全国细菌耐药监测网上传数据标准-V5.2 - 图文

全国细菌耐药监测网信息系统

数据上报标准V5.2

（此文档最后修改于 2014年4月14日）

全国细菌耐药监测网通过“全国细菌耐药监测网信息系统”收集所有成员单位的耐药监测数据，系统具备完善的数据筛选和容错处理功能，系统所支持上传的数据文件格式为WHONET 5.6软件所导出的通用数据文件格式，但后缀必需为“.dbf”。除此以外，系统还支持Excel表格，包括Excel2003以下版本生成的（*.xls）以及Excel2007/2010所生成的*.xlsx。

一、科室代码设置

监测网成员单位首次登录时须先使用【本院科室管理】功能，登记注册医院临床科室并将其映射至系统所要求的标准科室分类上，该映射关系可随着本院的科室变化随时进行调整（增加、删除、修改），调整之后不影响曾经上传过的文件，仅影响在调整时间点后上传的数据。而各医院临床科室对应上报数据文件中的WARD字段保存的值，可以是本院临床科室名称也可以是本院的临床科室代码，取决于各院在WHONET中是如何管理的，或者是如何从LIS系统导出的。完成医院科室设置后，在上传本院数据时，系统会自动将已经设置好的本院科室信息与系统标准的科室分类进行映射，并将映射结果直接写入DEPARTMENT字段，不影响WARD字段中上传的原始值，也就是说，DEPARTMENT字段实际上可以不填写，甚至是整列都不存在。其实，更好的做法是在上报的数据文件中直接将DEPARTMENT字段设置成系统内置的标准科室代码（3位字符）。

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二、数据文件各字段要求 1、来源ORIGIN

非必填字段，最长1个字符。若填写，则其必须为“h”，若不填写，数据上传后系统会自动补充，若填写值不为“h”，系统将自动替换成“h”。

2、国家COUNTRY_A

非必填字段，最长3个字符。若填写，则其必须为“CHN”，若未填写，数据上传后系统会自动补充。

3、医院INSTITUT

非必填字段，为卫生部统一分配的标准代码，标准6字符，前两位为国家标准省级代码（如北京为11，福建为35等），后4位为各省编码（从0001开始），例如福建省立医院为350001，若未填写，数据上传后系统自动补充已注册的医院标准代码，若填写则必须与本院的代码一致，否则系统会自动替换为正确代码，在数据上传时此字段不建议填值。

4、实验室LABORATORY

非必填字段，最长3个字符。系统不再将此作为医院标识，无具体格式要求，只要不超长，系统均可接受。

5、病历号PATIENT_ID

对于门诊病历不要求必须填写，对于住院病历要求必须填写，并且填写总量至少占住院病历数据量的95%，否则会导致整个数据文件系统无法接收，该字段最长16个字符。

6、姓氏LAST_NAME、名字FIRST_NAME、姓名FULL_NAME

系统原则上要求FULL_NAME必填，如果未填写系统可根据

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LAST_NAME和FIRST_NAME自动推算FULL_NAME的值。因此请根据本院实际情况填写如上三个字段中的任意一个字段即可，如果考虑到本院病人隐私问题，可将病人姓名加密，只要不超长，系统依然可以正常接收。以上三个字段的长度要求分别为：LAST_NAME（30字）、FIRST_NAME（20字）、FULL_NAME（50字）。

7、性别SEX

此字段要求必填，最长1个字，WHONET要求只能填写“f”或者“m”，系统提供了相关的容错处理机制，允许填写“男”和“女”，系统会自动将“男”替换成“m”，将“女”替换成“f”。

8、年龄字段AGE

此字段要求必填，最长3个字符。

（1）不带任何后缀的1~3位整数或者2位数字+\后缀，代表年龄是按岁计算。

（2）2位数字 + \即代表年龄按天计算。 （3）2位数字 + \即代表年龄按周计算。 （4）2位数字 + \即代表年龄按月计算。

（5）空值或其它字符，系统会认为是非法值，需补充修改后才能上报。

9、年龄类别PAT_TYPE

非必填字段，系统会根据年龄AGE自动生成，即使是数据中已经填写了该值系统也会强制替换，因此，该字段可以不填，若要填写，长度必须为3位字符，且要符合系统的计算规则，具体计算规则如下：

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1) 当AGE后缀为“d”代表“天”时： A. <=28d，生成“new”代表“新生儿”； B. >28d，生成“ped”代表“儿童”； 2) 当AGE后缀为“w”代表“周”时： A. <=4w，生成“new”代表“新生儿”； B. >4w，生成“ped”代表“儿童”； 3) 当AGE后缀为“m”代表“月”时： A. 0m，系统无法识别，需修正后才能上报； A. >=1m，生成“ped”代表“儿童”； 4) 当AGE为纯数字，代表“岁”时：

B. 0或者0y，系统无法识别，需修正后才能上报；

C. >=1或者>=1y并且<=14或者<=14y，生成“ped”代表“儿童”； D. >=15或者>=15y并且<=65或者<=65y，生成“adu”代表“成人”； E. >65或者>65y，生成“ger”代表“老年”。 10、科室（送检科室）WARD

为必填项，最大长度为15字，中英文不限，此字段所填写的值应该对应为本院科室维护模块中所录入的信息，可以是本院科室代码也可以是本院科室名称，而填写的值不在本院科室列表中时，系统会认为该值为非法值，需要修改之后再上传。

11、科室类别WARD_TYPE

为非必填项，最大长度为3个字。如果不填写，系统不进行校验，如果填写，则必须与WHONET内置的代码要求一致，见附表1。

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12、专业类别DEPARTMENT

为100%必填项，最大长度为3个英文字符，此字段所填写的值，必须为系统所规定的标准专业类别代码，见附表2。未在该附表中的值为非法值，无法通过系统校验。系统提供了容错处理，可直接通过WARD字段自动推算此列的值。因此，此字段其实可以不填写。

13、标本类型英文代码SPEC_TYPE

本字段为必填项，最低校验通过率为100%，要求 100% 必填，不能为空白，否则将导致整个文件校验失败，系统拒绝接收！系统只接受WHONET标准【标本字典】中的英文代码，见附表3。

意外情况：如果本字段所填写值，与从【SPEC_CODE】字段所推算出来的值不匹配，则同样会导致整个文件校验失败，并且被系统拒绝接收，必须改正之后才可以重新上传，且不仅仅是影响单列通过率的问题！

例如：痰标本的英文代码为“sp”，数字代码应该对应为“3”，如果填写了其它数字代码，会导致整个文件校验失败，并且被系统拒绝接收，必须改正之后才可以重新上传！

14、数字代码SPEC_CODE

本字段为必填项，最低校验通过率为100%，要求 100% 必填，不能空，否则将导致整个文件校验失败，并且被系统拒绝接收！

校验规则如下：

系统只接WHONET标准【标本字典】中的数字代码，具体请参照或者下载《全国细菌耐药监测网信息系统数据上报标准》文档中的《附表3：SPEC_TYPE与SPEC_CODE对照字典》中的【SPEC_CODE】列。

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除此以外的值，均为非法值，如果有一项填写错误，将导致整个文件校验失败，并且被系统拒绝接收！

意外情况：

如果本字段所填写值，与从【SPEC_TYPE】字段所推算出来的值不匹配，则同样会导致整个文件校验失败，并且被系统拒绝接收，必须改正之后才可以重新上传！

例如：痰标本的英文代码为“sp”，数字代码应该对应为“3”，如果填写了其它数字代码，会导致整个文件校验失败，并且被系统拒绝接收，必须改正之后才可以重新上传！

容错处理：

如果本字段未填写值，则系统会自动从【SPEC_TYPE】字段推算出本列的值，并且会给出警告提示，这不影响通过率，但这会影响高质量数据占比。

15、关于标本字段的其它规则

如果标本代码的确没有在系统所给出的字典库中列中，可以将SPEC_TYPE填写为“ot”将SPEC_CODE填写为“89”，代表“其它”。如果出现了SPEC_TYPE与SPEC_CODE两者都填写了值，但两值并不匹配的情况，例如：痰标本的英文代码为“sp”，数字代码应该对应为“3”，如果填写了其它数字代码，系统会给出提示，要求修正不匹配的数据后再次上传。超出附表（3）内的标本类型系统视为非法值，需修正后才能上报数据。另外，当标本类型为质控标本（即SPEC_TYPE为qc并且SPEC_CODE为75或者SPEC_TYPE为ex并且SPEC_CODE为99）时系统会忽略这些数

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据，并给出提示并自动忽略该条数据。

14、标本编号SPEC_NUM字段 100%必填字段，最大长度30字。 15、检验结果（细菌）ORGANISM

100%必填字段，标准3位英文字符代码，此代码为WHONET 5.6标准细菌代码；注意！系统仅接收革兰阳性菌与革兰阴性菌，见附表（4），不接受真菌，支原体，厌氧菌和分枝杆菌等。当发现在附表（4）所规定的标准代码外的数据时，系统会给出提示并自动忽略该条数据。

16、细菌类别ORG_TYPE

系统仅接受革兰阳性菌“+”和革兰阴性菌代码“-”，最大允许1字符，此字段可不填写。当系统发现未填写时会自动根据ORGANISM字段的值推导出来，当系统发现本字段中填写的值与系统所推导的合法值不匹配的时候，会自动将其替换成合法值。

17、β-内酰胺酶BETA_LACT

非必填字段，1字符，且值仅能为“+”或“-”，若填写为“n”、“ne”、“neg”、“negative”或者中文全角“－”，系统会自动将其修正为半角英文“-”，若填写为“p”、“po”、“pos”、“positive”或者中文全角“＋”，系统会自动将其修正为半角英文“+”。

18、超广谱β-内酰胺酶ESBL 规则同上。

19、耐甲氧西林葡萄球菌检测试验MRSA_SCRN 规则同上。

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20、诱导型克林霉素耐药试验INDUC_CLI 规则同上。

21、霍奇试验HODGE 非必需字段，规则同上。 22、碳青酶烯酶CARBAPENEM 规则同上。

23、送检日期（标本日期）SPEC_DATE 本字段为必填项，最低校验通过率为100%！

系统只接收特定的日期格式，例如2014年11月5日可以有如的表示方式：

20141105（长度必须为8位） 2014 11 05或者2014 11 5 2014-11-05或者2014-11-5 2014/11/05或者2014/11/5

2014年11月05日或者2014年11月5日 Nov 05 2014，其中Nov为英文的11月简写 Nov-05-2014，其中Nov为英文的11月简写 Nov/05/2014，其中Nov为英文的11月简写 05 Nov 2014，其中Nov为英文的11月简写 05-Nov-2014，其中Nov为英文的11月简写 05/Nov/2014，其中Nov为英文的11月简写 2014 05 Nov，其中Nov为英文的11月简写

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2014-05-Nov，其中Nov为英文的11月简写 2014/05/Nov，其中Nov为英文的11月简写 2014 Nov 05，其中Nov为英文的11月简写 2014-Nov-05，其中Nov为英文的11月简写 2014/Nov/05，其中Nov为英文的11月简写 错误的日期格式举例：

2014115中间没有任何分隔符，并且长度不为 8 位，系统将无法识别。

英文月份的简写请参照下表： 月份 1 2 3 4 5 6

24、报告日期（数据录入日期）DATE_DATA 为非必填字段，规则同上。 25、抗生素

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英文代码 Jan Feb Mar Apr May Jun 月份 7 8 9 10 11 12 英文代码 Jul Aug Sep Oct Nov Dec 所有抗生素代码采用Whonet 5.6标准代码。抗生素代码见附表（5）。 纸片法（K-b法）：

填写结果只能为6至80之间的整数，否则视为填写错误，系统会将该值忽略，这会影响该列的通过率。对应的字段名应为：抗生素英文代码+“_ND”+抗生素含量，例如：AMK_ND30、AMX_ND25。切记：不能为（S、I、R）、不能有小数、不能带任何符号（.><=等等）。

