细胞信号转导研究方法
更新时间:2023-05-29 11:06:01 阅读量: 实用文档 文档下载
细胞信号转导研究方法
信号转导的研究方法
细胞信号转导研究方法
生物样品的处理
组织样品
采集:新鲜、未污染,剥去脂肪和筋皮等结缔组织若保存,液氮速冻,-80℃冻存
蛋白质成分的保护通常在生物样品中加入适量的蛋白酶抑制剂:PMSF(苯甲
磺酰氟)、EDTA、胰蛋白酶抑制剂、胃蛋白酶抑制剂和亮抑蛋白酶肽。
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低温保存:根据蛋白质的用途决定保存温度:4、
-20还是-80,特殊要液氮
冻溶: -20或-80→4(一天) →室温
均匀摇晃,勿产生气泡,减少沉淀
组织提取物的制备:提取可溶蛋白(尽可能选
择含目标蛋白高的组织)
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步骤及注意事项:1、切成小块,放入预冷匀浆器,加入预冷缓冲液(2倍体积)
2、匀浆1-3min,若较长时间,则间隔1min3、匀浆方法选择:有的组织在匀浆前先冷冻后有利于破碎;
人工匀浆
4、缓冲液的选择:使用中性PH、离子强度适当 5、抑制蛋白酶的加入:根据蛋白质的可能降解情况加入(酶 抑制剂价格昂贵)
6、低温高速或超速离心 7、超声的方法
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细胞破碎与分离
破碎方法:
机械法: 非机械法:溶胞作用:酶溶法、化学法、物理法
酶溶法:用生物酶将细胞壁和细胞膜消化溶解 常用:溶菌酶、β -1,3葡聚糖酶、蛋白酶等; 缺点:价格高,通用性差
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化学渗透法:化学药品改变细胞壁或膜的通透性
有机溶剂(苯、甲苯)、表面活性剂(SDS、 TritonX-100)、金属螯合剂(EDTA)、变性剂 (尿素)
微波加热法:适用于热稳定的产物其他:反复冻融法、渗透压法、干燥法
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信号转导的研究方法受体
突变株的筛选(遗传学方法) 受体提纯(亲和层析) 标记配体法检测受体:
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受体与配体相互作用研究方法 :力(K)以及结合位点的密度(Bmax);
(1)饱和实验,用于测定放射性配体对受体的亲和
(2)抑制实验,用于测定未标记的竞争配体与受体 的亲和力(Ki); (3)动力学实验,用于测定放射性配体与受体的结 合速率常数(K+1)和解离速率常数(k-1)。
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饱和实验常用于确定受体密度(受体的数目)在实验干预(如药物治疗)时的变 化。保持受体数不变而改变放射配体浓度可得到饱和曲线。从该实验中 可估计受体最大结合量(Bmax)和受体对放射性配体的解离常数 (Ka)。
饱和实验的结果以结合配体数(与受体结合的放射性配体的浓度)为y 轴,游离配体数(未与受体结合的放射性配体的浓度)为x轴作图。当 放射性配体浓度增大时结合配体数逐渐增加,当达到某一点以后,再增
多放射性配体量也不引起结合配体数的显著增加。
饱和曲线的最高趋近点
所对应的y值,亦可代表所研究组织中的受体密 度。Kd为占据受体50%结合位点时的配体浓度。
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亲和标记法分离表面受体亲和标记(affinity labeling)是常用的分离细胞表面受体的方法
原理: 将细胞与超量标记的激素(配体)混合,以饱和所有特异受体的激素结合位点。洗去多余的激素,然后加入能 够与受体和配体结合的共价交联剂将激素与受体进行共价交 联。
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亲和标记胰岛素受体
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大多数交联剂含有两个可与蛋白质中自由氨基相互作用的基 团, 当表面受体与配体结合后,配体和受体上各自的自由
氨基的距离靠近到足以被小分子的交联剂结合时,受体和配体就会被交联在一起。
与交联剂共价结合的配体和受体能够耐受去垢剂和变性剂的 处理。
因而可用去垢剂和变性剂溶解细胞质膜,分离膜蛋白通过电 泳进行分析。
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与自由氨基反应的位点
交联剂的分子结构及与受体和配体的共价交联
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核受体作用的DNA元件研究方法 Chip on Chip
纯化的受体制备抗体→ CHIP →特异核酸 序列与已知序列的基因芯片杂交→受体结 合的核酸序列
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G蛋白
药理学激活剂及抑制剂 非水解的GTP类似物激活剂:γ -S-GTP、β ,γ -亚氨基GTP, 与活化G蛋白混合,使G蛋白持续活化状态
细菌毒素-霍乱毒素激活剂:ADP核糖基共价结合α 亚基,不可逆修饰,结合GTP,但不能水解
GDP类似物抑制剂:GDP β S,结合α 亚基的鸟苷酸位点,广泛应用
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生化实验检测特异性?
GTP结合实验:用GTP类似物[ γ -32P]GTP,检测G蛋白的存在,几种G蛋白的
免疫印迹实验:抗体 GTPase活性实验:不同反应底物:同位素标记法([γ -32P]GTP);级联反应荧光法(NADH,GTPase、丙酮酸激酶和LDH)
分子遗传学手段获得突变株)
借助G蛋白突变株(功能缺失突变株、显性负突变株、功能
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环核苷酸信使系统
cAMP/cGMP定性及定量测定3H/125I标记cAMP/CGMP竞争结合分析系统
酶联免疫方法(ELISA) 色谱分离-质谱测定 细胞内实时测定:荧光共振能量转移(FRET)及生物分子 荧光互补(BIFC)
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cAMP[3H]分析系统,优点是放射性半衰期长,可用于大量样品的分析;
cAMP[125I]分析系统,用于小量样品的分析;
cAMP ELISA测定方法,测定简便、敏感性高(特异受体) 。
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cAMP信号系统常用药理学试剂
cAMP类似物:竞争性结合PKA调节亚基上的cAMP结合位 点,PKA的竞争拮抗剂,PDE不能水解,Rp-cAMP、SpCAMP
与PKA的底物结合位点竞争的抑制剂:结合C亚基的ATP结合位点,抑制专一性低,异喹啉衍生物H89、KT5720
蛋白激酶抑制剂(PKI):结合C亚基的底物结
合位点,细 胞内源:α 、β 、γ 三种亚型,人工合成PKA抑制肽(高浓 度时对PKG的影响)
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cGMP信号系统常用药理学试剂 人工合成的cGMP类似物:8-Br-cGMP,直接激活 PKG
sGC抑制剂:NS2028PKG抑制剂:KT5823
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脂质代谢的常用方法
同位素示踪:通过标记32P 磷脂分子的定性和定量:色谱、质谱的应用脂组学
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