, 也没有发现潜在的 N 联糖基化位点, 但存在 4 个 Cys 残基, 推测可能会形成二硫键结构。在氨基 酸序列比较时,发现猫
分子上存在有
分
即 phex(12)phexserx 子类似的特征性序列结构,
和推导的氨基酸序列的同源性分布为 89.8%、
88.6% 、 88.4% 、 88.1% 和 90.6% 、 88.9% 、 85.2% 、
但与小鼠 的差异较大, 核苷酸的同源 84.9%;
性在 66.1%左右,推导的氨基酸序列的同源性为 与鸡 66.5%; 约为 30.1%。
的差异很大, 核苷酸序列同源性
(6)pheleu( x 代表相对变化的氨基酸)
。 图1.Fig.1.AmplificationofM, DL15000+2000 1, negativecontrol 2and3, feline
gene.
图 2. 重组质粒 pET的酶切鉴定
Fig.2.Identificationofrecombinantbyenzyme
digestion
M,DL15000+2000 1and3,nonrecombinant玉
芋;
2,4,5and6,recombinant玉芋.
2.4 猫 IL18 成熟蛋白氨基酸序列二级结构与三级 结构预测
用 HNN软件对猫 IL18 二级结构预测表明, 猫
IL18分子包括 3 段 琢 螺旋,中间由无规则圈曲相
连接 (图 3); 用 Swissmodel 软件进行三级结构预测 表明,猫 IL18 三级结构是由无规圈曲连接的多段 平行的 琢 螺旋所形成中空状的桶样结构 (图 4)。 2.5 不同物种 基因的遗传进化分析
序列分析表明, 猫
基因与犬、 羊、 牛和猪
等哺乳动物的
同源性相对较高(图 5), 核苷酸
图3.猫 IL18二级结构分析
Fig.3.Thesecondstructureanalysisoffeline
IL18by
hierarchicalneuralnetwork(HNN)method
图4.猫 IL18氨基酸序列 3D结构分析
Fig.4.3DstructureanalysisoffelineIL18aminoacidsequence
2.6 的构建
以重组质粒 pET为模板, PCR 可扩增出
目的基因片段(图 6); pET用
芋与预期结果相一致, 双酶切,
可得到 5369表明该重组质粒构建正确。 和 579bp2 个片段 玉(图 和 7),
2.7 猫
基因在
中的表达及其检测
经 SDSPAGE 分析, pET转化菌的诱导产
物在约 27.5kD处有 1 条特异的蛋白带(图 8 箭头 处), 与预期值大小相符; 而 pET28a(+)转化菌的诱 导产物和 pET
转化菌的非诱导产物在该处没
根据GenBank中报道的猫白介素-18基因(IL-18)序列,对用ConA刺激的实验猫外周血单核细胞(PBMCf)进行了RT-PCR扩增;将扩增得到的PCR产物纯化后克隆入pMD18-T中得到重组质粒pTIL-18,进行核苷酸序列测定,并与不同物种的IL-18基因进行了序列比较。结果该基因全长579bp,编码1
第 2 期 乔 军等:猫白介素 18基因的克隆、 序列分析及其表达
201
图 5. 不同物种
GenBankaccessionnumberswereasfollows:
Y11133
NM_001009207
基因的遗传进化分析
genes ofdifferentspecies
TNI555459.
Fig.5.Phylogenetictreebasedonhomologyof
NM_204608
有蛋白带。结果表明猫 在大肠杆菌中实现了
转化的
表达。凝胶薄层扫描结果显示, pETBL21(DE3)在 IPTG诱导 6h 后的 IL18 蛋白的最高
表达量可占菌体总蛋白量的 13.6%。
图7. 重组质粒 pETdigestion
M,DL15000+2000 1,3,的酶切鉴定
byenzyme
/
玉芋.