MIC法：

对于除高浓度庆大霉素和高浓度链霉素以外的MIC法字段，系统要求只能为小数或者1、2、4、8、16、32、64、128、256、512，不在这些数字范围内的，均为非法值。可以有前导【>、<、=】符号。合法情况举例：等于纯整数数字或者小数数字：4、4.0；大于或者大于等于上述两类数字：>4、>=4、>4.0、>=4.0；小于或者小于等于上述两类数字：<4、<=4、<4.0、<=4.0；对应的字段名应为：抗生素英文代码+“_NM”；例如：AMK_NM、AMX_NM；切记：不能为（S、I、R）不能为非2的平方数如6、7、99、100等等。

MIC法特殊字段-【GEH_NM】高浓度庆大霉素的填写规则： 以下特殊规则将直接替代普通MIC法的校验规则，具体如下： 1、仅允许出现如下值：250，256，500，512，513，1000，1024，1025，不在这些数字范围内的，均为非法值，影响通过率。 2、可以有前导【>、<、=】符号

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3、如果填写了【SYN-S】，系统将自动替换为【<=500】 4、如果填写了【SYN-R】，则将自动替换为【>=1000】

MIC法特殊字段-【STH_NM】，高浓度链霉素的填写规则： 以下特殊规则直接替代普通MIC法的校验规则，具体如下：

1、仅允许出现如下值：500，512，1000，1024，2000，2048，2049，不在这些数字范围内的，均视为非法值 2、可以有前导【>、<、=】符号

3、如果填写了【SYN-S】，系统将自动替换为【<=1000】 4、如果填写了【SYN-R】则将自动替换为【>=2000】

MIC法特殊字段-【SXT_NM】复方新诺明的填写规则：

该结果上传后系统自动将数据为320的字符替换为16，160替换为8，80替换4，40替换为2，20替换为1，10替换为0.5，其余字符保持原始数据。

A. 系统会将数据中出现的一些特殊字符替换为合法字符，具体如下： a) 全角“≧”或“≥” 将替换为半角“>=” b) 全角“≦”、“≤” 将替换为半角“<=” c) 全角“＞”将替换为半角“>” d) 全角“＜”将替换为半角“<” e) 全角“＝”将替换为半角“=” f) 全角“．”与“。”将替换为半角“.”

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在数据中若出现未在附表（5）中的其它抗生素字段，系统会自动忽略该字段的数据，不予保存。

本系统目前抗菌药物敏感性执行标准为CLSI M100-S23，上传数据如果有未达到该折点标准的数据，系统会将该组数据中的未达到CLSI M100-S23标准的抗生素结果忽略。如某一抗生素，CLSI M100-S23折点为S:<=2，I:4-8，R:>=16，测定结果为<=8，这样的数据系统无法判断是敏感还是中介，系统在统计的时候会自动将该组数据中的这个抗生素结果给忽略掉，不予统计。

2014新版细菌耐药监测信息系统具备了强大的数据容错处理功能，能将上传的不合格数据自动修正或删除，处理为合格的数据文件，同时具备一定的学习功能，用户可以下载经容错处理后的数据发现并纠正错误，不断改进，提高数据质量，同时可将修正后数据用于本机构细菌耐药监测统计分析。

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附表1：

WARD_TYPE 字典

代码 含义 out 门诊病人 in 住院病人 inx 住院病人（非-ICD） icu 重症监护病房 int 过度监护病房 eme 急诊 nur 家庭护理 com 社区 hos 其它医院 lab 实验室 aba Abattoir（屠宰场） vet Veterinary clinic（兽医诊所） far Farm（农场） fie Field（野外） sto Store/Market（商店/超市） res Restaurant（饭店） zoo Zoo（动物园） mix 混合 unk 未知（不明来源） oth 其他

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附表2：

系统内置标准科室分类字典

代码 neu car res dis end hem nep ger rhe med oim sur ort urs ces cas bus nes vas ots 名称 神经内科 心内科 呼吸内科 消化内科 内分泌内科 血液内科 肾脏内科 老年病内科 风湿免疫科 (大)内科 其它内科 外科 骨科 泌尿外科 胸外科 心脏外科 整形烧伤外科 神经外科 介入血管外科 其它外科 代码 obg ped pes neo oph oto sto der inf chi rad onc eme out icu rcu ccu ecu reh oth 名称 妇产科 儿科 小儿外科 新生儿科 眼科 耳鼻咽喉科 口腔科 皮肤性病科 感染疾病科 中医科 放射治疗科 肿瘤科 急诊科 门诊科 重症医学科 呼吸监护室 心脏监护室 急诊监护室 康复医学科 其它

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附表3：

SPEC_TYPE与SPEC_CODE对照字典

名 称 鼻腔拭子 咽拭子 痰 支气管分泌物 耳部标本 眼分泌物 口腔拭子 皮肤拭子 关节拭子 导尿管尿 尿液 血液 脑脊液 肺穿刺液 腹水 胃液 排泄物 液体 胆汁 伤口拭子 外科手术伤口拭子 脓肿 脓液 羊水 气管插管 窦道拭子 棉签 吸气管 无菌体液 器官 宫颈拭子 脐带标本 阴道拭子 活检组织 组织 脑部组织 心脏标本 心脏瓣膜 肝脏穿刺液 粪便 直肠拭子 肌肉标本 手部拭子 手臂拭子 腋窝拭子 结膜拭子 中耳拭子 外耳拭子 瘘管 生殖器拭子 男性外生殖器拭子 女性外生殖器拭子 胎盘组织 乳房穿刺液 乳汁 SPEC_CODE数字代码 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 SPEC_TYPE英文代码 no th sp br ea ey mo sk jt uc ur bl sf lu ab ga dr fl bi wd sw as ps am tr si sb at fn og cx um va bx ti bn he hv li st re mu ha ar ax co em eo fi gn gm gf pl bt mi 名 称 水 食物 不明标本 质控 头发 指甲 鼻咽拭子 足拭子 尸检标本 异物 胎粪 子宫内避孕器 前段尿 脐部拭子 隔离标本 腹部脓肿 烧伤标本 永久导管 角膜标本 脓胸 胸膜脓肿 硬膜下脓肿 人工心脏瓣膜 小支气管肺泡灌洗液 起博器 胰腺标本 心包积液 导管尖端 人工骨 人工分流管 人工血管 保护性导管刷 扁桃体穿刺液 褥疮溃疡 非导管尿 肾穿刺尿 未知来源尿 扁桃体脓肿 牙龈脓肿 肛周脓肿 皮肤脓肿 阑尾 外周导管 培养基 前庭大腺囊肿 引流液 心内膜 附睾标本 会厌拭子 食管拭子 输卵管 疖 胆囊标本 髋关节标本 髋关节液 SPEC_CODE 数字代码 96 97 98 99 100 101 102 103 104 105 106 107 108 109 110 111 112 113 114 115 116 117 118 119 120 121 122 123 124 125 126 127 128 129 130 131 132 133 134 135 136 137 138 140 141 142 143 144 145 146 147 148 149 150 151 SPEC_TYPE 英文代码 wa fo un qc hr nl np ft au fb mc iu fv us is ad bs cp cr ee ep es hp mb pm pn pd cs pb sh pv pc tn ud uz uo uu pt de ac ak ap ch cm cb dn ec ed eg eh fa fu gb hi hf 15

lem 勒米诺菌属(Leminorella sp.) pr- 变形杆菌属(Proteus sp.) prv 普罗威登斯菌属(Providencia sp.) bcx Burkholderia cepacia complex gc2 Salmonella Group C2 (O:6,8) ros 玫瑰单胞菌属(Roseomonas sp.) ber 伯杰菌属(Bergeyella sp.) flu 荧光杆菌属(Fluoribacter sp.) tat 塔特姆菌属(Tatumella sp.) yer 耶尔森菌属(Yersinia sp.) yok 科泽菌属(Koserella sp.) yok 预研菌属(Yokenella sp.) ery 丹毒丝菌属(Erysipelothrix sp.) lit 利斯顿菌属(Listonella sp.) phb 发光杆菌属(Photobacterium sp.) flv 黄单胞菌属(Flavimonas sp.) fra 弗郎西斯菌属(Francisella sp.) gar 加德纳菌属(Gardnerella sp.) kin 金菌属(Kingella sp.) koc 考克菌属(Kocuria sp.) lat 乳球菌属(Lactococcus sp.) leu 明串珠菌属(Leuconostoc sp.) lis 李斯特菌属(Listeria sp.) mo- 布兰汉菌属(Branhamella sp.) mo- 莫拉菌属(Moraxella sp.) ne- 奈瑟菌属(Neisseria sp.) nod 拟诺卡菌属(Nocardiopsis sp.) oli 寡源杆菌属(Oligella sp.) pas 巴斯德菌属(Pasteurella sp.) ple 邻单胞菌属(Plesiomonas sp.) psy 嗜冷杆菌属(Psychrobacter sp.) rhd 红酵母属(Rhodococcus sp.) sim 西蒙斯菌属(Simonsiella sp.) spb 鞘氨醇杆菌属(Sphingobacterium sp.) stp 链霉菌属(Streptomyces sp.) tay 泰勒菌属(Taylorella sp.) vi- 弧菌属(Vibrio sp.) wee 威克斯菌属(Weeksella sp.) xan 黄单胞菌属(Xanthomonas sp.) ren 肾杆菌属(Renibacterium sp.) aub 金杆菌属(Aureobacterium sp.) exi 微小杆菌属(Exiguobacterium sp.) cel 纤维单胞菌属(Cellulomonas sp.)

- - - - - - - - - - - - + - - - - + - + + + + - - - + - - - - + - - + - - - - + + + + 21

cel 厄氏菌属(Oerskovia sp.) arc 弓形菌属(Arcobacter sp.) cox 考克斯体属(Coxiella sp.) bar 巴尔通体属(Bartonella sp.) ehr 埃里希体属(Ehrlichia sp.) chl 衣原体属(Chlamydia sp.) ori 东方体属(Orientia sp.) aun 脲气球菌(Aerococcus urinae) lps 假肠膜明串珠菌(Leuconostoc pseudomesenteroides) pai 乳酸片球菌(Pediococcus acidilactici) pdn 有害片球菌(Pediococcus damnosus) pdx 糊精片球菌(Pediococcus dextrinicus) ppv 小片球菌(Pediococcus parvulus) ppo 戊糖片球菌(Pediococcus pentosaceus) map Streptococcus, microaerophilic cao 拥挤棒杆菌(Corynebacterium accolens) cf1 CDC Coryneform Group F-1 cg2 CDC Coryneform Group G-2 ci1 CDC Coryneform Group I-1 ce3 西地西菌 3(Cedecea sp. 3) ce5 西地西菌 5(Cedecea sp. 5) mmo 摩根摩根菌(Morganella morganii) mmo 摩根摩根菌摩根亚种(Morganella morganii ss. morganii) msb 摩根摩根菌塞氏亚种(Morganella morganii ss. sibonii) trb 特拉布尔斯菌属(Trabulsiella sp.) tgu CDC Enteric Group 90 tgu Trabulsiella guamensis (CDC Enteric Group 90 atr 肠棕气单胞菌(Aeromonas trota) ply 淋巴管巴斯德菌(Pasteurella lymphangitidis) nfr 非发酵革兰阴性杆菌(Non-fermenting gram negative rods) spa CDC IIk-1 spa 少动鞘氨醇单胞菌(Pseudomonas paucimobilis) spa 少动鞘氨醇单胞菌(Sphingomonas paucimobilis) bba 杆状巴尔通体(Bartonella bacilliformis) ead 大肠埃希菌(产碱殊异株)（Escherichia coli (alkalescens-dispar)) vx1 非O1,非O139群霍乱弧菌(Vibrio cholerae non O1, non O139) vhi 霍乱弧菌O1群彦岛型(Vibrio cholerae O1 Hikojima) vin 霍乱弧菌O1群稻叶型(Vibrio cholerae O1 Inaba) gc4 Salmonella Group C4 (O:7,14) ge2 Salmonella Group E2 (O:3,15) ge3 Salmonella Group E3 (O:3,15,14) dpi 懒惰狡诈颗粒菌(Dolosigranulum pigrum) dol 狡诈颗粒菌(Dolosigranulum sp.)

+ - - - - - - + + + + + + + + + + + + - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - + + 22

cmc CDC Coryneform Group G-1 cmc 麦金利棒杆菌(Corynebacterium macginleyi) sga 沙门菌鸡血清型(Salmonella Gallinarum) sga 沙门菌鸡白痢血清型(Salmonella Pullorum) svc 鼠伤寒沙门菌哥本哈根变种(Salmonella Typhimurium var. Copenhagen) mor 摩根菌属(Morganella sp.) g64 Salmonella Group 64 (O:64) sal 沙门菌属(Salmonella sp.) sro 沙门菌属(粗糙型)（Salmonella sp. (rough)) sno 沙门菌，未分型(Salmonella, nontypable) snt Salmonella, non-Typhi xtp Salmonella, non-Typhi/non-Paratyphi bcs 芽胞杆菌属(Bacillus sp.) chd Chlamydophila sp. abi 乏养菌属(Abiotrophia sp.) pdm CDC EF-5 pdm 美人鱼发光杆菌美人鱼亚种(Listonella damsela) pdm 美人鱼发光杆菌美人鱼亚种(Photobacterium damsela ss. damsela) pdm 美人鱼发光杆菌美人鱼亚种(Vibrio damsela) alo 差异球菌属(Alloiococcus sp.) aoi 耳炎差异球菌(Alloiococcus otitidis) so1 气味沙雷菌1(Serratia odorifera 1) ari 亚利桑那菌属(Arizona sp.) ari 亚利桑那菌属(Salmonella enterica ss. arizonae (Subgroup I)) ari Salmonella subgroup 3a g61 Salmonella Group 61 (O:61) g63 Salmonella Group 63 (O:63) sht Salmonella enterica ss. houtenae (Subgroup I sht Salmonella subgroup 4 sbg 沙门菌乍得血清型(Salmonella bongori) sbg Salmonella subgroup 5 sdi Salmonella enterica ss. diarizonae (Subgroup sdi Salmonella subgroup 3b ssl Salmonella enterica ss. salamae (Subgroup II ssl Salmonella subgroup 2 sec Salmonella enterica ss. enterica (Subgroup I sec Salmonella subgroup 1 gro Salmonella Group O (O:35) sii 肠炎沙门菌印度亚种(Salmonella enterica ss. indica (Subgoup VI)) sii Salmonella subgroup 6 b16 鲍氏志贺菌血清16型(Shigella boydii serotype 16) b17 鲍氏志贺菌血清17型(Shigella boydii serotype 17) b18 鲍氏志贺菌血清18型(Shigella boydii serotype 18)

+ + - - - - - - - - - - + - + - - - - + + - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 23

d11 痢疾志贺菌血清11型(Shigella dysenteriae serotype 11) d12 痢疾志贺菌血清12型(Shigella dysenteriae serotype 12) d14 痢疾志贺菌血清14型(Shigella dysenteriae serotype 14) d13 痢疾志贺菌血清13型(Shigella dysenteriae serotype 13) f4c 福氏志贺菌4c血清型(Shigella flexneri serotype 4c) f5a 福氏志贺菌5a血清型(Shigella flexneri serotype 5a) eep 肠致病型大肠埃希菌(Escherichia coli, enteropathogenic (EPEC)) 149 大肠埃希菌O149(Escherichia coli O149) of4 大肠埃希菌O149:F4(Escherichia coli O149:F4) eeh 肠出血型大肠埃希菌(Escherichia coli, enterohemorrhagic (EHEC)) 103 大肠埃希菌O103(Escherichia coli O103) 145 大肠埃希菌O145(Escherichia coli O145) ant 固氮弓形菌(Arcobacter nitrofigilis) ade 反硝化无色杆菌(Achromobacter xylosoxidans ss. denitrifican) ade 反硝化无色杆菌(Alcaligenes xylosoxidans ss. denitrificans) ade CDC Vc axy 木糖氧化无色杆菌(Alcaligenes xylosoxidans) axy 木糖氧化无色杆菌木糖氧化亚种(Alcaligenes xylosoxidans ss. xylosoxidans) - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - + + + + + + - - - + + + + + - - 24

axy CDC IIIa axy CDC IIIb ach 无色杆菌属(Achromobacter sp.) c58 CDC Enteric Group 58 eo3 CDC EO-3 cac 食酸代尔夫特菌(Comamonas acidovorans) cac 食酸代尔夫特菌(Delftia acidovorans) cac 食酸代尔夫特菌(Pseudomonas acidovorans) aus 耳棒杆菌(Corynebacterium auris) cgy 解葡萄糖苷棒杆菌(Corynebacterium glucuronolyticum) dho CDC Coryneform Group 3 dho CDC Coryneform Group 5 dho 人皮杆菌(Dermabacter hominis) der 皮杆菌属(Dermabacter sp.) bdo Burkholderia dolosa (genomovar VI) bub Burkholderia ubonensis (genomovar X) bvt Burkholderia vietnamiensis (genomovar V) gsa Globicatella sanguinis gsa 血液球链菌(Globicatella sanguis) glo 球链菌属(Globicatella sp.) mcc 巨型球菌属(Macrococcus sp.) mba 树状微杆菌(Microbacterium arborescens) nfv 微黄奈瑟菌黄色生物变种(Neisseria subflava biovar flava) npe 微黄奈瑟菌深黄生物变种(Neisseria subflava biovar perflava)

nsb 微黄奈瑟菌浅黄生物变种(Neisseria subflava biovar subflava) vog 霍乱弧菌O1群小川型(Vibrio cholerae O1 Ogawa) eo2 CDC EO-2 reu 杀虫嗜铜菌(Ralstonia euphora) atu 放射杆菌根瘤菌(Agrobacterium radiobacter) atu 放射杆菌根瘤菌(Agrobacterium tumefaciens (radiobacter)) atu CDC Vd-3 atu 放射杆菌根瘤菌(Rhizobium radiobacter) rzo 根瘤菌属(Rhizobium sp.) ro5 玫瑰单胞菌基因种5(Roseomonas genomospecies 5) rot 罗氏菌属(Rothia sp.) tur 苏黎士菌属(Turicella sp.) tot 耳炎苏黎士菌(Turicella otitidis) kte 土生拉乌尔菌(Klebsiella terrigena) kte 土生拉乌尔菌(Raoultella terrigena) kpl 植生拉乌尔菌(Klebsiella planticola (trevisanii)) kpl 植生拉乌尔菌(Klebsiella trevisanii) kpl 植生拉乌尔菌(Raoultella planticola) bam Burkholderia ambifaria (genomovar VII) scl Macrococcus caseolyticus scl 解酪蛋白巨大球菌(Staphylococcus caseolyticus) btb Burkholderia stabilis (genomovar IV) gai 爱知戈登菌(Gordona aichiensis) kor 克雷伯菌肠道菌群47型(Klebsiella Enteric Group 47) kor 解鸟氨酸拉乌尔菌(Klebsiella ornithinolytica) kor 解鸟氨酸拉乌尔菌(Raoultella ornitholytica) egv 浅黄肠球菌(Enterococcus gilvus) bnc Burkholderia cenocepacia (genomovar III) epa 苍白肠球菌(Enterococcus pallens) cgr 肉芽肿鞘杆菌(Calymmatobacterium granulomatis) cgr Klebsiella granulomatis (Lympho. granul.) cgr Lymphogranuloma venereum rao 拉乌尔菌属(Raoultella sp.) crg 银色棒杆菌(Corynebacterium argentoratense) cpc 粪球菌属(Coprococcus sp.) bah Burkholderia anthina (genomovar VIII) sbt Salmonella subterranea gne 革兰阴性肠道菌(Gram negative enteric organism) svi 草绿色链球菌,α-溶血(Streptococcus viridans, alpha-hem.) ped 片球菌属(Pediococcus sp.) stb 链杆菌属(Streptobacillus sp.) sbo 牛链球菌(Streptococcus bovis) sb1 牛链球菌I型(Streptococcus bovis I)

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sb2 牛链球菌II型(Streptococcus bovis II) sbv 牛变种链球菌(Streptococcus bovis-variant) sgy 解没食子酸链球菌(Streptococcus gallolyticus ss. gallolyticus) pec 溶果胶杆菌属(Pectobacterium sp.) evi 豕肠球菌(Enterococcus porcinus) evi Enterococcus villorum ean 驴肠球菌(Enterococcus asini) asb 温和气单胞菌(Aeromonas veronii biovar sobria) fme CDC IIa fme 脑膜败血伊丽莎白金菌(Chryseobacterium meningosepticum) fme 脑膜败血伊丽莎白金菌(Elizabethkingia meningosepticum) fme 脑膜败血伊丽莎白金菌(Flavobacterium meningosepticum) avv 维龙气单胞菌(Aeromonas veronii biovar veronii) alm 交替单胞菌属(Alteromonas sp.) gte 土戈登菌(Gordona terrae) elz Elizabethkingia sp. moi 被孢霉属(Moritella sp.) mvi Moritella viscosa moi 黏性弧菌(Vibrio viscosis) lan 鳗利斯顿菌(Listonella anguillarum) smg Rothia mucilaginosus smg 粘滑口腔球菌(Stomatococcus mucilaginosus) c4c CDC IVc c4c Ralstonia paucula bro 索丝菌属(Brochothrix sp.) hit Histophilus sp. clv 棍状杆菌属(Clavibacter sp.) cay 显核菌属(Caryophanon sp.) hso 睡眠嗜血杆菌(Haemophilus somnus) hso Histophilus somni cmg 密歇根棍状杆菌密歇根亚种(Clavibacter michiganense ss. michiganense) cmg 密歇根棍状杆菌密歇根亚种(Corynebacterium michiganense) def Delftia sp. sgu 副血链球菌(Streptococcus parasanguinis) spu Streptococcus pasteurianus c60 CDC Enteric Group 60 c63 CDC Enteric Group 63 c64 CDC Enteric Group 64 c68 CDC Enteric Group 68 c69 CDC Enteric Group 69 smu 变异链球菌(Streptococcus mutans) ajo 约氏不动杆菌(Acinetobacter johnsonii) lok 橡树岭军团菌(Legionella oakridgensis)

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sfi 无花果沙雷菌(Serratia ficaria) pst 斯氏普罗威登斯菌(Providencia stuartii) psu 尿素阳性斯氏普罗威登斯菌(Providencia stuartii urea +) tpt CDC EF-9 tpt 痰塔特姆菌(Tatumella ptyseos) pga Pasteurella gallicida pga 多杀巴斯德菌鸡杀亚种(Pasteurella multocida ss. gallicida) aur 脲放线杆菌(Actinobacillus ureae) aur 脲放线杆菌(Pasteurella ureae) cop 哥本哈根沙门菌(Salmonella Copenhagen) slo 沙门菌伦敦血清型(Salmonella London) cle 拉氏西地西菌(Cedecea lapagei) ent 肠球菌属(Enterococcus sp.) pau 沙门菌圣保罗血清型(Salmonella Saintpaul) bln 迟缓芽胞杆菌(Bacillus lentus) lir 以色列军团菌(Legionella israelensis) pts 龟巴斯德菌(Pasteurella testudinis) bre 短杆菌属(Brevibacterium sp.) bre CDC Coryneform Group B-1 bre CDC Coryneform Group B-3 boc 黄褐二氧化碳嗜纤维菌(Bacteroides ochraceus) boc 黄褐二氧化碳嗜纤维菌(Capnocytophaga ochracea) eho 保科爱德华菌(Edwardsiella hoshinae) shd 宋内志贺菌(Shigella sonnei) s01 I型宋内志贺菌(Shigella sonnei Form I) s02 II型宋内志贺菌(Shigella sonnei Form II) thm 沙门菌汤普逊血清型(Salmonella Thompson) bpe 百日咳鲍特菌(Bordetella pertussis) egg 日沟维肠杆菌(Enterobacter gergoviae) hes 切斯特沙门菌(Salmonella Chester) sat 伤寒沙门菌血清型(Salmonella Typhi) cdt 白喉棒杆菌(Corynebacterium diphtheriae) cdp 棒杆菌属(类白喉)（Corynebacterium sp. (diphtheroids)) cdp 类白喉菌(Diphtheroids) svr 沙门菌韦尔肖血清型(Salmonella Virchow) cfr 弗劳地柠檬酸杆菌(Citrobacter freundii) g56 Salmonella Group 56 (O:56) vfu 弗尼斯弧菌(Vibrio furnissii) bvc 乳酪短杆菌(Brevibacterium casei) hse 惰性凝聚杆菌(Haemophilus segnis) spg 巴拉圭链霉菌(Streptomyces paraguayensis) vho CDC EF-13 vho CDC Enteric Group 42

