载体构建
更新时间:2024-03-18 15:32:01 阅读量: 综合文库 文档下载
一、目的基因的a(4.2k) PCR
1、PCR体系(引物ath-a-4.2k-F ath-a-4.2k-R 酶 fusion聚合酶 体积单位 μ l) DNA fusion 5*fusionHF 2.5mM F R ddH2O Buffer dNTP 2 *3 0.25 0.75 4 12 2 6 0.5 1.5 0.5 1.5 10.75 32.75 totle 20 60 98°C 30s 98°C 15s 56°C 30s 72°C 4min30s 72°C10min 16°C∝ 30cycle
(注:聚合酶说明:fusion聚合酶是高保真聚合酶,扩增片段为平末端) 2、跑胶
1%琼脂糖凝胶胶跑20min,观察实验结果。 3、胶回收(试剂盒回收) (1)、在紫外光下将扩增条带用刀切下,要尽量快(紫外会诱导基因突变)放在1.5mL的离心管中;(注意:刀头尽量伸进离心管内部,防止污染离心管外部可接触部位) (2)、在离心管中加入300-400μ l的Buffer DE-A,混合均匀后于75°C水浴锅加热溶解直至透明; (3)、加0.5倍Buffer DE-A体积的Buffer DE-B,混合均匀。 (4)、吸取步骤3中的混合液,转移到DNA制备管(置于2mL离心管)中,12000g离心1min。弃滤液。 (5)、将制备管置回2mL离心管,加500μ l BufferW1;12000g离心30s,弃滤液; (6)、将制备管置回2mL离心管,加700μ l BufferW2;12000g离心30s,弃滤液;以同样的方法再用700μ l BufferW2洗涤一次,12000g离心1min;(注意:加BufferW2之前必须确定其中已经加入无水乙醇) (7)、将制备管置回2mL离心管,12000g离心2min,之后在静止2min(吸附DNA并晾干); (8)、将制备管置于1.5mL离心管中,在制备膜中央加25-30μ l Eluent或去离子水,室温静置1min,12000g离心1min洗涤DNA。(注意:将去离子水或者Eluent加热到65°C将提高洗脱效率)。
二、加A(注:聚合酶说明:fusion聚合酶是高保真聚合酶,扩增片段为平末端,需加A才能与载体结合)
1、体系:体积单位 μ l 10mM dNAP totle 回收DNA片段 10*taq Buffer Taq酶 18 2 0.5 0.5 21 在PCR仪中72°C 30min,16°C∝ 2、跑胶观察结果并回收获得ath-a-4.2k-addA片段。 三、连接TOPO载体(T载体)
体系:体积单位 μ l Salt Solution ddH2O TOPO载体 胶回收产物 1 1 2 2 totle 6 室温下放一白天(10h左右)获得ath-a-4.2k-TOPO载体。 四、转化:转到大肠杆菌中表达(DH5α) 连接产物中加50μ l感受态DH5α 冰上30min 42°C水浴30s 冰上3 min 加250μ l无抗LB 37°C摇床摇1 12000g离心1min 涂板(Spe抗性,筛选) 37°C培养箱过夜(8h左右)
五、菌落PCR
1、 体系:体积单位 μ l 引物:ath-a-4.2k-5-F ath-a-4.2k-5-R Taq 10*PB2.5mM F R ddH2O (PCR dNTP Buffer) 0.5 2 2 0.5 0.5 14.5 *50 98°C 30s 28 cycle
25 100 98°C 15s 100 56°C 30s 25 25 72°C 4min30s 725 totle 20 1000 72°C10min 16°C∝
2、操作:
(1) 将Mix分装到PCR板中;
(2) 取一个新的Spe板打格并标记;
(3) 用10μ l的枪头挑取筛选到的单克隆,在新的Spe板划线并把枪头一起打到PCR板中; (4) 用排枪吸打取出枪头; (5) 加阳性对照并盖好盖子;
(6) 放入PCR仪设定程序开始扩增。 3、跑胶
1%琼脂糖凝胶胶跑20min,观察实验结果,标记阳性单克隆。 六、摇菌
将标记的阳性单克隆接到Spe LB培养液中在37°C摇床中摇菌。 七、保菌
吸取一点菌液于保菌管中,按1:1的比例加入80%甘油吸打均匀,液氮速冻后放入-80°C冰箱。
八、提质粒(试剂盒)
第一次使用时,将试剂盒携带的RNase A全部加入到Buffer S1 中,混合均匀,4°C贮存。 1. 取1-4 ml在LB培养基中培养过夜的菌液(若使用丰富培养基,菌液体积应减半或更少),12,000×g
