分子生物学名词解释

更新时间:2023-09-22 08:51:02 阅读量: 经管营销 文档下载

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1.翻译(translation):以mRNA为模板,氨酰-tRNA为原料直接供体,在多种蛋白质因子和酶的参与下,在核糖体上将mRNA分子上的核苷酸顺序表达为有特定氨基酸顺序的蛋白质的过程。

2.密码子(codon):mRNA中碱基顺序与蛋白质中氨基酸顺序的对应关系是通过密码实现的, mRNA中每三个相邻的碱基决定一个氨基酸,这三个相邻的碱基称为一个密码子。 3.密码的简并性(degeneracy):—个氨基酸具有两个以上密码子的现象。

4.同义密码子(synonym codon):为同—种氨基酸编码的各个密码子,称为同义密码了。 5.变偶假说(wobble hypothesis):指反密码子的前两个碱基(3’-端)按照标准与密码子的前两个碱基(5’-端)配对,而反密码子中的第三个碱基则有某种程度的变动,使其有可能与几种不同的碱基配对。

6.移码突变(frame-shift mutation):在mRNA中,若插入或删去一个核苷酸,就会使读码发错误,称为移码,由于移码而造成的突变、称移码突变。

7.同功受体(isoacceptor):转运同一种氨基酸的几种tRNA称为同功受体。 8.反密码子(anticodon):指tRNA反密码子环中的三个核苷酸的序列,在蛋白质合成过程中通过碱基配对,识别并结合到mRNA的特殊密码上。 9.多核糖体(polysome):mRNA同时与若干个核糖体结合形成的念珠状结构,称为多核糖体。

1.中心法则(central dogma):生物体遗传信息流动途径。最初由Crick(1958)提出,经后人的不断补充和修改,现包括反转录和RNA复制等内容。

2.半保留复制(简称复制)(semiconservative replication):亲代双链DNA以每条链为模板,按碱基配对原则各合成一条互补链,这样一条亲代DNA双螺旋,形成两条完全相同的子代DNA螺旋,子代DNA分子中都有一条合成的“新”链和一条来自亲代的旧链,称为半保留复制。

3.DNA聚合酶(DNA polymerase):指以脱氧核苷三磷酸为底物,按5’→ 3’方向合成DNA的一类酶,反应条件:4种脱氧核苷三磷酸、Mg+、模板、引物。DNA聚合酶是多功能酶,除具有聚合作用外,还具有其它功能,不同DNA聚合酶所具有的功能不同。

4.解旋酶(helicase):是一类通过水解ATP提供能量,使DNA双螺旋两条链分开的酶,每解开一对碱基,水解2分子ATP。

5.拓扑异构酶(topoisomerase):是一类引起DNA拓扑异构反应的酶,分为两类:类型I的酶能使DNA的一条链发生断裂和再连接,反应无需供给能量,类型Ⅱ的酶能使DNA的两条链同时发生断裂和再连接,当它引入超螺旋时,需要由ATP供给能量。

6.单链DNA结合蛋白(single-strand binding protein ,SSB):是一类特异性和单链区DNA结合的蛋白质。它的功能在于稳定DNA解开的单链,阻止复性和保护单链部分不被核酸酶降解。 7.DNA连接酶(DNA ligase):是专门催化双链DNA中缺口共价连接的酶,不能催化两条游离的单链DNA链间形成磷酸二酯键。反应需要能量。

8.引物酶及引发体(primase & primosome):以DNA为模板,以核糖核苷酸为底物,在DNA合成中,催化形成RNA引物的酶称为引物酶及引物体。大肠杆菌的引物酶单独没有活性,只有与其它蛋白质结合在一起,形成一个复合体,即引发体才有生物活性。

9.复制叉(replication fork):复制中的DNA分子,未复制的部分是亲代双螺旋,而复制好的部分是分开的,由两个子代双螺旋组成,复制正在进行的部分呈丫状叫做复制叉。

