药物基因检测位点及意义

更新时间:2023-10-20 11:43:01 阅读量: 综合文库 文档下载

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检测项目名称 基因位点 01CYP2C19*2(G>A) 细胞色素氧化酶2C19*2型,代谢酶 02CYP2C19*3(G>A) 细胞色素氧化酶2C19*3型,代谢酶 60CYP2C19*17(C>T) 细胞色素氧化酶2C19*17型,代谢酶 152PON1(A>G) 对氧磷酶1,代谢酶 01CYP2C19*2(G>A) 细胞色素氧化酶2C19*2型,代谢酶 02CYP2C19*3(G>A) 细胞色素氧化酶2C19*3型,代谢酶 69VKORC1(1639G>A) 维生素K环氧化物还原酶复合物1亚单位,靶点 检测意义 氯吡格雷 预测氯吡格雷抵抗风险,给出个体合适剂量,提高氯吡格雷疗效,降低无效用药风险。 氯吡格雷为前药,体外无活性,口服经肠(ABCB1)吸收,入肝脏,经肝药酶CYP2C19*2、*3、*17代谢激活,其活性代谢产物,再经过PON1激活,才能发挥抗血小板的功效。CYP2C19*2、*3、*17及PON1酶活性决定了氯吡格雷的疗效。 其中,CYP2C19*17突变后,氯吡格雷活性增强,敏感度高,出血风险高,需高度关注出血风险,尤其是蛛网膜下腔出血。 氯吡格雷简化版 (只测两个位点) 仅仅判断氯吡格雷抵抗风险,只能测出部分抵抗患者,会有漏检,且不能判断出血风险。 华法林 12CYP2C9*3(1075A>C) 细胞色素氧化酶2C9*3型,代谢酶 华法林经CYP2C9代谢后失活,基因突变者导致该药在体内蓄积,应减量;VKORC1为华法林作用靶点,基因突变者,对华法林敏感性增加,应减量。 VKORC1 CYP2C9用于起始剂量和维持剂量的计算,起始剂量给药五天后,转入维持剂量微调。 缩短调药时间,降低血栓和出血等不良反应发生。 阿司匹林 106PEAR1(G>A) PEAR1 :GG等位基因对阿司匹林抗血小板应答好; AA\\AG基因型,用阿司匹林(或结合氯吡格雷),PCI患者,心梗和死亡率高。 预测疗效,给出个体化用量。 30%~50%的人携带有Lys504基因突变。突变者中42.4%,正常剂量硝酸甘油起效慢,应换药或联用其他抗心绞痛药物。 预测硝酸甘油抵抗风险,避免用药无效事件 PM 弱代谢型:换药,用比索洛尔或卡维地洛。或减少75%剂量。 IM 中间代谢型:换药,用比索洛尔或卡维地洛。或减少50%剂量。 UM 超快代谢型:换药,用比索洛尔或卡维地洛。 美托洛尔的副作用有头晕、头痛、乏力、四肢冰凉、心跳减慢、胸闷、血压忽高忽低等等。 美托洛尔疗效和副作用受CYP2D6代谢酶影响,检测该基因判断患者代谢快慢,给出个体化用药剂量建议,提高疗效,降低副反应。 AA基因型心衰患者,使用坎地沙坦治疗,疗效应答比AC、(CC)型好。 预测疗效。 TT基因型,降脂效果最好,其次是CT型。CC型降脂效果较小。 预测降脂效果 GG基因型患者,阿托伐他汀治疗,降脂效果比GT、TT型者明显。 预测降脂效果 1、677的TT基因型,叶酸转化为甲基叶酸受限,使用叶酸不能降低血中同型半胱氨酸水平。应配合使用大剂量VB12。 硝酸甘油 20ALDH2(1510G>A) 线粒体乙醛脱氢酶2,代谢酶 06CYP2D6(2850C>T) 细胞色素氧化酶2D6 2850位点多态性,代谢酶 美托洛尔 08CYP2D6(100C>T) 细胞色素氧化酶2D6 100位点多态性,代谢酶 10CYP2D6(1758G>A) 细胞色素氧化酶2D6 1758位点多态性,代谢酶 坎地沙坦 64AGTR1(1166A>C) I型血管紧张素II受体1166位点,靶点 62ABCB1(3435T>C) 多耐药基因1的3435位点,药物转运体 阿托伐他汀 13ABCB1(2677T>G) 多耐药基因1的2677位点,药物转运体 叶酸 68MTHFR(677C>T) 亚甲基四氢叶酸还原酶,代谢酶 93MTHFR(1298A>C) 亚甲基四氢叶酸还原酶,代谢酶 2、1298的CC基因型,叶酸转化为甲基叶酸受限,使用叶酸不能降低血中同型半胱氨酸水平。