- - - - - - - - - - - - + - + - - + + + - - - - - - - - - - - + + + - - - - + - + - - 27

vho 霍利斯格利蒙菌(Vibrio hollisae) cho 人心杆菌(Cardiobacterium hominis) cho CDC IId lau Legionella interrogans serovar autumnalis lba Legionella interrogans serovar ballum lbt Legionella interrogans serovar bataviae lcc Legionella interrogans serovar canicola lgp Legionella interrogans serovar grippotyphosa lic Legionella interrogans serovar icterohaemorr aan 无硝不动杆菌(Acinetobacter anitratus) ac- 不动杆菌属(Acinetobacter sp.) pcn 犬巴斯德菌(Pasteurella canis) acy 嗜低温弓形菌(Arcobacter cryaerophilus) sui 猪链球菌(Streptococcus suis) sba 巴雷利沙门菌(Salmonella Bareilly) sgl 鸡葡萄球菌(Staphylococcus gallinarum) lwa 沃斯沃军团菌(Legionella wadsworthii) ske 肯塔基沙门菌(Salmonella Kentucky) pot Salmonella Potsdam gm+ 革兰阳性菌(Gram positive bacteria) chy 豚肠弯曲菌(Campylobacter hyointestinalis) ave 维龙气单胞菌(Aeromonas veronii) swd Salmonella Wandsworth smb 姆班达卡沙门菌(Salmonella Mbandaka) scu 肉葡萄球菌(Staphylococcus carnosus) spn 肺炎链球菌(Streptococcus pneumoniae) raq 水生拉恩菌(Rahnella aquatilis) sfr 野鼠链球菌(Streptococcus ferus) ema 病臭肠球菌(Enterococcus malodoratus) yin 中间耶尔森菌(Yersinia intermedia) hmu 红嘴欧螺杆菌(Helicobacter mustelae) sod 气味沙雷菌(Serratia odorifera) bbr 支气管炎鲍特菌(Bordetella bronchiseptica) bbr CDC IVa srt 鼠链球菌(Streptococcus rattus) ssm 索马里链霉菌(Streptomyces somaliensis) cvi 紫色色杆菌(Chromobacterium violaceum) oul CDC IVe oul 解脲寡源杆菌(Oligella ureolytica) vip 副溶血弧菌(Vibrio parahaemolyticus) vmi 拟态弧菌(Vibrio mimicus) cpd 假白喉棒杆菌(Corynebacterium pseudodiphtheriticum) sub 乳房链球菌(Streptococcus uberis)

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bfi 坚实芽胞杆菌(Bacillus firmus) aju 琼氏不动杆菌(Acinetobacter junii) lst 斯太格尔沃特军团菌(Legionella steigerwaltii) psp 多杀巴斯德菌败血亚种(Pasteurella multocida ss. septica) psp 败血巴斯德菌(Pasteurella septica) ecl 阴沟肠杆菌(Enterobacter cloacae) cpt 鹦鹉热嗜衣原体(Chlamydia psittaci) cpt 鹦鹉热嗜衣原体(Chlamydophila psittaci) nda 达松威尔拟诺卡菌(Nocardiopsis dassonvillei) g58 Salmonella Group 58 (O:58) smf 念珠状链杆菌(Streptobacillus moniliformis) bpm 短小芽胞杆菌(Bacillus pumilus) gol Salmonella Goldcoast sbn 沙门菌勃兰登堡血清型(Salmonella Brandenburg) g53 Salmonella Group 53 (O:53) ppg 穿孔素假单胞菌(Pseudomonas pertucinogena) lru 红光军团菌(Legionella rubrilucens) krn 肺炎克雷伯菌鼻硬结亚种(Klebsiella pneumoniae ss. rhinoscleromatis) krn 鼻硬结克雷伯菌(Klebsiella rhinoscleromatis) nme 脑膜炎奈瑟菌(Neisseria meningitidis) lom 罗米他沙门菌(Salmonella Lomita) rri 立氏立克次体(Rickettsia rickettsii) sse 沙门菌山夫登堡血清型(Salmonella Senftenberg) laa 不同军团菌(Legionella anisa) kpn 肺炎克雷伯菌(Klebsiella pneumoniae) kpn 肺炎克雷伯菌肺炎亚种(Klebsiella pneumoniae ss. pneumoniae) c2c CDC IIc c2e CDC IIe c2h CDC IIh c2i CDC IIi c2c 黄杆菌IIc生物群(Flavobacterium group IIc) c2e 黄杆菌IIe生物群(Flavobacterium group IIe) c2h 黄杆菌IIh生物群(Flavobacterium group IIh) c2i 黄杆菌IIi生物群(Flavobacterium group IIi) ear 美洲爱文菌(Ewingella americana) prg 雷特格普罗威登斯菌(Providencia rustigianii) mbv 牛莫拉菌(Moraxella bovis) hne 幽门螺杆菌(Helicobacter nemestrinae) shy 猪葡萄球菌(Staphylococcus hyicus) sol 口腔链球菌(Streptococcus oralis) smh 曼哈顿沙门菌(Salmonella Manhattan) ban 炭疽芽胞杆菌(Bacillus anthracis) sgm 非溶血链球菌(Streptococcus, non-haemolytic (gamma))

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cbt 伯氏考克斯体(立克次体)（Coxiella burnetii) lbi 伯明翰军团菌(Legionella birminghamensis) sfa 法尔肯泽沙门菌(Salmonella Falkensee) slq 液化沙雷菌(Serratia liquefaciens) fmd 土拉热弗郎西斯菌中亚细亚亚种(Francisella tularensis ss. mediasiatica) bab 马耳他布鲁菌(Brucella abortus (melitensis)) bca 卡他莫拉菌(Branhamella catarrhalis) bca 卡他摩拉菌(Moraxella (Branh.) catarrhalis) swo 沃信顿沙门菌(Salmonella Worthington) vel 霍乱弧菌埃尔托生物型(Vibrio cholerae El Tor) afa 粪产碱菌粪亚种(Alcaligenes faecalis (odorans)) afa 香味类香味菌(Alcaligenes odorans) afa CDC VI bsr 嗜热脂肪酸土杆菌(Bacillus stearothermophilus) sto 口腔球菌属(Stomatococcus sp.) bpa 副百日咳鲍特菌(Bordetella parapertussis) bpa CDC IVb cxe 干燥棒杆菌(Corynebacterium xerosis) aeq 马驹放线杆菌马驹亚种(Actinobacillus equuli) grf Salmonella Group F (O:11) ehs 腺热埃里希体(Ehrlichia sennetsu) lga 加维乳球菌(Lactococcus garvieae) hag 埃及嗜血杆菌(Haemophilus aegyptius) ler 艾里塔拉军团菌(Legionella erythra) seq 马葡萄球菌马亚种(Staphylococcus equorum) vme CDC Enteric Group 16 vme 梅奇尼克夫弧菌(Vibrio metschnikovii) rpw 普氏立克次体(Rickettsia prowazekii) spl 普城沙雷菌(Serratia plymuthica) hci Clo-1 hci 同性恋螺杆菌(Helicobacter cinaedi (CLO-1)) enp 超压肠杆菌(Enterobacter nimipressuralis) nas 星状诺卡菌(Nocardia asteroides) asa 杀鲑气单胞菌(Aeromonas salmonicida) rak 螨立克次体(Rickettsia akari) cda CDC Enteric Group 15 cda 戴维斯西地西菌(Cedecea davisae) eca 铅黄肠球菌(Enterococcus casseliflavus) ppl 类产碱假单胞菌(Pseudomonas pseudoalcaligenes) sac Salmonella Hirschfeldii (S. Paratyphi C) sac 丙型副伤寒沙门菌(Salmonella Paratyphi C) kcr 栖冷克吕沃菌(Kluyvera cryocrescens) soi 奥里翁沙门菌(Salmonella Orion)

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rco 斑疹热立克次体(Rickettsia conorii) sxy 木糖葡萄球菌(Staphylococcus xylosus) eas CDC Enteric Group 17 eas 阿氏肠杆菌(Enterobacter asburiae) sma 粘质沙雷菌(Serratia marcescens) squ 马链球菌(Streptococcus equi) squ 马链球菌马亚种(Streptococcus equi ss. equi) bmy 蕈状芽胞杆菌(Bacillus mycoides) clt CDC Ve-1 clt 浅黄假单胞菌(Chryseomonas luteola) clt 浅黄假单胞菌(Pseudomonas luteola) sgc 无乳链球菌(Streptococcus agalactiae) sly 非解乳链球菌(Streptococcus alactolyticus) sit 中间葡萄球菌(Staphylococcus intermedius) scc 大鼠链球菌(Streptococcus cricetus) vca 哈维弧菌(Vibrio carchariae) hap 副嗜沫凝聚杆菌(Haemophilus paraphrophilus) lcr 肠膜明串珠菌乳脂亚种(Leuconostoc cremoris) lcr 肠膜明串珠菌乳脂亚种(Leuconostoc mesenteroides ss. cremoris) ein 中间肠杆菌(Enterobacter intermedius) sbr 沙门菌布灵得卢柏血清型(Salmonella Braenderup) rde 龋齿罗氏菌(Rothia dentocariosa) ngl 长奈瑟菌解糖亚种(Neisseria elongata ss. glycolytica) lmo 产单核细胞李斯特菌(Listeria monocytogenes) mpp CDC M-2 mpo 多态莫拉菌(Moraxella mima polymorpha (var. oxidans)) mpp 苯丙酮酸摩拉菌(Moraxella phenylpyruvica) mut 尿道莫拉菌(Moraxella urethralis) vci 辛辛那提弧菌(Vibrio cincinnatiensis) drb 德比沙门菌(Salmonella Derby) mwi CDC Enteric Group 46 mwi 威斯康星米勒菌(Moellerella wisconsensis) sla 沙门菌鸭血清型(Salmonella Anatum) nno 新形诺卡菌(Nocardia nova) bse E群β-溶血链球菌(Streptococcus, beta-haem. Group E) emn 蒙氏肠球菌(Enterococcus mundtii) bcn 马耳他布鲁菌(Brucella canis (melitensis)) lpa 巴黎军团菌(Legionella parisiensis) lla 乳酸乳球菌(Lactococcus lactis) lla 乳酸乳球菌乳亚种(Lactococcus lactis ss. lactis) lla 乳酸乳球菌乳酸亚种(Streptococcus lactis) psh 类志贺邻单胞菌(Plesiomonas shigelloides) ams 阿姆斯特丹沙门菌(Salmonella Amsterdam)