10.复制眼θ结构:在一段DNA上,正在复制的部分形成眼状结构。复制眼在环状DNA上形成的结构与希腊字母θ相象,所以叫θ结构。

11.前导链(1eading strand):在DNA复制过程中,以亲代链(3’→ 5’为模板时,子代链的合成 (5’→ 3’)是连续的.这条能连续合成的链称前导链。

12.冈崎片段(Okazaki fragment)、后随链(1agging strand):在DNA复制过程中,以亲代链(5’→ 3’)为模板时,子代链的合成不能以3’→ 5’方向进行,而是按5’→ 3’方向合成出许多小片段,因为是冈崎等人研究发现,因此称冈崎片段。由许多冈崎片段连接而成的子代链称为后随链。

13.半不连续复制(Semidiscontinuous replication):在DNA复制过程中,一条链的合成是连续的,另一条链的合成是不连续的,所以叫做半不连续复制。

14.逆转录(reverse transcription):以RNA为模板合成DNA的过程。

15.逆转录酶(reverse transeriptase):催化以RNA为模板合成DNA的逆转录过程的酶。 Temin(1960)首次从劳氏肉瘤病毒中发现。逆转录酶具有多种酶活性:依赖RNA的DNA聚合酶活性;依赖DNA的DNA聚合酶活性,RNA水解酶活性,DNA合成方向5’→ 3’。合成时需要引物与模板。 16.突变(mutation):基因组DNA顺序上的任何一种改变都叫做突变。分点突变和结构畸变。 17.点突变(Point mutation):是指一个或几个碱基对被置换(replacement),这种置换又分两种形式:转换(transition)一--指用一个嘌呤碱置换另一个嘌呤碱,一个嘧啶碱置换另一个嘧啶碱;颠换(transversion)一--指用嘌呤碱置换嘧啶碱或用嘧啶碱置换嘌呤碱。

18.结构畸变:基因中的缺口插入(insertion)或缺失(deletion)某些碱基造成移码突变使DNA的模板链失去功能。

19.诱变剂(mutagen):使基因组发生突变的物理、化学、生物因素叫诱变剂。

20.修复(repair):除去DNA上的损伤,恢复DNA的正常结构和功能是生物机体的一种保护功能。

21.光裂合酶修复(又称光复活)(photoreactivation):可见光将光裂合酶激活,它分解DNA上由紫外线照射而形成的嘧啶二聚体,使它们恢复成两个单独的嘧啶碱。

22.切除修复(excision repair):在一系列酶的作用下,将DNA分子中受损伤部分切除,以互补链为模板,合成出空缺的部分,使DNA恢复正常结构的过程。

23.重组修复(recombination repair):DNA在有损伤的情况下也可以复制,复制时子代链跃过损伤部位并留下缺口,通过分子间重组,从完整的另一条母链上将相应的核苷酸序列片段移至子链缺口处,然后用再合成的多核苷酸的序列补上母链的空缺,此过程称重组修复。 24.诱导修复和应急反应(induction repair and SOS response)(SOS修复):由于DNA受到损伤或复制系统受到抑制所诱导引起的一系列复杂的应急效应,称为应急反应。SOS反应主要包括两个方面:DNA损伤修复(SOS修复或称诱导修复)和诱变效应。SOS修复是一种易出差错的修复过程,虽能修复DNA的损伤而避免死亡。但却带来高的变异率。

25.DNA重组(recombination):DNA重组是指在真核生物减数分裂过程中,细菌细胞的转化中、病毒转导中等发生的DNA片段的交换或插入。

26.基因工程(又称基因重组技术)(gene/genetic engineering):是将外源基因经过剪切加工,再插入到一个具有自我复制能力的载体DNA中,将新组合的DNA转移到一个寄主细胞中,外源基因就可以随着寄主细胞的分裂进行繁殖,寄主细胞也借此获得外源基因所携带的新特性。

27.转录(transcription):由依赖于DNA的RNA聚合酶催化,以DNA的一条链的一定区段为模板,按照碱基配对原则,合成一条与DNA链互补的RNA链的过程。