应配合使用大剂量VB12。 检测叶酸代谢通路,通路受阻者,体内叶酸缺乏,各种代谢及合成不足,从而引发多种疾病,比如糖尿病,高血压、脑卒中、偏头痛、痴呆、动脉硬化、静脉血栓、精神疾病,胎儿发育异常等。 1、 治疗胃食管反流、胃溃疡、根除H.pylori等,PM、IM疗效好; 2、 EM疗效不理想,EM者应加用法莫替丁等; 3、 UM者,换用雷贝拉唑。 预测疗效,减少无效用药 TT基因型(*1/*1),酶活性正常,正常剂量给药。CC基因型(*3/*3),酶活性低,硫鸟嘌呤和嘌呤类似物毒性高,可使患者出现严重骨髓抑制,可致命,应减剂量。TC基因型(*1/*3),减少剂量到正常起始剂量的30-70;CC基因型(*3/*3),巯嘌呤禁用或将剂量减少到正常起始剂量的6%,硫唑嘌呤减少剂量到正常起始剂量的10%,并将给药频率从每天一次减少到每周三次。并根据骨髓抑制情况进一步调整药物剂量。硫鸟嘌呤给药情况类似。 预测疗效及毒副作用:酶活性高,药物有效成分被代谢灭活的多,毒性低,疗效也减低,疾病复发率高。酶活性低,药物有效成分被灭活的少,疗效好,但副作用风险高,复发率低。 判断股骨头坏死的风险:PAI-1 4G/5G: 4G5G 高风险,5G低风险;ABCB1 C3435T:CC高风险;C T/TT低风险。 01CYP2C19*2(G>A) 质子泵抑制剂:奥细胞色素氧化酶2C19*2型,代谢酶 美拉唑、泮托拉唑、兰索拉唑、埃索美02CYP2C19*3(G>A) 拉唑 细胞色素氧化酶2C19*3型,代谢酶 19TPMT*3(T>C) 硫唑嘌呤 巯嘌呤、硫鸟嘌呤 巯嘌呤甲基转移酶*3型,代谢酶 糖皮质激素 27PAI-1(4G/5G) 纤溶酶原激活物抑制物-1,效应分子 62ABCB1(3435T>C) 多耐药基因1的3435位点,药物转运体 21GSTP1(313A>G) 谷胱甘肽S转移酶基因1,代谢酶 环磷酰胺 68MTHFR(677C>T) 亚甲基四氢叶酸还原酶,代谢酶 18DPYD*2A(476002G>A) 二氢嘧啶脱氢酶*2A型,代谢酶 153DPYD*13(1679T>G) 二氢嘧啶脱氢酶*13型,代谢酶 风险较高: PAI-1及ABCB1均为高风险,即两个高风险,则风险度高。需高度关注骨骼反应,同时配伍用双膦酸盐。降低激素剂量并换用其他药物。 风险度中等:PAI-1及ABCB1中,有一个高风险,则风险度中等,需要关注骨骼反应,一旦有不良反应征象,即配伍用双膦酸盐。 风险度低:PAI-1及ABCB1均为低风险,则风险度低。但仍需关注骨骼反应,一旦有不良反应征象,即配伍用双膦酸盐。 糖皮质诱导的股骨头坏死患者平均年龄在35岁左右,正值壮年,若因为药物的副作用致残,很可惜。基因检测可以预测糖皮质激素诱导的股骨头坏死风险。筛查出高风险患者,配合使用双膦酸盐,预防股骨头坏死。 1、GSTP1的AA和AG型,与GG型相比,血液毒性的风险较低,风险比低约3倍。 2、GG和AG型的应答率较高,为71.5%;AA型的应答率仅为50%。 预测毒性风险,减少伤害 TT基因型粘膜毒性和ADR比CT和CC型高;CT型毒性较低;CC型,副作用风险低。 预测粘膜毒性 1、*2A的GG基因型、*13的TT基因型、2846的TT基因型:DPD 活性正常,5-FU使用标准剂量 2、*2A的GA基因型、*13的GT基因型、2846的AT基因型:DPD活性减少30% - 70% ,易出现氟尿嘧啶药物中毒,5-FU起始剂量至少减少50% 氟尿嘧啶、卡培他滨 154DPYD(2846 T>A) 二氢嘧啶脱氢酶2835位点,代谢酶 3、*2A的AA基因型、*13的GG基因型、2846的AA基因型:DPD完全失活,禁用5-FU,换用其他药物。 