芋
Fig.7.Identificationofrecombinant2, 4,图 6. 重组质粒pET的 PCR鉴定
byPCR
Fig.6.IdentificationofrecombinantM,DL15000+2000 1and2,positiverecombinant3 讨论
人 IL18 于 1996 年首次被克隆(Ushio (Dinarello, 1999; Gardella
,它是由激活的单核细胞及巨噬细胞产生 1996)
。Ushio , 1999)
(1996) 用 Northern 杂交技术对成年人不同组织的
图8. 猫
基因在
DE3(BL21)中的表达 genein
DE3(BL21)
4~8,
mRNA 进行分析,结果发现胰、肾、脾和骨骼肌
mRNA 含量较高,肝和肺中也能检测到。 Okamara etal.(1998) 发现肝 Kuffer 细胞
这与有无 LPS 刺激无关, 但单 mRNA 表达量较高,
核细胞只有当 LPS 刺激后才有高表达。在分子组 成,鼠
前体蛋白由 192 个氨基酸组成,分子
Fig.8.Expressionoffeline
M,standardproteinmarker 1,BL21(DE3)transformedbypET28a 2and3,uninducedBL21(DE3)transformedbyinducedBL21(DE3)transformedbypET
arrowindicates27.5 ;
与鼠 有 65%同源性,也没有糖基化位点和疏
都有
无 N 联糖基化位点、 无野生型疏水信号肽 23.8kD,
样位点。人 基因编码 193 个氨基酸前体蛋白,
水信号肽位点。在分子结构上,鼠和人
即 phex(12)phexserx(6) IL1 类似的特征性结构,
根据GenBank中报道的猫白介素-18基因(IL-18)序列,对用ConA刺激的实验猫外周血单核细胞(PBMCf)进行了RT-PCR扩增;将扩增得到的PCR产物纯化后克隆入pMD18-T中得到重组质粒pTIL-18,进行核苷酸序列测定,并与不同物种的IL-18基因进行了序列比较。结果该基因全长579bp,编码1
202农 业 生 物 技 术 学 报 2007 年
pheleu。本实验在分析猫 存在 IL1 类似的特征性结构。
分子时, 也没有发
导 NK细胞产生 IFN酌(Okamura 。鉴于
现其含有信号肽序列和 N 联糖基化位点,但同样
目前的研究表明, IL18 是一种多效细胞因子, 可能在大型猫科动物疫病 IL18 的多种生物学功能,
的防治中发挥重要的作用,因此对全长的 基 因进行了融合表达,由于 IL18 分子含有多段疏水 它主要具有以下生物学功能:第一, IL18可以刺激
T 细胞进行分化增殖,能诱导 CTL 细胞和 PHA 激
活的 T 细胞的增殖(Reddy, 2004 Okamura 1995)
。第二, 可诱导 B 细胞的分化增殖。Airoldi (2000)检测了 IL18 对 B 细胞的刺激能力,
发现 IL18 对活化的 B 细胞具有激活能力,对静止的 B
细胞不产生刺激效应。第三, IL18 可以通过 IL2R 的某些成分来激活 NK细胞的增殖 (Okamura
1998),
同时诱导 NK细胞的细胞毒活性。第四, 可诱 参 考 文 献
AiroldiI,GriG,MarshallJD,CorcioneA,FacchettiP, GuglielminoR,TrinchieriGandPistoiaV.Expressionand functionofIL12andIL18receptorsonhumantonsillarB cells(J).Journalof
2000,165:6880~6888
BietF,LochtCandKremerL.Immunoregulatoryfunctionsof interleukin18anditsroleindefenseagainstbacterial pathogens(J). 2002,80(3):
147~162
DinarelloCA.Interleukin18(J).
1999,19(1):121~132
GardellaS,AndreiC,CostiglioloS,PoggiA,ZocchiMRand RubartelliA.Interleukin18synthesisandsecretionby dendritic
cells
are
modulated
by
interaction
with
antigenspecificTcells(J). 1999,66(2):237~241
LebelBinayS,BergerA,ZinzindohoueF,CugnencP,Thiounn N,FridmanWHandPagesF.Interleukin18:Biological propertiesandclinicalimplications(J).
2000,11(1):15~26
OhkusuK,YoshimotoT,TakedaK,OguraT,KashiwamuraSI, IwakuraY,AkiraS,OkamuraHandNakanishiK. Potentialityofinterleukin18asausefulreagentfortreatment andpreventionof
majorinfection.
性 琢螺旋结构, 导致表达量不高。将表达的蛋白进 行纯化和复性后,我们初步进行了体外淋巴细胞转 化试验 (MTT 法), 结果复性的蛋白没有检测到生物 学活性 (另文发表)
, 这与 Ushio 研究结果
不同。 本实验表明, 用原核表达系统来制备具有生物 学活性的 IL18 蛋白是非常困难的,下一步我们将 利用毕赤酵母或杆状病毒表达系统来表达猫 IL18, 探讨重组猫 IL18 的生物学活性,为其在猫科动物 病毒性感染的防治研究提供了基本资料。
OkamuraH,TsutsuiH,KomastuT,YutsudoM,HakuraA,
TakimitoT,TorigoeK,OkuraT,NukadaY,HattoriK,Akita K,NambaM,TanabeF,KonishiK,FukudaSandKurimoto M.CloningofanewcytokinethatinducesIFNgproduction byTcells(J).
1995,378:88~91
OkamuraH,TsutsuiH,KashiwamuraS,YoshimotoTand NakanishiK.Interleukin18:Anovelcytokinethataugments bothinnateandacquiredimmunity
1998 70:281~312
OkamuraH,KashiwamuraS,TsutsuiH,YoshimotoTand NakanishiK.Regulationofinterferongammaproductionby IL12andIL18(J). 1998,10 (3):259~264
ReddyP.Interleukin18:Recentadvances(J).
2004,11(6):405~441
UshioS,NambaM,OkuraT,HattoriK,NukadaY,AkitaK, TanabeF,KonishiK,MicallefM,FujiiM,TorigoeK, TanimotoT,FukudaS,IkedaM,OkamuraHandKurimoto M.CloningofthecDNAforhumanIFNγ inducingfactor, expressionin
andstudiesonthebiologic
activitiesoftheprotein(J). (9):4274~4279
ZhangXY(张艳仙).Progressoninterleukin18(J).
国外医学
·生理、 病理科学与临床分册).1999,19 (6):532~535(inChinese)
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