28.模板链(template strand)[又称负(-)链,反意义链(antisense strand)]:转录过程中用作模板的这条DNA链,称模板链。

29.非模板链(nontemplate strand)[又称正(+)链,编码链(coding strand),有意义链(sense strand)]:与模板链互补的那条DNA链,称非模板链。

30.不对称转录(asymmetric transcription):因为RNA的转录只在DNA的任一条链上进行,

所以把RNA的合成叫做不对称转录。

31.启动子(promoter):DNA链上能指示RNA转录起始的DNA序列称启动子。

32.转录单位(transcription unit):RNA的转录只在DNA的一个片段上进行,这段DNA序列叫转录单位。

33.内含子(intron):真核生物基因中,不为蛋白质编码的、在mRNA加工过程中消失的DNA序列,称内含子。 34.外显子(exon):真核生物基因中,在mRNA上出现并代表蛋白质的DNA序列,叫外显子。 35.转录加工(post-transcriptional processing):细菌中很多RNA分子和几乎全部真核生物的RNA在合成后都需要不同程度的加工,才能形成成熟的RNA分子,这个过程叫转录后加工。 36.核内不均一RNA(hnRNA):是真核生物细胞核内的mRNA前体分子,分子量较大,并且不均一,含有许多内含子。 37.RNA的复制(RNA replication):某些病毒RNA既可以做为模板合成病毒蛋白质又可在 RNA复制酶(RNA replicase)的催化下,以自身RNA为模板,合成互补的RNA新链,合成方向5'→3’,这一过程叫RNA复制。

1.Silent mutation:没有明显性状改变的突变。是中性突变中的一种特殊情况。即在基因中碱基对发生替换,改变了mRNA的密码子,结果蛋白质中相应位点是发生了相同氨基酸的取代,由于氨基酸的序列未发生变化,所以蛋白质仍具有野生型的功能,实际上就是同义突变。

2.Back mutation:回复突变是指突变体的表现型回复为野生状态的突变。正向突变改变了野生型性状,突变体所失去的野生型性状可以通过第二次突变得到恢复,这种第二次突变就叫做回复突变。

3.Attenuator(衰减子):一个受到翻译控制的转录中止子结构。由于翻译作用的影响,其后面的基因或者被转录,或者在衰减子处实现转录的中止即产生衰减作用。

4.Insulator(绝缘子):能阻断激活或失活效应的元件。可在增强子和启动子之间阻断增强子的激活作用,也可防止异染色质的扩增,引起基因表达。 5.Inverted repeat:反向重复。方向相反的两端重复序列。

6.Negative superhelix of DNA:原来的绳子的两股以右旋方向缠绕,如果在绳子一端向松缠方向捻转,再将绳子两端连接起来,则会产生一个右旋的超螺旋以解除外加的捻转所造成的胁变。这样的DNA螺旋叫做负超螺旋。

7.Chi sequence:DNA分子上的同源重组热点序列5GCTGGTGG3,由RecBCD特异识别。

8.TILLING:Targeting Induced Local Lesions In Genome,即定向诱导基因组局部突变。指以筛选突变基因为主的反向遗传学研究。