预测血液毒性,氟尿嘧啶、卡培他滨主要经过DPYD二氢嘧啶脱氢酶代谢灭活,DPYD二氢嘧啶脱氢酶活性高低,决定了氟尿嘧啶、卡培他滨的毒性。DPYD活性高,能将80%的氟尿嘧啶、卡培他滨灭活,毒性小。DPYD活性降低,不能将氟尿嘧啶、卡培他滨灭活,其毒性会破坏正常组织,引发毒性。 TT和CT基因型,紫杉醇类治疗,血液毒性和神经毒性发生率高,疾病控制率和总的生存率,较CC基因型低。 预测效果和神经毒性风险 AA基因型,出现毒副作用的风险最高,生存率降低,其次是AG型;GG型毒副作用风险最低,生存率较高。 CC基因型,铂类治疗,生存率高,同时严重的中性粒细胞减少的风险也高;CT型居中;TT型,生存率低、中性粒细胞减少的风险也低。 预测疗效,无效者建议换药 紫杉醇 62ABCB1(3435T>C) 多耐药基因1的3435位点,药物转运体 21GSTP1(313A>G) 谷胱甘肽S转移酶基因1,代谢酶 铂类 29XRCC1(1196T>C) X射线修复缺陷基因1的Arg399Gln位点,药效相关基因 15UGT1A1*6(211G>A) UDP葡萄糖醛酸转移酶1家族*6型,代谢酶 16UGT1A1*28(TA6/7) UDP葡萄糖醛酸转移酶1家族*28型,代谢酶 34MGMT(2661500A>G) O-6-甲基鸟嘌呤-DNA甲基转移酶2661500位点,药物效应相关基因 伊立替康 预测致死性、迟发性腹泻风险 替莫唑胺 AA基因型,MGMT表达水平最高,替莫唑胺IC50药物剂量最高;AG基因型其次;GG基因型,MGMT表达水平最低,替莫唑胺IC50药物剂量低,最敏感,预后较AA型和AG型好。 预测疗效,MGMT表达沉默(即不修复烷化剂的损伤),疗效好,否则,替莫唑胺疗效差。

35MGMT(66G>A) O-6-甲基鸟嘌呤-DNA甲基转移酶66位点,药物效应相关基因 68MTHFR(677C>T) 亚甲基四氢叶酸还原酶,代谢酶 神经胶质瘤:替莫唑胺+放疗治疗,A意味着MGMT甲基化,替莫唑胺结合放疗,预后较好。 同上 TT基因型粘膜毒性和ADR比CT和CC型高;CT型毒性较低;CC型,副作用风险低,可用较高剂量。 CC基因型,粘膜毒性和ADR比AC和AA型高。AC型毒性较低。AA型毒性低,患者甚至可使用较高剂量,以获得较好疗效。 甲氨蝶呤 93MTHFR(1298A>C) 亚甲基四氢叶酸还原酶,代谢酶 检测叶酸代谢酶的意义在于,此酶活性高低,与疗效和副作用直接相关。 酶活性高者,叶酸代谢通路畅通,甲氨蝶呤治疗,发生副作用风险低,但药物敏感性也相对较低。 酶活性低者,叶酸代谢通路受阻,甲氨蝶呤治疗,发生副作用风险高,但药物敏感性好。 通过检测MTHFR基因,可预判甲氨蝶呤的疗效及黏膜炎和血液学毒性。给出个体化用药剂量,提高疗效,降低副作用。 T等位基因者,胰岛素抵抗 检测胰岛素抵抗 AA、GA基因型,免疫抑制效果较好,GG型效果弱于GA与AA型。 检测免疫抑制效果。 同时提醒:免疫抑制效果好者,发生感染的风险也高,需要给予更多关注,及时调整剂量。 出现腹泻的风险,CC基因型最高,CG其次,GG基因型最低。 预测霉酚酸酯的腹泻风险。慢代谢者的感染风险也较高。 胰岛素 126IRS1(C>T) 胰岛素受体底物1,靶点 85IMPDH2(7766A>G) 肌苷5'-单磷酸脱氢酶2,靶点 (用免疫抑制剂,需测) 98UGT1A8*2(518C>G) UDP葡萄糖醛酸转移酶1家族,多肽A8的*2型,代谢酶 (脏器移植患者,可选择性检测) 霉酚酸酯 94TNF-α(308G>A) 肿瘤坏死因子基因308位点,药物效应基因 (脏器移植患者,选择检测) 肾移植患者,AA和AG基因型,移植后12个月,出现活检证实的急性排斥反应的风险高。