离心1 min,弃尽上清。
2. 加250 μl Buffer S1 悬浮细菌沉淀,悬浮需均匀,不应留有小的菌块。 * 确认Buffer S1中已加入RNase A。 3. 加250 μl Buffer S2,温和并充分地上下翻转4-6次混合均匀使菌体充分裂解,直至形成透亮的溶
液。此步骤不宜超过5 min。
* Buffer S2使用后立即盖紧瓶盖,以免空气中的CO2中和Buffer S2中的NaOH,降低溶菌效率。
* 避免剧烈摇晃,否则将导致基因组DNA的污染。 * 此步骤不宜超过5 min。
4. 加350 μl Buffer S3,温和并充分地上下翻转混合6-8次,12,000×g离心10 min。 * 避免剧烈摇晃,否则将导致基因组DNA的污染。 步骤5~7可以选择负压法或离心法纯化质粒DNA。 A. 负压法
5A. 将质粒DNA制备管插到负压装置的接口上。吸取步骤4中的离心上清并转移到制备管中,
开启并调节负压至-20-30英寸汞柱,缓慢吸走管中溶液。
6A. 加500 μl Buffer W1,吸尽管中溶液。
7A. 加700 μl Buffer W2,吸尽管中溶液;以同样的方法再用700 μl Buffer W2 洗涤一次。 * 确认在Buffer W2 concentrate中已按试剂瓶上的指定体积加入无水乙醇。 * 两次使用Buffer W2冲洗能确保盐份被完全清除,消除对酶切反应的影响。 8A. 将制备管置于2 ml离心管(试剂盒内提供)中,12,000×g离心1 min。 B. 离心法
5B. 吸取步骤4中的离心上清并转移到制备管(置于2 ml离心管(试剂盒内提供)中),12,000×g
离心1 min,弃滤液。
6B. 将制备管置回离心管,加500 μl Buffer W1,12,000×g离心1 min,弃滤液。
7B. 将制备管置回离心管,加700 μl Buffer W2,12,000×g离心1 min,弃滤液;以同样的方法
再用700 μl Buffer W2 洗涤一次。弃滤液。
* 确认在Buffer W2 concentrate中已按试剂瓶上的指定体积加入无水乙醇。 * 两次使用Buffer W2冲洗能确保盐份被完全清除,消除对酶切反应的影响。 8B. 将制备管置回2 ml离心管中,12,000×g离心1 min。 9. 将制备管移入新的1.5 ml离心管(试剂盒内提供)中,在制备管膜中央加60-80 μl Eluent 或去离
子水,室温静置1 min。12,000×g离心1 min。
* 将Eluent或去离子水加热至65℃将提高洗脱效率。 九、测序
选取几个质粒送去测序(因为会有假阳性,所以常送去测序后进行序列比对来进一步确定所转基因正确)
十、LR反应(将测序正确的质粒继续进行LR反应) 体系:体积单位 μ l ath-a-4.2k-TOPO 1.5 PMDC99 1.5 Eluent 1 GatewayLR Clonese Enzyme Mix 1 totle 5 1、25°C 1h(PCR控温或者室温)
2、加0.5μ l蛋白酶K后置于37°C培养箱10min终止反应; 十一、转化
1μ l LR反应产物+50μ l感受态DH5α 冰上30min 42°C水浴30s 冰上3 min 加250 37°C摇床摇1h 涂板(Kan抗性,筛选) 37°C培养箱过夜(8h左右) 十二、菌落PCR 摇菌 保菌 提质粒(试剂盒) 测序 十三、转化(农杆菌GV3101转μ l无抗LB化,电击法) 步骤:
1、 提前半小时照紫外灭菌;
2、 将电击杯放在灭过菌的超净台晾干;
3、 将电击仪与插槽连上,打开电源,选择农杆菌转化; 4、 在电击杯中加1μ l质粒,50μl农杆菌感受态; 5、 按Pulse键电击;
6、 点击后立即拿出电击杯并加250μ l无抗LB培养液;
7、 将电击杯内的菌液转移到EP管中,于28°C摇床摇1h;
8、 涂板(三抗载体Kan Rif G)
注意:整个过程要在冰盒上操作,包括电击杯前放入冰盒。 十四、摇菌(大摇,因为下一步做拟南芥转化需量较多) 十五、转拟南芥
1、 将大摇的转化农杆菌6000g离心15min;
2、 配制转化液(5%的蔗糖—花粉等渗溶液 0.02%的Silwet-7—辅助转化 3、 将转化液倒入大培养皿中浸泡拟南芥花部(可以整体浸入) 4、 盖膜(用黑色塑料膜包上黑暗处理)生长24h; 5、 24h后揭开塑料膜正常生长
注意:所转化的拟南芥花必须是花蕾,快开而未开,避免已经授粉。
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