9.Silencer:一种通过一段延伸的DNA区域影响染色质结构,从而调节转录关闭的DNA元件。

10.Pseudo allele:是表型效应相似,功能密切相关,在染色体上的位置又紧密连锁的基

因。它们像是等位基因,而实际不是等位基因。

11. Ap位点:所有细胞中都带有不同类型、能识别受损核酸位点的糖苷水解酶,它能够特异性切除受损核苷酸上的N-β-糖苷键,在DNA链上形成去嘌呤或去嘧啶位点,统称为AP位点.

gRNA:一种引导RNA编辑的小RNA分子,它能决定核苷酸对mRNA的插入或删除。

Promoter:启动子,与RNA聚合酶结合的DNA区域。

Pseudogene:假基因,与正常基因结构相似、但丧失正常功能的DNA序列,往往存在于真核生物的多基因家族中。

Paracodon:副密码子,tRNA中决定负载特定aa的空间密码。tRNA中特定序列与AARS的tRNA结合位点的特异基团间的分子契合。

Extein:前体多肽经过剪接后保留在成熟多肽中的肽链。

Trans-acting factor:反式作用因子,参与基因表达调控的因子, 它们与特异的靶基因的顺式元件结合起作用。

PCD:细胞程序性死亡,在正常生理条件下,细胞自身遗传程序控制有关基因的正常表达,细胞裂解成凋亡小体,逐渐死亡的现象。

Cis-dominance:顺式显性,基因对同一染色体上基因表达的调控作用。

Cis-acting factor:顺式作用元件,对基因表达有调节活性的DNA序列,其活性只影响与其自身同处在一个DNA分子上的基因。

Genome imprint:基因印记,一定的组织和细胞中,某些基因在DNA水平上的表达程度及表达时受到甲基化修饰,使仅来自双亲中的某一亲本的基因得以表达。 Homeobox:在调节发育的蛋白编码序列中存在的180bp的保守序列。

Molecular biology:广义指在分子水平上阐明生物学现象;狭义指在分子水平上研究基因的结构与功能。

Cis-acting factor:通过核苷酸自身的特异二级结构控制与其紧密连锁的结构基因的表达,一般不编码蛋白质产物。 Molecular Chaperone:分子伴侣,帮助其它多肽进行正确折叠的蛋白质,一旦折叠完成后,该蛋白质将解离出去,不构成功能多肽的一部分。

Polarity mutation:极性突变,在一个操纵子中,与操纵基因近邻的结构基因发生终止突变后,它除了影响该基因自身产物的翻译外,还影响其后结构基因多肽的翻译,并且具有极性梯度的特征。

RNA editing:向mRNA中插入、删除核苷酸的一种转录后加工过程。

RNAi:是一种RNA对基因表达的干涉现象。一些小的RNA分子能够引起相应的mRNA降解及DNA的甲基化,导致基因的沉默。

Regulon:调节子。由一个调节基因的产物调控几个操纵元基因表达的基因表达调控单元。 Leading sequence:引导序列,转录起始点到翻译起始密码子之间的DNA序列。 Replicon:复制子(replicon):是DNA复制是从一个DNA复制起点开始,最终由这个起

点起始的复制叉完成的片段。DNA 中发生复制的独立单位称为复制子。 从DNA复制起始到复制终止的DNA区域。

Open reading frame:可读框,是以起始密码子开始,在三联体读框的倍数后出现终止密码子之间的一段序列。

在DNA片段中一种潜在的蛋白编码序列,具有起始密码子、终止密码子和二者间的密码子区域。

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hoogsteen bonding :在形成三螺旋与四螺旋DNA结构时,嘌呤A或G第6,7位与嘧啶3,4位形成的H键连接

homeobox:不同的转录因子基因内具有相似的与DNA seq.结合的同源区域。 heteroallele:非全同等位基因,在同一基因座位(locus)中,不同突变位点(site)发生突变所形成的等位基因 syn conformation of nucleoside:

核苷中碱基以糖苷键为轴旋转时的夹角χ= 0°±90°的构相

R-Loop; when an RNA strand hybridized with its complementary strand in a DNA duplex, thereby displacing the original strand of DNA in the form of a loop extending over the region of hybridization

paracodon : tRNA分子中为AARS 特定氨基酸所识别的若干Nts

epigenetics:The ability of different states, which may have different phenotype consequences, to be inherited without any change in the DNA sequence.