GG基因型风险低。 CYP3A5*3 GG等位基因者,代谢酶活性降低,可减少用药剂量并注意副作用的发生。 他克莫司疗效和副作用受CYP3A5*3代谢酶影响,代谢快者,用最大剂量;代谢慢者,药物体内蓄积,降低剂量,即可达到有效血药浓度,又可降低副作用。 GG基因型 (CYP3A5*3/*3) 代谢酶活性降低,药物暴露增加,与GA和AA型比,需要降低给药剂量并注意副作用的发生。GG型,按体重调整剂量,大约比AA型减少20%,GA型按体重调整剂量,大约比AA基因型减少15%。 可预判环孢素A在肝脏和肠道的代谢和排泄能力:快者给予正常剂量,慢者则药物体内蓄积,需适当减低剂量,一样可以达到有效血药浓度,并且降低毒副作用发生风险。 预测环孢素A在肝脏和肠道的代谢和排泄能力,快者给予正常剂量,慢者,药物体内蓄积,减低剂量,一样可以达到有效血药浓度,降低副作用。 阳性者,Stevens-Johnson综合征/中毒性表皮坏死松解症风险极高(OR=9.8-580),可预测20%-96%的别嘌醇所致SJS,禁用。 预测过敏反应,Stevens-Johnson综合征/中毒性表皮坏死松解症风险 77位点,预测77%以上的SJS病例 77 TB的T碱基者,均为HLA-B*1502阳性,使用卡马西平、苯妥因和磷苯妥因,出现Steven-Johnson综合征(SJS)和表皮松解综合征的风险非常高,应禁用卡马西平、苯妥因和磷苯妥因。 预测过敏反应,Stevens-Johnson综合征/中毒性表皮坏死松解症风险 他克莫司 58CYP3A5*3 (G>A) 细胞色素氧化酶3A5的*3型,代谢酶 58CYP3A5*3 (G>A) 细胞色素氧化酶3A5*3型,代谢酶 环孢素A 62ABCB1(3435T>C) 多耐药基因1的3435位点,药物转运体 133HLA-B*5801 白细胞分化抗原B *5801,毒副作用相关分子 别嘌醇 卡马西平、苯妥因、77HLA-B*1502TB(C > T) 磷苯妥因 白细胞分化抗原B1502标签位点B,毒副作用风险基因位点 奥卡西平 氯氮卓、氯米帕明、氯氮平、多塞平、氟西汀、奥氮平、丙米嗪、去甲替林、奋乃静、利培酮、硫利达嗪、文拉法辛、阿立哌唑、阿米替林 06CYP2D6(2850C>T) 细胞色素氧化酶2D6 2850位点多态性,代谢酶 08CYP2D6(100C>T) 细胞色素氧化酶2D6 100位点多态性,代谢酶 10CYP2D6(1758G>A) 细胞色素氧化酶2D6 1758位点多态性,代谢酶 58CYP3A5*3 (G>A) 细胞色素氧化酶3A5*3型,代谢酶 01CYP2C19*2(G>A) 细胞色素氧化酶2C19*2型,代谢酶 02CYP2C19*3(G>A) 细胞色素氧化酶2C19*3型,代谢酶 60CYP2C19*17(C>T) 细胞色素氧化酶2C19*17型,代谢酶 AA基因型的患者,代谢药物活性只有GG型的15%,药物易蓄积,用药3年后子宫内膜肿瘤和乳腺癌的风险,比GG基因型高,OR值为1.8。GA基因型也比GG型高,OR值为1.4。GG基因型者风险最低。所以,建议AA和GA基因型者,适当减少药物剂量。 预测代谢快慢,代谢慢者药物易蓄积,用药3年后子宫内膜肿瘤和乳UM型,换药;PM型,下调起始剂量50% 根据代谢快慢,给出个人适合的剂量。 GG基因型,代谢活性下降,副作用风险升高,可能需要下调剂量。GA基因型,代谢活性升高。AA型最高,可能治疗不理想 判断代谢状态和疗效,指导剂量调整; PM、IM代谢慢,应使用低剂量; EM用正常剂量; UM应换药或加大剂量。 喹硫平 舍曲林 雌激素 33SULT1A1(638G>A) 磺基转移酶1A1的638位点,代谢酶 腺癌的风险高;代谢快者,风险低。然而单从外表,无法判断一个人的代谢快慢,通过基因检测,可以清楚的看到患者的代谢情况。 