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ece 大仙人掌欧文菌(Erwinia carnegieana) ect 胡萝卜软腐病解果胶杆菌胡萝卜软腐亚种(Erwinia carotovora) pfl 荧光假单胞菌(Pseudomonas fluorescens) sko 科特布斯沙门菌(Salmonella Kottbus) ljr 约旦军团菌(Legionella jordanis) slx 列克星敦沙门菌(Salmonella Lexington) ssa 唾液链球菌(Streptococcus salivarius) spm 沙门菌巴拿马血清型(Salmonella Panama) sur 头状葡萄球菌解脲亚种(Staphylococcus capitis ss. ureolyticus) apk 类化脓隐秘杆菌(Actinomyces pyogenes-like bacteria) cco 大肠弯曲菌(Campylobacter coli) heq 马生殖器泰勒菌(Haemophilus equigenitalis) heq 马生殖器泰勒菌(Taylorella equigenitalis) kox 产酸克雷伯菌(Klebsiella oxytoca) acm 马杜拉放线菌属(Actinomadura sp.) ssn 血链球菌(Streptococcus sanguinis) ss1 血链球菌I型(Streptococcus sanguinis I) ss3 血链球菌III型(Streptococcus sanguinis III) ssn 血链球菌(Streptococcus sanguis) ss1 血链球菌I型(Streptococcus sanguis I) ss3 血链球菌III型(Streptococcus sanguis III) ss2 血链球菌II型(Streptococcus sanguinis II) ss2 血链球菌II型(Streptococcus sanguis II) lse Listeria seeligeri vfl CDC EF-6 vfl 河流弧菌(Vibrio fluvialis) bav 鸟鲍特菌(Bordetella avium) lec 勒克菌属(Leclercia sp.) sha 痢疾志贺菌(Shigella dysenteriae) sn1 痢疾志贺菌非1型(Shigella dysenteriae, not Type 1) cts 睾丸酮丛毛单胞菌(Comamonas testosteroni) cts 睾丸酮丛毛单胞菌(Pseudomonas testosteroni) aso 温和气单胞菌(Aeromonas sobria) sso 表兄链球菌(Streptococcus sobrinus) szo 马链球菌兽瘟亚种(Streptococcus equi ss. zooepidemicus) szo 兽疫链球菌(Streptococcus zooepidemicus) san 咽峡炎链球菌(Streptococcus anginosus) so2 气味沙雷菌2(Serratia odorifera 2) hin 流感嗜血杆菌(Haemophilus influenzae) hxt 未分型流感嗜血杆菌(Haemophilus influenzae (not typable)) hxb 非b型流感嗜血杆菌(Haemophilus influenzae (not type b)) ahe 溶血隐秘杆菌(Arcanobacterium haemolyticum) ahe 溶血棒状杆菌(Corynebacterium haemolyticum)

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bbe 短短小芽胞杆菌(Bacillus brevis) blt 侧孢短小芽胞杆菌(Bacillus laterosporus) bpn 泛酸枝芽胞杆菌(Bacillus pantothenticus) sho 人葡萄球菌(Staphylococcus hominis) sho 人葡萄球菌人亚种(Staphylococcus hominis ss. hominis) snb Staphylococcus hominis ss. novobiosepticus cbv 牛棒杆菌(Corynebacterium bovis) nco 空腔诺卡菌(Nocardia coeliaca) ppe 彭氏变形杆菌(Proteus penneri) lri 理查德勒米诺菌(Leminorella richardii) ssw 沙门菌施瓦曾格隆德血清型(Salmonella Schwarzengrund) sai 耳葡萄球菌(Staphylococcus auricularis) val 溶藻弧菌(Vibrio alginolyticus) pvu 普通变形杆菌(Proteus vulgaris) pgl 鸡鸟杆菌(Pasteurella gallinarum) hap CDC HB-2 hap 嗜沫凝聚杆菌(Haemophilus aphrophilus) pag 产碱假单胞菌(Pseudomonas alcaligenes) mnl 不液化摩拉菌(Moraxella nonliquefaciens) edu 耐久肠球菌(Enterococcus durans) sor 沙门菌奥兰宁堡血清型(Salmonella Oranienburg) psm 口巴斯德菌(Pasteurella stomatis) phe 亨巴赫普罗威登斯菌(Providencia heimbachae) mat CDC M-3 mat 亚特兰大莫拉菌(Moraxella atlantae) sna Salmonella Narashino mlu 藤黄微球菌(Micrococcus luteus) bsu 马耳他布鲁菌(Brucella suis (melitensis)) lio Listeria innocua rah 拉恩菌属(Rahnella sp.) erh 猪红斑丹毒丝菌(Erysipelothrix rhusiopathiae) nsi 干燥奈瑟菌(Neisseria sicca) shr 沙门菌哈达尔血清型(Salmonella Hadar) eal 解淀粉欧文氏菌(Erwinia amylovora) sam 沙门菌鼠伤寒血清型(Salmonella Typhimurium) 104 Salmonella Typhimurium DT 104 crc 膀胱炎棒杆菌(Corynebacterium cystitidis) pre 雷极普罗威登斯菌(Proteus rettgeri) pre 雷极普罗威登斯菌(Providencia rettgeri) sad 少酸链球菌(Streptococcus acidominimus) fpl Francisella tularensis biovar palearctica fpl 土拉热弗郎西斯菌B型(Francisella tularensis Type B) hpi 副流感嗜血杆菌(Haemophilus parainfluenzae)

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sml CDC IIk-2 sml 多食鞘氨醇杆菌(Flavobacterium multivorum) sml 多食鞘氨醇杆菌(Sphingobacterium multivorum) sri 罗森沙门菌(Salmonella Rissen) ssi 模仿葡萄球菌(Staphylococcus simulans) lch 彻氏军团菌(Legionella cherrii) pae 铜绿假单胞菌(Pseudomonas aeruginosa) ecr CDC HB-1 ecr 啮蚀艾肯菌(Eikenella corrodens) sts 沙门菌猪伤寒血清型(Salmonella Typhisuis) evu CDC Enteric Group 1 evu 伤口埃希菌(Escherichia vulneris) smi 米氏链球菌(Streptococcus milleri) skl 克氏葡萄球菌(Staphylococcus kloosii) ega 鹑鸡肠球菌(Enterococcus gallinarum) bs- β-溶血链球菌(Streptococcus, beta-haemolytic) sxa 非A群β-溶血链球菌(Streptococcus, beta-haemolytic (not Group A)) sbl 沙门菌布洛克兰血清型(Salmonella Blockley) emk 伊米克沙门菌(Salmonella Emek) nel 长奈瑟菌(Neisseria elongata) nel 长奈瑟菌长亚种(Neisseria elongata ss. elongata) ska 卡普士得沙门菌(Salmonella Kaapstad) yep 鼠疫耶尔森菌(Yersinia pestis) rrh 紫红红酵母(Rhodococcus rhodochrous) mip 小多胞菌属(Micropolyspora sp.) nla 乳糖奈瑟菌(Neisseria lactamica) hhe 溶血嗜血杆菌(Haemophilus haemolyticus) nca 狗奈瑟菌(Neisseria canis) liv 伊氏李斯特菌(Listeria ivanovii) cpb 假结核棒杆菌(Corynebacterium pseudotuberculosis) bon 波恩沙门菌(Salmonella Bonn) shc 鲍氏志贺菌(Shigella boydii) dxe D群链球菌(非肠球菌)（Streptococcus, Group D (non-enterococcal)) cml 无丙二酸柠檬酸杆菌(Citrobacter amalonaticus) sru 深红沙雷菌(Serratia rubidaea) vvu CDC EF-3 vvu 创伤弧菌(Vibrio vulnificus) sne 沙门菌新港血清型(Salmonella Newport) scg 产色葡萄球菌(Staphylococcus chromogenes) edi 阴沟肠杆菌液化亚种(Enterobacter dissolvens) pg1 假单胞菌Ⅰ型(Pseudomonas sp. group 1) spo 沙门菌浦那血清型(Salmonella Poona) bep 表皮短杆菌(Brevibacterium epidermidis)

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lad CDC Enteric Group 41 lad 非脱羧勒克菌(Escherichia adecarboxylata) lad 非脱羧勒克菌(Leclercia adecarboxylata) g57 Salmonella Group 57 (O:57) smt 缓症链球菌(Streptococcus mitis) psz CDC Vb-1 cvb CDC Vb-3 psz 斯氏假单胞菌(Pseudomonas stutzeri) cvb 类斯氏假单胞菌(Pseudomonas stutzeri-like) dco Dermatophilus congolensis hfn 芬内尔螺杆菌(Campylobacter fennelliae) hfn Clo-2 hfn 芬内尔螺杆菌(Helicobacter fennelliae (CLO-2)) api 皮埃肖无色杆菌(Alcaligenes piechaudii) c4d CDC EF-1 c4d CDC IVd c4d 类假单胞菌 2型(Pseudomonas-like group 2) hpc 副兔嗜血杆菌(Haemophilus paracuniculus) kas CDC Enteric Group 8 kas 抗坏血酸克吕沃菌(Kluyvera ascorbata) en- 肠杆菌属(Enterobacter sp.) cmy 类真菌棒杆菌(Corynebacterium mycetoides) lcn 辛辛那提军团菌(Legionella cincinnatiensis) lha 哈开理军团菌(Legionella hackeliae) nbr 巴西诺卡菌(Nocardia brasiliensis) ehf 恰菲埃里希体(Ehrlichia chaffeensis) pme CDC Vb-2 pme 门多萨假单胞菌(Pseudomonas mendocina) sti 豕链球菌(Streptococcus porcinus) not 豚鼠耳炎诺卡菌(Nocardia otitidiscaviarum) smc 猕猴链球菌(Streptococcus macacae) fho 土拉热弗郎西斯菌全北区亚种(Francisella tularensis ss. holarctica) cfv 胎儿弯曲菌性病亚种(Campylobacter fetus ss. venerealis) sep 白色葡萄球菌(Staphylococcus albus) sep 表皮葡萄球菌(Staphylococcus epidermidis) ncr 肉色诺卡菌(Nocardia carnea) ssv CDC IIk-3 ssv 食神鞘氨醇杆菌(Flavobacterium spiritivorum) ssv 食神鞘氨醇杆菌(Flavobacterium yabuuchiae) ssv 食神鞘氨醇杆菌(Sphingobacterium spiritivorum) crn 肾棒杆菌(Corynebacterium renale) ric 立克次体属(Rickettsia sp.) sdu 沙门菌都柏林血清型(Salmonella Dublin)

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sin 中间链球菌(Streptococcus intermedius) eae 产气肠杆菌(Enterobacter aerogenes) eae Klebsiella mobilis vo1 O1群霍乱弧菌(Vibrio cholerae O1) sre 沙门菌里丁血清型(Salmonella Reading) cjk CDC Coryneform Group JK cjk 杰氏棒杆菌(Corynebacterium jeikeium) swa 沃氏葡萄球菌(Staphylococcus warneri) cst 纹带棒杆菌(Corynebacterium striatum) nde 反硝化伯杰菌(Neisseria denitrificans) cht 沙眼衣原体(Chlamydia trachomatis) pch 绿针假单胞菌绿针亚种(Pseudomonas chlororaphis) gva 阴道加德纳菌(Gardnerella vaginalis) gva 阴道加德纳菌(Haemophilus vaginalis) yru 吕克尔耶尔森菌(Yersinia ruckeri) cfe 胎儿弯曲菌胎儿亚种(Campylobacter fetus) cfe 胎儿弯曲菌胎儿亚种(Campylobacter fetus ss. fetus) btu 苏云金芽胞杆菌(Bacillus thuringiensis) hdu 杜克嗜血杆菌(Haemophilus ducreyi) lsp 斯皮里特湖军团菌(Legionella spiritensis) koz 肺炎克雷伯菌臭鼻亚种(Klebsiella ozaenae) koz 肺炎克雷伯菌臭鼻亚种(Klebsiella pneumoniae ss. ozaenae) amd 中间气单胞菌(Aeromonas media) yen 小肠结肠炎耶尔森菌(Yersinia enterocolitica) hpr 副猪嗜血杆菌(Haemophilus parasuis) pav 鸟鸟杆菌(Haemophilus avium) pav 鸟鸟杆菌(Pasteurella avium) caq 水生棒杆菌(Corynebacterium aquaticum) cgi 牙龈二氧化碳嗜纤维菌(Capnocytophaga gingivalis) cj1 空肠弯曲菌生物1型(Campylobacter jejuni biotype 1) cj2 空肠弯曲菌生物2型(Campylobacter jejuni biotype 2) slv 利文斯通沙门菌(Salmonella Livingstone) npo 多糖奈瑟菌(Neisseria polysaccharea) lms 肠膜明串珠菌(Leuconostoc mesenteroides) lms 肠膜明串珠菌肠膜亚种(Leuconostoc mesenteroides ss. mesenteroides) soh 沙门菌俄亥俄血清型(Salmonella Ohio) lgy 格氏李斯特菌(Listeria grayi) lgy Listeria murrayi eic 鲶鱼爱德华菌(Edwardsiella ictaluri) ppu 恶臭假单胞菌(Pseudomonas putida) hfe 猫螺杆菌(Helicobacter felis) g52 Salmonella Group 52 (O:52) smr 沙门菌明斯特血清型(Salmonella Muenster)