intron early:认为所有基因原初均有intron,进化中原核生物中的intron逐渐消失的

PCD :细胞内由细胞死亡(凋亡)的基因启动,而导致DNA降解,细胞形成凋亡小体的程序化过程

retro-transposon:由RNA,cDNA介导的DNA分子插入基因组的现象,导致基因组的扩增

si RNA : 在Dicer的作用下被切割的20Nt左右的小RNA分子, 进入RISC系统, 参与RNAi过程

gRNA: 一种引导RNA编辑的小RNA分子,它能决定核苷酸对mRNA的插入或删除。 insulator: 能阻断激活或失活效应的元件。可在增强子和启动子之间阻断增强子的激活作用,也可防止异染色质的扩增,引起基因表达。

gene imprinting; 个体中双亲的基因由于DNA甲基化作用,而导致来自某一亲本基因表达的沉默的现象,

AARS ; 氨酰-tRNA合成酶,通过氨基酸结合位点的双筛作用和tRNA结合位点与tRNA的paracodon结合, 保证氨基酸与tRNA的准确结合。

Negative-repressible operon; 负调控的阻遏操纵子,操纵子中调节基因产物为阻遏蛋白, 效应物为辅阻遏蛋白的模式

syn conformation of nucleoside; 核苷顺式构象,核苷中碱基以糖苷键为轴旋转时的夹角χ= 0°±90°的构相

signal sequence; 引导分泌性蛋白穿膜的30氨基酸的短肽, N端15氨基酸多为疏水性氨基酸, 相随是亲水性氨基酸

homeosis: 由homeobox引发的同源异型表达现象

trans-splicing; 内含子的剪接过程发生在两条来源不同的pre-mRNA分子中, 被剪切的Intron为Y型

Alternative splicing(选择性剪切): 从一个mRNA前体中通过不同的剪接方式(选择不同的剪接位点组合)产生不同的mRNA剪接异构体的过程,而最终的蛋白产物会表现出不同或者是相互拮抗的功能和结构特性,或者,在相同的细胞中由于表达水平的不同而导致不同的表型。

Telomerase(端粒酶): 一种由RNA和蛋白质组成的核糖核蛋白复合体,属于逆转录酶。端粒

酶能延长缩短的端粒(缩短的端粒其细胞复制能力受限),从而增强细胞的增殖能力。

Degeneracy of genetic code (密码子的简并性):—个氨基酸具有两个以上密码子的现象。

Sense strand (有义链):双链DNA中的非模板链。

Codon bias(密码子偏爱性):遗传信息在由mRNA到蛋白质的传递过程中是以三联体密码子的形式传递的。每种氨基酸至少对应一个密码子,最多的有6种对应的密码子。编码同一种氨基酸的密码子称为同义密码子。在蛋白质的合成过程中,同义密码子的使用概率并不相同。某一物种或某一基因通常倾向于使用一种或几种特定的同义密码子,这些密码子被称为最优密码子(Optimal Codon),此现象被称为密码子偏爱性(Codon Usage bias)。

Epigenetics:表观遗传学是研究基因的核苷酸序列不发生改变的情况下,基因表达了可遗传的变化的一门遗传学分支学科。

Intron loop:内含子环,当mRNA与其基因组结构基因杂交配对后,内含子部分因不能与mRNA配对而突出成环。

PCD:细胞程序性死亡,生理条件下,在细胞自身遗传程序的控制下,有关基因的正常表达,细胞裂解成凋亡体(apoptotic bodies), 逐渐死亡的现象。

Wobble hypothesis:摆动学说认为,在密码子与反密码子的配对中,前两对严格遵守碱基配对原则,第三对碱基(密码子3‘位碱基和反密码子5’位碱基,也称为摆动位置)有一定的自由度,可以“摆动”,他认为除A-U、G-C配对外,还有非标准配对,I-A、I-C、I-U,由于存在摆动现象,所以使得一个tRNA反密码子可以和一个以上的mRNA密码子结合。

复制叉(replication fork):复制中的DNA分子,未复制的部分是亲代双螺旋,而复制好的部分是分开的,由两个子代双螺旋组成,复制正在进行的部分呈丫状叫做复制叉。

本文来源:https://www.bwwdw.com/article/ikyd.html

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