68MTHFR(677C>T) 1、MTHFR 667正常基因为CC型;CT型,酶活性下降40%,流产风亚甲基四氢叶酸还原酶,代谢酶 险增加1.38倍;TT型,酶活性下降70%,流产风险增加2.54倍。CC:野生型,酶活性正常; MTHFR 677 T基因型者,新生儿(24个月),心理发育指数比正常CT突变杂合型,TT突变纯合型,酶活性下降40%;孩子低3.5分。 2、MTHFR 1298正常基因型为AA型;AC基因型,流产风险增加1.29酶活性下降70%。 倍;CC基因型,流产风险增加2.23被。 93MTHFR(1298A>C) 3、MTHFR 677 T +MTHFR 1298 C的孕妇,流产风险增加2.48倍。 亚甲基四氢叶酸还原酶,代谢酶 AA野生型,酶活性正常; AC突变杂合型,酶活性下降; CC突变纯合型,酶活性明显下降。 4、两个位点组合后,MTHFR酶活性越低,不能提供足够的甲基供体,风险越大(详见附录3)。可采用叶酸、VB12等治疗。 1. PAI-1正常基因型为5G/5G; 2. 5G/4G基因型,发生习惯性流产或体外受精不着床的风险,是正常人的3-4倍; 4G/4G基因型,发生习惯性流产或体外受精不着床的风险,是正常人的44-55倍。 胎儿神经管发育异常、 习惯性流产、 27PAI-1(4G/5G) 纤溶酶原激活物抑制物-1,效应分子 自闭症 68MTHFR(677C>T) 亚甲基四氢叶酸还原酶,代谢酶 CC:野生型,酶活性正常; 1、677 TT基因型孕妇,若不在孕前及孕中服用甲基叶酸\\VB12\\VB6CT突变杂合型,TT突变纯合型,酶活性下降40%;等维生素,新生儿患自闭症的风险,是服用维生素的同基因型孕妇酶活性下降70%。 的4倍。 2、两个位点组合后,MTHFR酶活性越低,不能提供足够的甲基供体,93MTHFR(1298A>C) 风险越大 亚甲基四氢叶酸还原酶,代谢酶 AA野生型,酶活性正常; AC突变杂合型,酶活性下降; CC突变纯合型,酶活性明显下降。 68MTHFR(677C>T) 亚甲基四氢叶酸还原酶,代谢酶 CC:野生型,酶活性正常; CT突变杂合型,TT突变纯合型,酶活性下降40%;1、677 TT基因型孕产妇,更容易发生抑郁。补充叶酸有保护作用。 酶活性下降70%。 2、两个位点结合后,MTHFR酶活性越低,不能提供足够的甲基供体,93MTHFR(1298A>C) 风险越大 亚甲基四氢叶酸还原酶,代谢酶 AA野生型,酶活性正常; AC突变杂合型,酶活性下降; CC突变纯合型,酶活性明显下降。 176DIO2(T﹥C) II型脱碘酶 TT野生型,酶活性正常; TC突变杂合型,酶活性降低; CC突变纯合型,酶活性明显下降,转化受阻。 CC基因型的儿童,如果伴有游离甲状腺素T4水平下降,则智商低于85。8岁前,若给予恰当治疗,则智商可正常发育。约20%的孩子为CC突变,这些孩子要警惕游离T4减少。 孕中和产后抑郁 儿童智商基因 169C15orf60(G>A) 第十五号染色体第60开放阅读框 AA纯合子,比AG和GG,左侧大脑皮质稍薄,导致语言和非语言IQGG野生型,正常 评分稍低。但不影响总体智商。 GA突变杂合型,稍有异常,尚可。 AA突变纯合型,左侧大脑皮质稍薄,语言功能弱。 68MTHFR(677C>T) 1、 MTHFR 677 TT基因型的青少年(13-18岁),其总体认知能力仅亚甲基四氢叶酸还原酶,代谢酶 为48.4分;而MHTFR 677 CC基因型的孩子,其总体认知能力则高CC:野生型,酶活性正常; 达55.3分 CT突变杂合型,TT突变纯合型,MTHFR酶活性受677和1298两个位点突变影响。酶活性下降40%;综合检测677和1298酶活性下降70%。 两个位点基因突变,才能准确判断MTHFR酶活性。

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