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nci 灰质奈瑟菌(Neisseria cinerea) kur 库特菌属(Kurthia sp.) swy 韦布里齐沙门菌(Salmonella Weybridge) llc 乳明串珠菌(Leuconostoc lactis) bsh 球形赖氨酸杆菌(Bacillus sphaericus) cer 塞罗沙门菌(Salmonella Cerro) pim 静止嗜冷杆菌(Psychrobacter immobilis) sle 缓慢葡萄球菌(Staphylococcus lentus) ssr 松鼠葡萄球菌(Staphylococcus sciuri) sle 松鼠葡萄球菌缓慢亚种(Staphylococcus sciuri ss. lentus) ssr 松鼠葡萄球菌松鼠亚种(Staphylococcus sciuri ss. sciuri) hpg 类鹑鸡鸟杆菌(Haemophilus paragallinarum) pam 多杀巴斯德菌(Pasteurella multocida) pam 多杀巴斯德菌多杀亚种(Pasteurella multocida ss. multocida) lgs 加氏乳杆菌(Lactobacillus gasseri) sou Salmonella Ouakam sgi Salmonella Give bci 环状芽胞杆菌(Bacillus circulans) shg 沙门菌海德堡血清型 (Salmonella Heidelberg) hha 嗜血红素嗜血杆菌(Haemophilus haemoglobinophilus) mos 奥斯陆摩拉菌(Moraxella osloensis) efe CDC Enteric Group 10 efe 弗格森埃希菌(Escherichia fergusonii) sae 阿尔莱特葡萄球菌(Staphylococcus arlettae) sqn 马肠链球菌(Streptococcus equinus) lsc 卫生十字军团菌(Legionella santicrucis) bmt 马耳他布鲁菌(Brucella melitensis) pmi 奇异变形杆菌(Proteus mirabilis) sen 肠炎沙门菌肠炎亚种(Salmonella Enteritidis) enh 海氏肠球菌(Enterococcus hirae) mex 扭脱甲基杆菌(Methylobacterium extorquens) lgr CDC Enteric Group 57 lgr 格利蒙勒米诺菌(Leminorella grimontii) eta 迟钝爱德华菌(Edwardsiella tarda) bli 地衣芽胞杆菌(Bacillus licheniformis) bsg G群β-溶血链球菌(Streptococcus, beta-haem. Group G) baq 水生布戴约维采菌(Budvicia aquatica) nfl 浅黄奈瑟菌(Neisseria flavescens) vic 霍乱弧菌(Vibrio cholerae) cdl Citrobacter diversus-levinea c10 柠檬酸杆菌基因种10(Citrobacter genomospecies 10) c11 柠檬酸杆菌基因种11(Citrobacter genomospecies 11) ci9 柠檬酸杆菌基因种9(Citrobacter genomospecies 9)

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sct 星座链球菌星座亚种(Streptococcus constellatus) sem 嗜虫沙雷菌(Serratia entomophila) hal 蜂房哈夫尼亚菌(Hafnia alvei) scp 山羊葡萄球菌(Staphylococcus caprae) aha 溶血不动杆菌(Acinetobacter haemolyticus) smn 沙门菌慕尼黑血清型(Salmonella Muenchen) esa 阪崎肠杆菌(Enterobacter sakazakii) nsu 微黄奈瑟菌(Neisseria subflava) fnv 新凶手弗郎西斯菌(Francisella novicida) ali 利尼埃放线杆菌(Actinobacillus lignieresii) efa 粪肠球菌(Enterococcus faecalis) efa 粪肠球菌(Streptococcus faecalis) sav 沙门菌阿雷查瓦莱塔血清型(Salmonella Arechavaleta) kde CDC TM-1 kde 脱硝金菌(Kingella denitrificans) avi 浅绿气球菌(Aerococcus viridans) bmg 巨大芽胞杆菌(Bacillus megaterium) saa 甲型副伤寒沙门菌(Salmonella Paratyphi A) tns Salmonella Tennessee pvo 家禽鸟杆菌(Pasteurella volantium) spy 化脓性链球菌(Streptococcus pyogenes) sch 猪霍乱沙门菌(Salmonella Choleraesuis) smo 沙门菌蒙得维的亚血清型(Salmonella Montevideo) ntr 南非诺卡菌(Nocardia transvalensis) sag 沙门菌阿哥纳血清型(Salmonella Agona) lwl Listeria welshimeri req 马红球菌(Corynebacterium equi) req 马红酵母(Rhodococcus equi) hpy 幽门螺杆菌(Helicobacter pylori) pda 达可马巴斯德菌(Pasteurella dagmatis) gm- 革兰阴性(Gram negative bacteria) bcg 凝固芽胞杆菌(Bacillus coagulans) cpi 多毛棒杆菌(Corynebacterium pilosum) scr 乳酸乳球菌乳脂亚种(Lactococcus lactis ss. cremoris) scr 乳酸乳球菌乳酯亚种(Streptococcus cremoris) sli 沙门菌利兹菲尔德血清型(Salmonella Litchfield) nmu 粘液奈瑟菌(Neisseria mucosa) ctg CDC EF-19 ctg 土生丛毛单胞菌(Comamonas terrigena) sbm 沙门菌病牛血清型(Salmonella Bovismorbificans) inf 沙门菌婴儿血清型(Salmonella Infantis) brd 布雷登尼沙门菌(Salmonella Bredeney) aca 醋酸钙不动杆菌(Acinetobacter calcoaceticus)

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abx 鲍曼不动杆菌复合群(Acinetobacter calcoaceticus-baumannii comple) gnc 革兰阴性球菌(Gram negative cocci) gpc 革兰阳性球菌(Gram positive cocci) alw Acinetobacter calcoaceticus var. lwoffii alw 鲁氏不动杆菌(Acinetobacter lwoffii) skd 凯道古沙门菌(Salmonella Kedougou) wvi CDC IIf wvi 粘液威克斯菌(Weeksella virosa) shl 溶血葡萄球菌(Staphylococcus haemolyticus) bsf F群β-溶血链球菌(Streptococcus, beta-haem. Group F) bsl 枯草芽胞杆菌枯草亚种(Bacillus subtilis) gpr 革兰阳性杆菌(Gram positive rods) cmi 极小棒杆菌(Corynebacterium minutissimum) cnt 内特西地西菌(Cedecea neteri) cnt 西地西菌 4(Cedecea sp. 4) hpl 副溶血嗜沫嗜血杆菌(Haemophilus paraphrohaemolyticus) mla 腔隙摩拉菌(Moraxella lacunata) eam 河生肠杆菌(Enterobacter amnigenus) bce 蜡样芽胞杆菌(Bacillus cereus) yfr 弗雷德里克森耶尔森菌(Yersinia frederiksenii) nfa 皮诺卡菌(Nocardia farcinica) shb 福氏志贺菌(Shigella flexneri) pat 鸭鸡杆菌(Pasteurella anatis) ehe CDC Enteric Group 11 ehe 赫氏埃希菌(Escherichia hermannii) aeh 嗜水气单胞菌(Aeromonas hydrophila) pty Salmonella Paratyphi sab 乙型副伤寒沙门菌(Salmonella Paratyphi B) sab 乙型副伤寒沙门菌(Salmonella Schottmuelleri) pmy 产粘变形菌(Proteus myxofaciens) skr 沙门菌克雷菲尔德血清型(Salmonella Krefeld) lde 肠膜明串珠菌葡聚糖亚种(Leuconostoc dextranicum) lde 肠膜明串珠菌葡聚糖亚种(Leuconostoc mesenteroides ss. dextranicum) pog 产气巴斯德菌(Pasteurella aerogenes) yro 罗德耶尔森菌(Yersinia rohdei) gnr 革兰阴性杆菌(Gram negative rods) lsh 赫伦荒原军团菌(Legionella sainthelensi) cmu 粘膜弯曲菌 (Campylobacter mucosalis) ehc 犬埃里希体(Ehrlichia canis) eav 鸟肠球菌(Enterococcus avium) sjv 沙门菌爪洼血清型(Salmonella Javiana) ssy 沙门菌斯坦利血清型(Salmonella Stanley) acv 豚鼠气单胞菌(Aeromonas caviae)

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aja 让达气单胞菌(Aeromonas jandaei) cku 库切尔棒杆菌(Corynebacterium kutscheri) bsc C群β-溶血链球菌(Streptococcus, beta-haem. Group C) yre CDC Enteric Group 45 yre 小棒科泽菌(Koserella trabulsii) yre 雷金斯堡预研菌(Yokenella regensburgei (Kos. trabulsii)) llo 长滩军团菌(Legionella longbeachae) cgm 谷氨酸棒杆菌(Corynebacterium glutamicum) lja 詹姆斯敦军团菌(Legionella jamestowniensis) hph 副溶血嗜血杆菌 (Haemophilus parahaemolyticus) cas 生痰二氧化碳嗜纤维菌(Capnocytophaga sputigena) cmt 马特吕绍棒杆菌(Corynebacterium matruchotii) efm 屎肠球菌(Enterococcus faecium) efm 屎肠球菌(Streptococcus faecium) amu 马杜拉马杜拉放线菌(Actinomadura madurae) our CDC M-4 our 尿道寡源杆菌(Oligella urethralis) kki CDC M-1 kki 金氏金菌(Kingella kingae) yes 假结核耶尔森菌(Yersinia pseudotuberculosis) ykr 克里斯腾耶尔森菌(Yersinia kristensenii) pln 兰氏巴斯德菌(Pasteurella langaa) yal 阿尔多韦耶尔森菌(Yersinia aldovae) aba 鲍曼不动杆菌(Acinetobacter baumannii) ftu 土拉热弗郎西斯菌(Francisella tularensis) ftu 土拉热弗郎西斯菌土拉热亚种(Francisella tularensis ss. tularensis) ftu 土拉热弗郎西斯菌A型(Francisella tularensis Type A) cbb 唾液弯曲菌牛生物变种(Campylobacter sputorum ss. bulbulus) ebl 蟑螂埃希菌(Escherichia blattae) swe 沙门菌韦太夫雷登血清型(Salmonella Weltevreden) ncb 革兰阴性球杆菌(Gram negative coccobacilli) pcb 革兰阳性球杆菌(Gram positive coccobacilli) cup 乌普萨拉弯曲菌(Campylobacter upsaliensis) cul 溃疡棒杆菌(Corynebacterium ulcerans) ybe 伯克韦尔耶尔森菌(Yersinia bercovieri) ymo 莫拉雷耶尔森菌(Yersinia mollaretii) eps 类鸟肠球菌(Enterococcus pseudoavium) era 棉子糖肠球菌(Enterococcus raffinosus) esh 解糖肠球菌(Enterococcus saccharolyticus) ese 杀鱼肠球菌(Enterococcus seriolicida) eso 孤立肠球菌(Enterococcus solitarius) hib 流感嗜血杆菌(b型)（Haemophilus influenzae (type b)) lbn 布吕嫩军团菌(Legionella brunensis)

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lge 吉斯特军团菌(Legionella geestiae) llg 兰斯格军团菌(Legionella lansingensis) lln 伦敦军团菌(Legionella londoniensis) lmr 摩拉维采军团菌(Legionella moravica) lna 水手军团菌(Legionella nautarum) lfr 嗜肺军团菌弗雷泽亚种(Legionella pneumophila ss. fraseri) lpc 嗜肺军团菌牧场亚种(Legionella pneumophila ss. pascullei) len 嗜肺军团菌(Legionella pneumophila) len 嗜肺军团菌嗜肺亚种(Legionella pneumophila ss. pneumophila) lqi 昆里万军团菌(Legionella quinlivanii) lsk 沙氏军团菌(Legionella shakespearei) ltu 图森军团菌(Legionella tucsonensis) lwo 沃斯利军团菌(Legionella worsleiensis) nma 脑膜炎奈瑟菌A血清型(Neisseria meningitidis, serogroup a) nmb 脑膜炎奈瑟菌B血清型(Neisseria meningitidis, serogroup b) nmc 脑膜炎奈瑟菌C血清型(Neisseria meningitidis, serogroup c) mme 嗜中温甲基杆菌(Methylobacterium mesophilicum) mme 嗜中温甲基杆菌(Pseudomonas mesophilica) sul 科氏葡萄球菌解脲亚种(Staphylococcus cohnii ss. urealyticum) slu 路邓葡萄球菌(Staphylococcus lugdunensis) stt 巴斯德葡萄球菌(Staphylococcus pasteuri) ssf 施莱福葡萄球菌施莱福亚种(Staphylococcus schleiferi ss. schleiferi) smp 糖单孢菌属(Saccharomonospora sp.) svd 绿色糖单孢菌(Saccharomonospora viridis) bhe 汉氏巴尔通体(Bartonella henselae) bhe 汉氏巴尔通体(罗卡利马体)（Rochalimaea henselae) bqu 五日热巴尔通体(Bartonella quintana) bqu 五日热巴尔通体(Rochalimaea quintana) bvi 文氏巴尔通体文氏亚种(Bartonella vinsonii) bvi 文森巴尔通体(Rochalimaea vinsonii) bez 伊丽沙白巴尔通体(Bartonella elizabethae) bez 伊丽沙白巴尔通体(Rochalimaea elizabethae) cpn 肺炎嗜衣原体(Chlamydia pneumoniae) cpn 肺炎嗜衣原体(Chlamydophila pneumoniae) cpn TWAR gra Salmonella Group A (O:2) gc3 Salmonella Group C3 (O:8) gd1 Salmonella Group D1 (O:9) gd2 Salmonella Group D2 (O:9,46) gd3 Salmonella Group D3 (O:9,46,27) ge1 Salmonella Group E1 (O:3,10) ge4 Salmonella Group E4 (O:1,3,19) grh Salmonella Group H (O:6,14)

