DNA分析软件

DNA序列分析软件ORF Finder：www.ncbi.nlm.nih.gov/gorf/gorf.html

序列外显子分析软件GENSCAN：http://genes.mit.edu/GENSCAN.html

蛋白质结构、性质分析软件：

蛋白质活性位点预测软件Psite：http://linux1.softberry.com/berry.phtml

蛋白质结构域预测软件SMART：http://smart.embl.de/

蛋白质亚细胞定位软件PSORT：http://psort.ims.u-tokyo.ac.jp

等电点及分子量预测软件：http://isoelectric.ovh.org/或http://www.expasy.ch/tools/pi_tool.html

信号肽SignalP : http://www.cbs.dtu.dk/services/SignalP

保守结构域搜索使用

NCBI Conserved Domain Search :http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/cdd/wrpsb.cgi

跨膜结构域预

测 Tmpred:http://www.ch.embnet.org/software/TMPRED_form.html

蛋白氨基酸序列的疏水性分析使用ProtScale：http://www.expasy.org/tools/protscale.html

蛋白质的疏水性由ProtScale tool (http://www.expasy.org/cgi-bin/protscale.pl)预测；蛋白质的高级结构由SWISS-MODEL (http://swissmodel.expasy.org/) 预测；蛋白质在细胞内的定位由在线软件TargetP1.1（http://www.cbs.dtu.dk/services/TargetP/）分析；蛋白质的功能区由PROSITE tools (http://au.expasy.org/prosite/)预测；采用clustalX1.8软件进行氨基酸多序列比对；用AliBee - Multiple Alignment

（http://www.genebee.msu.ru/services/malign_reduced.html）分析BmTnC与其它无脊椎动物TnC的氨基酸序列相似性；蛋白质的等电点以及分子量由Compute pI/Mw tool（http://us.expasy.org/tools/pi_tool.html）预测[39]。跨膜区分析http://www.cbs.dtu.dk/services/TMHMM/

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