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gri Salmonella Group I (O:16) grj Salmonella Group J (O:17) grk Salmonella Group K (O:18) grl Salmonella Group L (O:21) grm Salmonella Group M (O:28) grn Salmonella Group N (O:30) grp Salmonella Group P (O:38) grq Salmonella Group Q (O:39) grr Salmonella Group R (O:40) grs Salmonella Group S (O:41) grt Salmonella Group T (O:42) gru Salmonella Group U (O:43) grv Salmonella Group V (O:44) grw Salmonella Group W (O:45) grx Salmonella Group X (O:47) gry Salmonella Group Y (O:48) grz Salmonella Group Z (O:50) g54 Salmonella Group 54 (O:54) g67 Salmonella Group 67 (O:67) ngo 淋病奈瑟菌(Neisseria gonorrhoeae) nko 淋病奈瑟菌柯霍亚种(Neisseria gonorrhoeae ss. kochii) nko 柯霍奈瑟菌(Neisseria kochii) asu 猪放线杆菌(Actinobacillus suis) eco 大肠埃希菌(Escherichia coli) ssd Salmonella Sandiego svg 弗吉尼亚沙门菌(Salmonella Virginia) sfo 居泉沙雷菌(Serratia fonticola) bhz 欣茨鲍特菌(Bordetella hinzii) tpm 少变冢村菌(Tsukamurella paurometabolum) bmb 迈克布瑞德短杆菌(Brevibacterium mcbrellneri) cjd 空肠弯曲菌德莱亚种(Campylobacter jejuni ss. doylei) caj 空肠弯曲菌空肠亚种(Campylobacter jejuni) caj 空肠弯曲菌空肠亚种(Campylobacter jejuni ss. jejuni) ccm 狗咬二氧化碳嗜纤维菌(Capnocytophaga canimorsus) ccm CDC DF-2 ccy 犬咬二氧化碳嗜纤维菌(Capnocytophaga cynodegmi) ccy CDC DF-2-like cgn 颗粒二氧化碳嗜纤维菌(Capnocytophaga granulosa) chc 溶血二氧化碳嗜纤维菌(Capnocytophaga haemolytica) cd3 CDC DF-3 hpu 幼禽螺杆菌(Helicobacter pullorum) fgl 粘金黄杆菌(Chryseobacterium gleum) fgl 粘金黄杆菌(Flavobacterium gleum)

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fin CDC IIb fin 产吲哚金黄杆菌(Chryseobacterium indologenes) fin 吲哚金黄杆菌(Flavobacterium indologenes) fod CDC M-4f fod 香味类香味菌(Flavobacterium odoratum) fod Myroides odoratum caf CDC Coryneform Group ANF-1 caf 非发酵棒杆菌非发酵亚种(Corynebacterium afermentans) ci2 CDC Coryneform Group F-2 ci2 CDC Coryneform Group I-2 ci2 无枝菌酸棒杆菌(Corynebacterium amycolatum) cpq 接近棒杆菌(Corynebacterium propinquum) cd2 CDC Coryneform Group D-2 cd2 解脲棒杆菌(Corynebacterium urealyticum) ebr 短稳杆菌(Empedobacter brevis) ebr 短稳杆菌(Flavobacterium breve) gbr 支气管戈登菌(Gordona bronchialis) gbp 暗红戈登菌(Gordona rubropertinctus) gsu 痰戈登菌(Gordona sputi) mre 直杆干草菌(小多胞菌属)（Micropolyspora faeni) mre 直逗号糖多胞菌(Micropolyspora rectivirgula) mre 直杆糖多孢菌(Saccharopolyspora rectivirgula) pce 洋葱伯克霍尔德菌(Burkholderia cepacia) pce CDC EO-1 pce 洋葱伯克霍尔德菌(Pseudomonas cepacia) bgl 唐菖蒲伯克霍尔德菌(Burkholderia gladioli) bgl 唐菖蒲伯克霍尔德菌(Pseudomonas gladioli) bma 鼻疽伯克霍尔德菌(Burkholderia mallei) bma 鼻疽伯克霍尔德菌(Pseudomonas mallei) bmu Burkholderia multivorans (genomovar II) bpy Burkholderia pyrrocinia (genomovar IX) adf 德拉菲尔德食酸菌(Acidovorax delafieldii) adf 德拉菲尔德食酸菌(Pseudomonas delafieldii) afc 速生食酸菌(Acidovorax facilis) afc 速生食酸菌(Pseudomonas facilis) atm 中等食酸菌(Acidovorax temperans) atm Pseudomonas temperans pdi 缺陷短波单胞菌(Brevundimonas diminuta) pdi CDC Ia pdi 缺陷短波单胞菌(Pseudomonas diminuta) pve 泡囊短波单胞菌(Brevundimonas vesicularis) pve 泡囊短波单胞菌(Pseudomonas vesicularis) pma CDC I

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pma 嗜麦芽窄食单胞菌(Pseudomonas maltophilia) pma 嗜麦芽窄食单胞菌(Stenotrophomonas maltophilia) pma 嗜麦芽窄食单胞菌(Xanthomonas maltophilia) spf CDC Ib-1 spf CDC Ib-2 spf 腐败希瓦菌(Pseudomonas putrefaciens) spf 腐败希瓦菌(Shewanella putrefaciens) sbe 深海希瓦菌(Shewanella benthica) shn 羽田希瓦菌(Alteromonas hanedai) shn 羽田希瓦菌(Shewanella hanedai) rgi 吉拉尔玫瑰单胞菌(Roseomonas gilardii) rce 颈玫瑰单胞菌(Roseomonas cervicalis) rfa 福尔玫瑰单胞菌(Roseomonas fauriae) sdf 缺陷乏氧菌(Abiotrophia defectiva) sdf 缺陷乏养菌(Streptococcus defectivus) snv 营养变异链球菌(Streptococcus, nutritionally variant) wzo 动物溃疡伯杰菌(Bergeyella zoohelcum) wzo CDC IIj wzo 动物溃疡伯杰菌(Weeksella zoohelcum) ldu 迪莫夫荧光杆菌(Fluoribacter dumoffii) ldu 杜莫夫荧光杆菌(Legionella dumoffii) lgo 戈尔曼荧光杆菌(Fluoribacter gormanii) lgo 戈曼荧光杆菌(Legionella gormanii) ecc 盲肠肠球菌(Enterococcus cecorum) ecb 鸽肠球菌(Enterococcus columbae) eds 殊异肠球菌(Enterococcus dispar) efv 黄色肠球菌(Enterococcus flavescens) esu 硫磺色肠球菌(Enterococcus sulfureus) fmz 水氏黄杆菌(Flavobacterium mizutaii) fmz 水田黄杆菌(Sphingobacterium mizutae) fph 蜃楼弗郎西斯菌(Francisella philomiragia) fph 蜃楼弗郎西斯菌(Yersinia philomiragia) hac 伴放线菌凝聚杆菌(Actinobacillus actinomycetemcomitans) hac CDC HB-3 hac CDC HB-4 hac 伴放线凝聚杆菌(Haemophilus actinomycetemcomitans) kkr 克里斯廷考克菌(Kocuria kristinae) kkr 克里斯廷微球菌(Micrococcus kristinae) kro 玫瑰色考克菌(Kocuria rosea) kro 玫瑰色微球菌(Micrococcus roseus) kva 变异考克菌(Kocuria varians) kva 易变微球菌(Micrococcus varians) lqu 考特拉军团菌(Legionella quateirensis)

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lci 柠檬明串珠菌(Leuconostoc citreum) mxc 犬莫拉菌(Moraxella canis) ooe 酒酒球菌(Leuconostoc oenos) ooe 酒酒球菌(Oenococcus oeni) nwe CDC M-5 nwe 莫拉菌 M-5(Moraxella sp. M-5) nwe 韦弗奈瑟菌(Neisseria weaveri) nni CDC M-6 nni 莫拉菌 M-6(Moraxella sp. M-6) nni 长奈瑟菌硝酸盐还原亚种(Neisseria elongata ss. nitroreducens) pbe CDC HB-5 pbe 贝氏巴斯德菌(Pasteurella bettyae) pmr 麦氏巴斯德菌(Pasteurella mairii) ptr 海藻糖比贝尔施泰因菌(Pasteurella trehalosi) for CDC Ve-2 for 栖稻假单胞菌(Flavimonas oryzihabitans) for 栖稻假单胞菌(Pseudomonas oryzihabitans) fth 嗜温鞘氨醇杆菌(Flavobacterium thalpophilum) fth 嗜温鞘氨醇杆菌(Sphingobacterium thalpophilum) sau 金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus) sau 金黄色葡萄球菌金黄亚种(Staphylococcus aureus ss. aureus) sca 山羊葡萄球菌(Staphylococcus capitis) sca 头状葡萄球菌头状亚种(Staphylococcus capitis ss. capitis) stc 科氏葡萄球菌(Staphylococcus cohnii) stc 科氏葡萄球菌科氏亚种(Staphylococcus cohnii ss. cohnii) sde 海豚葡萄球菌(Staphylococcus delphini) sfe 猫葡萄球菌(Staphylococcus felis) sms 蝇葡萄球菌(Staphylococcus muscae) sps 鱼发酵葡萄球菌(Staphylococcus piscifermentans) spv 小牛肉葡萄球菌(Staphylococcus pulvereri) spv 小牛葡萄球菌(Staphylococcus vitulinus) ssb Staphylococcus saprophyticus ss. bovis sap 腐生葡萄球菌(Staphylococcus saprophyticus) sap 腐生葡萄球菌(Staphylococcus saprophyticus ss. saprophytic) slc 施莱福葡萄球菌凝聚亚种(Staphylococcus coagulans) slc 施莱福葡萄球菌凝聚亚种(Staphylococcus schleiferi ss. coagulans) src 嵴链球菌(Streptococcus crista) sqm 停乳链球菌似马亚种(Streptococcus dysgalactiae ss. equisimilis) sqm 似马链球菌(Streptococcus equisimilis) sgo 戈登链球菌(Streptococcus gordonii) sve 前庭链球菌(Streptococcus vestibularis) sgs 灰色链霉菌(Streptomyces griseus) ppi 皮氏罗尔斯顿菌(Burkholderia pickettii)

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ppi CDC Va-1 ppi CDC Va-2 ppi CDC Va-3 ppi 皮氏罗尔斯顿菌(Pseudomonas pickettii) ppi 托氏假单胞菌(Pseudomonas thomasii) ppi 皮氏罗尔斯顿菌(Ralstonia pickettii) mlq 昆虫微杆菌(Microbacterium liquefaciens) bal 蜂房类芽胞杆菌(Bacillus alvei) bal 蜂房类芽孢杆菌(Paenibacillus alvei) bmc 浸麻类芽胞杆菌(Bacillus macerans) bmc 浸麻类芽孢杆菌(Paenibacillus macerans) bpo 多粘类芽胞杆菌(Bacillus polymyxa) bpo 多粘类芽孢杆菌(Paenibacillus polymyxa) bay 乙酰微小杆菌(Brevibacterium acetylicum) bay 乙酰微小杆菌(Exiguobacterium acetylicum) cce 纤维化纤维素菌(Cellulomonas cellulans (O. xanthineolytica)) cce 纤维化纤维素菌(Oerskovia xanthineolytica) otu 震颤厄菌(Cellulomonas turbata) otu 震颤厄氏菌(Oerskovia turbata) mim 蛾微杆菌(Microbacterium imperiale) abu 比茨莱弓形菌(Arcobacter butzleri) rja 日本立克次体(Rickettsia japonica) ots 恙虫病东方体(Orientia tsutsugamushi) ots 恙虫病立克次体(Rickettsia tsutsugamushi) afo 布氏阿菲波菌(Afipia broomeae) afd 克利夫兰阿菲波菌(Afipia clevelandensis) apf 猫阿菲波菌(Afipia felis) afi 阿菲波菌属(Afipia sp.) c59 CDC Enteric Group 59 cbk 布拉克柠檬酸杆菌(Citrobacter braakii) cfa 法默柠檬酸杆菌(Citrobacter farmeri) cdi 差异柠檬酸杆菌(Citrobacter diversus) cdi 科泽柠檬酸杆菌(Citrobacter koseri (diversus)) csk 塞德拉克柠檬酸杆菌(Citrobacter sedlakii) ea2 河生肠杆菌生物2型(Enterobacter amnigenus 2) g59 Salmonella Group 59 (O:59) cwe 沃克曼柠檬酸杆菌(Citrobacter werkmanii) cyo 杨氏柠檬酸杆菌(Citrobacter youngae) ecg 生癌肠杆菌(Enterobacter cancerogenus (taylorae)) ecg 生癌肠杆菌(Enterobacter taylorae) ea1 河生肠杆菌生物1型(Enterobacter amnigenus 1) ehm CDC Enteric Group 75 ehm 霍尔姆肠杆菌(Enterobacter hormaechei)

- - - - - - + + + + + + + + + + + + + + - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 46

f5b 福氏志贺菌5b血清型(Shigella flexneri serotype 5b) pal 无恒变形杆菌(Proteus inconstans) pal 产碱普罗威登斯菌(Providencia alcalifaciens) g51 Salmonella Group 51 (O:51) g55 Salmonella Group 55 (O:55) g60 Salmonella Group 60 (O:60) g62 Salmonella Group 62 (O:62) g65 Salmonella Group 65 (O:65) g66 Salmonella Group 66 (O:66) sqv 食醌沙雷菌(Serratia proteamaculans ss. quinovora) sgr 格利蒙斯沙雷菌(Serratia grimesii) eag 成团泛菌(Enterobacter agglomerans) eag 成团泛菌(Pantoea agglomerans) pan 泛菌属(Pantoea sp.) aeu 嗜矿泉气单胞菌(Aeromonas eucrenophila) apn 斑点气单胞菌斑点亚种(Aeromonas punctata) apn 斑点气单胞菌斑点亚种(Aeromonas punctata ss. punctata) ash 舒氏气单胞菌(Aeromonas schubertii) lpe 海利斯顿菌(Listonella pelagia) pdp 美人鱼发光杆菌杀鱼亚种(Photobacterium damsela ss. piscicida) acx 食酸菌属(Acidovorax sp.) brv 短波单胞菌属(Brevundimonas sp.) she 希瓦菌属(Shewanella sp.) ro4 玫瑰单胞菌基因种4(Roseomonas genomospecies 4) ro6 玫瑰单胞菌基因种6(Roseomonas genomospecies 6) saj 毗邻颗粒链菌(Granulicatella adiacens) gct Granulicatella sp. hac Aggregatibacter actinomycetemcomitans hap 嗜沫凝聚杆菌(Aggregatibacter aphrophilus) hse 惰性凝聚杆菌(Aggregatibacter segnis) agt Aggregatibacter sp. bxx Shigella boydii, nontypable dxx Shigella dysenteriae, nontypable fxx Shigella flexneri, nontypable 135 Neisseria meningitidis, serogroup W135 nmy Neisseria meningitidis, serogroup Y 479 Shigella flexneri, serogroup AA479 fvx Shigella flexneri, variant X fvy Shigella flexneri, variant Y - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - + + - - - - - - - - - - - -

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附表5：

抗生素字典

抗生素 代码 AMC AMC AMK AMK AMP AMP AMX AMX AMX ATM ATM AZM AZM CAZ CAZ CEC CEC CEP CFP CFP CHL CHL CIP CIP CLI CLI CRB CRO CRO CSL CSL CSL CSL CTT CTT CTX CTX

英文名称 Amoxicillin/Clavulanic acid Amoxicillin/Clavulanic acid Amikacin Amikacin Ampicillin Ampicillin Amoxicillin Amoxicillin Amoxicillin Aztreonam Aztreonam Azithromycin Azithromycin Ceftazidime Ceftazidime Cefaclor Cefaclor Cephalothin Cefoperazone Cefoperazone Chloramphenicol Chloramphenicol Ciprofloxacin Ciprofloxacin Clindamycin Clindamycin Carbenicillin Ceftriaxone Ceftriaxone Cefoperazone/Sulbactam Cefoperazone/Sulbactam Cefoperazone/Sulbactam Cefoperazone/Sulbactam Cefotetan Cefotetan Cefotaxime Cefotaxime WHONET 字段名 阿莫西林/克拉维酸 AMC_ND20 阿莫西林/克拉维酸 AMC_NM 阿米卡星 AMK_ND30 阿米卡星 AMK_NM 氨苄西林 AMP_ND10 氨苄西林 AMP_NM 阿莫西林 AMX_ND25 阿莫西林 AMX_ND30 阿莫西林 AMX_NM 氨曲南 ATM_ND30 氨曲南 ATM_NM 阿奇霉素 AZM_ND15 阿奇霉素 AZM_NM 头孢他啶 CAZ_ND30 头孢他啶 CAZ_NM 头孢克洛 CEC_ND30 头孢克洛 CEC_NM 头孢噻吩 CEP_ND30 头孢哌酮 CFP_ND75 头孢哌酮 CFP_NM 氯霉素 CHL_ND30 氯霉素 CHL_NM 环丙沙星 CIP_ND5 环丙沙星 CIP_NM 克林霉素 CLI_ND2 克林霉素 CLI_NM 羧苄西林 CRB_ND100 头孢曲松 CRO_ND30 头孢曲松 CRO_NM 头孢哌酮/舒巴坦 CSL_ND30 头孢哌酮/舒巴坦 CSL_ND75 头孢哌酮/舒巴坦 CSL_NDXX 头孢哌酮/舒巴坦 CSL_NM 头孢替坦 CTT_ND30 头孢替坦 CTT_NM 头孢噻肟 CTX_ND30 头孢噻肟 CTX_NE 48

中文名称 CTX CXM CXM CZO CZO CZX DOR DOR DOX ERY ERY ETP ETP FEP FEP FOS FOS FOX FOX GEH GEH GEN GEN IPM IPM LNZ LNZ LVX LVX MAN MEM MEM MET MET MEZ MFX MFX MNO MNO NET NET NIT NIT

Cefotaxime Cefuroxime Cefuroxime Cefazolin Cefazolin Ceftizoxime Doripenem Doripenem Doxycycline Erythromycin Erythromycin Ertapenem Ertapenem Cefepime Cefepime Fosfomycin Fosfomycin Cefoxitin Cefoxitin Gentamicin-High Gentamicin-High Gentamicin Gentamicin Imipenem Imipenem Linezolid Linezolid Levofloxacin Levofloxacin Cefamandole Meropenem Meropenem Methicillin Methicillin Mezlocillin Moxifloxacin Moxifloxacin Minocycline Minocycline Netilmicin Netilmicin Nitrofurantoin Nitrofurantoin 头孢噻肟 头孢呋辛 头孢呋辛 头孢唑啉 头孢唑啉 头孢唑肟 多尼培南 多尼培南 多西环素 红霉素 红霉素 厄他培南 厄他培南 头孢吡肟 头孢吡肟 磷霉素 磷霉素 头孢西丁 头孢西丁 高浓度庆大霉素 高浓度庆大霉素 庆大霉素 庆大霉素 亚胺培南 亚胺培南 利奈唑胺 利奈唑胺 左旋氧氟沙星 左旋氧氟沙星 头孢孟多 美洛培南 美洛培南 甲氧西林 甲氧西林 美洛西林 莫西沙星 莫西沙星 米诺环素 米诺环素 奈替米星 奈替米星 呋喃妥因 呋喃妥因 CTX_NM CXM_ND30 CXM_NM CZO_ND30 CZO_NM CZX_ND30 DOR_ND10 DOR_NM DOX_ND30 ERY_ND15 ERY_NM ETP_ND10 ETP_NM FEP_ND30 FEP_NM FOS_ND200 FOS_NM FOX_ND30 FOX_NM GEH_ND120 GEH_NM GEN_ND10 GEN_NM IPM_ND10 IPM_NM LNZ_ND30 LNZ_NM LVX_ND5 LVX_NM MAN_ND30 MEM_ND10 MEM_NM MET_ND5 MET_NM MEZ_ND75 MFX_ND5 MFX_NM MNO_ND30 MNO_NM NET_ND30 NET_NM NIT_ND300 NIT_NM 49

NOR NOV OFX OXA OXA PEN PEN PEN PIP PIP POL POL QDA QDA RIF RIF SAM SAM SSS STH STH STR STR SXT SXT TCC TCC TCY TCY TEC TEC TGC TGC TIC TIC TOB TOB TZP TZP VAN VAN VAN Norfloxacin Novobiocin Ofloxacin Oxacillin Oxacillin Penicillin G Penicillin G Penicillin G Piperacillin Piperacillin Polymixin B Polymixin B Quinupristin/Dalfopristin Quinupristin/Dalfopristin Rifampin Rifampin Ampicillin/Sulbactam Ampicillin/Sulbactam Sulfonamides Streptomycin-High Streptomycin-High Streptomycin Streptomycin Trimethoprim/Sulfamethoxazole Trimethoprim/Sulfamethoxazole Ticarcillin/Clavulanic acid Ticarcillin/Clavulanic acid Tetracycline Tetracycline Teicoplanin Teicoplanin Tigecycline Tigecycline Ticarcillin Ticarcillin Tobramycin Tobramycin Piperacillin/Tazobactam Piperacillin/Tazobactam Vancomycin Vancomycin Vancomycin 诺氟沙星 新生霉素 氧氟沙星 苯唑西林 苯唑西林 青霉素G 青霉素G 青霉素G 哌拉西林 哌拉西林 多粘菌素B 多粘菌素B 奎奴普丁/达福普汀 奎奴普丁/达福普汀 利福平 利福平 氨苄西林/舒巴坦 氨苄西林/舒巴坦 磺胺类 高浓度链霉素 高浓度链霉素 链霉素 链霉素 复方新诺明 复方新诺明 替卡西林/克拉维酸 替卡西林/克拉维酸 四环素 四环素 替考拉宁 替考拉宁 替加环素 替加环素 替卡西林 替卡西林 妥布霉素 妥布霉素 哌拉西林/他唑巴坦 哌拉西林/他唑巴坦 万古霉素 万古霉素 万古霉素 NOR_ND10 NOV_ND5 OFX_ND5 OXA_ND1 OXA_NM PEN_ND10 PEN_NE PEN_NM PIP_ND100 PIP_NM POL_ND300 POL_NM QDA_ND15 QDA_NM RIF_ND5 RIF_NM SAM_ND10 SAM_NM SSS_ND200 STH_ND300 STH_NM STR_ND10 STR_NM SXT_ND1_2 SXT_NM TCC_ND75 TCC_NM TCY_ND30 TCY_NM TEC_ND30 TEC_NM TGC_ND15 TGC_NM TIC_ND75 TIC_NM TOB_ND10 TOB_NM TZP_ND100 TZP_NM VAN_ND30 VAN_NE VAN_NM 50

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